| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-123I15.T7 (MSMg01no123_i15.b1) | MSMg01-123I15.TJ (MSMg01no123_i15.g1) |
|---|
| ACC | AG333117 | AG333118 |
|---|
| length | 1,313 | 1,279 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 325 (130 - 454) | 333 (124 - 456) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_i15.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_i15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:24 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_i15.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_i15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:25 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CAAAACCNTNNNNAACCACTGGGCGCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCATAACTAGTGGGTACCTTTAAACCCCTGAGAGAAGATTCT
ATTGGTCCATATTCCCCCTTAGCTTACCCAAGAACTGCCTAGAATAGTGC
CAATAGCAGAAAGAAACACATGACCTCAGTCTATTAAATTCTATTCTGCC
TAATATTTTATAACTAGCATCAGTGAATTAATCTATAAATCTCCCTTGGT
AATTAACAGCTCCTAACAGTGTGGGCTATGGTCTTACACTATCGTGGTTC
GGACTTTTGCAGGGCATAGGTTGACACTGTGACTCACCTTGGAATCTAGA
GCTAGTCTATCCTCTATTATAACCAGTCCTGAGCATAATCTACCATATTC
TAACCTTTTCTATTTTACCTAGAAGGTATATGAGTCTATAACCACCACAA
AGAATATTTTTTACCCCCACCCTTTCTAGGTACCCCCTGTTTCAAACTGA
AAAATAAATGCAAATTTCTAAAAAGTATTAATTGGGATTGGCCTTTTGTG
CCAAAACTATGACCAGGCAACAATATGCTTGAAGGCCTGGACTTGGGTGA
CATTCAATATGAAACGATAGAAATGACATGATACTTAGAATTAAAATAAT
CAATAAGTTTACAATTTCTGGAAAATAAGCATAAGAATGCTATATTATAA
ATAGTAGGATGAACATACACTGCTTAAAGACCAAATAATGTCATATACTC
CAATATCAATAACTTCAATAGACAAAGGCTTCAATTAAATGGTCCGTCCA
AAAGTTAGACCTCCCCGGTTCACGTTGAATGGTAGAGATCACATACCACG
GAGAGCGTTGAATGTATAACCGGCATCCATATACCTATATGAATTACCGT
TAGAAAAGGGAGAAACCTGTGGTATAATTGCCGCCATAACTGGCATTACT
AATCGTAAATGTTTTGCGTCCCTTCCCAAAGTTATAAATACAAATCTTCT
CTACTTTTTCTTACTCTAAAACCCCAATGCTGTTTGTAACAACCATAATT
TTTGAACCTTATTTTAATTCCCCTTCTCTGGTCATATCTGTTATCTAAAA
TTTCTCCCGTCCATTACGTCATGCNCCTAATTTATTTTCGTTTCCCTTTT
AATCCTCTGGAAAGTCCCCCTTTCTATCTTTAAAATCTCCCGCTTGAATT
TTTCTCCTTCCTCTCCCTCACCTCTATGAATCCTTCCNAATACCTCCTTG
TAGTATCTAATTACTTCTCTCGCACCCCCTCCCTCCTTCTAATATGGCTC
ACACTCAATTAAT
| NNNNTTCAGATTGGTAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTAAGCCACTCACTCCCATTCTCGCGG
TGTAATAGTGGCCTTAAGGGCAAGCAACGAATCAGGAGCTGTCACGCCAT
ATCAGGTGCTGAAACGTCACGCTGCGGGTTATAAAAGCAGCGCCATTTTC
CAGGTTCGGAATCTTCCTGAGAAGCAAGCAATAAAGCTTTTGCCGCGGAA
GATTCTGGTTTGTTGCATCTTTCTTGCTGGTCGAGCGGGACGCAATAACT
GGCGCCGAAGAACCCAGGAACTGTCATCACACCAGCGCAAGGAAGATCCC
TCGTTCGCGGGGCAGAATCAGAACCGTAGGACAAAAGGCTCTACAAGGTA
AGTATTATCTTGAAATTTCTCCAGAGTTAGAAGCCCTTTTGATTGTTTGC
ACGGCGATTACACTTTTCCTTTAGGTTTCGTTTTGTTTCCACCACTGGAA
CTGCTGACTGGTTCTCAGTCACGGTCAGGCCTGGACAGCCAGCGGCAGTA
TGGGAATCTCCTATTCTATAGTAGTGGCCTTACGCTTGGTCCTGAAGCAG
CGTGGCCTAAAAATCGCCACTAAGACCTTAGAGGGATTTGTCAGAGAGAT
AGACCGTGTTGCACCATGGTATGCTTGCTCAGGGTCATTAACCTGTCGCC
TCTTGGGACAAACTGAAAGGAGATCTAGTTAGGGAACAGCATAAAGGCAA
ATTTAAGCAGGGATTATGCCGCTATGGAAATTGGTGAAACCGTGTTTAAC
AGATGAAGATTGTCAGCAAATGGTATAAACGGTGCAGAAAGTTCTGGACG
AAGTTCAGAAAGTCTATCACAAGTACAGCCGTTAGAGAGAGTAAAAGTTA
TAGAGGATACCCATGGCCCTGAAAATTTTAGCCTTTCCCCGGTCCTTGAC
CCGAGTAATAAAAATTCCCAGGGTAAAATCCTTGGCTTTAATTAAAAAAA
CGGATGTCATAGGTAAAAAACAAGTTAATATGACCTGACTAGCTATATAC
TGTATATGACCTTTCTCCCCCCCTCCTGATGAACTTTACTCCCCTAACCC
TTTATGATTTCTTTACTCTAATCTAGGTCTCTATTGCCCTCTCTAAAAAA
AGTCTATCTCTCCAGTAGTATTCAGTTTCTCTCAATCATTATAATAGTTT
CTCTCTTCCAATCATTTCGTCGCTCTCTCTTTTCCCCTATTATTCCGTCA
TTCTCTCCCTTTTGATACTCATGTTTCTC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 3 0 3 0 0 0 0 3 9 10 9 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 11 15 8 8 8 10 8 8 8 23 22 24 28 24 24 30 37 44 50
50 48 43 43 43 50 23 22 10 9 9 22 22 33 33 31 30 28 25 29 19 15 9 9 10 10 11 10 9 9 9 9 9 10 15 10 10 10 9 10 21 26 53 57 57 57 53 38 36 36
36 36 36 36 36 33 33 31 31 31 30 25 21 11 12 9 8 8 9 8 8 8 8 8 10 10 13 11 12 13 15 30 32 41 50 50 44 31 29 29 28 33 39 50 36 42 42 42 47 47
48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 50 50 50 68 68 68 57 57 47 44 46 40 43 43 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 52 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 52 52 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 52 57
52 54 59 59 59 68 68 68 57 57 57 68 57 57 57 57 57 54 54 57 59 57 59 59 54 54 59 59 43 37 31 32 32 39 37 43 44 57 57 59 57 57 54 59 59 59 59 48 48 57
57 57 48 57 48 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 47 47 43 43 43 43 43 48 43 43 43 43 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59
28 20 12 12 12 11 8 8 8 8 8 19 30 46 46 50 50 59 59 43 43 37 37 43 43 43 46 46 59 59 47 47 43 43 43 43 47 59 59 59 59 59 57 48 48 43 43 39 39 35
28 26 10 13 10 10 10 13 14 14 12 10 10 12 10 11 12 11 11 12 27 25 43 43 39 39 39 37 37 48 43 39 39 39 43 46 37 32 21 15 12 12 12 13 12 12 11 11 11 12
20 20 22 19 24 28 37 44 59 59 48 48 48 57 59 59 59 48 48 48 48 48 42 42 30 30 30 43 42 36 36 43 42 43 40 39 39 42 42 47 47 47 47 47 48 46 47 43 43 44
42 37 30 30 30 42 42 57 57 54 54 54 47 40 36 27 27 25 36 36 44 57 48 48 44 46 43 43 43 43 43 50 33 28 24 24 24 28 28 37 33 43 32 32 18 18 18 23 32 43
35 43 43 43 32 29 29 43 43 43 44 43 44 44 47 47 42 42 33 33 32 37 37 37 37 38 42 35 35 44 36 37 37 44 25 25 14 14 15 27 38 46 42 37 35 35 37 39 43 43
43 43 43 39 41 30 30 30 37 42 43 39 36 36 43 34 39 30 30 25 33 24 28 28 29 21 21 19 26 23 37 37 37 23 21 14 21 21 33 33 39 39 32 30 28 26 29 27 31 30
28 28 28 23 24 20 23 23 32 32 28 28 24 28 23 21 33 28 28 30 28 26 33 30 30 29 30 30 31 29 37 31 21 21 13 15 18 26 29 37 39 29 23 19 15 15 15 27 22 12
12 12 15 15 14 12 11 13 11 8 8 8 8 8 8 8 8 15 19 16 16 9 10 8 10 13 10 13 10 15 13 12 10 12 12 10 10 13 11 18 17 11 10 8 7 8 6 6 6 8
10 10 16 15 15 12 9 9 9 9 9 9 12 10 8 8 8 11 12 13 13 10 10 10 11 10 10 13 17 14 8 8 8 8 8 10 18 18 30 21 13 8 8 8 8 7 9 9 9 10
10 9 9 9 10 10 12 16 14 12 8 8 8 8 8 10 19 17 18 10 10 10 10 10 11 16 12 15 10 10 7 7 10 10 10 10 10 10 10 13 14 10 9 9 9 15 11 8 8 8
8 8 8 8 10 10 10 8 9 9 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 15 10 11 11 11 21 21 28 22 11 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 7 7 9 10 8 12 10 6 6
10 10 9 9 9 13 17 11 11 8 10 10 10 15 10 9 9 10 10 10 11 13 15 15 23 19 15 15 15 13 15 10 10 10 10 10 11 10 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8
12 8 10 10 10 9 9 16 11 11 11 9 10 8 8 8 8 8 15 18 11 12 10 12 8 8 8 10 10 9 9 10 11 11 8 11 8 8 8 9 9 10 8 6 6 8 8 8 8 8
8 10 18 11 11 8 13 10 10 9 9 10 10 12 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 10 8 8 8 8 11 11 12 11 11 11 9
9 7 8 8 8 8 8 8 9 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 10 10 3 0 3 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 13 9 9 11 12 13 10 8
9 10 10 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 13 14 12 10 10 8 6 6 6 10 10 13 10 9 11 22 12 10 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8
8 8 6 6 8 6 8 8 8 15 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 9 10 12 3 0 3 6 6 8 8 13 12 10 10 8 8 8
8 10 12 8 12 10 8 8 8 10 12 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 13 13 8 8 8 7 8 12 8 8 7 7 11 11 11 7 6 8 8 14 8 8 6 6 8 8 8 8
8 8 8 6 10 6 6 6 6 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 0 3 6 6 6 9 6 6 6 7 7 7 7 7 8 15 11 9 9 10 10 10 13 7 8 8 6 8 8 9 19 15 15 8 9 11 19 21 30 22 22 24 33 35 35 34 29
29 33 29 28 35 36 50 53 53 50 50 50 50 47 47 27 21 10 10 11 12 14 16 17 12 10 9 9 8 8 8 9 9 10 25 30 33 41 47 47 50 53 53 53 53 53 53 36 33 28
31 31 31 33 33 33 33 25 22 12 12 11 13 12 8 8 8 8 10 12 18 20 15 18 14 29 29 47 47 48 50 48 50 50 50 57 41 41 23 28 22 32 32 42 48 57 48 42 42 42
48 48 54 54 48 48 48 48 48 48 57 54 54 54 54 47 48 46 46 37 41 41 41 41 41 44 43 40 40 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 57 57 48 48 54 54 57 57 57 57 57
57 57 50 47 54 54 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 43 43 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 59 59 68 59 59 57 52 52 52 52 52 57
59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 57 52 52 52 59 59 59 59 43 43 43 57 57 57 54 54 27 27 11 11 11
27 27 52 57 59 52 52 52 52 52 43 44 43 43 43 44 43 43 44 57 57 57 50 43 37 37 42 44 43 43 43 43 43 39 39 43 44 57 57 57 40 46 44 42 35 35 39 43 57 59
59 59 59 48 48 48 48 47 48 43 43 37 39 37 32 32 39 42 39 35 35 39 42 42 43 39 42 42 30 30 42 42 46 48 48 47 47 48 48 57 59 57 47 47 47 48 59 37 30 25
18 18 11 12 12 12 12 14 22 24 34 34 46 41 43 47 59 59 57 43 43 43 39 39 39 39 39 40 39 32 32 33 33 35 39 39 46 57 57 57 57 48 59 43 43 43 43 47 47 48
48 37 36 19 19 18 21 28 27 23 14 18 15 18 15 20 20 24 27 28 24 28 27 38 42 57 59 57 57 57 47 47 47 42 42 35 35 42 43 35 35 35 43 43 33 33 27 27 27 43
43 43 39 50 43 52 52 52 43 43 41 41 31 43 43 36 14 17 17 17 30 36 32 18 14 14 30 32 35 35 35 44 43 36 36 32 43 24 15 8 14 10 14 14 13 14 18 27 26 37
43 43 35 24 18 21 21 38 38 42 48 46 57 43 43 43 57 44 32 26 14 14 14 24 24 36 30 30 42 44 44 44 32 30 30 36 44 25 25 25 36 40 46 44 36 25 25 19 19 11
11 11 17 22 28 35 40 40 35 35 35 33 37 32 32 28 24 23 19 19 21 21 12 12 12 24 25 24 25 15 14 14 23 21 15 14 14 15 21 25 25 21 21 22 32 31 31 23 20 24
13 12 14 19 17 17 14 14 15 18 11 14 11 15 10 11 19 24 24 24 29 29 30 30 34 47 43 43 32 28 23 23 23 32 32 28 31 31 30 23 24 18 13 14 14 16 22 22 15 24
24 24 15 21 16 15 24 15 21 21 28 28 28 26 27 22 22 24 22 26 17 17 15 17 16 15 10 10 10 10 13 15 15 21 17 22 24 15 15 12 12 12 15 13 13 12 15 15 13 13
10 11 11 12 11 12 10 10 10 10 10 10 10 13 13 10 10 13 15 17 28 28 28 15 20 13 12 10 18 21 23 16 12 12 12 14 12 9 9 9 11 11 12 19 16 17 10 8 8 8
8 8 8 14 15 18 12 10 10 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 10 11 11 9 9 9 9 9 10 11 11 12 12 11 10 12 12 12 13 11 13 13 12 11 13 10 9
9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 12 9 10 8 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 15 12 11 11 10 10 9 8 10 10 10 10 13
15 10 10 8 6 6 6 6 6 8 11 8 8 6 6 8 8 10 10 10 15 13 10 9 9 9 10 10 10 12 12 15 10 13 10 12 12 10 10 10 10 10 10 9 10 8 8 11 12 10
10 8 8 8 8 6 6 6 7 11 10 10 10 6 6 6 6 8 8 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 12 11 11 12 12 9 9
8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8
10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 9 9 8 8 6 7 6 8 8 8 8 6 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 15 13 10 10 10 10 9 10
8 8 8 8 8 8 9 11 11 11 11 8 8 9 7 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 11 11 8 8 6 6 6 6 6 8 8 12 12 11 11 11 11 13 13 14 13 16 9
8 8 6 6 8 8 6 9 11 15 10 10 10 10 12 11 11 9 8 8 8 6 6 8 8 10 15 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 10 9 9 11 10 8 8 8 8 8 8 8
13 15 8 10 7 7 10 8 12 11 11 10 10 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 11 12 15 14 9 9 9 12 13 14 11 6 6 6 6 8 8 8 8 11 10 8 7 7 8 8 8
8 10 10 8 12 7 7 10 12 14 10 10 8 6 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 8 8 11 7 7 |
|---|
