BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-130N09.T7 (MSMg01no130_n09.b1) | MSMg01-130N09.TJ (MSMg01no130_n09.g1) |
ACC | AG338490 | AG338491 |
length | 1,230 | 711 |
length of high quality (start - end) | 280 (126 - 405) | 286 (73 - 358) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no130_n09.b1 PHD_FILE: MSMg01no130_n09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:44:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no130_n09.g1 PHD_FILE: MSMg01no130_n09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:44:50 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCGGTCGTATNNNNNGCAGTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCTGAGGTCAGCACTGACCGATAGGTGGCCCTGAGAGAAGC
AGGGACTAAGAGGAAACCCTTTAAATTCTCCAGGCCCTTCCGAATAAACT
CACCAGGTGGCAACCCTATCCATTTAGGTGCCAGGAAAGACCAGGGCAAA
GTTTATTGCTATTGAGAAGAGGCCTCCCTCAGCTGTCACGGCATACCTGG
CTAGCCCAGGTATACACTGCTTCTCCAGGCAGGAATGATCTTTCCCTCTG
GGACCCAGGACCATAGGATGAAGGTGCAGGATGGGGACTTCCAGATGCCG
CAGACCTAGGTGCGCCACAAGATCAGGTTTGCTGGAGGAACATCAAAGCG
TTTTCGGTTGTGGTCGGTTTCTCTTTGGTACAGGTAGCCACAGGTGGGCT
TCTGCAGTGTGTATACCCCCCCCAGAGAATTGGAATACTGTGAGTTGAAG
AAACTGAACCTGATGCTAGTGTCTGGGTTCTGCCCCCGAGGATCCACCAC
CACTGGTACATAAGCTGCCTCCAGAGTCTGCTCTCGGTCCCGTTTCCATT
TCTGGGACAATGCCGTCAGCGGCACCTTTGCCTTTGTGCCTGATGTCATC
TTTTGCCCACGGCTGGGGACTAAGGATTTCTGTGAATCCTAGGAAGAGAA
AAGGAAGGAGAAAGTTGGCAGGGATGAATGCCGGGGCACCAGACTGTGAT
GTTGCAATTGCTACAGCCAGGGCAGGAAGGAGAATGGGGCACGATGCGGG
GTCCCCAGCTCAGCTGGCCAAGATGCCAGAGCCCCCAGAACAGGAGACAG
CCTGCAAGCCCCTCCCCTAATCGCTGCTCCTGAGGACTTCCGCCTAATTT
TCAACAGCACCTGTCAGCTCCGAAAGCTGAGTACCTGGATGTTGACGTCA
GTGCCGTTCTTTCTTTCCCCCCCCTCCCCCCTTCACCAATCCTCACTCCT
CCCCAGGGCCTCCTGAAGCAAAGCTCCCCAATCTCTGGAAACGAATATGC
CCTCACCCCCCCTTCCTCCTGGAAAACCCACTCCCTTTGAACCCTTGGAA
GACCTCCCCCCATTCCCGGCCTCCGGGCCATTTCCTCTTTTGTTCCAAAA
GATTAATTTTGTGGGTTTTATAATACCCCACCAAATCTCCCACCTTTTGG
CCTCCTATATCACTTGGGTTAAAAAAAACC
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTAGGGGCAGGCTGGAGAGAAGGCTTAG
GAGATTATGATCTTTCGCTGCTCTGGCAGAGGACCCAGGTTTGGTTCCCA
GCATCCACGCGGTGGTTCACAATCATGTGTAACTCCAGTTCCAGGGCACC
CTAGGACCTCTTCTGACCTCCCAGGGCATCAAACAAACAACACACGTGTA
TGTATGGCACACACACACACACACACACACACACACACCCCACATACACA
CAAAATATTAACAAATGTTTAAACAGAAGTTCGGTATATAAGCAAGTCAG
CATTTTCTTATGTCCCACCCGACCGAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAGGACT
GGTCCCAGGTTCACCAAATGGATGAATGATAAGAATGATTTAAAAACAAC
AACAACAACAAAATGGACATGACCTTCTAGGTACATCGAAGGAGAAAGTA
TATTGTAGGTGTGTTGAGAGCACAGCCAGAGGCAAAGCCATCTAGGAGAG
TCCAGAGCTTTGTGCTGAGAGGGGGAGGGGGGATGGGAGAGGGTATTTTT
CTTCTCTCGGCCGGCGCCGGCTTCCCCTTTTCTTCGCTTGCCCCTTTCCC
TCTTTTTTTCTTTCGCCTTCCTTTTCCCTTTTTTTTTCTCCTCCGTCCTT
TCTCTTTCTTT
|
quality values | Open.Hide.12 12 11 11 12 9 9 9 11 3 0 0 0 0 0 3 7 7 7 7 10 8 8 8 8 8 6 6 10 8 12 15 17 8 8 8 8 8 12 22 24 35 32 28 37 33 34 34 34 47
47 48 43 47 42 42 47 42 42 38 36 36 36 36 36 36 33 33 33 40 33 25 19 19 9 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 13 19 18 25 28 28 31 31 35 35 36 50 50 50 44
43 43 34 33 35 35 35 31 31 31 42 30 27 29 18 15 12 17 16 10 10 8 8 8 10 18 28 30 37 37 39 30 48 48 57 44 44 27 40 24 25 23 28 32 43 48 43 43 54 54
57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 54 50 50 50 50 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 48 24 24 11 11 11 11 25 25 59 57 57 57 59
57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57
52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 37 37 37 37 44 44 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 57
57 43 43 43 57 57 57 57 57 59 54 54 59 59 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 57 57 54 54 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 48 57 57 57 48 48 48 48 59 59 59 59
59 31 30 17 15 12 12 12 15 12 12 18 15 23 30 34 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 57 46 46 43 47 48 59 59 59 48 57 57 57 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59
41 37 31 30 21 21 11 11 11 11 12 12 11 9 9 9 11 11 14 8 8 8 8 8 9 22 29 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 41 47 46 28 28 19 12 11 11 12 12 12 12
13 26 24 30 28 31 37 39 48 48 48 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 59 57 57 57 48 57 57 59 59 59 59 59 57 68 57 57 48 48 47 50 50 54 59 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 48 54 54 54 48 48 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 59 59 44 44 43 57 44 57 57 43 43 43 50 50 59 59 59 59
59 54 50 46 43 43 43 46 46 48 48 48 42 59 43 54 59 59 59 57 57 44 44 37 43 43 57 57 54 54 48 57 47 46 41 39 39 46 48 48 48 48 48 48 48 54 54 59 59 59
59 54 54 54 57 59 59 59 59 59 59 47 47 43 43 39 39 39 43 47 43 43 48 48 48 48 48 47 41 37 22 18 18 17 14 19 30 39 34 47 37 37 30 37 32 43 43 39 39 43
43 43 59 43 43 43 39 39 36 39 30 30 24 28 23 34 30 37 37 33 32 25 28 32 39 39 37 37 39 39 39 39 39 43 35 30 30 27 27 16 11 13 13 21 27 23 21 15 20 20
31 40 36 35 35 42 42 47 48 47 47 47 40 39 39 39 39 39 39 39 39 37 30 24 24 19 24 23 21 21 22 18 15 18 21 20 18 32 32 19 19 24 32 34 37 43 39 39 37 37
43 32 30 33 33 33 29 29 22 24 31 20 12 13 18 15 17 18 27 21 20 19 19 26 22 22 21 18 16 17 13 13 10 10 10 17 11 11 9 9 10 10 14 14 11 20 24 19 16 22
28 22 20 15 12 9 10 12 14 22 24 30 22 21 14 14 12 12 9 8 8 8 13 15 17 10 13 11 12 12 24 22 28 28 28 28 27 17 13 9 9 10 9 11 13 10 10 10 9 10
13 16 18 18 20 17 13 17 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 9 10 13 16 15 10 8 8 8 8 8 12 15 12 10 8 9 8 13 10 11 11 8 8 8 8 8 8 10
9 9 8 12 12 10 11 15 19 21 16 19 19 25 21 21 13 8 8 8 10 17 19 15 15 11 9 10 9 9 12 17 15 10 10 13 10 11 10 8 8 8 8 10 10 12 12 15 12 12
13 26 19 11 9 9 9 13 15 10 8 8 8 8 9 9 9 8 10 13 11 11 8 10 6 6 6 8 15 12 10 8 8 8 8 6 6 7 7 6 8 6 6 8 8 6 6 8 8 10
11 10 10 10 10 10 15 16 12 14 14 14 12 10 8 8 8 8 10 8 9 8 13 9 9 9 8 7 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 13 10 10 10 11
10 11 11 11 9 9 10 10 10 11 9 9 9 12 10 15 20 14 6 8 6 6 8 8 10 10 9 8 8 6 6 11 10 6 6 6 8 8 9 9 9 9 10 12 12 12 12 8 12 8
9 10 10 10 10 10 11 12 13 13 6 6 6 6 8 8 8 8 11 13 9 9 8 8 10 10 6 6 6 6 8 6 7 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 12 13 13 13 9 8
8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 6 8 8 6 8 6 6 6 6 11 15 24 17 15 14 11 11 11 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 8 13 3 0 3 10 19 23 22 22 24 28 30 25 31 33 33 33 33 27 19 8 10 8 8 6 10 12 12 12 11 12 11 21 21 22 29 29 21 21 10 11 12
22 21 33 21 18 9 12 11 11 11 11 15 11 12 12 11 11 11 22 22 33 33 34 37 44 57 57 57 57 57 48 48 47 47 47 50 53 53 53 53 53 53 53 57 50 50 50 53 57 57
57 53 57 57 57 36 36 44 44 39 37 37 37 30 27 12 12 12 15 19 22 36 34 40 33 33 33 36 36 36 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 42 48 42 48 48 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 43 43 57 48 68 68 68 68 50 50 50 57 54 54 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 59 47 47 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 48 48 48 57 57 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 44 39 26 24 15 13 17 12 25 19 25 33 37 43 43 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 29 16 6 6 6 8 8 13 13 16 12 10 8 8 8 8 8 11 11 11 12 15 12 18 24 34 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48
48 48 48 48 59 59 59 59 28 28 11 10 9 9 9 12 21 28 32 37 34 32 33 33 37 43 39 57 57 48 59 59 59 48 47 40 43 43 43 34 34 28 30 30 41 41 43 47 48 57
48 48 48 57 57 68 57 57 54 54 54 57 59 59 59 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 48 48 48 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 48 47 47 43 43 43 57 57 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 54 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 44 43 43 44 57 57 59 59 57 57 48 48 42 47 37 39 39 39 37 46 43 48 48 57
57 59 59 54 54 47 47 43 46 47 59 43 57 48 48 37 43 28 28 28 37 37 43 43 43 43 43 40 40 40 39 37 37 39 31 31 35 35 37 25 23 12 12 12 12 11 11 10 8 8
6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 11 11 12 10 10 8 8 8 10 8 8 8 7 6 7 7 11 7 6 8 8 9 12 11 11 11 10 12 12 12 12 9 10
10 12 12 12 15 13 11 12 11 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 10 19 19 20 19 19 14 14 14 15 10 13 10 13 12 14 12 9 8 8 8 8 8 10 10 14
10 13 8 8 8 10 8 8 8 13 9 |