| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-134G12.T7 (MSMg01no134_g12.b1) | MSMg01-134G12.TJ (MSMg01no134_g12.g1) |
|---|
| ACC | AG341129 | AG341130 |
|---|
| length | 1,258 | 1,272 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 695 (89 - 783) | 599 (97 - 695) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no134_g12.b1 PHD_FILE: MSMg01no134_g12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:49:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no134_g12.g1 PHD_FILE: MSMg01no134_g12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:49:46 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NCCCTTCATTGNNNNTACAATGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXCGCGGAATTCTCACCTGAGGAATACCCCCTTAAAGAGAAGCACCTGAA
AAAATGCTCAACATCCTTACTCATCAGGGAAATGCAAACCAAAACAACCC
TGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGT
GACAGCAGATGCTGGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTG
TTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGT
TCCTCAGAAAACTGGATATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTC
CTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGGACACATGCTC
CACTATGTTCTTAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAGGAAC
CCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTAC
ACAATGGAGTACTACTTAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCT
AGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACATT
CACAAAGGAACTCACACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCC
AAAACCTAAGATACCCAAGATATAAGATACAATTTCCTAAACACATGAAA
CTCAAGAAAAATGAAGACTGAAGTGTGAACACTATGCCCCTCCTTAGAAG
TGTGAACAAAACACCCTTGGAAGGAGTTACAGAGACCAAGTTTGGAGCTG
AGATAAAAGGATGGACCATGTAGACACTACCATATCCGGGGATCCATCCC
ATAATCAGCTTCCAAATGCTGACACCATTGCATACACTAGCAAGATTATG
CTGAAAAGGACCTGAAATCGCTGTCTCTTGTCAGAGAATGCCTGGGGCCA
TCAAACTAAAAATTGAAGGCTCACAGTCGGCTTTTTGGAGGGATTATAGG
GCCCCCTCTGTAGGAGTTTTTTGAAGGTTCCCTATAATCTTTAGGTATCT
TCTCTCCCCTTTGGTGGGAATACCATTTTGAATTATCTCCTTTCCCCGAT
GTTCTTTATCCTTCTGTTCTTTCTTTAAAAATGGCTCAATTTCTCCTCCT
TGTAAAATAGAGTCCTCTGTACCTCTCTTCCTTTTTTCCTCTACTCTCGT
GGATATCTGGTCCTTATATATATTGTTTGTGTTTTTCTTCTTCTCTCTCT
TTCTTTTC
| CCTGTCTTTTTTNTAACATGTGAGGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAATGTTCCCTGATCTCCTG
GGGCTGACAAGCATAACCCGAAAATGAGGGCACTATGCTTTGATCAGCTA
CAGAATAAATAAGGAGCTGAAATCAGTTGTTTGAAGGAAATATGACTACG
GGGCTTGCGTTTGATCAGCAATCTTCAGATTTTTAGGTGAAAGCAAGATA
ACTTGTATAAAACTCCTTGTTTGCTCTTTGTAAACTTTTTCTTAAAGAGT
AGCAGCATTCTTCAGAGTGAAGCTGGGGAACCTTGGCGTATTAGGAGTTT
AACCTCTGGTAATTCAGATAAGTGACTTGTCCCAAGAGGTTTGTTATGGC
TTCCTACTTAGAGAACCCAACCTTTTAAAACAAAACAAAACAAAACAGAA
CAAAACACCCCCCTGTGTGTTGGGGGAGGGGATATGCCACAGTGCATGTG
TGGAGGTCAGAGGACAACCTAGGGTCACCTTACACATCGTTTCTGGCAGG
TCTTTTGTTGTTAGTTGCTTTATATGCCAGGCCAGCAGGCCTACAAGCTT
GTGGGTATTCCCCTGTCTCCACCCTACATGTTGATGGCAAGACATTGGGA
TTATAGATGTGTGCTACCATGCCTAGAATCACATGAGCTCTCGGGACTCA
GACTCAGGTTGGGTTCTGGGATTTAGACTCAGGTGCCCATTCTAACATAT
CAAGCATTATCCCGTGAGCTGTCTTCTTAACCATGGTATACACTCTTTAA
GGTCTCATAGGGTTATGTTTGTTGTTTTACTTATAGTTCTCCCCTCTACC
CGATTTCCTCTTTTGCATCTTGATATTTCTCTCATATTTTCCTGTTTCTT
TGTTCTTTTCTTGCTCTTCTTTATATTTTTATCATCTATTCTCTCCACTC
TCCTTTTACTTCTCTTTTTCTCTCCTTATTTCCTCTTATTGTTTCTTATA
TCTTCTCTTCCTATCTATTATTTTTCTCTCTTTTTTTTGTCCATCTTCTT
CTATTCTCTCTCTCCTTCTTTTTGTTTTTTATCTTTCTATCTATTCACTT
TCTTATATACTTTACTTTCTCTTCCTTTTTCATTCCTTCTCTTCTCTTCT
TTCTTTTCTTTCTTTGCTTATTTTTTTTCCTTCTTTCCTCTTAACTCCAT
ATCTTCTTTTGCTCATTATATATCTTATTCTCACTCTTCTTTCGTATTCC
CCCTCTTCTCTATTTCTCTACC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 10 10 12 12 9 9 11 9 3 0 0 0 0 3 8 3 6 8 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 15 15 9 8 8 12 14 18 24 24 37 37 36 37 37 36 36 42
43 43 50 50 50 50 50 50 43 43 53 53 53 53 36 36 35 35 31 31 31 30 33 33 33 22 19 8 8 8 8 8 8 8 11 13 15 10 15 19 25 33 48 33 35 35 35 35 38 38
53 59 59 59 53 50 50 50 36 36 44 50 50 37 37 25 22 10 10 10 10 10 12 12 25 23 39 36 39 47 48 42 59 59 59 30 27 12 12 12 12 12 21 30 41 59 59 50 50 53
53 57 57 57 53 57 57 57 57 50 50 50 53 50 50 53 53 53 47 47 51 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 59 59 57 48 57 48 57 57 68 68
68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 68 57 57 68 68 68 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 57
57 57 57 57 59 52 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68
68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 33 15 9 9 9 10 13 20 39 44 59 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 52
57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59
57 54 54 54 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 43 43 44 44 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 44 43 30 30 30 43 43 48 48 48 59 48 48 54 54 54 48 48
48 48 48 48 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 48 59 48 48 59 59 59 57 57 48 48 43 43 43 43 43 43 41 50 42 41 39 39 39 37 37 39 39 41 41 41 39 35 33 37 37
37 39 39 43 43 43 43 47 39 43 37 40 40 43 43 43 43 43 57 50 50 50 47 47 42 37 37 37 37 28 37 37 37 37 37 47 43 43 37 32 37 37 37 43 41 30 21 18 18 21
23 33 39 40 40 40 40 40 41 41 39 39 32 27 25 30 30 37 37 32 29 26 29 28 27 37 32 31 24 30 16 16 24 27 34 41 48 48 37 27 32 22 22 17 27 22 36 36 47 24
23 9 9 9 18 23 34 36 36 39 37 39 32 32 35 39 34 39 28 26 32 37 39 39 40 40 37 32 32 22 22 22 26 17 16 11 11 14 16 25 33 22 18 11 11 11 12 12 12 22
19 22 13 15 10 11 16 16 17 17 37 32 29 26 32 36 33 39 35 23 22 16 16 12 12 12 17 30 18 11 9 12 8 12 10 24 17 19 22 22 27 28 37 26 26 12 12 13 18 15
12 10 11 12 14 14 12 17 16 14 18 18 12 17 10 10 10 10 10 12 24 22 20 20 15 15 19 22 22 13 11 10 10 12 8 8 9 14 11 13 15 15 15 27 19 21 11 12 11 9
9 8 12 9 11 11 13 10 11 15 26 19 10 10 12 12 10 15 10 15 13 16 10 10 8 8 8 11 13 9 13 13 10 9 9 8 8 8 10 12 10 13 14 12 13 12 9 10 13 9
9 10 13 8 8 8 8 11 11 11 11 10 10 10 9 8 8 8 8 8 9 9 9 11 12 14 15 15 8 8 6 6 8 10 13 13 10 10 10 11 17 15 18 15 12 9 9 9 9 9
9 11 12 19 19 12 12 12 11 11 11 11 11 11 11 11 11 18 22 18 14 9 9 10 10 10 10 10 12 10 9 9 10 10 12 8 11 11 11 11 16 19 18 19 11 11 11 10 15 12
10 10 10 10 10 10 11 11 12 14 13 11 12 12 11 12 12 13 16 11 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 15 8 8 8 10 8 8 8 10 10 10 10 10 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 8 10 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 9 11 12 12 12 15 12 12 8 8 6 6 6 6 8 8 12 12 9 9 8 8 8 8 8 8
11 11 11 10 10 10 11 11 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 12 14 24 19 19 9 8 8 6 6 6 6 12 11 17 17 12 10 10 10 9 9 9 9 9 12 15 8 10 6
6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 10 11 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 13 11 15 8 6 8 8 8
8 8 8 8 10 10 6 6 | Open.Hide. 8 8 8 8 9 10 8 11 10 19 17 3 0 3 7 7 7 6 6 6 7 6 6 6 6 8 6 6 8 6 11 11 12 13 8 8 9 8 9 10 15 19 13 15 8 10 10 22 19 20
20 28 28 32 35 35 42 37 37 35 35 36 38 38 53 47 50 50 50 50 59 47 27 21 9 7 7 8 8 8 8 12 8 6 6 6 14 12 16 17 26 26 26 29 14 14 15 26 26 42
42 42 53 53 50 53 47 53 50 50 50 33 33 33 21 21 8 8 8 8 8 11 24 30 43 46 43 43 43 43 37 31 27 21 16 10 10 11 11 12 21 30 34 41 50 33 31 31 36 36
36 53 57 53 53 53 57 57 57 50 53 53 53 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 54 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57
59 57 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 57 59 59 59 59
57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
62 62 47 47 43 39 39 39 39 15 21 43 43 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 59 59 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 43 59 59 59 59 57 57 50 50 43 52 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 68 68 68 68
68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 57 57 57 57 57 57 43 43 43 39 39 37 37 37 37 37 40 44 36 47 46 59 48 54 54
54 40 43 24 24 24 33 33 48 57 57 48 43 43 43 43 48 57 57 48 48 48 57 57 59 48 48 48 41 42 41 41 39 39 32 30 29 37 37 37 41 47 46 46 48 43 39 30 30 21
25 19 19 19 29 29 39 43 37 37 23 23 16 23 18 28 28 31 31 43 46 46 57 57 48 43 42 27 27 12 12 12 24 19 23 11 11 11 23 41 59 40 28 19 16 11 19 18 18 11
14 15 22 19 19 17 17 14 20 19 14 9 9 11 15 18 17 11 9 9 10 17 17 14 10 10 12 21 22 24 21 30 24 26 19 16 13 13 13 13 28 25 21 15 11 11 11 18 23 22
18 13 13 12 16 11 11 11 21 10 10 9 9 10 12 10 11 11 11 11 13 16 11 12 11 13 12 10 10 11 11 9 9 6 6 6 6 8 8 10 11 8 8 6 6 8 13 12 10 9
9 9 10 10 6 6 6 6 8 10 8 6 8 6 6 8 8 8 8 15 15 15 10 9 11 20 15 9 8 8 8 8 11 9 9 8 8 8 8 10 8 9 8 8 6 6 8 6 6 8
8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 8 10 9 9 9 9 9 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 9 9
9 9 8 10 6 6 8 8 9 9 9 9 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 9 11 11 10 13 11 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 14 13 9 9 9 9 9 10 14
14 11 11 11 9 6 8 6 6 8 10 10 11 10 8 8 10 13 8 8 6 6 8 10 13 11 7 6 8 8 6 7 8 8 8 10 8 9 9 9 9 9 9 9 11 11 8 8 8 6
8 8 10 12 10 9 9 9 11 9 9 9 9 9 8 9 8 8 8 8 8 8 8 12 11 12 10 10 11 14 16 17 11 11 12 15 12 9 11 9 12 9 9 9 8 8 7 7 10 6
6 8 8 9 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 7 6 8 15 10 8 7 9 13 13 12 12 6 8 6 6 8 8 10 7 9 8 6 6 8 8 9 13 10 10 10 12 8
8 6 6 8 6 8 6 6 6 9 15 18 9 9 9 11 19 10 9 9 10 10 11 11 7 7 10 13 9 8 8 8 8 10 8 9 15 8 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8
8 8 6 6 12 12 12 10 11 10 12 12 10 10 6 6 6 6 8 8 9 18 18 18 16 8 8 8 10 10 10 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8
8 8 10 13 11 9 9 11 10 8 8 6 6 8 8 9 8 6 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 11 6 9 10 11 15 8 8 8 6 6 7 6 6 7 7 10
10 8 8 8 11 13 13 13 8 12 8 8 8 8 7 7 8 8 6 6 8 6 |
|---|
