BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161H01.T7 (MSMg01no161_h01.b1) | MSMg01-161H01.TJ (MSMg01no161_h01.g1) |
ACC | AG360844 | AG360845 |
length | 1,211 | 1,248 |
length of high quality (start - end) | 667 (195 - 861) | 111 (284 - 394) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_h01.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_h01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_h01.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_h01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:03 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNNGGTGCTTGGGCGCTAAGACTACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCT
ATTATCTTACTGATACCATAAGGGATTACAATTTGAAATTGGAGATTCCT
TTCCATCTTTAAAGAAATCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATAT
ATATATATATATATATATATATATATAATCTCAAGCATACCACAACATTC
AATCTATACAAACTATATTTGTGATTACACACAGATGTCTTCTTCCCTTA
TGACTACTGTTCTTCAAATATTTCTTATTTAAAACAAAAGATATTGTTTG
CTGTTCTTAATCTTTCTGTTTAATAATCTCATAGAAGTATATTCTCATCT
GTCACAATATGAATCAAGATCATAATTAGAATGCACAAATAGAGAATGTT
ACTCGGAAATCAACTTTCTTTTTTAAAATAGTGACTGGAACTATTGTTTT
TTTTTTCCCCCCCCTTGATTTACAGTCCTGCTATAAAAAAAAGGGGATCA
TCATGAATTATTTTCTTTCCTCTCACATGTATTTATTATTTTTCCTGTGT
ACTTTTGTACATAACTTGTAAATTAATATTCACCATATACTGGCAGATGC
CTGCAGAGTCCAGAGAGCATCAGATATCCATAAAATCATGTGTAGGATGT
GGGTGCTAAGGCAAAACCAAAATTCTCTTCAAGAGCAATAAGCTCTTAAA
TACTGAACCTTACAGCATATGCATGTTTATGTACCCTTATCCCATTCTTC
TGTGTCAAATCATTCCTGTCTTTCTCTCTCTTTGTTTTATAGATAGGGTC
TCACTGTGTGAACTTGGCTGTCCTGGACCTCTCCATATCCACCAGCCTCA
CCTTGAACTCTCAGAGAATCACCTGGCTCTTACTCCCAAATGCTTGGATT
AAAGGTCTTCTACCATGCTCAGAAAATTTTTCTTCTTAACTTATGTTTGG
CGCATAATAACTTGACCAAAATTATAAACCCCCACTTTGAATTAAGAAAA
AAAAGTTTAATTTTAATTTTTAAAAATAAAAGGGCTGGGAAAAATTTTAT
GGAAATAACCTAATTTATTTTTCAAAAGGTTTTTTTTAGGAAAAATTCTA
AAACTTTAAGAAAAAAAAAATGAAAAAAAGGATTGTTTCTAACAAGGGGA
AAAAATATTTCTAAAAAAAAAAAAGGTTACCCCTTTCCTGGCTGGCGATG
AAAAAATATAA
| NNAAAAAGACGGTAGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAATTTTCATGGGGGGGGAAATGAATCTGTA
AATATTTTTTTGGAAAAAGGGACATTTTTACTATGTCAATCCGGCTGATC
CATGAGCAGGGAATATGTCAGCATCTTCTAAAATCTTTTAAAATTTCTTT
GTGAAAACTTAAAGTTCTTGGGCTACAGTTCTTTCACTTGCTTTGTTAGA
GCCACACCATGATAGTTTATTTTATGGGGATACGGGCCCTAAATCTCAAA
ACAGCCATGATTCAAAACACAAATATGGAGGTTAAAATGAAGGAAGACCA
AAGTGGGGATGCTTCAATCCCACATAGAAAAGGAAACAAAGTAATATCTT
TAGGAAGACAAAGGGAGGGACCAGTATGGTAGAGAGGAGGGAGAGATTTT
TTTTTTCCCCCCCCCCCCAATCATTGGAATTGCCAGAAAAAAAGAACGGA
GATTTAGGTAAGTTAATAGAAAGATGTAGCAATGGGAGCTGACCTTAAAG
AGGAGACACAAAAATCCCTTTAAAAAATACAGAAAAAAACAACCAAACAC
ATGGAATTGAACAAAACCATCCAAGGTCTAAAAATTGAAGTAGAAACAAT
GAAGAAACCCCAAAGGGAGAAAACTCTGGAGATAGAAACCCTAGGGAAAA
AAATCAGGAACCATAGATGTGAGCATAAGCAACAGAATACAAGAGATGGA
AGAGAGAATATTAGGTACAGAAGATTCCTTAGAGAACATTTACCCAACAA
GAAAAGAAAATGCAAAATGTAAAAATATCCTAACCCAAAATATCCAGGAA
ATCCAGAACAAAATGAGGAGAGCAAACCTACGGAAAAAAGGGGTAGATGA
AAATGAAGATTTTCAACTTAAAGGCCCAGAAAAAATCCTTCACAAATTAT
AAAAAAAAACTTCTCATACCTAAAGAAAGAAATGGCCTTAAACATTCCAA
AAAGCCTAAAAAACTCCCAATAGACGGGATTCTAAAAAAAAAATCCCCTC
CGGACCCCTATTTATTTTAAAAACACCGGGCCTTTTAATCCGGACAAAAA
TTTTAAAGCCGCTTACGGGAAAAAAGGCTCGGTAAATCAATAATAGGGCG
AAATTTTTTAAAAATTTCCCCGAAATTTTTTTCCCTTGAAAAATTGATAA
ACCCAAGAAACCCTGGCCGCAGGTGTTTAATTACACCCTCTAAAAAAT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 7 13 13 11 12 14 13 8 8 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 17 22 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 37 37 37 32 28 28 32 29 24 25
28 28 28 33 33 36 41 41 37 33 33 33 25 25 10 10 9 9 9 9 11 18 15 24 32 32 37 37 32 36 38 50 53 53 57 57 57 53 50 50 47 47 50 57 57 53 53 44 44 39
37 33 25 19 10 9 10 10 13 10 8 8 8 8 8 19 30 41 33 33 33 33 33 36 36 36 36 38 38 38 43 53 53 53 53 53 53 53 53 47 47 47 51 51 68 68 68 68 68 68
53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 42 38 36 36 36 36 31 33 39 37 37 37 25 17 9 9 9 9 9 11 20 15 15 24 26 20 10 10 10 15 13 20 20 30 41 57 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 54 68 68 59 59 59 59 59 54 54 54 54 54 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 52 52 52 57
57 57 57 59 59 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 68 68 68 68 68 57 59 59 68 59 59 59 57 54 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 57 48 44 36 21 23 15 17 12 18
12 13 18 32 41 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 44 44 39 39 40 44 43 50 50 59 59 29 27 18 17 18 18 29 34
37 34 31 28 24 28 28 23 20 11 9 9 9 13 17 25 34 41 47 48 59 59 59 43 43 34 34 32 32 32 31 36 31 28 31 34 28 22 11 11 9 8 8 8 8 18 16 17 19 30
41 59 50 50 53 53 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 57 54 54 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57
59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 54 57 44 44 37 46 43 57
57 59 54 59 57 59 43 43 43 47 57 59 57 54 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 44 44 43 39 39 39 39 37 43
59 59 59 59 59 59 47 47 41 41 41 41 37 37 41 43 47 47 59 59 59 46 46 41 43 41 41 31 32 35 31 31 43 37 30 30 39 39 47 50 50 59 59 41 47 43 43 41 41 44
59 59 47 47 47 47 48 48 48 48 57 50 48 50 50 50 50 57 59 59 57 48 48 48 48 48 48 57 57 59 57 57 57 57 54 54 57 57 57 54 54 59 57 57 57 48 48 48 57 48
57 47 47 43 48 48 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 42 41 41 39 39 39 34 34 35 37 33 36 34 41 41 59 47 59 48 48
48 48 48 33 33 33 33 33 32 39 41 41 44 39 39 37 31 32 37 37 30 28 11 9 9 9 9 9 12 41 43 41 37 37 41 37 37 37 37 37 32 34 32 35 31 26 34 39 39 41
31 31 37 37 28 21 13 13 12 24 22 27 12 10 10 10 10 11 14 28 25 22 22 19 16 12 18 9 16 11 14 11 11 10 9 9 9 15 17 15 18 14 13 13 21 13 14 10 10 11
22 26 19 15 12 18 15 14 9 9 9 13 10 14 16 13 10 11 10 10 9 10 10 16 14 18 15 15 18 12 9 9 10 10 10 14 18 21 11 11 10 12 11 11 10 10 12 13 8 8
10 9 8 8 10 8 8 7 9 9 9 9 11 11 10 10 13 11 10 10 9 12 13 10 9 9 11 11 17 20 18 22 14 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 9 9 12 22
18 15 12 10 11 8 9 14 15 16 18 28 27 19 15 15 16 17 22 12 12 14 13 29 19 10 10 10 8 15 15 9 9 8 8 10 10 10 11 11 12 12 14 14 13 15 11 11 10 10
10 10 15 15 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 7 6 6 6 13 13 16 11 11 10 11 9 10 10 10 10 11 18 16 13 14 12 12 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 10
8 7 7 7 7 7 7 10 8 8 8 8 8 19 15 28 16 12 8 8 8 8 8 8 8 11 11 13 8 10 8 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 7 9 9 9 8
15 14 14 17 16 11 11 12 8 10 6 7 6 6 11 11 11 13 15 17 14 9 10 9 7 7 8 8 9 11 10 13 16 10 11 11 16 15 11 11 10 9 9 9 10 10 10 10 9 7
6 8 8 8 10 8 8 8 7 7 7 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 9 8 8 9 8 8 8 8 8 11 14 16 9 9 10 11 12 19 16 25 12 22 10 15 10 16 14 20 19 19 34
29 31 21 30 26 39 37 43 37 37 24 24 15 16 16 32 19 33 30 42 30 30 33 59 31 20 17 11 11 11 34 34 41 20 20 20 20 15 24 15 17 17 17 18 18 12 15 11 12 12
22 22 28 32 39 44 59 41 41 15 15 12 15 15 15 15 15 14 14 14 18 18 29 27 23 32 32 32 25 25 20 20 16 16 11 15 15 24 16 15 18 18 18 13 13 13 16 15 27 24
24 13 12 12 12 12 13 12 12 13 13 12 12 21 15 21 12 15 15 27 19 19 13 13 17 18 16 15 16 16 14 14 14 24 24 38 36 17 16 16 15 15 23 38 23 26 20 38 21 21
11 12 12 18 15 20 20 35 35 35 35 20 20 20 35 24 24 15 15 11 15 15 22 22 35 35 35 35 35 35 35 43 35 35 26 18 18 15 18 13 24 24 18 18 18 21 21 13 12 12
12 12 13 22 18 33 24 21 13 13 13 15 24 27 27 32 14 14 17 36 38 28 28 19 19 13 18 13 16 16 24 24 13 13 13 32 32 43 29 29 29 41 27 27 29 28 28 36 36 35
38 37 39 42 32 27 14 14 18 24 32 32 39 50 44 44 43 43 43 42 42 28 24 20 27 27 20 28 28 42 42 31 27 27 20 20 20 20 20 26 36 28 28 24 20 20 20 32 32 44
27 27 14 14 14 14 14 15 14 21 21 32 28 24 21 24 17 17 24 34 32 33 28 24 23 20 23 23 35 28 36 43 39 39 37 37 39 59 33 37 23 32 18 16 9 12 9 9 9 9
11 12 12 16 23 14 14 14 28 30 40 39 39 32 30 28 36 25 25 25 36 40 37 28 23 23 21 15 28 26 17 17 17 25 25 35 39 32 37 25 25 17 25 17 17 11 10 10 14 23
29 26 31 17 15 15 14 13 13 23 41 19 19 18 15 10 10 13 22 30 38 21 21 15 21 11 11 9 9 9 11 12 13 18 15 17 17 26 27 34 28 23 12 11 11 9 9 9 17 12
12 22 23 43 59 59 48 47 47 39 43 43 48 47 47 34 34 25 25 18 27 18 23 18 21 15 25 18 20 16 20 12 12 12 18 18 18 21 19 17 22 22 36 36 39 37 30 30 14 14
18 24 24 20 20 20 20 20 20 32 34 44 32 35 32 37 36 41 43 59 59 57 59 59 48 39 39 28 26 17 14 14 21 34 40 59 59 39 39 36 36 35 36 39 39 32 32 23 28 15
15 15 20 32 32 34 28 37 36 25 28 36 43 47 47 36 36 28 28 28 37 37 35 28 28 23 23 23 28 32 41 37 30 30 30 37 31 28 34 25 25 12 12 12 25 23 26 22 15 20
15 27 12 13 13 21 21 30 37 37 39 39 32 34 34 18 18 17 18 18 32 32 28 23 23 23 23 18 21 12 12 12 12 12 19 19 33 31 32 28 28 30 25 30 31 31 26 34 43 59
40 39 32 32 30 37 31 32 28 32 30 24 12 12 11 12 11 19 12 11 11 20 22 22 25 18 18 14 14 14 23 23 30 25 25 19 19 23 29 22 28 23 23 19 18 15 21 16 17 28
23 24 20 22 23 28 20 25 30 32 34 37 28 24 30 32 25 21 10 10 11 10 10 10 19 23 28 18 15 15 10 10 10 13 13 15 11 11 11 19 13 22 14 11 12 11 11 12 12 9
9 9 14 17 14 14 14 13 12 9 9 9 12 17 14 16 12 12 11 12 19 27 28 24 24 28 28 30 22 15 19 13 16 18 15 14 17 19 14 10 10 10 16 12 12 11 11 8 8 9
8 10 10 12 11 11 12 12 15 24 24 24 23 23 23 29 25 12 11 11 14 9 11 13 11 11 14 20 22 26 23 19 19 17 23 17 14 14 14 14 28 20 12 15 10 10 10 10 10 14
16 11 9 9 8 8 8 8 8 12 12 21 14 12 10 9 10 9 10 10 13 18 19 20 20 18 13 11 10 8 8 8 8 8 10 10 13 14 10 13 12 13 11 8 8 8 8 9 9 13
15 18 10 10 10 10 12 9 8 8 8 10 9 11 11 11 9 12 10 12 11 8 8 8 8 9 12 10 10 11 17 10 10 11 11 8 10 10 10 12 15 10 8 7 7 8 8 8 11 16
11 12 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 11 13 8 8 6 6 6 9 10 12 11 9 8 8 8 8 8 11 16 17 9 9 8 9 8 8 8 8 6 10 6 6 6
10 10 9 10 8 8 8 8 9 10 6 6 6 6 10 15 13 10 10 10 8 8 6 6 6 6 10 10 10 10 11 11 11 15 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 11 15 12 12 10
8 8 8 10 10 12 10 10 10 9 9 11 10 9 9 9 9 15 11 11 10 10 12 13 13 6 7 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 7 7 7 6 8 8 8
8 8 10 9 9 13 15 12 9 9 11 8 12 10 8 8 10 10 17 15 10 10 10 11 15 14 18 19 23 18 17 15 10 6 6 6 6 7 9 11 10 10 10 10 10 10 9 10 9 11
10 8 8 8 8 6 6 6 15 8 11 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 13 6 6 6 6 10 6 6 8 10 6 6 6 6 6 7 8 8 8 10 7 7 |