BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-175B18.T7 (MSMg01no175_b18.b1) | MSMg01-175B18.TJ (MSMg01no175_b18.g1) |
ACC | AG370199 | AG370200 |
length | 693 | 709 |
length of high quality (start - end) | 629 (45 - 673) | 312 (398 - 709) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no175_b18.b1 PHD_FILE: MSMg01no175_b18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:46:07 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no175_b18.g1 PHD_FILE: MSMg01no175_b18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:46:07 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCTTGTGCACAATAGGTATTTCCTGTGTGGTGTCCAAGATGCATAGGT
TATTATATTTGCGAAGGTGAATAAGAGTAGATCACTGTGTTGATTAGTTG
TGTACCACTTACATTATACATTACAGATTATAACTGCCCTACACAGGCCA
ATACCCTTATTATCTTCATGATACTATAGAGTTATTAGACACCTCTCTTC
TGAGGTCACAGTAACCTGAGTGACTTGTCATATGGCTCAACCTTGTGTGA
GCTCATTCTTTTGACAGCTTTAAGTTCTTTCTCAGAAAACAGTCTTCACT
TCTGTATTATAGAGGTTAAACACTGCATTATTACCATGATTGCCTAGGTG
CTTGGTACAGCAAGCTCATGGTTGGATGGCACATCCAGTTACCCAGGGCA
CTGTACTTGGGAAGGCCAGGGCATAGTTGTTTGAGAGGTTATTATCTTGA
AATATTTAATCATTTTAAACAATTTTTTTCATTCTACACTGGCCATCAAA
AACTCGGTGGCTAATATTTACACTTGAAGTAATTTCAGGGACTGAATGTA
TGACCTGGCTCCTTAGCACAAAATCCCTGATACTTGAATATGAGACTCAA
TAATAAGACCCAAAAGGAAGGCTCAGAGCCAGGCTTGTTCACA
| NNCCCGCCCCNNNCCCTCTATGATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGCCTATT
GTTTAACTATCCAAATTGACAAATCTAAAGCTGGTGTGTTGACTTTCCAA
TTGGCTTGGGACTTCCCAACTAATCTGGGATTTTGGAGTATTCAGAATAT
ATGAAGAATGAATAAAAAAATAAAACAAAACAGGAAGTAAAATCATCACA
GATTCTTGACTATGTAAGTAAAGAATTAATTAAATCAGTTCAAAATGGAA
AAGGGATAAATGAGTAAAGATCTGCAGACTCAAGAGGCTCTCTGAGAGGA
CAGCCTCTGGAACTCGCTGATTATTCTTTCTAGCCGCCCCCCGCCCTTTC
TTTTTTCTTTTTCTCTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCATTTTCT
CTTTCTCTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTCTTCTTCTTTTTTTCTTTTT
CTTTTCCTTTTTCTTTTTCTTTCATTAGATATTTACTTTATTTACATTTC
AAGTATTATCCCCCTTCCTAGTTTCCCCTCCAAAAATCCCCTATCCTTCC
CTCCTTCCCCTGCTCCCCAACCCCCACACTCCTGCTTCCCATCCCAGGCA
TTCCCCTATATTGGGGCAAAGAGCTTTCACAGGACCAAGGGCCTTTTCTC
CCATTGATG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 9 8 8 8 12 21 32 32 33 32 27 22 19 30 16 23 22 24 24 28 37 46 19 19 12 9 9 9 11 11 9 12 12 13 19 29 36 33 33 33 33 33 36 43 43 47 33 36
36 33 44 26 30 23 24 18 11 10 10 10 13 17 21 22 22 28 37 39 48 48 53 59 57 57 48 59 59 59 59 57 57 57 47 48 48 48 48 57 57 54 54 54 54 54 54 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 59 57 57 57 57 47 50 51 50 50 50 68 68 68 68 57 57 42 48 42 47 48 57 48 57 57 59 57 68 68 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 50 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57
57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62
62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 54 43 44
43 43 43 39 39 43 43 62 44 43 27 26 23 41 27 31 31 43 39 39 39 39 39 44 44 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 62 62 33 33 9 9 9 17 21 43 43 62 62 62 62 38 33 13 11 11 34 34 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 39 39
43 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 52 57 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 59 59 57 57 54 57 54 54 52 59 57 57 57 59 57 57 57 59 59
57 57 57 57 57 44 44 32 28 28 43 43 52 57 57 68 68 57 57 47 47 47 57 59 68 68 68 57 57 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 47 43 43 57
59 59 59 57 47 46 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 43 32 32 32 42 47 46 43 43 57 59 48 48 47 42 42 24 24 20 20 20 28 41 43 57 57 57 57 48 48 48
43 44 48 41 41 41 41 59 59 41 35 37 43 59 32 32 15 26 21 28 28 37 37 48 48 48 57 50 50 50 50 50 57 57 57 59 59 59 59 59 47 47 36 30 30 26 22 15 14 14
21 26 36 37 39 36 36 32 29 27 32 31 25 34 43 41 41 41 41 28 25 11 10 15 10 10 15 19 16 16 17 20 26 23 22 27 30 26 28 13 13 13 13 | Open.Hide. 0 0 3 7 7 14 14 7 7 3 0 0 0 3 6 6 6 7 7 7 8 9 8 8 8 10 8 14 23 23 25 22 25 31 37 37 37 37 37 39 41 41 47 47 53 38 42 42 42 33
37 30 28 22 24 20 20 20 32 31 43 59 59 57 42 40 41 41 41 42 48 59 68 57 54 54 54 40 40 40 40 40 40 57 57 57 48 48 48 46 50 50 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 51 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 59 59 59 52 52 38 38 16 14 14 18 18 43 44 57 57 68 68 68 50 50 50 50 50
50 57 57 57 57 52 59 52 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 34 34 11 12 11 32 32 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 44 43 35 35
35 50 50 57 68 68 57 57 57 57 68 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 54 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 68 57 59 59 47 47 28 37 36 30 30 32 32 39 47 59 59 59 57 57 68 57 57 48 59 59 50 50 50
50 50 50 57 59 57 57 26 23 9 9 9 23 26 41 30 25 12 10 10 8 6 6 6 6 6 6 8 11 12 21 15 9 10 9 9 9 11 11 7 7 6 6 6 7 9 10 15 21 31
41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 37 34 28 18 18 12 11 12 12 10 10 10 10 10 15 19 18 28
34 47 59 59 59 59 48 57 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 59 59 43 43 43 43 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 43 50 43 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
43 43 32 33 33 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 59 59 68 59 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 54 59 59 59 57 68 57 57 57 57 57 57 59 57 54 57 57 57 57 59 59 59 57 59 59 59 53 50 47 47 53 53 59 59 59 59 48 48 48
59 59 59 59 59 59 47 47 47 47 43 41 37 37 41 44 44 41 37 37 41 41 59 59 59 41 41 40 40 40 41 37 37 32 29 29 37 39 37 39 39 41 41 43 59 47 47 46 46 41
43 41 41 41 41 32 32 20 18 |