BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-176J01.T7 (MSMg01no176_j01.b1) | MSMg01-176J01.TJ (MSMg01no176_j01.g1) |
ACC | AG371226 | AG371227 |
length | 1,220 | 1,237 |
length of high quality (start - end) | 270 (137 - 406) | 383 (71 - 453) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_j01.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_j01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_j01.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_j01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CGGTGCTTGNNNNAACACGGGGCGCTAAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCG
CGGAATTCTCATCATATACTGGGGCCCTATAAAGCCCCCCNNNAANGNAN
AAAGAGGGNNNNGNCTCCTTTAAAACCCCCCTAGGNTTGAAACTACTTTT
GAGGCAGGGTAGGTCTCACACAAGGGCCTTTAAACTCTATCTAGCCGAAG
AGAACCTTATATCCTGATTTTTAAAATTTTTTTTGCCATGACCACCTAAA
TGCCACACCTGTCATTTGAAAATGTTAAGAGTAGCTGGGCTTGATGGCTC
ATTCACTTAATCCCAGAACTCAGAAGGCAGAGATGGTGTGGATCTCTGTG
AGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTATATAGTGAGTTCCAGGACAGAAGGTGTG
GCCCTGTTTTTTTATGNGNGGCCTTGNAGGNATGGGCTGTAAGACCTCAT
CCTACCAGCCTAGAATTCAGCCTTCCACTAGCAGCCTTCAGATGAAGATG
TAGAACTCTCAGCTCTGCCTGCATCATGCCTGCCTAGATGCTGCCCTGCT
CCCACCTTGAGGATAATGGACTGAACCTCTAAACCTGTGAGTCAGCCCAA
CTAAATGTCCTTTATAAGACTTGTCTTGGTCATGGTGTCTGTTCACAGCA
GTAAAACCCTAAGTAAGCCATTCACATAGCCAAGGTTGACTTTGAACTTA
AAATCTAGCTGCCTTGGATGTAGCATCCTGTCCAAATTGAGATGGATCAG
AAGGTAAAGGCCCTGCTGCTAAGCCTGACTTCCTGAATTTGATGGTCAGA
GCCCACGCAGTGGGAGGAGAGAACTCATTCCCATAACTGTCCCGTGCCCC
CCATGTGTGTGCCATGGCACGAGTGTCCCACCCCACGAAAAAGCTTCTGA
AAACCAAAGCGGAACAACCTTACAGACCCCTTATCCGGGCTGGAGAGACG
GCCCAGCAGTCCAGAGCCCTGGCCTGCTCCTTCCGGGGGGCTCTGGCCTC
ATTGGCCCGCTACCCCAAGGGCAGTTCCAACCTCGGATGGTAAATCCCCT
TCCCCGAACTCCTCGGACGGCTTTTTCCCCGGCCCCCCTGGGAACCCTCA
CATCACTACTCACCTTCCCCCTCTCAACGAACCTTCTGTGCCGGGCGGGC
GTCCCACCTCTTCGGGCCGTCCACGCTAACAAACCGGCTCCTCCTCCCCG
GCTCTGCACGCCCCCCCATG
| NNNAACGAGGCGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAAGATCAGCCTGCCTCTGACTCCAGAGTT
CTGTACTTTGAGGCGTGTGCATCACATCAGCCAGCTCCCCCTCCCCCACA
GTCTCACGTATTTCAGACTAGTCTCAAATACACTGTGTCGCTGAGGGTTG
CCTTGGCTCCTGATCCTCCTGCCTCAACCTCTCAAGTTTGGGGTACAGGT
ATCCATTACCTTGCATGGCTCCGGAATGAGGTGCTGGGGTTGACCCAAGA
TCAGAAGGAGGGGCTGGTTCTGTCTTGCCAGGTGTGCTGAATAGTTTTAT
GTCAACTCGACAGAGCTAGATTCATCAAAGGGGAGTAAGCCTCAATTGAG
AATAACCCCTACATTAAGATCCAGCTGTAGGGCACTTGCTTAATTAGTGA
TTTTTTTTGCCCCCCCCCGCCCACTGTGGGTACTGCCATCAAAGAAGTGG
TGGTCCTGGGTTGTATAAGAAAACAGGCTAAGCAAGCCATGAGGAGCAAG
CAACCCCACCATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCCTCCAGGATCCTGCTCT
GTTTGAGTTCCTGTCCTGATTTCCTTCAGTGATGAACTGTGGTATGAAAA
AAAAAAATGTAAGCCAAATAAACCCTTTCCTCCCCAAGTTGCTTTGGCCA
TGGTGTTTCATCACAGTAAAAGAAACTGTAACTAAGACACAAGGCTTGTC
CCAGTCCCCACCCACAGGGGCCAGAGCAATTAGGAATTTGTGACACCCCT
GTGTGCTCCCTCTTTGCTGCTCACTAAGTCCCCTCTCAGCTTCAGCCTCC
CTGCCCACCACAACCACAGAAGAGAACTGTCCTTGGGAGCATCCCCTAAG
CCTACAAGCTTAAAGAATCACTCGGACTCTTTAAGTCCAGTGCCACGTGG
CAAGTGCCCTAACTCATCTCCCTTCTGCCTTTCTCCGGCTCCGGGGTAAT
AGGGCTTGCTTCTTGGAAACCCTCTGAAACTTTTTTTGTGTCCGGCAGAA
ATGGATCAACACCCCCCCCTTAGCTTGGTATTCTGCCCTCCCAAAAAAAC
CCCTCTCTATCGTTAAAACATTGTCCTATCATTTTTCCTTACTCCATAAC
TTATCTTGTTCTATCCATGTTATCCCCTCTCTTGAAACTTCATGGCTTAT
CCTCCCTCTTAGATCATCTACATATTCTCCCTCTTTC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 8 8 9 3 0 0 0 0 3 9 9 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 17 17 8 8 8 6 6 10 10 24 22 26 28 28 29 29 29 32 32 28 24
28 37 32 39 35 35 38 33 33 33 33 33 37 37 37 37 37 29 19 9 9 9 9 9 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 12 14 3 0 0 0 3 3 0 3 0 3 0
3 23 23 24 24 7 7 3 0 0 0 0 3 0 3 6 6 7 7 13 8 8 9 21 15 10 8 8 8 9 10 10 17 21 3 0 3 27 27 59 41 33 33 33 33 33 36 53 57 57
57 57 57 59 59 59 53 42 40 40 42 42 30 43 30 37 37 43 43 43 43 43 43 57 57 47 59 43 41 39 44 48 48 48 42 42 39 39 39 57 37 37 37 48 48 54 57 57 57 57
68 68 68 57 57 37 37 37 48 48 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 59 59 52 52 52 57 57 68 68 68 68 57 57 68 68 68
68 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52
52 54 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 48 32 24 12 12 12 18 32 40 57 57 57 57 59 59 59 57 57
68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 57 54 59 54 47 47 47 47 54 59 59 68 68 59 59 57 54 50 53 53 48 57 48 59 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 50 50 59 59 59
59 59 27 25 19 18 17 11 12 9 8 8 7 7 7 3 0 3 0 3 27 27 47 25 25 3 0 3 27 3 0 3 27 27 59 59 59 47 41 43 47 59 48 59 59 59 59 59 47 47
47 37 31 24 25 12 12 12 18 27 31 35 30 35 35 37 32 28 15 12 12 12 12 12 28 32 40 57 57 57 57 57 57 57 59 54 59 59 57 57 57 57 57 68 68 57 57 42 39 30
30 39 39 43 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 57 57 57 54 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57
57 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 68 59 59 57 59 57 59 59 59 57 57 54 57 57 57 57 57 48 57 57 57 59 68 59 59
57 57 57 59 59 59 57 44 43 43 43 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 44 44 39 39 44 43 46 46 57 57 57 54 48 48 48 47 48 48 54 59 57 57 54 54 54 48 48
43 43 43 42 42 48 47 47 47 57 57 37 43 28 28 36 35 57 48 48 39 59 24 24 14 18 18 31 21 16 12 12 12 21 21 28 33 21 23 21 18 18 41 41 57 50 48 48 47 39
39 47 37 37 30 34 23 23 23 34 34 37 37 37 37 32 32 32 39 41 33 30 30 21 28 30 39 34 26 20 20 18 19 17 19 10 10 10 19 19 33 32 30 24 24 22 23 18 18 17
14 19 19 24 28 59 59 37 43 39 28 24 24 25 30 33 25 23 23 19 16 22 18 15 11 12 12 25 21 9 9 9 14 15 10 9 9 9 16 9 11 11 11 11 11 12 12 19 23 22
22 14 16 9 10 10 16 13 12 9 9 9 10 15 18 24 23 30 30 15 14 9 9 8 11 12 18 18 13 9 8 8 8 9 17 17 20 24 12 12 10 10 9 8 8 8 10 13 10 10
11 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 15 11 13 9 9 8 8 8 8 9 17 13 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 16 16 17 14 13 11 8 8 10 10 10 8 8
8 8 9 9 12 10 10 10 14 15 14 13 12 9 9 9 9 10 11 11 12 8 8 8 8 13 10 11 12 12 10 13 12 13 15 12 9 9 9 9 9 10 10 8 8 8 10 10 10 11
9 8 7 8 8 8 8 9 13 12 13 8 8 8 8 8 10 10 9 10 10 13 22 10 8 6 6 6 8 10 12 12 12 14 11 15 15 18 15 15 8 6 6 6 6 7 7 12 10 6
6 8 8 15 11 7 6 6 6 6 6 9 10 15 18 11 11 11 10 9 14 12 10 10 10 11 11 8 8 12 10 10 9 9 9 9 10 10 12 12 10 10 10 10 11 14 22 15 9 9
10 12 10 12 6 6 8 8 10 8 10 6 6 8 6 8 8 10 10 8 8 10 12 10 8 8 8 8 13 10 9 9 9 9 10 16 9 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6
8 8 8 10 10 10 10 10 12 10 10 8 8 8 10 8 8 8 10 9 13 8 8 8 10 8 9 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 8 8 8 8 8
8 10 10 13 10 6 6 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 6 7 10 10 10 6 6 8 6 9 10 11 13 11 10 8 8 8 7 6 8 8 8 9 10 11 8 8 8 8 9 12
9 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 10 10 28 13 13 10 10 9 9 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 7 9 6 6 8 8 6 15 6 6 6 7 11 7 7 6 7 8 8 8 10 11 21 19 22 11 11 11 23 23 31 28 28 35 53 36 36 36 37 37 37 50
53 50 50 53 57 53 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 48 48 50 50 47 47 47 50 50 68 68 68 50 50 54 54 48 50 43 50 50 50 41 42 46 46 46 37 37 37 43 48 50 50
50 43 43 47 47 43 43 50 50 50 50 50 57 50 53 53 53 44 44 39 37 37 34 27 18 17 9 9 9 18 27 36 42 37 39 41 44 47 36 38 38 42 50 50 57 59 57 57 50 50
50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 57 57 57 57 48 43 50 43 43 43 43 48 50 54 54 54 54 57 57 47 47 41 48 47 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59
68 68 59 59 57 57 68 68 57 57 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 54 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 68
57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 52 52 52 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 57 68 68
57 57 59 59 59 54 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 54 46 47 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 48 59 59 48 35 26 12 8
8 8 8 8 10 19 36 44 59 59 59 68 68 68 59 57 54 54 54 54 54 57 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 50 57 57 57 53 59 59 59 59 59 41 32 16 23
12 10 10 10 11 14 16 11 10 10 10 11 13 16 21 23 14 13 12 12 27 33 59 47 47 46 32 30 15 12 10 10 10 10 10 17 25 15 13 13 13 9 8 8 8 6 8 9 12 12
12 12 30 30 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 43 43 43 46 46 39 39 29 37 28 40 40 50 57 57 59 47 47
37 37 32 44 37 39 39 43 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 46 46 43 57 57 57 59 50 54 57 57 50 59 57 57 57 59 59 59 59 57 59 59 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 54 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 44 44 35 35 35 44 44 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 46 48 48 48 48 57
57 57 57 57 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 43 43 43 59 43 48 39 39 30 37 37 37 37 37 37 37 41 37 35 41 41 41 41 46 46 30 30 17 17 21 25 20 30 32 37 37
39 39 39 41 39 39 36 37 38 37 37 30 30 30 39 39 41 37 37 41 41 32 32 20 23 23 28 24 23 17 13 13 20 25 18 24 28 28 24 30 30 37 37 39 34 34 25 23 24 20
18 13 11 11 14 14 19 23 22 22 19 26 19 13 11 13 12 8 8 9 9 10 15 15 14 13 12 12 13 25 25 13 11 11 10 10 10 16 23 16 32 28 26 9 8 8 8 8 14 17
13 13 14 12 12 15 16 28 24 24 28 28 22 18 27 26 22 22 24 22 18 17 22 19 19 15 14 22 23 34 26 25 33 29 22 19 24 26 32 18 18 21 12 12 23 11 12 17 11 11
10 10 10 10 18 11 15 18 19 11 11 10 10 10 16 13 15 14 22 19 15 19 11 11 10 12 10 8 8 8 8 8 11 13 10 10 14 10 10 10 8 8 8 8 8 8 12 10 11 19
12 13 18 13 12 10 14 10 12 13 17 13 13 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 12 24 28 28 12 12 9 11 11 15 16 18 11 10 10 10 10 10 10 10 12 9 11
12 13 16 9 9 9 15 12 8 8 8 9 10 10 12 13 13 12 12 13 11 9 10 10 9 10 9 12 9 15 12 10 10 9 9 6 8 8 8 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 10
11 12 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 12 11 11 10 12 10 10 11 11 11 10 16 21 19 22 17 13 10 9 9 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 6 6 8
8 13 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 10 8 8 10 8 8 8 8 12 10 9 12 12 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 10 7 7 8 8 11 11 12 14 12 20 16 13
10 10 15 15 14 10 10 6 6 8 10 13 13 16 12 9 12 9 9 9 12 12 10 8 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8
10 8 8 6 6 8 8 6 6 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 18 11 12 10 11 6 6 6 6 8 8 9 10 9 9 9 10 10 11 13 13 10 8 8 8 8 8 8 7
7 7 8 8 7 12 7 6 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 8 9 8 13 7 6 8 8 8 10 10 8 12 12 12 |