BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-182B10.T7 (MSMg01no182_b10.b1) | MSMg01-182B10.TJ (MSMg01no182_b10.g1) |
ACC | AG375068 | AG375069 |
length | 727 | 729 |
length of high quality (start - end) | 486 (73 - 558) | 315 (46 - 360) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no182_b10.b1 PHD_FILE: MSMg01no182_b10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:55:44 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no182_b10.g1 PHD_FILE: MSMg01no182_b10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:55:44 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | ATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTAGCATATACATGAATGTTGTCTCTA
CCATGAGATCCAGCTTTATACACTTCTCACATTCATGCTATTTGTATGTG
TCTACTCCAGAATGCAAATTCTAAAGCTGAATGCCACATAATTAATAAAG
CACAAGAAAGGGTTTCCTGAAGGAAAAGCTTTCAGGTGGTATTAAATTTT
ATTTACTTTATAAAGGTTTGACAAATTCCTTACATTTCTTGGGGTTCTCT
AGTGTGAACATTCTAACTTTTGATCAGACATGAATCCAAAACAACATGAA
ACAAGTAAATACTTTTTTTTTTCCAACATGAACTTTTTAATGAACACTTT
TGAATTAAAAACTACCCACTCAAGTACATGTTGAATGGGAAAGTGTGTGG
CAGACTATTTGTGGTCAGATATAACACATTTATACATCTATGAATCATAA
AAACAGAAATAAAATTGGCTCCAAGTGTACATAATGATGAAGTGCTATGT
GATGAGCCATAGAGTTTTCTTTTACAGGAATATGGGCAACGCGTTAAAGG
GATCCAAAGAATCTCTATAAAGTCCACCAAATTATGTTACAGCCTCATGA
ATTCCTCATACCAGGAATGCATCAATAATTTTTCGATAGCCCCATGGCAT
TACTGAATGCCCTTCCCTGCCTGCCTC
| CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTGAATGAGGTAAGGCTGTTGATCCCGGTGGGACGCAGGTCCGCTC
TGAAAAACAATGGCTTTAACTTTAAAGATAAGTGTCAAACCAAAAGTCTC
CTCCAATGACCATTTTACATTAAAAGTCGTCCACTCGAAGGCGCAAAAAG
TCTGCCAAGGTCCCTTCTTAATTTTTACTGAAAGATTATGGGCCCTTGAT
CTAACTTCAGTCCAGTGGTCTAAAGTCAAACTTGGGGGTGGGGGGTCATT
ACAGTCCTTCTAATATCACAGAAAACAGACACAAAACACACACACTGACA
AATACCTGATTTTATTCACACCCCCCACACACACACACTGACAAATGCCC
GTATTCTAAAGGACCCCCCCCAACCAACTCTTAATTGCTAAAAAAGTTGG
GGAAGTGCTTAAGTCTTCCATTCTAGGACGACTACCAACTTTTTATTTCC
CACCCCAGACTTACTCCTGGAGTCATTCCCCACCATTAAGTCTCCCCCTA
TAGTCACGCAGTTTCCTGTTGATCCTATCAAGTATTGCAGCATTATATTA
CAAGATTTTTTCCTTCACCTATTAATTTTCTCCTCCACTCTAAGTAATGC
CTTCTTCTTGTTATTTTTAAATTAACGACTCTCCCGAAATAATATACACA
TATTATTTATTTTTTCACATAAAAAAAAN
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 8 8 21 17 30 23 23 28 34 39 47 41 50 50 53 53 48 48 42 42 47 47 33 25 15 9 6 6 7 7 6 6 10 10 11 12 15 22 22 59 44 44 47 47 50 53
53 50 50 50 41 33 18 13 9 9 9 9 9 23 15 12 10 10 23 23 33 36 59 43 44 50 50 53 53 53 53 53 53 53 47 47 47 53 53 53 68 54 54 54 59 57 57 57 68 51
51 51 50 50 50 50 50 50 51 51 51 50 50 51 68 68 68 68 57 57 43 37 37 57 57 57 57 68 68 68 51 51 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 47
47 57 57 57 68 68 68 68 68 51 50 50 50 52 52 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 52 43 57 57 57 57 59 59 57 57 52 52 52 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 52 52 52 43 43 62 52 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 45 45 45 57 59 59 59 68 59
59 59 54 52 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 33 33 33 24 28 19 29 29 38 38 35 43 35 43 43 57 37 37 37 57 50 57 52 52 52 57 57 57 52 52
52 57 57 57 57 54 54 54 54 57 59 59 59 57 57 57 59 59 54 54 54 50 50 57 57 68 57 57 43 44 43 59 44 48 48 48 57 48 54 48 57 44 43 43 43 44 44 57 59 59
57 57 57 59 59 59 35 35 35 25 26 15 17 17 18 23 15 15 11 18 15 34 32 48 48 59 59 59 43 43 43 41 33 30 24 20 12 11 28 28 34 34 43 43 39 43 37 43 36 36
35 35 35 28 32 31 36 36 34 34 28 22 15 10 10 10 13 20 31 34 34 30 28 28 32 33 35 37 37 30 22 16 9 9 9 23 23 33 33 37 42 39 43 43 43 47 40 32 30 30
37 37 40 44 28 28 18 18 9 9 9 18 17 28 32 32 19 20 20 24 29 33 33 33 34 43 57 48 48 43 43 40 43 43 43 24 24 24 22 19 10 8 8 8 11 14 31 36 34 37
30 30 24 25 12 17 15 19 10 10 10 8 8 10 8 8 8 10 18 13 17 17 24 23 18 15 14 13 11 15 15 17 18 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 19 15 15 9
9 8 8 8 10 9 13 12 22 13 13 13 13 18 18 29 30 25 16 14 10 10 10 10 15 12 12 12 19 23 15 15 12 14 12 14 10 10 10 16 14 24 24 23 22 10 10 12 12 9
9 21 25 13 14 10 16 9 9 9 9 12 11 9 11 11 13 12 12 11 13 13 11 11 11 11 11 11 10 13 10 8 10 8 11 12 15 11 11 10 12 15 9 9 9 9 6 8 6 6
6 6 9 8 8 8 8 11 13 16 10 9 9 9 9 10 10 12 13 10 9 10 10 10 10 10 10 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 14 33 37 34 29 28 28 22 22 32 32 30 26 25 27 37 37 39 34 27 18 24 22 24 35 39 47 39 43 36 37 43 43 57 29 29 22 22 22 42 34 57 68 42
42 42 42 42 47 57 51 51 50 54 54 54 57 57 57 57 57 59 57 54 54 57 57 57 57 57 68 68 57 59 59 57 57 57 35 35 35 40 40 50 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 50 50 50 54 54 54 59 59 59 38 38 20 27 21 21 21 38 38 50 50 50 50 50 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57
59 57 57 68 57 57 57 57 57 47 47 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57
68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 50 50 57 57 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68
57 57 57 57 68 57 57 57 57 54 57 57 59 59 54 50 50 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 57 59 47 47 47 48 48 59 48 48 48 47 47 48 48 46 59 57 57
48 44 44 44 43 43 46 57 57 54 47 36 36 23 23 28 28 24 28 23 18 18 14 28 28 46 43 40 40 23 23 23 23 23 28 28 40 43 57 57 57 57 48 48 48 48 47 39 39 39
39 37 34 35 20 21 11 13 13 16 16 17 12 11 11 13 11 11 9 10 10 16 12 9 11 8 10 10 10 11 12 15 24 28 20 20 20 23 23 32 32 36 36 36 39 43 28 28 15 21
23 32 39 28 15 9 9 9 9 10 17 15 19 12 12 12 14 13 11 10 10 11 12 21 21 30 24 21 12 8 8 8 10 15 22 14 10 10 13 14 14 25 19 24 19 15 15 15 16 13
18 12 12 12 15 12 13 18 24 30 30 17 14 14 18 21 23 31 23 22 13 10 10 10 8 8 10 11 12 12 15 17 19 15 15 16 21 16 22 18 18 20 20 18 17 14 16 18 15 19
12 13 13 24 22 11 11 11 12 9 9 9 10 12 19 21 19 13 8 8 8 8 10 12 15 21 21 14 14 14 10 10 10 10 10 9 10 8 6 6 6 8 8 9 9 9 10 10 10 13
15 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 10 8 10 8 8 8 8 8 8 11 12 18 18 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 7
7 8 8 9 8 10 14 10 12 13 10 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 12 13 8 8 8 8 8 12 12 11 6 6 7 6 10 8 8 8 10 10 11 11 9 9
9 9 9 9 11 11 8 8 8 6 8 6 7 8 11 8 8 8 8 8 9 12 8 11 13 8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 11 10 12 11 8 8 8 8 8 13 10 10 10 10 10
10 10 10 15 15 15 15 8 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 6 7 8 8 9 9 9 10 3 0 |