BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-260E21.T7 (MSMg01no260_e21.b1) | MSMg01-260E21.TJ (MSMg01no260_e21.g1) |
ACC | AG403006 | AG403007 |
length | 846 | 749 |
length of high quality (start - end) | --- | 650 (81 - 730) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no260_e21.b1 PHD_FILE: MSMg01no260_e21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:56:22 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no260_e21.g1 PHD_FILE: MSMg01no260_e21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:56:22 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GCAGTGGAGAAGGGANGNAAAGGAAGGGAATCCAAAAGGGGGGGGAAGAG
GTTGGCTTCCCCCAGAAAACGATAAGGAGAAGAAATGGGTGCTGGTGACG
GAAACATGTTAGTACCTCTAGGTTAACGTGCGGGAGCAGAGATACTATGC
ATATTTTTCCTCCTCAGATCTATCAACTAATAAACAGATAAATCAAGTGT
ACAGACAAAGCTATCGTGCGTCGAGGTACCGCCGATAAGGAAGTGATTTA
TTATACTACTTCTTATATTAAAAGAACATTAATAACTATGTGTACAAAAT
ACCAAATAGAAGAAATAATATATCACCAACATGATATTTCTTTAAAACGT
TAGCAACCGAGAGATAGACGGCATAAGACAAGAAAGAGGAGGGGGTGAAT
ATAGACTTATTAGAAGTATCCCCCCGTCGGAGAGATACAACTTTTAATAA
ACGTATATTTATCTTCACTGGACTAGGTGTATGGAGTCGGGGGGCGATTT
GTTCAATTACTAACTGTTGAACGAGAATAAGGCTATAGAACCGGCAGCTG
GGTAAATCGATGAGCGAAGAAGGCGGAAACACAAGCTTTATATATGCAAC
TAGGATATAAACGGGTAGCGGGCGAAGCATAGTGAAGATTCAGGCACTGG
CTGTGGATACGGGAGAAGCCATGATAATGCACTCTGCACCTTTGCGCTGC
CGCGAGGTGATCAGGGTGTCGGCCAACGGATCTCAGGTTGTACTTATGCG
CTCTCCGTGAATTTACAGGACTGTACGCTGATGCGGAGTAAGGTGCTAAT
GTGGCTGGGGACTATGATGGGAAAGTCTAATGCGGTAGATCGGCGG
| TTTCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTGCTAACCTGCATCCACTG
ACCACAGAGCTCAGCGATAAATTCTGAGCCATGAAAGCAGTTACAGTAGC
GGTGGTGGCTGGCAGAGGAGACGGTAAAAACATCCATTTCTGTCCCAGCT
GCATGTTTGCAAAAAACCTTACAGATCCACCAGAAAACACAGACAAAACT
TCACAAGAAGACAGATAAAACTTTCCAATAACAGACAGAACTTTCGGGTT
AGCCAGAACCAGGTAGGCAGATGGTCTTGCTATTCGCCCTACACGGGAGG
TTATTGGGCCTTTGAACAAAACCCTTCCATGTCTAGGATTGCGATCCCAC
AGACAGTGACTCGCTAGGAGGCCTCTATAGATGGCTTCTACCTTTCTTAG
CACGGCAGTTCATCCCCATAGTCTATGAACTGAAGCCTCAGAGCCTTGGA
ACATCTCTAGGCACATGCCTCCCAAAGTTACCTCAGAGTTCTGAAGTGAA
AGTCTGGCTTTAGAATTTGGATGTGTGGTCTGAATCTCACTGGGAGCCTC
CAGAAAGTGTTAATCGCACTGGCCCAGAATAAGACCACTACTATACTCTT
AGGCCAGATTAGAAGAAGCTTTAATTAAATACTGGCCATGTGGATGGACT
CTGGCCAGGTCCATAGCCTGGTTCCCAGGAAAATGGTCATGAGTCGTGG
|
quality values | Open.Hide.10 10 10 9 10 8 10 8 12 8 8 8 8 8 3 0 3 0 3 10 9 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 15 11 14 16 14 15 15 22 17 18 10 10 10 10 11 10 10 10 10
10 11 11 12 12 12 11 11 12 15 15 10 9 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 8 10 10 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 11 8 8 6 6
8 8 8 8 10 10 8 8 8 9 8 10 10 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 13 10 11 8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 11 12 8 8 8 8 8 8 12 12 9 8
8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 11 11 8 8 10 10 10 10 9 9 9 9 9 10 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 9 11 11 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 7 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 9 8 8 10 10 8 8 10
6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 11 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 7 9 9 11 12 10 10 10 10
8 6 8 8 8 11 12 10 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 11 9 9 8 8 8 8
6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 10 10 10 8 8 6 6
8 6 10 10 11 10 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 6 10 10 10 15 13 10 8 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 11 11 12 12 13 12 12 9 9 9 9
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 12 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 13 13 8 8 8 10 10 8 8 8 6 6 8 8 11 9 8 8 8 8 8 8 9
11 11 11 11 11 10 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 10 8 10 9 6 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 11 10 9 9 9 9 9 9 9
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 11 11 11 12 15 13 13 13 12 9 9 9 9 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 11 12
12 10 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 6 7 8 8 13 16 10 9 8 8 6 6 8 8 10 12 12 12 10 10 10 10 10 10 12 10 9 8 8 10 8
8 8 8 8 10 13 12 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 11 9 9 9 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 12 12 12 11 11 12 15 10 8 7 6 8 8 11 11 11 6 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 13 8 8 6 6 8 8 8 6
6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 6 7 7 6 8 8 8 10 9 9 9 9 8 8 7 7 9 9 10 8 8 8 8 8 6 6 8 6 | Open.Hide. 7 7 7 6 6 7 13 15 13 8 8 8 8 19 25 47 36 38 39 42 42 47 48 53 53 53 50 50 50 50 50 47 41 27 21 13 9 9 9 9 9 9 10 9 10 10 13 13 20 12
15 26 32 41 41 47 47 53 44 50 50 47 30 24 13 10 8 8 8 9 7 7 9 10 12 14 22 24 31 28 48 50 53 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 47 47 57
47 47 47 51 51 51 68 68 68 47 51 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 51 51 57 57 54 47 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 62 62 62 68 68
68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 52 39 39 39 29 29 35 43 43 59 59 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 52 62 62
62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 68 68 62 68
68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 43 35 35 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57
57 57 57 57 57 68 68 57 59 52 52 52 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57
57 68 57 57 48 48 48 57 57 57 57 59 43 42 37 33 41 42 46 57 54 54 57 57 54 54 57 68 57 57 59 59 59 59 59 57 57 48 50 50 48 48 48 57 48 39 39 43 43 39
39 39 41 34 41 32 30 28 34 29 28 35 37 41 41 41 41 41 48 43 40 40 40 41 39 36 35 31 36 37 31 31 37 37 47 41 42 42 50 50 50 50 59 59 59 59 43 41 32 32
34 25 31 31 31 35 37 31 28 28 15 15 32 32 25 21 19 24 30 37 47 37 37 37 37 32 25 26 39 37 43 41 39 31 31 34 32 43 43 36 35 24 24 22 27 22 27 30 30 30
37 34 41 36 36 31 37 37 39 39 24 30 32 32 23 23 19 16 19 13 12 25 22 27 29 32 36 14 11 11 11 11 13 13 12 12 13 12 24 28 32 28 28 28 31 28 28 22 22 |