BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-308J20.T7 (MSMg01no308_j20.b1) | MSMg01-308J20.TJ (MSMg01no308_j20.g1) |
ACC | AG432645 | AG432646 |
length | 750 | 754 |
length of high quality (start - end) | 630 (72 - 701) | 291 (77 - 367) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no308_j20.b1 PHD_FILE: MSMg01no308_j20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:49:59 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no308_j20.g1 PHD_FILE: MSMg01no308_j20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:49:59 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (71,358,406 - 71,358,889) | (71,200,416 - 71,200,706) |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCCAGTCCTTGCACTAGCCTCCAAGGGCGACCTGATCTCAACTGCTCA
AGTCACAGGCTGCATGGCCACGCTCAGCTGATGGAGCGCAGAGGAGCAAA
CTCAGGGCTGTGCACTCACAAGCACTCTGCCAGCTATGCTACATCCCCAG
CCTCAGTCTCCCATGCTCTCACCTTGTTTATCATTCCTCAACTTCAAAAG
CATTTTAATTAAGCCCACAGCATGAATGTATGAAAATTTCAAAGAATTAA
AATATTACATTGACAATATTACATTGAAATATAATATTACAATGATAATA
TTGCATTGAAAAAAATAAGTTTGGGGGCTGGAAAGAAGGCTCAGCAGTTA
AGACCAATGGTTGCTCACTCCCGCAGAGGACCTAGGTTCAGTTCCCAGCA
CCTACCTGATGGCTTCCAGGCATACCTAACCCCAGCTCCAGCAGATCCAA
CACACTCCTGACCTCAGAAGGCCCAGACATACATGCAAGCAAAACATTCA
CACATGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGACTACTCTT
CTGAAGGTCCGGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTCGCAACCA
TCTGTAACAAGATCTGACTCCCTCTTCTGGACAGCTACAGTGTACTTACA
TATAATAAATAATTAAATCTTTAAAAAAAAAACATTCACTCATAACAGGA
| ACGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGTGACACTTGGGCTTCCTCCAG
TCGGGATCTTCTGGCAGCCAGCCGGGGGCTCTCCCTGGCCCAACTCCCTC
CCTCCCTACTCAGCTCCTTTGTTTCCCGCTCCACTCGGCGCACCTCGGCG
CTGTCAGAGTGAGAGAGCAGAGGGAAGGTACAGGAGGTCCTGCCTCCGCC
CCCAACCGCCCGCCCCGTCCCCCGCCCGCCCCGCCGCGCTCCTCTGCCCC
TCCCCCGCACCTTCTAGCTCCACAACCCTGTTTCTGGGGGCCGAGATCAC
CCGTCCCTCTACGCGCTGTTCGGTACCTACACCCCCCCCCCCCGCCTGCC
TGCCCGTGGTGAGAGCACCATCTCCACCCCCCAAAAAAAAAAAAAAACAC
TGGGTGCGCGTGTGGGGCCTTTCCTCCCCGGCCTAGCGAAGAGTGCATTT
AGTTTGTAAAGGATGGAGAGAGGTTTAAGGACATCTCCTCTGTCCACCCC
AGAGAAGAAAAGATACCCCCATCCTTGTTTTTGACAGCTGCCCACAACTT
CACTGTCCCTGCTCCAGCCGTCGGAGGTAGCAACTTCTGATTCAAGGCGC
GCGGCACTGAAGGACCAGACCCCCGACCAAAATCATCTTCTTCTACAATG
CGCATCCGCCCTTGATCTGTGTTTGCGGTAATATGTCCCCTTCTTCTCCT
GGAG
|
quality values | Open.Hide. 7 7 6 6 6 7 13 18 37 41 33 32 32 28 28 37 24 24 25 28 28 28 48 50 30 30 31 31 31 30 34 22 13 12 13 13 14 23 28 18 20 21 28 28 31 59 48 48 36 36
36 36 36 36 31 31 31 31 47 27 27 12 11 9 11 11 12 11 16 16 28 21 24 24 26 32 28 57 57 53 53 53 57 43 37 40 47 47 47 53 50 48 48 42 48 48 42 42 42 42
42 42 68 68 68 68 51 51 50 68 68 53 54 54 44 32 18 13 13 15 16 23 10 10 10 10 10 17 25 42 47 47 47 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 57 57 57 59 54 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 68 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 50 50 43 43 43 44 59 59 59 57 54 54 54 57 57 57 57 44 37 44 44 47 47 54 57 57 57
57 57 57 57 57 59 68 59 59 59 59 59 54 40 38 31 20 20 20 20 41 34 43 43 43 31 32 23 31 30 30 32 33 39 43 47 57 57 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
57 57 57 57 47 48 48 48 48 59 59 50 47 41 39 23 23 11 11 11 9 10 8 8 8 8 12 27 30 50 50 44 44 39 39 35 35 35 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57
57 57 57 57 57 68 57 57 54 48 48 59 59 68 68 68 57 57 57 54 54 54 59 57 68 68 68 57 57 57 57 59 54 54 54 57 48 57 48 48 59 59 59 59 59 57 57 68 57 57
57 57 57 44 44 39 41 48 46 46 47 47 47 42 39 43 43 43 42 42 33 33 28 37 30 42 42 48 57 57 59 59 43 39 39 30 30 30 39 47 59 43 43 37 43 36 37 37 36 37
37 37 37 30 30 24 29 28 28 24 28 23 35 35 37 37 43 43 43 37 39 28 36 25 30 33 33 28 28 30 36 36 43 43 48 48 48 43 43 43 43 43 43 43 33 33 33 33 33 37
41 41 32 29 9 8 6 6 6 15 12 12 10 14 11 17 21 37 37 41 41 33 33 33 33 21 21 14 14 14 22 26 34 41 41 34 31 37 39 37 41 41 59 29 30 17 15 14 22 28
43 34 34 25 30 21 30 30 33 33 33 36 36 36 39 43 43 43 43 43 43 39 42 33 33 33 32 37 29 29 32 28 30 26 28 12 19 11 21 21 37 37 28 28 34 34 21 19 11 11
11 21 19 8 6 6 10 17 30 25 19 11 11 11 17 20 25 25 15 9 9 9 12 12 41 30 29 19 14 14 16 16 18 18 13 11 10 11 11 11 11 12 8 13 6 6 6 7 8 8
| Open.Hide. 6 6 6 6 10 8 8 8 8 19 25 41 37 47 48 57 57 59 57 57 50 53 53 53 53 53 53 57 57 50 57 57 43 43 25 37 36 43 30 41 41 41 41 42 43 42 31 30 37 37
48 48 50 50 51 57 57 43 43 43 59 48 48 36 36 41 41 36 36 25 15 26 33 48 50 47 57 48 47 54 48 53 53 50 50 50 57 57 57 57 68 59 59 68 68 50 50 50 50 50
50 59 59 50 50 50 53 53 50 50 50 57 50 50 50 50 47 53 59 59 47 41 37 30 21 12 12 12 12 15 28 32 59 59 59 59 48 48 47 47 57 57 50 47 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 54 57 57 68 57 57 57 59 59 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 46 43 46 46 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57
59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 54 54 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68
68 68 68 57 57 57 59 59 54 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 52 52 50 59 57 57 57 59 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59 47 47 43 57 57 59 59
68 68 68 68 59 59 57 57 57 68 68 57 57 57 57 54 54 54 54 57 54 57 57 59 44 36 19 18 9 10 10 12 13 19 19 28 28 43 43 43 43 43 39 39 43 43 50 57 59 48
43 43 43 43 48 48 48 50 48 43 40 37 25 21 12 10 7 8 8 7 7 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 9 14 14 18 18 24 24 24 14 9 9 9 11 22 19 34 23 23 23
32 23 23 23 24 21 15 14 9 9 9 17 21 39 28 28 12 15 15 16 11 15 15 17 9 9 9 19 19 31 32 32 23 17 11 12 12 15 16 18 20 17 12 10 10 10 8 9 10 22
22 25 18 12 11 10 8 8 8 8 8 8 8 19 14 24 22 23 31 39 39 39 39 40 34 34 23 23 13 19 10 10 10 18 22 36 36 34 30 22 15 15 21 25 33 28 30 21 23 15
9 8 8 8 8 8 11 19 19 23 23 24 23 24 15 15 12 12 12 19 19 23 12 11 10 10 10 13 19 26 30 37 24 22 12 12 12 22 18 21 21 12 12 12 12 11 11 18 13 15
12 15 13 12 12 11 12 12 19 22 21 11 11 11 18 25 37 31 41 17 17 17 21 14 12 12 12 12 12 25 25 18 18 11 11 11 13 15 11 11 8 6 6 6 6 10 9 10 13 19
10 13 12 19 14 20 22 29 33 33 43 43 31 30 20 20 14 14 11 11 7 7 8 10 9 9 9 11 18 10 8 8 6 6 8 8 8 10 10 9 8 8 10 10 8 8 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 13 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 14 9 9 8 8 8 10 12 13 11 11
11 12 12 12 11 11 11 11 11 11 12 12 10 13 8 8 8 8 9 10 10 8 9 9 9 9 9 12 11 11 6 6 8 8 8 8 11 13 14 19 23 19 19 16 15 14 8 8 8 8
6 7 6 6 |