| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-323P07.T7 (MSMg01no323_p07.b1) | MSMg01-323P07.TJ (MSMg01no323_p07.g1) |
|---|
| ACC | AG442231 | AG442232 |
|---|
| length | 1,271 | 1,265 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 350 (89 - 438) | 680 (137 - 816) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_p07.b1 PHD_FILE: MSMg01no323_p07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:08:06 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_p07.g1 PHD_FILE: MSMg01no323_p07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:08:06 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NCATTTCTNNNNNNGGCATTGGGCGCTAAGACTCCTATGGGAGAGGATCC
GCGGAATTCTTAGCCATAGGAAGTAGCCTTTAATGACGTGTCATCTTGTT
AGAATACTTTGGCATTCTTGGAGGAAGTGTGTTATTGTGGAAGTGGGCTC
TGAGGTCCTATGTTCAAGCTCTGTCCAATGTGGAACCCAGTCTCTTCATT
TTTATCTATGGATCAAGATGTAGAACTCTCAGCTTTTTCTCCAGAACCAT
GTTTGCCTGCACGCTGCCGTGCTTCCCACCATGATAATAATGGGCTAAAC
CTCTGAAACTGTAAGCCAGCCCCAATTAAATGTTTTCCTTTATAAGAGTT
GCCTTGGTCATGGTGTCTGTTCCCAGCACCAAACCCTAAGACAAGCAGTG
TCTGCAATTTTATCATTCAGCAAGGAGGGTACTATCCAGTATAGAGAAAC
AGCTCACGAAATACTGCAGAATACCATTTGTAAACAGACAAAGGAACTGA
GTAGCCATTTCTCAAATAAAAGATAAACAACCAACATGAAGGTAACGTCA
AATATCATTAGTCATCAACAAAATGTAAGTTAGAACTGCACAGTGATATC
AACTAAACACAGAATGTTATCAATAATGTCAACAATAACAGATGCTAGTG
AGGATGCAGAGAAGGGAGAAGTCTCAGCTGGAAAACTGGTGCACTTATCA
CAGTAAGCAGTATGGATGGCATAAAAAATGTAGAACTACTGATCCCTTCC
ACNANGAACGNNCCTCTTTATGTATGCNCCCCCCATATGTATATATATGT
GTGTGTGTGTATATATATATATACATACACTTACCCTCTTATTTATCCTC
CCCTTTTTTTTTTTTTTTGGTTATCTCTTTTATTTATATATGTATGTTTC
TTTTTCTATTTATATTCAATTTCCCTTCCTTCTCTATATTAACATCACTT
ATACTTTCCTCTTCTTGGTTTCTTCTTTTTCCTTTAAATAACACTTTTAT
TTCATATCATTTTTTTTAATCTTAACTTTACCTTATATTCTTACCTCTTC
TTAAATCTCCCTTTTCTATTAAATTTTATCCACCTTTCTTCTTAATCTAT
CTCCTCTAACTTTTACATTTCTTACTTACATATTCCTCCTTTTTCTTTTC
TTTATTTCTCATACCTATCCCGCTTTTCTTCTCTTCCTCTTTCTATTTCT
CTTATTTTTTTTTCCTTCTTTATCATTTTCTAAACTTTTCTTCTTTCTCC
TTTCTTTTTCTTTATACCCTT
| CCATTCTTNNNNNNGTTCATGGATGCTGGGGCCXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTATAAACATCCTGTTCTGTAA
AACAAACAACTTGACCGTCTTTTTAATCCCTGCCCCCCACGAACACACTC
TGTCTCTCTGAATTTGTCTTTTCTGCACATGTAAAATAAATATGACTGAC
TTCTTTCATTTTTGCCCAGTGTTTTAATAATTTATCCTGTGTCAGTTTGC
TTCTTTTTTTATAGTTGAATAACTATAGCCATTGTATGGGTATACCATCA
TTTATTCAGTTATTAGCCAAAGGACTTTCAGATTATCTCTATCTTTTGAC
TGTCATAAGCAAGGTTATTAATAACAGCACACAAATTTTTGTATGGACAT
ATATTTTTATTTTACCATAATTCCTAGAAATCGTACTGACAGGTTATATG
GTAGCTCTAATATTTTAAATATATACTGATTTTTTAAAATACATTTTTAG
TTGAGATAGACATTTGTCACTTTCACCTACCCTTTCCTCCCCTCAGCTCC
TGTAAGTTCCCTTCCCTCTACTCGCTCCTCTCCACCATCTCAAGTTGATA
GACTCATTGCCTTTGATTGTTATTTTTACATTCATATATATGTGTATGTA
TGCAAACATATATGAATGCCACCTGCGGAGTCCATTTTATTAGTTTCTGT
GTATATAGTTTCAGAGCTGACTCCTCAGAATTGGATGACCAATCAGGGGC
TCATTCCAGGGACCGGCTAACTCTCCTCCTTCCACCAGCCTTTAGTTACC
TGTACCTTTGTGTCTAGCAGAACGACCCCATGAGATTCTCCTGCTACCAC
CGAGGTATGTCTGTTGATTCAGGAAGACTGTTTCATACCAGACTTATGTA
TTTTGGCTTTTACAGTCTTACTGATCCTCCCTCTGAAAATATTCCTTAAC
CCTTAAATTCAGAAACTGGGAAAAAAATTTTGTCTGTTGGGGCTTGGGGC
CCCCCCACCCGGTGACTTCTGCATTGTGTCCAAGGGGGCTTTCTGGGAAG
GCTCCCCCCGGTTGAAAAAAAGCTTTCCCTGTAAAACCACCTTCCCCTGA
AAAAAAAAAGGGTCCCCTTCTTTCTCAAAATGAATTTTCCGCCTTAAAAA
AAACCCTCCCCTATGTTTTCTAAAGGCGAAATTATTTTTTTGTGGGGTTT
TCAAAATAGAACATGGGTCTCTACCCCTTTTTTTACACCATAAACCACTC
TTCCTGGAGAGAGCG
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 7 7 10 10 9 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 7 7 7 7 8 8 10 10 8 8 8 8 8 11 13 8 8 8 8 10 8 8 21 19 33 36 36 40 40 42 47 47 50
43 47 47 47 53 43 43 50 53 53 53 50 50 53 47 41 41 31 31 31 33 29 21 15 9 9 9 12 8 8 8 8 8 10 17 11 11 10 17 21 29 31 33 33 31 31 35 35 36 36
38 53 36 36 35 35 31 31 33 33 37 25 23 11 9 10 10 10 10 13 15 24 31 33 43 43 39 37 30 30 28 28 33 36 43 53 57 57 57 59 59 53 53 53 53 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 68 50 50 68 68 51 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 52 57 57 44 68 68 68 68 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 44 48 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 68 59 59 57 44 44 42 42 44
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 48 48 48 48 48 57 47 43 43 43 43 43 43 48 57 48 59 41 34 28
30 30 41 30 18 12 11 12 16 15 11 11 11 13 17 22 28 28 28 39 43 34 34 30 39 24 30 15 17 17 19 29 28 40 24 18 12 12 12 12 12 19 15 15 17 18 18 19 19 23
28 23 23 16 16 10 10 10 13 13 11 11 11 11 21 15 12 11 11 10 8 8 8 8 8 8 19 31 34 24 24 20 32 32 35 35 37 37 40 40 40 37 37 35 35 35 39 37 42 30
40 23 21 10 10 11 11 25 28 47 46 37 34 28 13 13 15 24 19 20 20 20 20 23 32 30 41 20 20 20 32 32 48 57 59 57 54 57 34 32 14 14 14 14 19 32 32 42 42 35
35 42 47 57 57 50 50 43 44 31 43 43 57 59 59 57 57 59 59 59 59 52 52 52 59 38 38 14 14 13 34 29 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 50
50 57 57 59 59 59 68 68 68 68 48 48 37 43 43 57 57 68 59 59 44 44 33 28 35 44 44 48 42 37 37 44 44 25 25 32 44 44 57 57 68 68 68 57 59 59 44 44 23 23
28 33 43 46 57 34 28 12 12 12 28 28 43 43 26 26 14 15 15 32 32 43 28 23 12 11 11 23 23 46 50 50 43 59 41 37 34 28 25 30 27 27 21 22 18 25 34 41 41 41
47 47 41 41 32 32 35 35 31 37 37 41 43 29 29 32 32 29 29 39 39 37 31 31 31 31 32 37 37 26 24 28 25 24 22 25 37 37 39 41 41 46 46 46 25 21 10 10 10 12
17 3 0 3 0 3 9 11 11 3 0 0 3 6 7 6 10 7 6 9 9 9 9 9 9 9 3 0 3 17 13 10 14 14 14 19 25 35 35 47 37 48 48 48 40 40 37 37 24 24
15 15 15 21 21 21 10 13 10 16 12 19 21 28 13 13 8 8 8 10 10 10 10 8 8 6 6 8 12 8 8 8 8 8 14 13 14 12 18 14 14 12 17 11 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 14 16 22 16 19 17 19 14 11 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 11 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 9 15 10 12
10 10 10 9 9 9 9 12 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
12 14 15 14 14 10 10 10 10 14 12 12 10 8 9 13 10 12 9 16 12 9 8 8 10 10 8 11 13 8 8 8 10 8 8 11 11 11 11 12 14 13 9 9 10 15 15 12 9 9
9 8 8 10 8 8 6 6 6 10 14 14 14 19 10 10 8 8 8 8 10 10 8 8 9 9 10 8 8 8 9 9 8 10 9 7 12 8 10 11 9 9 9 9 9 9 10 10 10 9
9 10 10 10 10 13 8 8 8 8 10 15 13 9 8 8 8 8 8 11 11 9 9 9 15 11 10 10 8 10 6 6 8 8 12 12 15 15 10 10 10 10 10 10 11 13 10 9 9 10
10 11 12 12 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 8 10 10 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 9 16 16 12 11 9 8 8 8 8 8 10 19 10 10 8 10 10 10 10
10 9 9 12 9 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 10 11 10 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 13 13 8 8 8 8 8 12 9 9 12
12 8 8 6 6 8 8 16 13 16 17 10 7 9 9 9 11 14 14 14 12 10 13 10 10 10 12 11 11 12 8 8 8 11 11 8 8 10 10 10 10 10 9 9 12 15 13 10 10 8
9 8 10 8 8 8 10 12 14 14 13 16 10 11 11 11 8 8 8 8 6 | Open.Hide. 9 9 9 9 10 9 9 3 0 0 0 0 0 0 3 7 6 6 6 7 6 6 6 6 6 10 6 6 6 6 12 9 10 6 6 6 6 8 7 10 19 19 19 8 9 9 17 17 17 8
8 19 23 35 35 35 33 36 37 29 29 36 42 38 38 36 53 41 50 50 50 42 41 27 23 9 11 9 9 8 8 8 12 12 10 12 12 10 10 10 10 10 13 26 26 31 31 31 31 36
53 59 59 59 59 59 59 53 53 36 36 31 31 31 28 29 19 15 10 12 11 13 11 16 11 11 11 18 22 16 12 8 8 8 8 8 11 21 23 39 40 40 41 48 59 53 53 53 53 53
53 57 53 53 53 53 53 53 50 50 48 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 54 50 50 50 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59
57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 48 48 48 59 59 59 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 31 35 25 21 10 10 10 10 13 25 31 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 48 57 57 57 59 59 59 57 57 48 48 48 57 48 59 59 68 68 68 59 59
59 59 59 59 28 40 41 43 43 47 48 59 59 59 68 68 68 59 59 57 57 54 54 54 54 54 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 48 48 59 59 59 59 59 59
59 50 57 48 50 50 57 57 57 59 59 59 68 68 68 46 46 46 46 46 50 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 43 43 43 59 59 68 59 59 59 68 59 59 59 59
59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 68 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 59 59 68 59 59 59
59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 54 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 39 39 44 41 47 47 47 46 46 43 37 37 40 40 43 43 47 47 47 47 50 43 43 37 35 21 34 27 57 59 59 59 48 48 43 47
47 59 43 43 43 57 48 48 57 57 41 34 18 18 14 18 18 34 34 43 37 37 31 31 23 23 12 12 15 21 30 37 37 39 36 27 27 22 19 19 29 29 25 15 12 12 24 24 35 33
34 34 37 23 15 8 8 8 9 9 21 13 16 16 19 23 39 44 36 34 41 41 41 39 37 31 32 32 33 32 30 27 30 30 20 14 11 12 19 21 40 34 36 28 28 22 32 34 35 37
34 34 23 23 23 25 32 37 33 28 28 28 28 19 13 11 11 11 11 11 11 14 16 23 16 13 11 11 11 14 14 16 10 9 9 9 9 10 10 18 19 27 28 24 24 24 22 20 16 16
11 11 11 12 13 14 12 16 19 17 16 16 16 27 19 18 18 13 11 10 10 12 8 7 7 7 9 15 19 30 21 16 11 17 10 8 8 9 8 7 9 9 9 9 10 13 12 12 12 12
17 9 9 10 12 11 30 20 22 20 20 21 10 10 9 9 9 9 9 8 10 10 10 13 12 9 8 8 8 11 13 10 10 10 12 12 12 19 10 10 10 10 10 10 13 10 11 10 8 8
8 8 8 8 8 8 15 9 8 9 9 9 10 10 9 11 10 8 8 12 9 9 11 11 11 15 15 13 14 21 13 11 11 12 18 12 12 18 17 10 10 10 10 9 13 13 12 12 12 20
16 22 14 12 9 10 9 11 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 9 10 9 9 8 8 6 6 6 8 8 11 8 8 8 11 11 10 9 9 10 16 10 11 9 11 9 10 8 8 8
9 8 8 8 11 10 15 13 11 11 11 8 8 8 8 8 11 16 20 16 14 9 9 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 7 9
14 9 8 10 8 11 11 17 18 17 11 11 11 11 9 9 10 9 7 12 8 8 8 8 8 8 10 8 12 9 9 9 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 10 10 8 12 12 15 18
19 22 12 13 12 12 12 12 13 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 10 10 10 8 8 9 10 8 8 6 6 12 12 16 13 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 13
11 11 11 6 8 6 6 8 6 10 9 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 8 8 10 10 10 17 32 26 18 10 8 7 6 6 6 6 8 8 12 10 10 10 10 10 10 10
9 12 10 14 8 10 8 8 8 13 8 8 7 7 7 |
|---|
