BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-332E10.T7 (MSMg01no332_e10.b1) | MSMg01-332E10.TJ (MSMg01no332_e10.g1) |
ACC | AG448351 | AG448352 |
length | 1,317 | 1,310 |
length of high quality (start - end) | 583 (143 - 725) | 699 (94 - 792) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_e10.b1 PHD_FILE: MSMg01no332_e10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_e10.g1 PHD_FILE: MSMg01no332_e10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:33 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNGGGCCGTTCTTGGNNNAACATTGGGCGCTAAXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXCGCGGAATTCCCACTTGGATTTCACTTAAACTGACTCCGCTGTAT
GNNGGNNCAGGNCAAANTTAGCCTTATAAACCTGATNTATATTACTCAGT
AGACTCTTAAGTAATAGACAGATTGACTATACATACCAGGCTGTGTCTGT
GACTGGATGATGGCTGTTTGGGGATGAAAACGAACTTCTATATCTATATA
CGAACTACACACAAAATGACTATTCTGCTACAGTTTTACCAGTATTAAGG
GAAAAACAACAACAACAAAGGGATTGCAGTAGATGCCCAAGGGTGCTTTT
TAAACTGTGGAATGTGGATTTCCTCCCTTCCTTTCTTAGTGTCCTTGTTC
TTCTGTACTGATCTTTCTCGAAATACCCTTCAGGACCTAACATCATATAT
AGAGGTAATAAGACCAGGAGTTTACCTTTAATAGAGTTCTCACCGCCTAT
TCTTTTGTGAGTCTTTCCCTCTTTTCTCCTTCAGTTCTGAGTACAGGCGG
GTGGAAATATGGGGTCAAGACTGGCATCTCCTCATTTTTATTTTTAAAAG
ATTAGTGCTGCCTGTGGGTTTTAATATACTTCCCCTCTGCTACATTAATG
TCTACTTTCCTATTTAAAAAGCTTAATACTGAGCCATAGGGATTTCCAAT
TAAGCTTAAGAAAGCCATGAAAAGCAAGCATTCTGTTCTTTAAGATAGAA
AGTGTAACTTTGGGATATGAGAAAATAATTTGAAATGGCCATTCCTGTTC
TATATCCTTCCAAATTTCACTCACTCTTCCGTCCCATTTCCTTTCCCTCC
CTTCTCCGACCTGAANAAGCTTATTTTTCACTGCTTAACGCTATTGTCCA
TCCCAGGCTATTTATGTGGNTGTTTATGGTAGATCATTGTTTGAGTTATC
TTGGGATGATTAAACGCACAAATCTATTTGGGTCCTTTGGGAAAAAACCC
GGAGCTATAGTTGTTTTAGGCGAGGGAAGGTTAACCCTCTTCCGATCCCC
CCAAGGTTTTAGTGGAGGCGAGAATAAATTCTTTTTTTTTTTAAGAAAAA
AATTAAAAAAAACGGGCTGGAATTGTGTAGCTCTTTTTGTAAGGGGGGGA
GGATTAGGCTTTCCTTCCTTTTTTTTTTTTTGGCTTTTTAAACAAAAAAA
AGGGGATTGGCAAAGGTTCCTCCCTTCTCTTACCGGGGGGGGGGAATGAA
GTTTATTCTCTCTTTGTGGTATGGAAAGAGAAAGATCCCCTTTGTGGTGG
TATAAGAAACGAGGCCA
| NCCCCATCATTNNNNNAAAGCATGGAGNCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTCAAGTGCCGAATACCG
AATGGCAGAGAAGCACCTGACCCTATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGG
AAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATG
ACTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCATGGATGTGGAGA
AAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCAC
TCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCG
GAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATTCAGAAGATGTCCCAAC
TGGTAAGAAGGACACATGCTTCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAA
TAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATA
CAGAAAATGTGGTACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAA
GAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCA
TCCTGAGTGAGGTAACCAATTCACAAAGAAACTCACACAATATGTACTCA
CTGATAAGTGGATATTAGCCCCAAACCTAGGATGCCCAAGATATAAGATA
CAATTTGCTAAACACATGAAACTCAAGAAGAATGAAGACTGAAGTGTGGA
CACTATGCCCCTCCTTAGAAGTGGGAACAAAACACCCGTGGAAGGAGTTA
CAGAGACAAAGTTTGTAGCTGAGATCGAAGGATGGACCATGTATAGACTG
CCATATCCAGGGATCCACCCCATAATCAGCATCCAAACGCCTGACACCAT
TGGCATACCTAGCAAGATTTTATCGAAAGGACCCAGATGTACCTTGCTCC
TGCGAAACTATGCCCGGGCCTACCAAACTACAAATGCGGAAGCTTCACAA
CAATCTAATGGATGGATCCCTCGGGTTCCCTATGTAGGAACTAAAATAAA
AACCTCAGGAACTAAGGGAATCTGTCCCCCTCTAGTGGGAACATATTATT
AACTTACCAATTCCCCGGCAGCTCTTGACTCTTCCTACTAATTAAACAAA
GAGGCCCTAATCTTCCCTTACTGTTATAAAAGGCCATTTGTCATGTAACT
TTCATAGTCCCTTATCTCGATACACCTGTCCCCATATGACTATAAGTTGT
ACTTTCAATTCTATTTCAACTCCAACTCTTTCTCTCTCTTCCTCTTCCTG
TCTCATCATA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 3 6 6 9 9 9 10 10 10 9 9 3 0 0 0 3 7 7 7 7 7 7 8 8 10 10 8 8 8 8 8 13 15 14 17 14 16 10 16 10 24 24 42 37 32 33 33
37 37 48 50 50 50 47 50 50 50 50 37 30 33 21 17 14 29 24 30 29 24 30 30 37 28 13 17 8 7 8 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 13
3 0 0 3 3 0 0 3 7 7 3 0 3 25 25 3 0 3 21 9 9 9 13 8 8 8 8 8 8 8 9 10 12 13 8 3 0 3 10 9 11 15 23 23 31 29 29 16 12 12
26 26 36 57 27 32 19 17 11 19 19 36 36 36 36 43 43 43 34 30 23 28 34 42 39 41 48 43 46 33 23 19 11 11 21 24 26 37 37 32 37 25 36 32 37 43 44 44 57 57
47 47 44 44 43 43 57 57 59 57 57 42 42 32 32 42 42 42 42 43 43 47 57 57 57 57 43 43 31 31 33 44 43 43 35 43 43 57 50 52 52 52 57 57 52 52 43 43 32 24
14 14 14 38 24 32 32 21 23 27 44 23 27 27 32 32 43 43 52 52 52 57 59 59 57 52 43 43 39 39 28 43 43 52 43 57 43 43 43 32 38 31 43 43 43 43 32 35 35 38
43 43 52 44 38 27 20 20 32 32 33 32 32 32 38 18 18 18 24 36 44 43 37 43 43 43 42 32 24 32 32 24 29 44 32 44 35 32 32 32 32 28 36 23 28 28 43 47 57 47
34 27 18 18 19 32 36 47 47 47 44 44 47 37 37 35 39 39 46 46 54 48 59 48 47 47 43 46 46 43 43 43 47 43 43 25 24 12 12 18 28 21 24 32 33 39 37 37 47 59
47 47 39 39 30 37 37 39 39 39 19 15 8 8 8 8 15 15 11 9 12 23 26 59 59 59 48 48 57 47 43 43 39 31 31 24 24 31 32 32 25 28 28 36 36 48 59 47 48 48
48 48 46 46 43 57 43 43 41 37 37 37 39 37 37 28 28 28 44 37 44 43 44 44 59 48 48 44 36 23 20 20 30 27 24 32 24 35 41 44 42 48 46 32 30 18 18 32 34 50
54 54 54 59 44 59 57 57 57 59 57 57 57 59 57 59 59 59 47 47 47 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 47 59 43 43 43 59 48 57 43 40 32 32 20 20 20 28 34 36 35
35 28 32 24 28 28 44 44 40 40 30 25 21 31 23 28 30 39 39 46 57 42 47 39 39 32 42 42 47 47 37 32 23 23 32 37 43 48 48 48 48 48 43 37 34 23 23 23 23 23
20 21 21 11 11 11 29 24 37 31 37 37 39 37 28 28 25 28 36 39 47 47 48 48 48 48 48 40 47 35 35 35 43 43 43 43 39 39 33 40 34 42 30 30 30 42 39 39 32 28
20 20 23 32 37 37 39 35 35 35 47 39 39 39 32 32 33 30 30 37 37 34 30 26 14 14 28 30 43 34 34 23 23 20 22 24 24 12 12 12 25 19 28 28 25 24 20 18 18 30
34 37 30 30 30 37 34 28 25 33 32 20 23 12 12 11 21 21 34 25 26 26 27 32 15 8 8 8 8 10 12 18 18 18 19 15 12 18 14 27 19 32 14 22 11 15 11 20 20 13
13 14 28 28 24 15 15 15 27 27 34 25 20 19 23 26 28 26 30 17 20 23 33 30 41 41 36 36 32 27 22 12 12 12 25 19 18 18 18 16 24 28 34 34 37 37 31 24 24 19
19 23 28 28 34 30 24 28 16 25 13 18 18 24 24 31 19 19 20 20 21 17 28 23 28 30 25 26 16 16 12 11 11 16 15 19 17 34 36 41 41 41 27 25 12 12 12 25 22 29
29 27 31 39 39 17 17 9 9 9 16 15 15 12 3 0 3 10 12 15 27 25 21 22 22 26 27 22 14 14 14 23 18 18 10 9 9 11 14 17 25 28 28 20 25 18 18 22 16 12
13 9 8 8 8 8 8 8 8 12 10 9 9 9 9 9 10 10 3 0 3 10 8 8 8 8 8 12 12 12 9 9 9 10 10 9 9 9 9 14 14 11 10 10 10 9 8 10 11 11
11 13 13 11 16 11 11 11 16 14 18 15 16 15 10 10 9 9 9 12 7 6 6 6 6 10 9 10 10 10 15 14 16 16 16 16 16 12 8 6 6 6 6 6 8 12 12 8 8 8
8 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 8 8 7 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 8 11 11 8
8 7 8 8 8 8 10 10 13 10 8 8 6 6 6 8 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 13 19 24 22 16 10 10 6 6 6 6 6 6 8 8 9
19 13 9 8 8 9 10 10 14 13 15 9 9 9 10 11 9 9 9 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 9 20 23 21 11 11 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6
6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 11 12 12 12 12 11 10 10 10 11 12 12 22 24 16 15 11 11 10 10 8 8 8 8 13 19 17 11 10 12 8 9 9 9 9 19 15 15 11 15
10 10 11 11 11 8 8 8 8 8 8 11 11 11 12 12 13 11 8 8 8 8 8 8 11 12 12 9 9 6 8 6 6 8 7 8 8 9 10 9 10 11 7 6 6 6 8 8 8 9
8 6 8 8 7 8 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 6 6 6 8 9 15 11 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 10 8 8 6 7 7 7 11 11 11 9 9 | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 6 6 9 9 3 0 0 0 0 0 3 9 9 7 6 6 6 6 6 8 3 0 3 6 6 6 7 8 12 11 7 6 6 6 8 7 9 19 16 19 9 10 10 17
15 21 10 15 17 28 28 35 35 37 37 37 35 35 35 35 35 36 36 44 44 50 50 47 47 27 27 9 9 9 9 12 13 11 8 8 8 8 8 8 8 9 10 17 25 30 37 33 33 43
33 33 31 33 33 32 35 35 36 31 31 28 28 35 37 24 25 22 19 12 10 11 12 12 12 16 16 16 28 30 28 24 24 28 28 39 33 33 33 32 43 44 48 43 40 32 23 23 31 32
43 43 43 47 43 43 36 36 36 43 46 46 44 36 30 28 30 44 37 32 37 29 32 24 23 25 40 40 46 43 37 37 37 39 37 42 43 43 42 37 32 35 39 39 39 43 37 42 42 48
48 48 40 44 43 43 32 32 32 39 39 50 50 57 44 38 20 20 20 38 38 38 43 42 35 32 32 22 19 27 43 43 43 43 44 44 31 31 38 31 31 35 38 32 24 20 20 32 38 43
57 57 59 59 57 43 39 43 33 35 39 43 57 57 57 43 35 35 43 44 39 45 57 57 35 35 26 26 26 26 43 44 57 57 44 44 31 31 31 43 43 52 52 52 52 52 62 43 52 52
52 43 43 35 43 43 62 43 43 43 35 26 26 27 43 43 39 39 35 31 31 43 44 44 38 29 13 13 29 38 38 43 43 43 31 44 43 43 43 43 35 31 31 35 43 43 52 43 43 33
43 43 43 31 39 39 43 43 52 62 62 43 43 35 39 43 62 62 62 62 62 43 43 39 39 59 43 52 43 44 41 41 43 39 39 39 26 26 12 12 13 39 39 39 39 43 43 35 35 35
39 39 43 43 21 43 43 44 43 21 23 23 13 13 12 13 12 13 13 13 39 39 62 45 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 31 31 43 44 43 52 52 62 62 62 62 62 62
62 43 43 35 39 31 43 43 39 39 17 29 29 43 43 52 62 62 62 62 52 43 43 33 43 43 43 43 52 52 62 62 62 43 39 41 39 39 31 31 35 43 43 43 44 35 35 35 44 44
52 52 43 62 43 43 52 62 45 62 43 62 52 45 52 52 62 62 43 43 26 41 43 62 43 62 45 45 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 52 57 57 57 59 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 43 43 52 57 57 57 59 43 43 52 52
52 57 57 57 57 52 57 57 57 59 59 59 57 57 52 52 52 52 57 57 57 54 54 57 57 57 57 68 57 57 52 54 54 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 43 43 44 47 44 48
57 57 57 44 41 27 20 20 34 32 57 47 57 57 57 59 42 42 32 42 44 43 43 57 43 47 47 44 43 37 43 46 48 48 48 48 43 46 43 48 48 48 48 48 57 57 43 43 43 43
48 48 48 57 43 57 48 48 43 43 47 48 48 48 48 48 48 48 48 48 41 43 37 37 30 33 28 20 22 24 22 22 32 39 34 33 28 28 37 37 44 37 37 36 37 39 39 37 37 28
32 32 39 41 41 27 27 11 11 12 23 25 39 39 25 25 11 11 11 17 10 10 10 18 19 25 31 37 34 37 41 37 37 30 33 30 30 27 18 15 10 10 8 8 9 10 12 11 13 13
10 17 18 15 15 15 21 22 23 11 11 11 23 23 11 11 11 11 11 11 19 13 12 10 6 6 6 11 11 16 16 10 13 10 10 9 11 11 15 15 12 12 10 10 9 12 11 11 10 17
14 10 10 12 12 12 12 22 18 13 10 10 10 21 19 16 16 12 21 22 30 30 28 28 23 13 10 10 16 22 10 15 15 14 15 10 19 8 8 8 8 8 12 15 15 19 14 16 14 8
8 8 9 9 8 8 8 10 11 15 9 9 10 13 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 14 20 19 18 14 14 13 21 13 10 9 9 9 14 18 17 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 15 15 17 11 10 10 12 10 10 11 10 8 8 8 8 10 10 9 9 10 10 13 13 10 10 8 10 8 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8
10 10 10 11 11 11 11 12 10 9 10 10 12 12 10 11 9 8 8 8 8 10 8 10 8 6 6 6 7 8 8 8 8 8 10 10 9 8 7 6 6 8 8 13 12 11 11 11 15 10
10 8 8 6 6 8 8 8 8 11 13 18 15 12 12 12 12 9 9 9 14 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 12 10 11 11 11 8 8 8 8 8 10 9 10 15 14 13
13 10 10 9 10 10 10 12 10 8 10 8 8 8 10 10 12 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 13 6
6 8 6 10 10 6 10 6 6 8 8 11 12 11 11 11 10 10 10 6 8 6 6 6 8 10 11 11 10 10 10 8 8 8 7 7 10 10 12 10 10 8 10 12 10 8 8 10 10 10
13 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 9 9 9 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 12 8 10 10
8 8 8 8 8 8 8 6 6 12 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 10 10 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 17 13 9 8 9 10 10 8 7 7 7 7 10 8 8
8 8 8 9 10 9 10 9 9 9 |