BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-374H05.T7 (MSMg01no374_h05.b1) | MSMg01-374H05.TJ (MSMg01no374_h05.g1) |
ACC | AG480244 | AG480245 |
length | 782 | 772 |
length of high quality (start - end) | 441 (44 - 484) | 337 (59 - 395) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no374_h05.b1 PHD_FILE: MSMg01no374_h05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:13:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no374_h05.g1 PHD_FILE: MSMg01no374_h05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:13:41 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | TATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCCTGGGGATTCCGCTGGTCCCAAAACACATCTGCCTTCCTGCCATCAG
GAAGATTATCCCAAAATCTTCCCAGGAGCTCCACTCCAGTCTTAAATCCC
CAGCCTGGGATGCTGAGGTAGTAACGGTCATGTGTGGGCTGACCACGTGG
TAGGCATTGCAGCATAACTGGTGTCCTAGTGTACCAGGAATCTTGGAGGA
GGGCCTTCCCTGCTTTACATGGGGCTAGACTGAGGCTCTCAAGGTCCCGT
GTTTCCAGCTTCCTATTCAAGAGTAGTTGGGCACCATGCTCACCTGCCCG
CCTTTCCTCCTACAGGGCGCCATGGCGGCCACCTACTTTGCTCTGAACAG
GACCCCACAGGCACCGAGGCTAGAGCCTGTGCTCTCATCTAGCTTGGCCC
AACGCAGAGGCATGAAGAGACTCACGTCTACCAGGTTGTAGTGGCCAGCC
AAGTCTCCAGCCTCAGTCGCCCTGCCCAACGTCCTCTCAGCCTCACAGAC
GCCAGATACAGGTCCTGTTCATGGGCACTTGAGTGCCCCTTGATCCCGCA
CAAATATGGATCTGGCCCTGGTTATCTCCTCTGTTTCCTTGTCGCCCTGG
TAAGGGTTCTGCCCTTAATGCCTGATTTTGTTTTGTCTACCTTCTCGCCC
GCTCTTCCTTTCCTTTGTGATTAATCCATCGGATTTTTTTACTTTTAATC
TCTTTTGTGGGGTCTCTTCTTTTTTTCACAAG
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXACAACAGCTCTGGCTTCCAGCATGAAATCTGCACCAAATCAA
GAATTGCACCCTGACTAACCCATCCCAGAAACATTGACAGTTGATGACAT
CCAGAAAAGAGTCATTCCTCCTGAAGGATGTAGCCCTGGTAGATCAACCA
CTCCAGTGGATGCCCCCACACTCATGAACATATGACAGCAGGTTATTAAA
ATAGGACATGAATTTTGTGGGTTGTTGGAGTGACTGTGGGGCTGCATCTG
GCATGAGTCAGGGAAGGGCAGGGGTTGACTAGGATCCAGATATATTTAAT
GGATATCTGAAGTTCTCAAAAAAATATTATGACATTTAAAAACCATAAAA
AAGCTGGGCAGTGGTGGCCCAACCTTTGATCCCAGCACTTGGGAGGCAGA
GGCAGGCAGATTTCTGAGTTTGAGGTCAGCCTGTCCTTCATAGTCTGTTC
CAGAACAGCCAGTGTTACACCGAGAAACCCTGTCTCTTTATTTTTTTTCA
TTGAACCCTATATTTACTTTCTTTTTTTACTTTAACCCCTTATAAAGCTC
ATCTATACCTATCTCTGTTTTTTTTGTAGTAATAACTCCCTCTCTATTTT
TTTTCTTTTTTCCCTTTTTTTTCCCTTTCTTTTTACCATATGGTATTTTA
ATTTACTCTTATTAAAAATTTTCCTATTTACACTTTTATTACTTCTTTTA
TGCCTATATTCCTATTCTTCTG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 17 22 34 28 22 23 8 8 8 23 27 36 36 39 39 33 36 39 44 28 24 28 25 20 19 25 9 9 9 10 9 10 12 13 10 10 14 16 28 28 59 48 57 36 36 36
31 33 33 50 47 47 31 22 8 6 6 6 8 6 6 6 17 29 47 47 37 37 39 48 48 47 36 50 50 36 36 42 43 57 57 59 59 59 59 59 59 59 53 53 68 68 50 50 47 47
43 57 41 42 50 50 50 50 68 50 50 41 47 47 47 54 57 68 68 68 68 68 68 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 48 48 46 46 46 48 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 47 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 57 57 52 52 52 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 59 57 57 68 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 38 38 32 20 20 20 38 38 52 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 54
54 57 59 59 68 59 59 57 57 57 57 50 43 43 43 50 59 59 59 48 48 54 48 57 48 54 59 57 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 68 68 57 57 57 54 54
54 54 54 48 57 42 42 30 32 32 39 39 48 57 57 57 57 57 57 48 48 48 59 59 48 43 43 43 43 48 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 47 47 47 47 43 43 36 29 25 34
33 36 36 39 32 32 20 20 28 32 25 25 25 32 32 28 28 28 40 40 43 43 39 39 43 47 37 59 39 35 24 28 15 20 15 26 21 23 23 14 14 11 15 11 17 11 19 15 20 20
23 23 37 37 39 39 34 26 23 14 14 18 25 19 17 17 28 28 40 41 30 31 24 14 14 16 23 22 22 32 32 39 37 41 41 40 30 29 17 17 17 26 30 28 22 22 25 27 24 28
20 18 18 13 12 9 9 9 10 17 13 11 11 11 17 15 17 15 14 20 20 11 12 11 15 12 12 15 23 22 15 9 9 9 9 9 12 12 7 11 19 13 10 10 11 11 12 19 13 13
11 12 11 11 10 10 12 11 12 17 12 15 8 7 6 6 8 8 8 7 6 6 8 8 9 11 11 13 20 23 19 13 9 9 10 15 14 17 12 10 6 6 8 8 11 11 13 15 17 10
10 9 9 9 9 10 19 11 11 13 11 11 8 8 7 7 7 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 11 12 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8 10 11 11
11 8 8 6 6 8 8 11 10 13 8 8 8 8 13 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 21 10 13 8 8 8 8 8 8 13 15 33 16 15 10 10 9 10 10 15 8 8 8 8 8
8 8 13 12 9 10 11 10 10 10 12 15 12 11 10 8 8 8 10 8 8 8 12 14 14 10 8 8 8 8 7 7 | Open.Hide.32 37 37 37 37 40 41 42 41 41 41 28 21 10 8 8 8 8 8 8 21 14 28 28 33 32 44 48 50 53 53 38 50 42 42 43 50 57 57 57 57 57 44 42 42 42 31 37 37 41
41 43 43 50 50 53 57 57 57 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50
57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59
59 57 57 43 57 39 44 27 33 19 19 20 20 23 38 44 43 52 52 52 52 52 52 57 57 52 52 52 52 57 52 54 54 54 57 57 57 57 54 54 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59
54 54 54 59 59 57 57 50 50 43 57 59 59 59 57 57 57 57 44 42 42 42 43 57 57 57 57 57 57 57 57 44 43 37 44 57 57 57 57 43 32 32 20 19 19 15 12 11 19 19
26 18 23 23 29 30 37 34 20 12 13 12 16 10 27 24 32 24 30 24 18 17 29 29 43 43 57 39 39 35 30 30 34 34 37 28 28 33 33 34 24 21 11 11 15 11 11 11 12 12
19 18 14 14 13 19 15 17 17 15 29 30 32 32 15 10 8 12 10 10 12 16 12 11 10 10 10 14 20 37 39 43 40 46 39 39 32 26 17 14 12 12 9 9 9 9 9 9 8 8
13 8 8 8 10 12 12 12 14 8 8 8 11 8 9 10 10 10 11 12 12 11 11 11 11 11 11 14 15 15 16 24 15 18 18 18 16 15 9 9 9 10 12 11 21 11 10 6 6 6
6 8 8 11 11 11 11 12 10 6 8 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 13 12 16 10 10 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 10
6 6 6 6 6 10 10 10 10 8 11 10 12 12 12 9 9 9 11 18 14 13 11 13 11 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 10 12 11 11 11 12 12 11 10 9 10 12
12 14 21 21 16 13 13 12 13 13 14 15 15 14 14 15 26 19 12 12 10 10 11 10 10 8 8 8 8 8 12 15 15 10 9 9 10 10 10 14 10 8 8 8 8 10 18 15 13 14
15 12 12 11 11 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 12 14 10 8 8 8 8 8 8 6 6 10 10 8 8 8 8 10 10 8 8 9 8 10 10 8 8 8 8 8
8 8 8 14 6 6 8 8 9 9 12 15 10 10 10 10 8 8 8 8 7 7 |