| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-399H16.T7 (MSMg01no399_h16.b1) | MSMg01-399H16.TJ (MSMg01no399_h16.g1) |
|---|
| ACC | AG499333 | AG499334 |
|---|
| length | 758 | 784 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 277 (48 - 324) | 334 (72 - 405) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no399_h16.b1 PHD_FILE: MSMg01no399_h16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:12:30 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no399_h16.g1 PHD_FILE: MSMg01no399_h16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:12:30 2005 |
|---|
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (30,779,986 - 30,780,258) | (30,929,485 - 30,929,818) |
|---|
| sequence | TATCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGC
GGAATTCACTCTGTGCCCCAGGCAGACCTTGAGCCTGTGATCCTCCTGCC
TCGGCTTCTCGAGAAGCTAGGATTATAGACCTATGCTTCAGACCCTTCGG
GAAGGTCTTTAAGTCTCACTTTATTTGAAAGGGGACATTGATGAGTGACA
CGGAGCAGCAGCACAGGAGTCACTTCATTTCATTTATTGATCCTTGTCTT
CTCGTTCATTTAACAGCTGGATCCGCTCACCAGCTTTTTTGAGAAAGGTG
GCTGTAAGACGCTGAAGTTTTTGTACCAGGAAGGAGAAGTGCCCGGTTTT
GGTAAGGATGTTTTATGAGGGGACCTCTGCTTGAAGTGAGCTGCTCGCCT
CTTTTTCCTTTCCACTTCCACAGGAAAACTTGATCAGAATTCTGTGCTTA
CTAATAATTTTTTTTTCGGAGGGCTGAAGCCTTCTTGTGCATGGTATGTT
TGCCTAAACTGGCTTACCTGCCTTTCCAACACTTGTCGACTTTAATACTT
TATACATCCTTTAAATCTCCATCTTAACAACACTCTGCCGTTCTGGAGAT
TTGCTCCCATTGTTACTTGCATTGATTGCTTTTCCTGACGCCTTGTAGTC
TCCTCCCCTCCCACTCCATGGTGTCGCCTTCTTCTTCTGTTCTGTCCACT
GGATGGCTCCCCTCTGCGCATGATCGTATTTCTGCCTTCCGGGCCTTTCT
CATTTCTA
| CGATGCAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTGGAGACGTTGAATTCATTTTATTCGTT
TTTTCCCCATTAAATTCAAGTCATCCCTCCAGGCTTAAGTAGGCACTCGA
TGTTCCATTTAAAGACTAAAACAATGGTAAATAAATGAATTCACACTGCG
GGGTTGGGGAGAGGCTTCAGCCATTAAATTGCTTGTCACAAAAGCACGAT
GAGTGAAGTCTGGTCAGATCCCATGAAAGATCCTGGGGGAGCCTGGCAAC
CACCTGTAACTGTAATTACAAACTCTGAAAGCAAGGTCAGGGTATCCCCG
GAGCATGCTGGAGAGGAGGCGAGTCATTGGGTGAGTTCCGAGAGATCTGC
CTCTGGTACCCCCCTGGGCGGCTGATGTAGAGCGAGTCCAGACATTAATC
TCAGGCTATACACACACAACCTCAGGTCTACATACACACATATACACTTA
AACACACATACATATAATACACCATCAATACTCACACATACACTCCTACT
TTTTTACTCTAACATACGCCTATCCTCCTTTATTTATACACTACCACTCA
CTTATACTTGCTCATATATCCCTTATACACCTTACTCCAATATACTCATG
TGTTACATTTTTACACCTCCTTATACTTATCTTCAACCTTCCTAAAAAAA
TGTATTTCTTATATTTATCTCCCCCTTCTCTTCTACTCATTCTCGTCCAT
CATTATATCTCCTTCCCTTCTCGCGCCCCACTTG
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 10 8 9 10 12 18 23 33 39 33 32 30 28 28 28 30 30 30 33 33 39 44 48 53 31 31 31 31 26 18 20 10 11 8 8 8 10 30 24 22 19 21 24 28 28 43 46
57 35 36 36 36 53 33 33 33 32 41 34 34 18 16 14 10 11 22 21 22 21 36 39 43 43 48 59 57 59 59 48 48 48 59 59 57 47 47 47 47 47 47 57 57 68 68 68 68 57
48 48 47 42 48 57 59 68 68 68 68 59 59 48 48 48 59 57 57 47 47 47 47 47 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 47 47 47 47 57 57 68 57 57 57 50 43
47 47 50 50 57 57 43 50 50 59 50 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 52 52 52 37 37 43 43 43 37 36 36 35 32 32 32 32 35 35 36 35 39
35 39 39 45 39 42 43 35 35 43 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 62 62 62 62 62 52 57 57 59 43
57 43 43 35 42 43 57 57 57 57 57 52 43 43 39 43 43 52 52 52 52 52 38 28 10 10 10 28 28 52 43 43 35 43 43 59 57 57 59 43 43 29 29 28 41 28 33 31 43 29
31 31 43 43 38 32 23 23 23 32 32 35 43 43 38 42 37 52 43 38 38 32 18 15 21 18 24 15 17 17 17 19 24 27 20 20 20 31 32 43 44 42 44 36 32 28 30 30 35 37
37 39 43 42 35 30 32 32 32 42 44 57 57 57 47 44 32 24 24 18 16 19 25 32 33 36 41 43 41 36 39 43 39 43 43 37 37 23 28 28 25 21 22 22 33 29 33 34 39 39
39 42 42 37 39 30 30 30 37 37 37 37 33 34 24 24 12 12 11 11 11 16 16 19 15 11 11 11 16 19 23 19 14 14 15 16 16 13 12 11 11 10 15 9 8 8 8 8 10 8
9 9 8 8 8 10 10 11 16 18 14 15 18 24 27 21 15 13 13 13 8 8 6 7 8 12 17 17 18 23 23 28 28 30 28 28 25 15 22 18 13 13 15 16 14 8 8 6 6 8
12 15 17 22 16 12 12 12 11 12 12 10 13 12 9 8 8 6 6 8 8 10 10 10 12 9 9 10 8 8 8 8 8 8 13 10 9 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 9 15 14
13 11 10 8 8 8 10 22 19 28 15 12 10 8 8 8 8 10 10 8 12 14 25 16 16 11 11 11 11 11 12 11 11 12 13 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8
8 10 8 8 10 11 8 12 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 10 10 11 9 9 9 9 11 11 17 22 15 12 12 10 10 9 9 12 13 10 8 10 8 8 8 10
10 8 8 8 8 8 8 12 12 10 10 10 8 8 8 8 6 6 8 6 10 9 8 8 8 8 8 10 12 11 11 14 16 15 16 9 10 10 10 16 10 10 8 11 10 8 7 7 7 8
8 10 10 12 12 9 10 12 12 9 8 12 9 8 8 9 8 8 8 8 9 10 11 10 9 9 10 10 12 12 9 12 12 12 14 10 10 10 10 10 10 10 10 13 8 8 8 13 19 23
18 18 10 10 10 10 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 8 10 10 10 9 17 12 9 9 12 22 30 47 40 41 43 32 28 28 28 28 37 37 23 21 8 8 6 6 6 6 6 8 9 13 18 17 25 28 39 27 25 11 12 11 26 26
50 47 34 27 12 12 9 9 9 9 9 17 22 28 24 21 28 33 33 38 36 43 43 37 37 44 44 57 57 57 50 57 50 50 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 68 57 57 57 44 43 44 59 59 59 54 54 54 57 57 50 50 50
50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 57 57 57 54 54 57 54 54 54 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57
52 57 59 52 52 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 52 52 57 57 62 62 62 62 62 62 57 57 57 52 52 52 43 43 35 39 39 43 43 57
57 52 45 45 45 57 52 52 57 57 44 43 35 35 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 37 37 52 52 50 44 38 35 35 43 47 57
57 57 57 57 57 57 54 54 52 57 38 38 20 27 27 44 26 21 12 12 12 24 32 44 59 59 59 57 57 57 48 44 44 24 24 11 11 11 24 25 44 44 47 47 57 59 57 44 44 24
24 20 19 20 14 14 14 24 32 37 43 28 28 23 28 31 36 36 28 25 25 29 30 35 35 35 33 37 41 35 35 32 32 28 28 28 40 43 43 37 34 25 25 28 28 32 28 28 23 23
23 28 32 19 15 8 8 8 10 11 16 14 17 13 12 12 12 18 25 28 20 21 12 25 22 28 23 32 21 16 10 10 10 10 10 11 28 28 28 13 13 13 18 18 28 28 20 20 20 23
22 21 11 9 8 10 8 12 12 22 32 20 18 17 18 28 30 12 13 18 18 26 25 25 21 21 16 16 19 16 15 16 13 15 12 12 12 17 11 11 11 19 12 11 11 11 11 11 11 11
11 12 12 12 12 19 14 15 15 12 11 11 15 23 12 13 13 8 8 8 11 11 6 6 6 7 10 8 8 10 10 11 11 11 12 18 11 11 11 13 7 8 7 10 8 8 11 11 11 8
8 9 10 8 8 10 9 9 12 17 23 19 13 10 8 8 8 7 8 8 8 8 8 10 8 10 8 13 11 12 12 12 10 17 10 12 10 19 12 12 10 13 8 8 8 8 10 15 8 8
8 8 8 8 9 13 9 9 10 12 10 10 10 12 12 16 11 11 11 11 12 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 9 9 9 13 21 12 8 8 8 8 12 10 10 10 8 8 8 8
6 6 6 8 8 12 10 11 12 12 11 8 8 8 8 11 16 21 18 8 8 8 8 8 6 9 11 14 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 15 12 9 8 6
6 8 6 8 8 8 10 16 19 15 8 8 8 8 7 7 7 8 8 8 8 10 10 9 10 15 9 9 9 9 9 10 10 9 9 11 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10
10 10 10 8 8 8 8 8 10 10 14 17 19 13 8 8 10 10 8 8 8 8 8 7 7 8 8 11 10 9 8 10 8 8 |
|---|
