BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-443K20.T7 (MSMg01no443_k20.b1) | MSMg01-443K20.TJ (MSMg01no443_k20.g1) |
ACC | AG533026 | AG533027 |
length | 694 | 754 |
length of high quality (start - end) | 254 (77 - 330) | 343 (78 - 420) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no443_k20.b1 PHD_FILE: MSMg01no443_k20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:11:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no443_k20.g1 PHD_FILE: MSMg01no443_k20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:11:21 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCCATTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCCAAAT
CCGCGGAATTCACAGGTGTGTTACACCAAACCTGTCTGTCGGTCCTCCTT
TATGTGTGTGTGGGCATGCATGTGAGTGTGTACATGTGCGTGCAGGCACT
GCTAGTACCACTGTCTTAAGTACGCTGGGACAAGGAACCATGAGCAAAAA
GCCAGGCAGCAATGGGTTAAAGCTGCAGCCCTCCAGCAGCCCAAGGGCTG
CCTCTGCCAGCTTACCATTGCTACTTTGAACCACAAACAGCATGCAGGTC
TCGATACAGTCCACTCACTCACTGTCACATCTGTGGCTTTGGCTGGGGCT
GAGGGCATCCCCAGGGTATCCCCACTTAACCCTATCACTTGGCTAATTCT
GACTAGTCTCCCCATCTTCCAGGTTGACGGCTGCTAGTGATGGTGCCTTA
ACACCATCCCAGAATAAAATGTTCAAGGGGCTGGCAAATCTCCCCCCAGA
AATTTGCTTAGGGCCCATAACCTAATTAAACAACCGGTATGACCCCCAGG
GTATTGTTTTCCAATGGGGTGGGCCTAGATGGGGTACCGCGCCGGCCCCC
GCGGGCCAAGGGCCCCTATCCCATTGGCAACAACTTTGGCCAATAAAAAA
TAACTTTCGGAGTGTGGCCCTCGTTTTTCTCTCTCTTTGTTCCN
| NNCCCATGATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAACCCAGGTCCTCTGGAAGAACA
ACAGCCAGTGTTCTTAACCACAGAGCCAGCTCTCCAGCCCCATAGTATTT
ATTTTATTCTCAATTATGTGTATGTGTTGTATGAGTATGTGCATGTGATG
CCAAAGGTCAGATATGGAGTTCCAGGTGGATGTGGGAGCTGGGAACTAAA
GGCTGGGTCCAAGCCGGGCAGTGGTAGCACACGCCTTTAATCCCAGCACT
AGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGATTTCTAGGCCAGCCTGGTCTAT
AGAGTGAGTTACAACAGCCAGAGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCTNAAA
AAAAAAAACCAAAAAATATTAAATAACAAAATAAAGGCTAGGTCCTCTGC
AAGAGCAGTATGTGGTCTTAACCGCTGAGCCGTCCCTCCACCTTTCCGTT
TGCCTTTTTTAATAAGGCACTTATCACGCTTGATTTAGTAAACCCAATGG
CTAGGGAATTTATCTTCTCACGCTTACCCAGAAAATTTTCAAATATTCTT
AGTCTCCAGTCTGGGTTTAGAAGCTCCAATTTACTTTTCTTGGTTTTAAA
TTTTGGGGGAGAGAATTACAATGAATTCCAGGGCCGCCCGGGGCTATGTC
CCGTTTCTTCATGTTAACCTGGCCTTACGCAGTAAGAACTCTGCCTTATA
AAAA
|
quality values | Open.Hide. 7 7 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 12 17 23 37 37 37 32 30 30 37 37 37 32 31 32 37 37 37 37 28 28 28 28 28 30 29 27 9 9 6 7 7 9 9 7 10 8 8
9 11 16 18 13 22 22 28 28 28 29 33 33 33 47 44 29 23 9 9 9 9 9 9 9 9 18 18 37 33 36 33 37 37 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 53
53 53 53 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 54 54 42 43 37 30 30 30 38 33 28 28 28 30 40 42 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 54 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 50 57 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 54 59 59 57 57 57
57 57 57 57 59 59 59 59 48 48 50 57 57 50 48 48 59 59 59 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 48 48 48 54 59 59 59 54 48 48 57 57 68 59 59
57 68 57 57 57 54 48 48 48 48 48 48 57 54 54 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 57 59 57 57 57 48 48 48 48 57 48 53 50 50 59 59 59 59 59 44 44 41 41 44 44
47 41 42 50 50 42 47 44 41 39 37 32 37 37 37 41 42 50 50 50 50 50 50 41 25 23 12 11 12 9 9 9 19 11 9 9 11 13 23 27 25 27 30 30 22 22 22 27 25 19
17 9 9 9 12 15 25 37 37 37 37 21 19 10 10 10 15 19 25 30 32 28 23 23 18 19 13 10 10 11 19 24 30 28 36 34 37 37 36 25 24 18 25 22 24 19 27 20 23 23
33 31 24 24 26 26 31 22 24 26 28 28 28 28 22 21 21 18 13 12 12 10 12 13 16 17 17 13 12 11 19 20 24 18 13 8 8 8 8 8 13 11 10 10 10 13 10 14 14 13
12 21 22 19 13 13 10 11 11 10 8 8 8 8 8 9 11 9 9 10 12 10 16 13 14 14 15 15 14 19 14 10 10 8 8 8 8 9 8 6 6 7 8 8 10 9 9 12 10 8
8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 15 12 13 9 9 9 10 9 8 8 12 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 9 9 10 9 9 14
12 11 11 13 12 8 8 8 13 14 10 9 10 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 11 10 10 9 9 9 9 9 8 7 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 13
8 8 8 8 8 12 10 8 10 10 10 10 10 10 11 11 10 9 11 11 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 13 12 8 8 8 8 8 8 7 7 8 7 6 7 6
6 6 6 11 11 13 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 16 19 10 10 9 9 10 10 12 8 6 6 6 6 6 9 9 10 13 10 10 10 10 9 3 0 | Open.Hide. 0 0 3 7 7 7 8 8 8 8 8 6 7 9 6 8 11 13 11 22 33 24 24 9 7 7 3 0 3 19 18 32 37 25 25 9 9 9 9 10 9 10 10 13 16 19 21 12 19 19
23 12 11 11 21 21 50 50 50 50 47 28 23 10 13 8 8 8 10 11 9 9 15 16 17 27 24 28 37 37 41 47 47 47 47 59 59 59 59 59 59 59 48 48 50 50 50 53 50 50
50 47 50 50 50 50 50 54 54 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 42 39 35 35 35 42 39 44 44 47 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 50 50 50 50 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 59 68 59 59 57 57 54 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 57 57 52 57 52 57 57 57 57 57 57 57 59 57 54 57 57 57 57 57 57 59 59
59 57 57 57 59 44 44 32 42 35 42 42 43 57 57 59 57 59 59 59 59 59 68 59 57 48 48 48 48 57 57 57 59 59 59 57 57 54 54 54 57 59 59 57 54 54 59 59 43 41
30 30 43 43 50 48 48 48 47 47 39 39 39 47 47 48 48 48 43 43 43 30 30 28 28 13 12 12 13 19 15 15 15 16 16 29 30 43 46 46 59 48 59 48 48 48 48 47 47 47
35 35 37 39 43 46 48 47 59 47 43 43 47 43 48 57 42 42 35 35 35 35 32 39 30 39 33 34 30 32 32 39 39 39 47 37 37 37 34 34 28 28 11 15 8 3 0 3 19 23
41 47 47 47 47 47 15 13 8 8 8 12 22 37 41 34 25 12 11 11 12 22 24 23 8 8 8 8 23 15 28 23 20 20 18 19 25 25 35 37 37 39 28 28 25 25 24 24 13 21
28 21 24 12 11 11 12 12 13 19 26 28 28 28 24 28 37 39 39 32 28 28 28 35 37 30 27 19 16 16 20 25 30 24 30 26 26 26 17 17 17 24 24 31 32 28 24 20 20 29
32 20 22 22 28 34 39 39 39 31 21 18 16 16 15 15 14 17 15 20 18 16 24 15 11 8 8 8 10 12 31 28 30 33 17 15 9 9 10 19 22 25 19 24 22 28 28 26 15 10
10 10 15 11 15 18 14 22 23 34 32 23 19 12 10 10 9 9 9 9 9 14 14 9 9 9 12 16 12 10 10 9 11 11 9 8 8 8 8 10 10 12 10 10 10 10 8 10 8 8
7 8 11 11 11 11 12 16 13 13 12 12 12 11 11 22 19 21 12 13 17 11 11 11 9 8 8 8 8 9 11 10 8 10 10 16 17 8 8 8 8 6 8 8 10 15 8 8 8 8
9 10 15 15 13 11 13 15 11 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 9 9 9 8 9 9 9 9 9 15 12 8 8 8 13 8 9 12 13 12 14 12 10 6 6 6 6 8
8 9 9 10 15 9 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 6 8 10 10 10 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 12 12 12 8 6 8
8 10 10 10 |