BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-474A17.T7 (MSMg01no474_a17.b1) | MSMg01-474A17.TJ (MSMg01no474_a17.g1) |
ACC | AG556199 | AG556200 |
length | 727 | 714 |
length of high quality (start - end) | 508 (75 - 582) | 507 (73 - 579) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no474_a17.b1 PHD_FILE: MSMg01no474_a17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:52:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no474_a17.g1 PHD_FILE: MSMg01no474_a17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:52:21 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTGATCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCAGAGGATCCGC
GGAATTCCTTATGTTCCATGAATTATCAGCCTAGTTTACTTGACCAGTAC
CAGGAAAATGAAATAGTTTACAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAGTTGC
AAGGAGTGATGCACATACCTTTAATCCCAGCATGTGAGAGGCAGAAGCAA
GTGGATCTCTGTGAGTTTGCGGCAAGCCTGGTCTACATAGTTTATTCCAG
GATAGCCTGGTCTACATGGTGAAATCCTGCTTCAGGGGAAACACACACAC
ACACACACACACACACATTTTTTTACACACACACACACAGAGAGCTCAGG
AGATGTTCAGTGTCTGTGAGGGCTGTGCATAAGGACCACATGAGCTCATC
AAAAAGGCTGGATGTGATGCTGCAGGCCTCGCATACCAGTGCTGAGGGCA
GAGACACAAGGGTCCCTAGGGCTTGCTGCCAACCAGCTTAGTTCAAGGTT
GAGTGAGAGACCCTGTGCTGAAAGGATATGGACAGTAGAGAGAGAGAGAT
GGGGTAGGACATCTGACTCTTCTCTTCGGGCTTGGCTCGCGTGTGCGCGC
GCACACACACACACACACACAGGTGAGGTCAAGGTAGGCGCCGGTTTATA
ATTAAATCTAACTCACCATCTCTATCTTTTCACTTTCCAACTCTCTCTCC
ACCTCGTCTCACCTTTTTTATCTCTTG
| NNCCGATGATAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXTTTCCCGCGGAATTCCTCCTTAGCATGCCTGAGACCCCTG
GGTTCCATTTTCATCCCATAACCAAAAAAATCAACCAACCTGTACAGGAC
TAGTTTTGTAGAAAGATACATGTAGGCTTGTAGTCAGAGTGTAATCAGAA
CACCTGCTTAGATTAAACCTGTGCGGTATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAT
ACGGACAAAGACCTGTGCAGAATCTCGCCCAGCTTAACGGAAGGCCTTAT
GTCCACACTGAATATTTTTCGTATGAGGTCCACCTGCCAGGGAAGTGTCT
GTGAGGAAGCATGGATTTGGGGCGTCTGTGCAGAAGTAGTGATGTCCCAC
GGCACCCACACAGAAACTCTTATGCATGGAAACATCTGGTAGCTGGTAGA
GGGAGTGGGTGGGACTTTCACCTGTTCACCACAGATGTATGGGCACAGCC
TGGGTGGGGACCGCATGACCTCTGGATGTATCTTTGGGTAAAAGGTGGTC
ATGCACCGGATATGATGGCACGTGATTGCCGTCCCAGCAACTGGGATTCC
GAAGCAGGCGAACTGCTGCACATTCAAGGCCAGCGAGGCTACATAGACCT
TGGCTCAAAAAGACAATACCCACAATAGCCTTATAGCTGCAGTTGGAGTT
CTGTGGCTAGTTTA
|
quality values | Open.Hide. 8 13 8 7 7 10 10 9 16 12 13 12 23 11 11 11 25 12 12 10 9 9 9 12 9 19 8 11 12 11 18 15 15 8 8 8 11 8 8 8 8 8 12 12 13 12 15 20 22 27
30 22 21 17 25 32 30 43 44 25 17 9 9 7 9 9 9 9 9 8 8 10 8 12 15 25 23 37 37 39 48 50 53 59 59 59 59 59 59 57 57 57 47 40 36 37 42 42 42 42
37 36 36 40 57 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 43 48 28 27 12 12 11 12 11 18 25 36 44 59 47 47 47 48 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 68
68 68 68 50 51 51 50 50 50 50 50 50 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 39
37 37 39 42 42 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 48 48 43 43 43 57 57 54 50 53 57 57 57 59 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 53 53 50 50 50 41 41 30 25 12 12 9 9 9 9 8 8 10 10 15 21 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 57 57 59 59 48 48 57
48 48 54 54 54 57 57 48 48 46 46 46 48 43 46 43 43 43 44 44 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47
43 43 59 59 57 57 57 59 54 54 54 54 57 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 57 57 44 57 57 48 57 48 59 48 57 57 57 57 44
43 39 43 43 59 59 57 57 44 44 40 40 44 42 44 39 39 32 44 44 57 57 59 59 48 48 48 48 48 48 48 48 47 47 48 48 57 43 43 35 35 30 43 40 43 42 42 39 43 43
57 57 57 57 47 43 39 36 39 37 37 37 33 37 32 32 37 37 41 41 37 37 41 43 41 41 39 39 39 36 36 37 37 39 23 27 14 14 14 28 25 39 33 43 43 43 43 43 43 39
37 30 28 41 23 28 28 43 39 34 34 33 33 37 39 39 48 48 59 41 39 30 30 30 30 30 31 31 22 16 12 10 10 10 10 18 15 15 10 11 10 19 8 8 8 17 22 37 34 26
23 14 14 15 24 22 22 13 15 15 19 25 26 22 22 11 11 11 11 11 11 6 6 6 6 10 7 7 6 8 6 9 8 8 8 8 8 11 11 8 8 7 6 6 8 17 13 10 10 9
9 9 14 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9
9 9 9 9 9 7 8 15 13 8 8 8 10 10 8 8 10 15 12 12 8 8 8 8 8 8 6 | Open.Hide. 0 0 3 7 7 12 15 10 8 8 8 8 17 3 0 3 13 21 26 36 35 37 37 39 39 39 37 32 32 41 23 16 11 11 8 12 6 6 6 6 6 6 8 10 16 14 12 15 27 23
11 11 10 21 21 37 26 21 12 9 11 12 11 11 12 13 15 15 11 9 9 12 16 23 23 47 47 50 50 59 59 53 47 50 50 53 53 59 57 53 53 53 53 53 57 57 57 57 57 57
68 68 59 42 42 41 41 41 42 42 51 42 42 28 36 36 31 37 42 41 41 41 42 48 50 51 59 57 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48 57 32 48 36 30 30 35 44 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 44 41 24 15 10 10
10 15 23 40 59 57 59 59 59 57 57 59 48 48 47 47 39 44 37 39 39 47 47 48 48 48 48 48 59 59 43 43 36 36 43 39 57 57 48 48 48 59 59 48 48 48 59 57 57 57
48 48 48 48 48 41 41 37 37 23 21 10 9 9 10 10 11 10 10 10 10 15 28 28 59 37 59 48 48 48 47 47 48 48 57 48 43 57 57 53 50 57 57 57 48 48 48 54 54 59
54 54 48 48 48 43 46 43 48 43 46 46 47 47 54 54 54 57 59 59 54 48 48 57 57 54 57 54 54 44 44 33 33 33 44 42 43 47 44 44 44 57 57 57 57 59 59 59 59 59
57 59 48 48 50 59 57 57 57 57 57 48 48 48 59 50 52 52 57 57 57 52 50 50 43 52 52 52 59 59 59 59 52 52 52 57 50 52 44 59 50 35 35 50 50 38 38 17 17 17
41 38 44 44 44 43 43 44 42 43 44 43 43 43 57 57 57 57 48 48 48 48 57 54 57 57 43 43 43 47 44 46 43 43 43 43 43 48 47 37 44 32 31 20 28 28 44 44 47 43
46 43 47 43 48 48 48 41 41 41 48 48 54 48 48 48 48 48 48 48 48 43 43 43 48 48 57 48 48 48 48 48 57 59 32 32 20 32 32 41 47 47 36 34 28 28 24 28 34 20
28 24 24 17 19 19 34 32 24 24 21 21 28 30 26 31 25 32 22 22 24 34 28 32 28 28 28 19 18 18 19 19 24 25 26 21 14 14 14 26 26 30 19 15 15 15 23 21 30 23
19 21 13 12 12 16 11 11 11 16 12 17 21 21 17 17 15 16 13 17 17 28 24 27 17 17 17 24 24 33 34 28 24 24 23 19 17 11 11 11 11 10 11 11 11 10 10 13 17 14
18 20 24 25 24 24 24 19 19 10 10 12 14 11 8 8 12 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 10 10 13 10 10 9 9 9 9 12 10 12 9 9 9 10 14 17 19 11 12
12 14 9 9 10 12 12 12 15 18 16 11 12 12 |