BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-480D07.T7 (MSMg01no480_d07.b1) | MSMg01-480D07.TJ (MSMg01no480_d07.g1) |
ACC | AG560902 | AG560903 |
length | 729 | 732 |
length of high quality (start - end) | 600 (48 - 647) | 655 (78 - 732) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no480_d07.b1 PHD_FILE: MSMg01no480_d07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:00:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no480_d07.g1 PHD_FILE: MSMg01no480_d07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:00:26 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ACCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCAGAGGATCCGCG
GAATTCTTGGTCTTGCTGGGTTCTGCAGACTTTGGATACCTGGGTTTGCA
ACACTGGCTGCCCCCTGTATCCTCTGACTAAAGAAAGTGGAGAATTTAAA
TGAACATCAGAACATCAGAAAGCATTTGAGGATATTAAGGAGGCCCTGTT
GACTGTGCTGGCCTTGGCACTGCCAGATTTAACCAAGCCCTTCACCCTTT
AGGTTGATGAAAGGGTGGGAGTGGCCAGAGGGTTATTACTCAGACTCTGG
GGCCTTGGAAGAGGCCTGTGGCACATCTGTCTAAAAAGCTGGACCCAGTG
GCCAGCACATGGCCCACATGTCTGAAGGCCATTGCTGCGGTAATCTTGCT
TGTTAAGGCTGCCAACAAGTTAACTTTGGGACAACAAATAACTGTGGTGG
CCCCCCACTCTCTTGAAAGCATTATCCGCCAGCCCCCAGACCGATGGATG
ACCCATGCCCAAATGACTCACTATCAGAGTCTGTTGCTGACTGAGCAGAT
AACATTTGCTCCTCCTGCTATCCTCAATCCTGCTACCCTCCTACCTGAGA
CACAAGACTCGTTGCCCGTCCACTGCTGCACTGATATCCTTGTGGAAGAA
ACAGGGGTCCGGAGTGATCTGCATGATCAGCCATGGNCAGGCGTTCCAAA
CTGGTATACAGCAGCTTTTTGCTGGAGGG
| NGCAATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATCTTAAAAGGCACTTATAATA
GGGTAATACTAAAAGAGAGCACATGGATCCATACACTAGACTAACGTGGG
AATGGAAAATTAATGTATGGGTTAGAGAGCACATACTGTGCTGGATTCTG
CTGGCAATGAAGGACAAATGAACAAAAATTCACAATTGAAAGTACAATGA
CTAAAGGGCACATACCATTTTTGCACCATAACGTGGGTGAGGATTTGTAA
GTCGAACCCTATTAAGTTGGTTTTTGTATGGATGCAAATCCAATACTTCA
TTTATCTCTGGAGCCACATAGTAATAAATTATTGCTATACAGACATTTGC
TAGATTATTTCAGGGTTCTGTTCTAAGAAGCACAATCTGAACACCCTCTT
CCCTTTATCCCTCATCTCAAGACCTCTCAAGAGTTAAGCTCAAGTGAGAG
AGTGAGGGAGAAGCACACAAAACTTTGCCCCTGAGTCCAGAGTACAGAGA
CAGACAGAGTCTTCACAAGGAAAGCAGAGATAGACAATTTACTGTACATA
CTCAGGTAAGCTTCAGACTGAGCAGATCTCATGTTCTTTTACAGCAGGAG
GACAGAGTCAAGAGAGCCAGAACAGGAGACAAGGAATTCTTGCCATGTAA
GTGCAGAACCAAAGAAGAGAGAGAGGAAAAAA
|
quality values | Open.Hide. 7 7 8 8 8 9 14 17 37 39 41 37 37 37 37 37 37 37 32 32 28 32 32 33 41 46 30 28 24 22 20 22 23 11 9 10 10 8 7 7 11 10 10 10 10 10 10 12 27 28
31 31 36 31 33 33 59 47 33 23 12 11 12 8 7 7 7 7 13 20 31 35 37 33 30 33 33 37 37 44 57 57 57 38 42 37 42 47 47 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68
68 68 68 68 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 57 51 51
51 50 50 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 43 43 43 35 31 31 39 43 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 47 57 57 48 48 57 59 59 59 59 59 50 43 43 39 39 40 34 34 30 34
29 36 39 39 39 47 59 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 50 50 50 50 50 46 47 39 44 44 44 37 39 44 59 59 59 44 44 37 37 43 43 31 28 28
34 37 37 37 40 40 40 39 37 37 32 27 27 32 27 31 43 43 41 35 31 37 41 41 41 41 40 40 43 47 46 41 43 37 37 37 32 27 28 31 31 32 32 26 23 19 8 6 6 9
8 14 17 22 22 23 28 28 26 31 28 28 30 30 30 33 37 37 37 37 43 39 39 34 34 28 26 22 24 24 30 26 33 18 17 3 0 3 23 17 31 37 37 32 24 26 18 18 18 22
24 30 25 18 24 15 26 26 28 28 28 30 30 30 30 32 32 43 36 31 32 36 32 16 13 9 9 9 9 | Open.Hide. 0 3 9 13 12 13 15 8 8 8 13 15 37 41 41 41 41 37 37 43 39 39 37 37 37 37 48 41 50 47 47 25 27 9 9 9 9 10 9 9 9 9 13 13 11 12 12 15 30 27
33 36 36 33 33 33 50 47 47 30 25 16 9 9 9 10 9 9 10 10 9 8 9 13 15 21 19 18 22 28 37 43 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 53 53 53
53 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 37 43 43 43 42 32 32 32 41 41 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 48
48 46 46 46 48 57 48 48 46 46 46 48 50 50 50 50 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 47 42 35 35 35 42 42 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 48 53 53 53 53 59 59 59 59
59 59 59 57 57 57 57 57 53 59 59 59 59 59 59 30 27 13 10 10 10 10 11 16 21 18 23 32 32 47 48 50 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 57 57 57 48 57 57 59 57 57 54 54 54 54 54 68 68 68 68 59 59 57 48 48 48 48 48 57 57 57 57 59 59 59 59 57 48 48 59 59 59
43 43 43 43 43 48 48 59 59 46 48 39 39 30 30 31 37 35 37 37 44 44 44 41 41 41 41 48 41 41 41 41 37 37 30 25 25 34 59 47 47 47 59 46 43 43 46 46 46 41
59 59 37 35 31 31 39 39 41 37 37 37 37 37 24 28 23 34 34 37 32 35 35 30 30 17 30 30 39 39 41 41 41 37 37 41 37 37 43 37 37 30 30 21 26 28 31 25 35 24
29 34 32 28 32 30 31 34 28 24 24 34 34 37 37 34 31 24 28 28 31 34 41 32 29 29 30 26 19 24 19 18 19 25 22 22 25 32 36 31 32 32 28 18 20 20 31 26 31 31
35 32 32 23 23 28 20 18 18 10 10 10 27 27 37 31 37 36 36 36 34 34 32 28 25 24 24 24 28 30 28 24 |