BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-489A12.T7 (MSMg01no489_a12.b1) | MSMg01-489A12.TJ (MSMg01no489_a12.g1) |
ACC | AG567613 | AG567614 |
length | 729 | 1,844 |
length of high quality (start - end) | 633 (79 - 711) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no489_a12.b1 PHD_FILE: MSMg01no489_a12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:12:07 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no489_a12.g1 PHD_FILE: MSMg01no489_a12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:12:07 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TTTTTNNTTGCTTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXCGCGGAATTCTTATTTTCCTTATTTGAATTCTTTGCTTAGTACAT
TCTTTGACATATACTCTCACATAAGCCTATGATTGCAATATTTGAAAATC
ATGTCACTTTGATGTCTCCATATTTTCATTTGTCTATATCTATATGTGGG
AACCTATATGTGGGAACAGAACACTGGTTGTACTATTGTTAATCTGTATT
CTTGCAGTGTTTGGGTTTGTAATAATCAAGTGAGCTATGCTCAGAACACA
CATGAGATTTCTTTAATAATCTCTAAATACATCTCTACCTCAATGGCTAC
ATTTTCAGCATATATGTTCTTTTCCATGAGAATTATTATTCCTCACCATT
ACAATAAAGAATATTAACTGTAAATTTCATAACTATGCAATATGAAATAT
CACTTAAGATCTTTCAGCAATCTGTAGGTTGCCATGTTGTCTTATTGACA
GTGCCCTTTGCCTTACAGAGATGCACAGTTTCATGAGGTTCCAATTTGTC
AATTGTGATCTTAGAGCTTGAGACACTAGTATTTTGTTTAGGAAAGATTC
TCCTCTGCCCATGTGTTACAGGCTTTTCCCCACTTAATCTGCTATTATTT
TCAGTGTATCTCCTGTTACTTGGAGGTCCTTGATCCACTTGGACCTCAGC
TTTGTACAAAGAGATAAGAATTCATCAGN
| TTCCTCTGTGCTTTTTCGAGTAACCTANCAGTACCCTTNNCAACGACTGA
GCACAGGGATCANANGACGAACACTCTCTCTCGTCCTCCTCCACATCAGA
GGACGGGNGTCTGCGCGTCGCCCGCGGTGTTCTTGCTCATCTCTCTCGTT
GTCGCCAGTCGTGTGTGAGTAATGTGTGTCAGTGCGTAGTAGCTCGAGCA
GGATTGCGCGTAGCACAGACACGCAGGTCAGACGTACTTACGTATTGTGT
GTTATACCGTGGTTGTCGCGGCGCTCGCGCGCCCTGCGATAGTANTTATC
CTCACGAACACGTCGTCGCATACTATAGCTCTNCTGNTGTTNCTGATATC
ACCACGCTGCACGTCCGCCGCCGCGCGCAGTCATCGATGTTGTGTGTATG
TGTGNCGATATATNTATTACNCANTTATAAGTGTATTAATGTGCGTCGTC
ACTAGATGTATATNGATTATGCGCGGACTAAAATAGATCAATACATATAG
GATATGTATATGTGGTGAGACACTCAGATANAGAATNTGTAGTAGTGATA
CGTGATTGTGATTATANCTAAAGTACGTAGGTAAGGTGAATCGAAGCATG
TATAATATATGGTTCGACGAGATACTAATGACACACATAACACGGATGCC
ACCGGTAGAGATATAGCACAGTCGACGAGTGNATNACATGATAGAGAGAT
ACNAGTTATAGANCAGCTTACNGTACCTCCTGACGGTACACGACGAGAAC
GNACGTAATAGTGTTGAGCAGCGGACGTCGATGACTATAAANATTTTGAC
TACGTCGACCCCGCTCGTCGTGCACGCGTAGTCTATTTATTTCTCTAATT
ACCGTCGCGTACGTCCGCGTATATTCTGTTTGCGTCTCNGCTGACTGTGT
CAGAGCGTCGATCAGCTCGTGTCGGTGTGTGTANATAGATAGGACGGCGC
GTCGTATGCTGTGCTCTGTCNGCGACGCGCGTTTATCGCGACGCTGCTCT
GCGCGTCGAGGGTACGCGTCTTTNTTTATGATATTTNTCTACACGANANG
ATAGCACGACGCCGCTACGCGTGCGCGCGTATCGAGTCGAGTATATATAA
CATGTATCAGATGACGTACGACTGGACGTATCTGTGATCTTCGGAATGAC
GCACGAGCGTACTCGTATGAGTGTATCGCACATCTGATAATAATATTATC
GCATACTAATCGTATCGCGGACACAATTATGGTACACAACACAGATACGA
TTGGCATACATGGAGTATACCTAGACAGATAATATCATATGATATCATCG
CTCATCACATCGTTGAACACGTATGTGTGGCTGTCAATATATGCGTGATG
ACTCAGACTGACTGAANATAGCAGATACGGACGCGTGTCATCGTCGTCAC
ACGCACTGCTGTCTTGCGTTGTGTCGAATATGTGCNTCGCGAGCGTGTAT
GCTCACGGCAGTNGTTGTGCACTAGTACGGGAGTCGTCGCCCGCTATACG
CATGATTCTCTNTACTCTGATACGACATCGGACCGCATGCGTGATGACAT
ATAGAGTGTGTCGTATGCCGAGCAGTCTGAAATATATANCGACTACTACG
TAGACGAGANCGTCGTGCATGTCTNGNGTCTGCAGTGATCTCATACTGTG
CTGCTGCGNTCAGANTGATACAGTAGCGACGCACATATATTATACATCGC
GCCGCTGCGACTGACTTGCACGACGGTCTGTANTTTNGTCCACGCTAGNC
AGCTCGANTATATGACGATCGCGCGGNCGTGCTGTNCANGATACATTTNG
ATACGCATAGTCGTGTGGCGCGGTGTGACTAGTCTGGCACNAGN
|
quality values | Open.Hide.10 12 9 13 3 0 0 3 7 6 6 6 8 8 8 11 12 13 13 23 26 30 30 25 22 22 30 32 28 15 17 21 28 28 36 24 18 20 15 15 7 7 7 10 8 6 6 6 8 9
10 10 15 10 10 10 18 26 34 31 31 31 28 31 31 47 25 23 13 13 14 8 11 9 9 9 12 18 25 25 22 24 33 37 47 47 59 59 59 59 57 57 57 57 57 50 50 50 47 47
47 57 57 68 68 51 51 50 50 68 47 68 68 68 68 51 51 50 68 68 68 53 53 57 57 57 57 57 68 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 47 47 43 47 47 57 68 57 57 57
57 53 57 57 53 53 50 57 57 57 59 57 57 57 53 53 50 50 50 59 59 32 30 18 14 14 14 12 24 19 34 36 41 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57
57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 59 57 54 54 54 57 57 54 54 54 54 54 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 54 57 57 57 57 48 59 48 48 48 59 59 59 57 57 48 48 50 57 57 57 57 48 57 48 59 59 59 59 59 47 47 47 43 41 32 32 36 36 39 39 36 39 39 41
47 47 59 59 59 59 41 32 32 41 41 41 41 47 41 41 41 41 41 41 37 37 41 43 59 41 47 50 41 44 43 43 43 57 59 59 48 48 48 48 41 41 40 39 39 39 32 28 28 39
34 34 28 28 34 28 32 32 47 37 41 32 29 34 28 24 24 33 33 31 31 30 29 25 22 20 31 26 31 31 31 39 36 28 24 24 28 28 30 29 24 24 28 24 22 23 24 20 20 32
28 30 33 31 30 25 25 19 21 19 24 13 18 13 16 13 12 12 12 16 16 19 16 16 15 18 11 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 8 10 6 6 6 6 8 8 6 7 7 7 6 6 6 7 8 8 10 10 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 10 10 13 15 3 0 0 3 11 8 8 6 7 8 8 8 6
6 6 6 6 6 7 7 7 7 6 6 3 0 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 6 7 6 7 7 6 6 6 6 8 6
9 9 8 8 8 8 3 0 3 7 7 7 8 8 8 11 11 11 12 10 6 6 6 6 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 11 7 8 7 7 6 6 6 6 6
6 10 12 10 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 9 9 9 9 10 10 10 8 6 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 11 11 11 11 12 16 12 11 11 8 8 6 6
6 8 10 10 8 8 8 10 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 12 8 8 6 6 6 6 9 9 6 6 6 6 8 6 10 10 6 8 6 6 6 6 6 6 7 11 9 9 9
8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 7 6 6 10 10 10 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8
9 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 12 10 10 10 10 9 10 8 8 8 8 10 10 12 3 0 3 8 3 0 3 10 10 3 0 3 8 10 10 10 10 6 6
6 6 6 8 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 11 13 9 9 10 8 9 7 7 6 6 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 9 10 10 10 9 10
8 8 8 3 0 3 9 9 9 9 12 18 3 0 3 8 8 8 8 3 0 3 3 0 3 9 8 8 8 8 8 8 8 10 7 7 6 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8
8 8 8 8 11 10 10 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 10 8 8 8 6 9 9 10 10 10 11 9 9 9 8 8 6 6 6 6 6 8 9 10 10 12 16 18 10 8 8 8
8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 11 11 6 6 6 6 6 6 3 0 3 11 11 10 3 0 3 8 8 8 7 6 6 6 8 8 9 6 6
6 6 6 6 8 8 12 10 10 10 9 8 9 10 9 3 0 3 10 10 8 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 10 8
9 9 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 10 11 9 6 7 6 6 8 8 10 10 8 8 6 6 7 6 6 6 6 6
8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 12 10 9 9 8 6 6 6 6 6 7 9 6 6 6 6 6 3 0 3 3 0 3 6 6 6 8 6 8 8 8 6 6 6 9 9 13
10 3 0 3 10 10 11 10 10 10 10 3 0 3 6 6 6 6 8 8 3 0 3 8 10 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 11
3 0 3 9 9 9 10 10 9 9 6 8 8 8 8 6 7 9 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 7 9
9 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 8 6 6 6 8 8 9 9 10 7 9 9 9 7 7 6 6 9 12 6 7 6 6 6
6 8 6 6 6 8 8 18 13 11 11 11 11 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 10 6 6 6 6 6 7 6 6 8 9 8 7 7 3 0 3 9 9 9 9 11 9 9 9 8 6
6 6 6 8 6 10 11 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 10 11 11 9 9 9 3 0 3 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 12 12
10 10 10 10 9 8 10 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 3 0 3 8 6 6 6 6 6 7 6 9 9 8 8 10 8 6 8 7 7 7 7 10 11 10 10 10 8 8 6
6 6 6 8 6 6 7 8 8 9 7 8 8 9 10 8 8 7 7 6 7 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 3 0 3 6 8 8 13 10 9 9 3 0 3 0 3
6 6 6 6 6 8 6 6 6 11 10 10 10 8 8 7 7 10 10 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 8 9 9 11 11 10 10 8 6 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10
9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 7 8 9 6 7 6 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 10 11 9 9 8 8 8 8 9 6 6 7 7 12 12 15 14 13
12 8 8 6 6 8 8 10 10 6 6 6 8 8 8 8 9 8 10 10 8 8 8 8 8 8 12 13 10 9 9 12 9 8 10 8 8 8 10 13 11 15 14 14 11 10 9 9 8 9
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 10 12 10 6 6 6 6 6 8 6 8 10 8 8 8 9 9 9 9 11 11 11 11 10 9 9 8 8 8 8
6 7 7 6 6 6 8 9 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 8 6 10 10 9 9 6 6 6 6 10 6 9 7 6 6 6 6 6 8 6 6
6 6 6 9 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 13 6 8 8 8 8 9 8 11 8 9 6 7 8 6 6 12 7
6 6 6 6 8 8 9 7 8 6 7 9 7 8 8 3 0 3 10 10 9 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 9 10 8 8 6 6 6 6 6 8 8 10 10 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 8 7 10 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 7 7 7 7 7 8 10 11 9 9 9 3 0 3 6 6 8 6 7 8 6 6 6 7 6 6 8
8 10 9 8 8 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 9 9 8 10 8 10 8
8 9 9 12 11 10 12 10 9 9 3 0 3 6 6 8 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 13 10 12 10 10 11 12 12 11 10 15
9 9 7 8 8 9 8 6 6 6 6 8 6 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 9 9 3 0 3 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8
8 8 8 10 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 9 8 8 8 6 6 6 6 8 3 0 3 0 3 6 8 8 6 7 6 8 6 6 6 6 6 6 8 6 8 6 6 6 6 7 8
8 8 8 8 8 6 6 3 0 3 10 10 13 3 0 3 8 8 8 11 11 8 8 7 7 8 6 7 7 7 7 7 7 7 8 7 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 6
9 12 12 11 11 10 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 7 10 9 11 11 8 6 6 6 6 6 10 9 9 9 3 0 3 8 3 0 3 9 9 8 8 8 9 11 10 13 3 0 3
8 8 8 6 6 9 3 0 3 6 6 6 9 8 8 6 6 6 6 6 8 8 9 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 3 0 3 3 0 3 6 8 6 8 8 8 8 3 0 3
8 8 11 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 3 0 3 3 0 |