BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-505H01.T7 (MSMg01no505_h01.b1) | MSMg01-505H01.TJ (MSMg01no505_h01.g1) |
ACC | AG580080 | AG580081 |
length | 757 | 759 |
length of high quality (start - end) | 706 (49 - 754) | 632 (79 - 710) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no505_h01.b1 PHD_FILE: MSMg01no505_h01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:33:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no505_h01.g1 PHD_FILE: MSMg01no505_h01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:33:21 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NACTTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCAAGGCTTATACCTAACCATGATAAAAGCAATCTACAGCAAAC
CAGTAGCCAACATCAAAGTAAATGGTGAGAAGCTTGAAGCAATCCCACTA
AAATCAGGGAGTAGACAAGGCTGTCCACTCTCTCCATACCTATTCAACAT
TGTACTTGAAGTCCTAGCCAGAGCAATTTGACAACAAAAGGGGATCAAGG
GGGATACAAATTGGAAAAGATGAAGTCAAACTATCACTTTTTGCAGATGA
TATGATAGTATATATAAGTGACCCTAAATATTCCACCAGAGAACTCCTAA
ATCTGATAAACAGCTTCAGTGAAGTAGCTGGATATAAAATTAGCTCAAAC
AAGTCAATGGCCTTTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGAAAT
TAGGGAAACAACACCCTTCTCAATAGTCACAAATAATATAAAATATCTTG
GCGTGACTCTAACTAAGGAAGTGAAAGATTTGTATGATAAAAACTTCAAG
TCTCTGAAGAAAGAAATTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTCCC
ATGCTTATGGATTGGCAGGATCAACATTGTAAAAGTGGCTATCTTGCCAA
AAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATCAAAATTCCAACTCAATTC
TTCAACGAATTAGAAAGAGCAATCTCTAAATTCATCTGGAATAACAAAAA
ACCTAGG
| CCCAATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTTTCACCCCAAATATGTC
TCTTACAATATTTATTTTGTTCTATGTCCTATCACGGTGAACCAGAGCTG
TCTGTGTGTCCACCTGATTGAACTTATCAGTGAGAGCCTGGTGAACTCAG
GAGATGATATACAAATAAAGAACAGGTCTATGACCCAGTGGGGATAACCT
TAGCCAAAATGCCCAAGAGTGGGGAGATGGAACCTGAAGAGACACCCTCC
AGTAGATAAACATGGCCCCCATTTGAGGAATGAGCCCACCCACTCATCTT
CAAAAGTCTTGACCCAGAATTCTGTCTAAAGGAAATGCATGGACAAAAAA
AAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGCAATGACTAAAGGAAAGTTTAT
CCAGAGACTGGCCTAATCTGGGATCCATCCTATGGGCAGGCACTAAACCT
GACAGTATTACTGATGCCAGGTTGTGCTTTCAGACAGGAACCTAGCATGG
CTGTCCTCTGAGAGGCTCTTAAGAACAGTTGTCTGGGACAGATGTTGATA
CTTACAGCCAAGCATTGCTGTAAGTAATGTAAGTAAGCTTCCATTCCCTA
TGGAAGAATTAGGGAAAGGATTAAAGGAGCTGAAGGGAGTGGCAAACCCA
TAGGAAGAACAACAATATTAACAATATTAACCAACCCAGATCCCTCAGAA
CTCCCAGAG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 8 8 9 11 24 26 39 44 41 33 32 32 28 28 37 37 27 26 15 18 18 30 31 47 27 25 27 18 15 9 11 11 17 12 11 11 21 23 35 28 28 31 26 26 28 43
57 47 36 31 31 31 33 33 37 29 23 15 11 11 11 11 12 18 21 34 32 43 33 33 33 32 32 35 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 46 46 42 47 42 42 48 48 54 44 42 41
41 39 43 43 59 42 32 39 36 48 47 47 47 47 47 48 57 68 68 57 50 47 47 47 48 57 68 68 68 59 59 54 54 57 57 57 57 57 43 43 42 44 37 44 44 43 43 47 50 59
57 57 57 43 43 35 50 50 50 50 51 51 57 57 37 52 52 57 57 68 68 59 59 52 52 52 50 57 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 52 57 57 59 57 57 52 52 57 57 59 59
59 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 52 52 43 43 59 43 35 43 43 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 52 52 52 45 45 57 57 68 68 68 68 62 62 52 52 52 62 62 68
68 68 68 62 62 43 39 39 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 35 41 43 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 45 62 62 62 62 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 44 43 43 45 52 43 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 43 43 31 44 44 62 62 44 44 52 52 52 43 62 62
62 52 52 52 62 62 68 62 62 62 62 52 62 62 44 43 35 35 44 44 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 43 43 43 43 35 44 43 62
62 62 62 45 52 52 62 44 59 43 35 35 43 44 52 52 52 52 43 43 43 52 52 52 59 59 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 44 57 52 52 52 52 43 43 38 42 43 43 52 43 43 37 37 43 43 59 59 43 43 43 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 50 48 44 59 59
48 48 48 59 59 47 47 42 42 35 59 42 48 42 44 44 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 47 42 37 30 30 42 43
33 37 37 37 43 41 41 57 57 59 59 57 57 53 53 50 50 47 47 48 59 59 59 48 41 34 32 32 28 19 13 26 22 36 41 41 41 41 47 59 59 48 43 43 39 39 39 39 39 36
39 43 43 48 48 48 42 50 42 41 39 39 39 37 34 39 39 32 30 32 37 37 37 43 43 46 41 41 39 39 39 37 37 44 39 39 37 34 39 39 39 37 41 37 59 32 28 25 25 28
37 39 39 38 29 29 33 33 35 36 36 47 47 34 28 23 20 18 18 27 34 41 34 34 28 28 37 39 39 37 37 32 28 27 34 32 26 25 25 25 25 25 32 37 35 31 25 34 20 28
28 28 20 22 29 29 41 36 37 32 32 36 37 30 31 25 37 30 30 30 34 34 30 31 30 30 30 25 26 27 25 22 24 24 24 28 32 32 32 32 24 28 22 25 24 23 23 26 26 29
27 25 19 19 24 20 20 | Open.Hide. 6 6 6 7 8 13 8 8 8 8 8 21 27 37 37 37 37 31 31 37 32 33 41 41 41 50 50 50 41 41 23 19 11 9 9 10 9 9 8 8 8 10 15 14 28 23 25 26 32 44
44 36 36 33 33 33 33 41 41 25 23 11 12 9 10 10 10 15 15 21 29 31 28 33 33 33 39 39 48 48 48 57 59 42 43 42 42 42 47 57 48 48 57 57 53 68 68 68 54 57
57 57 57 42 41 41 41 41 50 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 47 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 57 57 57 57 57 57 57 39 39 35 44 44 57 57 57 57
54 54 57 57 57 68 57 57 50 43 37 37 43 50 46 48 48 48 48 50 57 57 57 57 57 57 50 43 37 50 50 68 57 57 50 50 43 52 50 59 57 68 57 57 57 43 43 32 23 44
44 57 57 57 57 57 57 68 57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 52 57 57 52 52 57 57 57 57 57 52 43 43 35 44 59 68 68 62 62 62 62 62 62 52 52 43
44 41 34 17 26 26 44 44 62 62 62 52 52 43 43 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 43 43 43 62 62 44 44 43 43 43 35 43 43 43 43 39
39 43 44 62 68 68 68 44 62 52 52 52 62 62 62 39 39 43 43 39 39 44 44 39 39 23 29 39 44 62 62 62 62 62 43 43 43 52 52 62 52 43 44 43 39 39 43 44 62 62
52 52 62 62 62 62 54 54 62 62 62 43 39 39 27 14 39 41 44 44 52 62 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 62 44 43 35 35 44 44 38 38 12 12 29 33 62 62 62
62 62 34 33 11 11 12 34 38 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 38 38 38 30 45 52 52 43 43 43 43 43 43 44 44 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43
43 31 35 43 39 42 42 57 57 57 59 39 39 43 44 44 33 41 42 44 44 44 44 43 43 29 32 29 43 38 52 59 57 57 57 57 54 54 57 50 50 35 32 43 29 29 29 32 43 43
44 44 52 52 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 44 43 35 35 42 44 59 59 43 43 43 46 42 44 32 28 20 28 27 35 35 43 44 44 44 40 32 32 32 27 30 42 42 57 47
47 41 41 32 28 41 32 30 21 34 18 25 25 36 25 32 17 24 24 26 26 17 17 17 30 29 35 39 47 37 37 30 30 34 40 43 48 43 43 36 37 37 43 43 48 47 48 43 43 36
36 39 34 34 37 37 30 25 22 22 22 34 34 47 47 59 28 32 17 15 12 27 27 47 48 43 39 39 35 35 35 47 47 47 59 39 39 28 32 26 26 13 13 13 17 22 28 32 32 39
37 37 34 34 28 15 14 16 16 14 14 20 32 34 36 37 41 31 31 37 37 37 36 36 39 31 29 30 30 30 33 34 32 37 30 25 22 25 30 28 20 28 26 32 24 24 14 16 11 11
12 23 20 31 31 31 35 22 22 16 12 12 11 11 11 16 16 18 15 12 12 16 12 14 16 19 23 30 24 16 19 12 11 11 13 15 14 23 20 12 15 11 15 12 16 11 11 10 10 12
12 14 13 14 12 11 11 11 11 |