BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-006F03
Chromosome18 (Build37)
Map Location 75,770,152 - 75,874,143
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm672
Upstream geneMyo5b, Acaa2, LOC672799, Lipg, Rpl17, BC031181, Dym, LOC628356, EG667777, Smad7
Downstream geneZbtb7c, 4833419G08Rik, LOC668184, Smad2, LOC668188, EG639576
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-006F03.bB6Ng01-006F03.g
ACCDH843215DH843216
length9211,082
definitionDH843215|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-006F03, 5' end.DH843216|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-006F03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,770,152 - 75,771,072)(75,873,042 - 75,874,143)
sequence
gaattctctagaaaagccagtacacttgcagtcctgggctgagtagggag
gacatgtaggacatgggttcacctcccctgtgcggtggaacagagccctg
tccctccccacaccttacttctctccatgtaagagcacctcttccctccc
cccttactccccagtccttacccttctctgtcgatgtgtggcaggggctg
cttgggtgtgtggcggaccttccgatggaactgggtgaagtccagctttt
caggctgcaggtcccaggtggcaccactagagggcgagggagggcgacaa
atagaagacatgcggcaagaagccttcttaatacacaatagccaggaggt
tcaatgggcagggagggcctgttcggaccccacttggggtggaactcaag
atatcagggcttcacctttctacaactctgctgtgggaaaatatatgctt
cccaaacccgaatgtgggctagctgcccactctgtaggggtccccaacaa
caacccaatttgtttcatgagtacatttaagaagggctggagtgagaagg
acaaaaacctgtcacctgagcacaaaatggtgctcaggataaggtaagca
gggccatcctgggaccctcaccatggagagcctgtagttaggcagcccag
agttgggtagctcaggggatgggacagaggtgagcccaagaccactatcc
agcaggagcgataagagccagagataagtccccagtcctggggagcctgg
tcaatcccaagtaccatcaggaaccttctaaaatctgagccagtcagtct
gccttctgtgtgtgtgttactaaagagcaaacctcatgcatgccttagag
acaccacctctgggccacagagcccagtccctcttctctgttgactggag
ggtgagaagggtgtgtgtgta
gaattctaatcagatttcttggagcaagttgcatgcatgcacagaaggcc
acctagaccagaaatagaaagatctaggggacaagatctaatggcaagag
ccagcctattaggtgtgcatatggggaaagggagcctggctacttgttcc
cactggaaccctggacagaagataggctgttgcatgatagtagtgtctct
ctgattcaactgtctcacatcactaatattggtcaacagaagtacctcag
agagaaaaaaacgcagggacaaaacacctacttgccattgccagttatgt
caactcccagagctcagagagaaaaaacgcagggacaaaacacctacttg
ccattgccagttatgtcaactcccagagctcctaggctgggaccacccta
ttcccaactaggaaacaagttggctagtggtctggtaagggatccatccc
ttaggtgagcctcctgcttcctcacctgaggcccatgtatggaatccagt
agtcaacttcctggtcactacagacctttccacacaccaggcctatagag
gaactcacaaagttaaaggatcagttggcatgggggtgccgtttttagct
ttttccagggtggcaaagacatgccagaatctaccatatacaaatacact
ccagcagctaggtcatgtatttcccggctctattacatatcacattgcag
ggcccatcactcccactggacgcagggaaagaagaaagtcatttcttacc
ctcttgtgctaaacagtcctgagctggatgcagactcaatctctaacagg
tccgcagattaacaatctcccaaaacttgatctcttttatgaaatggaaa
tgatacaaataagcagtcccacagattttgtgaggattccatgaaataga
tatttagtaagtttgatacctactaaatcgtcagaaagtttactgtcagc
atgctcatatactgctatatgctcatataagatatcactaaattactcat
gagtatctcctttgacagcatgaggacataaacattcgttctctatgatt
tataatcatgatggaggaaatagaataaaaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_75770152_75771072
seq2: B6Ng01-006F03.b_44_964

seq1  GAATTCTCTAGAAAAGCCAGTACACTTGCAGTCCTGGGCTGAGTAGGGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTAGAAAAGCCAGTACACTTGCAGTCCTGGGCTGAGTAGGGAG  50

seq1  GACATGTAGGACATGGGTTCACCTCCCCTGTGCGGTGGAACAGAGCCCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGTAGGACATGGGTTCACCTCCCCTGTGCGGTGGAACAGAGCCCTG  100

seq1  TCCCTCCCCACACCTTACTTCTCTCCATGTAAGAGCACCTCTTCCCTCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCCCCACACCTTACTTCTCTCCATGTAAGAGCACCTCTTCCCTCCC  150

seq1  CCCTTACTCCCCAGTCCTTACCCTTCTCTGTCGATGTGTGGCAGGGGCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTACTCCCCAGTCCTTACCCTTCTCTGTCGATGTGTGGCAGGGGCTG  200

seq1  CTTGGGTGTGTGGCGGACCTTCCGATGGAACTGGGTGAAGTCCAGCTTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGTGTGTGGCGGACCTTCCGATGGAACTGGGTGAAGTCCAGCTTTT  250

seq1  CAGGCTGCAGGTCCCAGGTGGCACCACTAGAGGGCGAGGGAGGGCGACAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTGCAGGTCCCAGGTGGCACCACTAGAGGGCGAGGGAGGGCGACAA  300

seq1  ATAGAAGACATGCGGCAAGAAGCCTTCTTAATACACAATAGCCAGGAGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAAGACATGCGGCAAGAAGCCTTCTTAATACACAATAGCCAGGAGGT  350

seq1  TCAATGGGCAGGGAGGGCCTGTTCGGACCCCACTTGGGGTGGAACTCAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGGGCAGGGAGGGCCTGTTCGGACCCCACTTGGGGTGGAACTCAAG  400

seq1  ATATCAGGGCTTCACCTTTCTACAACTCTGCTGTGGGAAAATATATGCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCAGGGCTTCACCTTTCTACAACTCTGCTGTGGGAAAATATATGCTT  450

seq1  CCCAAACCCGAATGTGGGCTAGCTGCCCACTCTGTAGGGGTCCCCAACAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAACCCGAATGTGGGCTAGCTGCCCACTCTGTAGGGGTCCCCAACAA  500

seq1  CAACCCAATTTGTTTCATGAGTACATTTAAGAAGGGCTGGAGTGAGAAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCCAATTTGTTTCATGAGTACATTTAAGAAGGGCTGGAGTGAGAAGG  550

seq1  ACAAAAACCTGTCACCTGAGCACAAAATGGTGCTCAGGATAAGGTAAGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAACCTGTCACCTGAGCACAAAATGGTGCTCAGGATAAGGTAAGCA  600

seq1  GGGCCATCCTGGGACCCTCACCATGGAGAGCCTGTAGTTAGGCAGCCCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCATCCTGGGACCCTCACCATGGAGAGCCTGTAGTTAGGCAGCCCAG  650

seq1  AGTTGGGTAGCTCAGGGGATGGGACAGAGGTGAGCCCAAGACCACTATCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGGGTAGCTCAGGGGATGGGACAGAGGTGAGCCCAAGACCACTATCC  700

seq1  AGCAGGAGCGATAAGAGCCAGAGATAAGTCCCCAGTCCTGGGGAGCCTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGAGCGATAAGAGCCAGAGATAAGTCCCCAGTCCTGGGGAGCCTGG  750

seq1  TCAATCCCAAGTACCATCAGGAACCTTCTAAAATCTGAGCCAGTCAGTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATCCCAAGTACCATCAGGAACCTTCTAAAATCTGAGCCAGTCAGTCT  800

seq1  GCCTTCTGTGTGTGTGTTACTAAAGAGCAAACCTCATGCATGCCTTAGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCTGTGTGTGTGTTACTAAAGAGCAAACCTCATGCATGCCTTAGAG  850

seq1  ACACCACCTCTGGGCCACAGAGCCCAGTCCCTCTTCTCTGTTGACTGGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCACCTCTGGGCCACAGAGCCCAGTCCCTCTTCTCTGTTGACTGGAG  900

seq1  GGTGAGAAGGGTGTGTGTGTA  921
      |||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGAAGGGTGTGTGTGTA  921

seq1: chr18_75873042_75874143
seq2: B6Ng01-006F03.g_63_1144 (reverse)

seq1  CTTTTTA-TCTATCTCCTTCCATCACTGAATTATAAATTCCATAGAGAAC  49
      ||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||  ||||||||||
seq2  CTTTTTATTCTATTTCC-TCCATCA-TG-ATTATAAAT--CATAGAGAAC  45

seq1  GAATG-TTATGTCCCTCCAATGCCTGTCAAAGGAGATACTCATGAGTTAA  98
      ||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||   
seq2  GAATGTTTATGT-CCTC--ATG-CTGTCAAAGGAGATACTCATGAGT---  88

seq1  ATTTTAGTGATAATCTGTAATATGAGCAATAATAGCAGTAATATGAGCAA  148
      | ||||||||||   | | |||||||||   |||||||| |||||||| |
seq2  AATTTAGTGATA---TCTTATATGAGCA--TATAGCAGT-ATATGAGC-A  131

seq1  TGCTGACAGTTAAACTTTCTTGACGATTTAGTAGGTATCAAACTTACTAA  198
      ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGACAG-TAAACTTTC-TGACGATTTAGTAGGTATCAAACTTACTAA  179

seq1  ATATCTTATTTCATGGAATCCTCACAAAATCTGTGGGACTGCTTATTTGT  248
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATC-TATTTCATGGAATCCTCACAAAATCTGTGGGACTGCTTATTTGT  228

seq1  ATCATTTCCATTTCATAAAAGAGATCAAGTTTTGGGAGATTGTTAATCTG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTTCCATTTCATAAAAGAGATCAAGTTTTGGGAGATTGTTAATCTG  278

seq1  CGGACCTGTTAGAGATTGAGTCTGCATCCAGCTCAGGACTGTTTAGCACA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGACCTGTTAGAGATTGAGTCTGCATCCAGCTCAGGACTGTTTAGCACA  328

seq1  AGAGGGTAAGAAATGACTTTCTTCTTTCCCTGCGTCCAGTGGGAGTGATG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGTAAGAAATGACTTTCTTCTTTCCCTGCGTCCAGTGGGAGTGATG  378

seq1  GGCCCTGCAATGTGATATGTAATAGAGCCGGGAAATACATGACCTAGCTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCTGCAATGTGATATGTAATAGAGCCGGGAAATACATGACCTAGCTG  428

seq1  CTGGAGTGTATTTGTATATGGTAGATTCTGGCATGTCTTTGCCACCCTGG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGTGTATTTGTATATGGTAGATTCTGGCATGTCTTTGCCACCCTGG  478

seq1  AAAAAGCTAAAAACGGCACCCCCATGCCAACTGATCCTTTAACTTTGTGA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGCTAAAAACGGCACCCCCATGCCAACTGATCCTTTAACTTTGTGA  528

seq1  GTTCCTCTATAGGCCTGGTGTGTGGAAAGGTCTGTAGTGACCAGGAAGTT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCTCTATAGGCCTGGTGTGTGGAAAGGTCTGTAGTGACCAGGAAGTT  578

seq1  GACTACTGGATTCCATACATGGGCCTCAGGTGAGGAAGCAGGAGGCTCAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTACTGGATTCCATACATGGGCCTCAGGTGAGGAAGCAGGAGGCTCAC  628

seq1  CTAAGGGATGGATCCCTTACCAGACCACTAGCCAACTTGTTTCCTAGTTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGGATGGATCCCTTACCAGACCACTAGCCAACTTGTTTCCTAGTTG  678

seq1  GGAATAGGGTGGTCCCAGCCTAGGAGCTCTGGGAGTTGACATAACTGGCA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATAGGGTGGTCCCAGCCTAGGAGCTCTGGGAGTTGACATAACTGGCA  728

seq1  ATGGCAAGTAGGTGTTTTGTCCCTGCGTTTTTTCTCTCTGAGCTCTGGGA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCAAGTAGGTGTTTTGTCCCTGCGTTTTTTCTCTCTGAGCTCTGGGA  778

seq1  GTTGACATAACTGGCAATGGCAAGTAGGTGTTTTGTCCCTGCGTTTTTTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGACATAACTGGCAATGGCAAGTAGGTGTTTTGTCCCTGCGTTTTTTT  828

seq1  CTCTCTGAGGTACTTCTGTTGACCAATATTAGTGATGTGAGACAGTTGAA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTGAGGTACTTCTGTTGACCAATATTAGTGATGTGAGACAGTTGAA  878

seq1  TCAGAGAGACACTACTATCATGCAACAGCCTATCTTCTGTCCAGGGTTCC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGAGACACTACTATCATGCAACAGCCTATCTTCTGTCCAGGGTTCC  928

seq1  AGTGGGAACAAGTAGCCAGGCTCCCTTTCCCCATATGCACACCTAATAGG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGAACAAGTAGCCAGGCTCCCTTTCCCCATATGCACACCTAATAGG  978

seq1  CTGGCTCTTGCCATTAGATCTTGTCCCCTAGATCTTTCTATTTCTGGTCT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTCTTGCCATTAGATCTTGTCCCCTAGATCTTTCTATTTCTGGTCT  1028

seq1  AGGTGGCCTTCTGTGCATGCATGCAACTTGCTCCAAGAAATCTGATTAGA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGCCTTCTGTGCATGCATGCAACTTGCTCCAAGAAATCTGATTAGA  1078

seq1  ATTC  1102
      ||||
seq2  ATTC  1082