BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-012L08
Chromosome18 (Build37)
Map Location 68,215,974 - 68,373,986
singlet/doubletdoublet
Overlap geneD18Ertd653e
Upstream geneGnal, Chmp1b, Mppe1, Impa2, B430212C06Rik, Cidea, Tubb6, Afg3l2, Slmo1, Spire1, Cep76, Tnfsf5ip1, Ptpn2, Seh1l, LOC667939
Downstream gene4933403F05Rik, Rnmt, Mc5r, Mc2r
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-012L08.bB6Ng01-012L08.g
ACCDH847726DH847727
length1,067732
definitionDH847726|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-012L08, 5' end.DH847727|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-012L08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,372,916 - 68,373,986)(68,215,974 - 68,216,703)
sequence
gaattcaaataaaataaactctttgggtttccggttcaatgctttctagg
attattaactagattcgaagtattccaaatgcagtagagagttgggaagc
tggttccttggatacaagtgcttgttttgcaagaagacttgagtttgagt
ccccagaacccatctacatagcaaagcgcagctatacatgtatgtaacat
taggattgtgggacaggggaggcagatgcagaatacccactggccagaaa
gcttagcttaaaggatgaatttccaggtcagtaaaaaaaaaaaaagcttg
tctcaaagcactgatgagaagaacaatagaggagatgcctgcctaacatc
cttcctgttctggctacttcatgagcaagcacacacacatgcatataact
ctctctctgtctctgtctctgtctctgtctctgtctctgtctctctctca
cacgcacgcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaga
gtgcatgggcctctcatccttcccagaggtctcagtaacaaaaagcaatt
accaaacacaaagagatcaggagaccacacccagctagccttctctgact
gggtatccttggtcagccagcctttcttcacctcatgttctcatttgcaa
actcacatgaacactatttgacctacacacttcataaagctgtttttaga
aagacgagataatacaggaggaacgctacaatattaaatgatatgtattt
atataatcctgtgatcatattacaacggtattaatctttagatagccact
ccggttagctaataaacccaagaactataactcatatatatggtgtgggc
aaaataatgtgaatgctctatagaagcgagaagccttctctgcatgagag
actatgaagcaatgatttagatcagcaggaaaatgaaacaaagccatgtg
caggtgggcacctcggagctgaatgaagtgaggcagagcctgctacttct
atgctgtgtctttttctgccagtgatagcagaagagcttatttgtgctac
cctggagtactgcttgc
gaattcacgggggaggggggcagaagtcatccttacttgtctgttatgcc
tgaggtaactgctgtcagatgaggtggccattaagtaagtgtgaagtcac
actcacactcacaaggaggcaaacacaaggtggtctgacccagagtccgg
aattctactctttgacccattgtgtgcgaagcttttgtgttttaaatgct
gcagggtccagagcacccccaggattgccccccccccactccaccccgta
tttgaatcctcatggccatcagctttcttaactagggttggtgtccttct
tacttctaaagtggctgtagggctgaggcaggagattggaaaaaatgacc
agggtattaaacataggattccgtatagtccagctcgaatggatttggta
cctgctgtattctggtctccatggccagtgccggagatcgttacaatatg
ttcagaagcacaccacagacagatgcaacaggagaacacgggagccttgt
gggcagaaactcggtttgtttgctcacttctgtcttccccgcccctagta
taatttctggtcaaagtaatggctgccacaaatttgatggtgaaatgctc
attgtgtccatgtagcctttgggatgtccagtaggctagagagcaggatg
tatcatgggccagtcatagttgtctgtcacggactggactgggtataagc
tagtagcaagagtgggctggtggggggtgggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_68372916_68373986
seq2: B6Ng01-012L08.b_44_1110 (reverse)

seq1  GCAAG--GTACT-CAGGGTAGCACAAATAAGCTCTTCTGCTTATCCACTG  47
      |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
seq2  GCAAGCAGTACTCCAGGGTAGCACAAATAAGCTCTTCTGC-TAT-CACTG  48

seq1  GGCCAG-AAAAGACACAGCATAGAAGGTAGCAGGCTCTGCCCTCACCTTC  96
      |  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||
seq2  G--CAGAAAAAGACACAGCATAGAA-GTAGCAGGCTCTG-CCTCA-CTTC  93

seq1  ATTCCAGCTCCGAGGTGCCCACCTGCACATGGCTTTGTTTCATTTTCCTG  146
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATT-CAGCTCCGAGGTGCCCACCTGCACATGGCTTTGTTTCATTTTCCTG  142

seq1  CTGATCTAAATCATTGCTTCATAGTCTCTCATGCAGAGAAGGCTTCTCGC  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATCTAAATCATTGCTTCATAGTCTCTCATGCAGAGAAGGCTTCTCGC  192

seq1  TTCTATAGAGCATTCACATTATTTTGCCCACACCATATATATGAGTTATA  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATAGAGCATTCACATTATTTTGCCCACACCATATATATGAGTTATA  242

seq1  GTTCTTGGGTTTATTAGCTAACCGGAGTGGCTATCTAAAGATTAATACCG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTGGGTTTATTAGCTAACCGGAGTGGCTATCTAAAGATTAATACCG  292

seq1  TTGTAATATGATCACAGGATTATATAAATACATATCATTTAATATTGTAG  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAATATGATCACAGGATTATATAAATACATATCATTTAATATTGTAG  342

seq1  CGTTCCTCCTGTATTATCTCGTCTTTCTAAAAACAGCTTTATGAAGTGTG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTCCTCCTGTATTATCTCGTCTTTCTAAAAACAGCTTTATGAAGTGTG  392

seq1  TAGGTCAAATAGTGTTCATGTGAGTTTGCAAATGAGAACATGAGGTGAAG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTCAAATAGTGTTCATGTGAGTTTGCAAATGAGAACATGAGGTGAAG  442

seq1  AAAGGCTGGCTGACCAAGGATACCCAGTCAGAGAAGGCTAGCTGGGTGTG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCTGGCTGACCAAGGATACCCAGTCAGAGAAGGCTAGCTGGGTGTG  492

seq1  GTCTCCTGATCTCTTTGTGTTTGGTAATTGCTTTTTGTTACTGAGACCTC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCTGATCTCTTTGTGTTTGGTAATTGCTTTTTGTTACTGAGACCTC  542

seq1  TGGGAAGGATGAGAGGCCCATGCACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAGGATGAGAGGCCCATGCACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  592

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCGTGTGAGAGAGAGACAGAGACAGAGACA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCGTGTGAGAGAGAGACAGAGACAGAGACA  642

seq1  GAGACAGAGACAGAGACAGAGAGAGAGTTATATGCATGTGTGTGTGCTTG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAGAGACAGAGACAGAGAGAGAGTTATATGCATGTGTGTGTGCTTG  692

seq1  CTCATGAAGTAGCCAGAACAGGAAGGATGTTAGGCAGGCATCTCCTCTAT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGAAGTAGCCAGAACAGGAAGGATGTTAGGCAGGCATCTCCTCTAT  742

seq1  TGTTCTTCTCATCAGTGCTTTGAGACAAGCTTTTTTTTTTTTTACTGACC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTTCTCATCAGTGCTTTGAGACAAGCTTTTTTTTTTTTTACTGACC  792

seq1  TGGAAATTCATCCTTTAAGCTAAGCTTTCTGGCCAGTGGGTATTCTGCAT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAATTCATCCTTTAAGCTAAGCTTTCTGGCCAGTGGGTATTCTGCAT  842

seq1  CTGCCTCCCCTGTCCCACAATCCTAATGTTACATACATGTATAGCTGCGC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTCCCCTGTCCCACAATCCTAATGTTACATACATGTATAGCTGCGC  892

seq1  TTTGCTATGTAGATGGGTTCTGGGGACTCAAACTCAAGTCTTCTTGCAAA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTATGTAGATGGGTTCTGGGGACTCAAACTCAAGTCTTCTTGCAAA  942

seq1  ACAAGCACTTGTATCCAAGGAACCAGCTTCCCAACTCTCTACTGCATTTG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGCACTTGTATCCAAGGAACCAGCTTCCCAACTCTCTACTGCATTTG  992

seq1  GAATACTTCGAATCTAGTTAATAATCCTAGAAAGCATTGAACCGGAAACC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATACTTCGAATCTAGTTAATAATCCTAGAAAGCATTGAACCGGAAACC  1042

seq1  CAAAGAGTTTATTTTATTTGAATTC  1071
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAGTTTATTTTATTTGAATTC  1067

seq1: chr18_68215974_68216703
seq2: B6Ng01-012L08.g_67_798

seq1  GAATTCACGGGGGAGGGGGGCAGAAGTCATCCTTACTTGTCTGTTATGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACGGGGGAGGGGGGCAGAAGTCATCCTTACTTGTCTGTTATGCC  50

seq1  TGAGGTAACTGCTGTCAGATGAGGTGGCCATTAAGTAAGTGTGAAGTCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTAACTGCTGTCAGATGAGGTGGCCATTAAGTAAGTGTGAAGTCAC  100

seq1  ACTCACACTCACAAGGAGGCAAACACAAGGTGGTCTGACCCAGAGTCCGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACACTCACAAGGAGGCAAACACAAGGTGGTCTGACCCAGAGTCCGG  150

seq1  AATTCTACTCTTTGACCCATTGTGTGCGAAGCTTTTGTGTTTTAAATGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTACTCTTTGACCCATTGTGTGCGAAGCTTTTGTGTTTTAAATGCT  200

seq1  GCAGGGTCCAGAGCACCCCCAGGATTGCCCCCCCCCCACTCCACCCCGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGGTCCAGAGCACCCCCAGGATTGCCCCCCCCCCACTCCACCCCGTA  250

seq1  TTTGAATCCTCATGGCCATCAGCTTTCTTAACTAGGGTTGGTGTCCTTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAATCCTCATGGCCATCAGCTTTCTTAACTAGGGTTGGTGTCCTTCT  300

seq1  TACTTCTAAAGTGGCTGTAGGGCTGAGGCAGGAGATTGGAAAAAATGACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCTAAAGTGGCTGTAGGGCTGAGGCAGGAGATTGGAAAAAATGACC  350

seq1  AGGGTATTAAACATAGGATTCCGTATAGTCCAGCTCGAATGGATTTGGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTATTAAACATAGGATTCCGTATAGTCCAGCTCGAATGGATTTGGTA  400

seq1  CCTGCTGTATTCTGGTCTCCATGGCCAGTGCCGGAGATCGTTACAATATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTGTATTCTGGTCTCCATGGCCAGTGCCGGAGATCGTTACAATATG  450

seq1  TTCAGAAGCACACCACAGACAGATGCAACAGGAGAACACGGGAGCCTTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAAGCACACCACAGACAGATGCAACAGGAGAACACGGGAGCCTTGT  500

seq1  GGGCAGAAACTCGGTTTGTTTGCTCACTTCTGTCTTCCCCGCCCCTAGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAGAAACTCGGTTTGTTTGCTCACTTCTGTCTTCCCCGCCCCTAGTA  550

seq1  TAATTTCTGGTCAAAGTAATGGCTGCCACAAATTTGATGGTGAAATGCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTCTGGTCAAAGTAATGGCTGCCACAAATTTGATGGTGAAATGCTC  600

seq1  ATTGTGTCCATGTAGCCTTTGGGATGTCCAGTAGGCTAGAGAGCAGGATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTGTCCATGTAGCCTTTGGGATGTCCAGTAGGCTAGAGAGCAGGATG  650

seq1  TATCATGGGCCAGTCATAGTTGTCTGTCACGGACTGGACT-GGTATAAGC  699
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TATCATGGGCCAGTCATAGTTGTCTGTCACGGACTGGACTGGGTATAAGC  700

seq1  TAGTAGCAAGAGT-GGCTGGTGGGGGGTGGGG  730
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TAGTAGCAAGAGTGGGCTGGTGGGGGGTGGGG  732