BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-041C22
Chromosome18 (Build37)
Map Location 83,599,211 - 83,724,945
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC665284
Upstream geneMbp, EG637748, Zfp236, LOC100039563, Zfp516, LOC100041001, 4921531P14Rik
Downstream geneTshz1, Zadh2, LOC669856, Zfp407
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-041C22.bB6Ng01-041C22.g
ACCDH867918DH867919
length1,105860
definitionDH867918|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-041C22, 5' end.DH867919|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-041C22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(83,723,838 - 83,724,945)(83,599,211 - 83,600,069)
sequence
gaattccaatttaagtctgaaatgtccacaagttataagccttagcacat
gaacacttacctgactgtggctgcaaactggtgggaaccacagcccacag
acaccggcacttacaggtcacatagaatgattttcctccctaagtagaat
catctgggatctactttataggtatgaaaaactctatctgatcattgaaa
gtgctgtatgctgttcatgtttaactctttcccaatgagtgtgaggcaca
cgcctgtgcacactctccactgagtgttacatctgtaaggcacaccccta
tgcacactctcccactgagtgtcacacccctgtgcccaatttcccactga
gtgtcacagctgtaaggcacacgcctgtgcacacactcccaatgactgtc
aaagctgtaaggcacacccctgtgcacactctccactgaggatcacatct
gtaaggcatacccctgtgcacactctcccactgagtgtcacacccctgtg
cacaatttcccactgagtgtcacatctgtaaggcatacccctgtgcacac
tctcccactgattgtcacacccctgtgcacaaattccctctgagtgtcac
agctgtaaggcacacgcctgtgcacacactcccaatgactgtcacagctg
taaggcacactcctgtgcacactctcccactgagtgtcacaccccgtgca
caaattccctttgagtatcacagctgtaaggcacactcctgtgcacactc
tccactgagtgtcacatctgtaaggcacacctctgtgcacactctccact
gagtatcacagctgtaaggcacacccctgtgcacactctccactgagtgt
cacagctgtaaagcacacatccgtacaggtttttgtaggatgtgggtttt
tgttttctgaaattcatcaccaagagtgtagtttctgtgttgtgtggcaa
aaacttttgagttttatgagaattaccaaactgcttctcacagtgggtca
cactgacttaataccttccaccactgcattggagcaattcgtctctttgc
aaccttggcagcgttgggaaatgtcacatttcctatggaactctttttga
aggtg
gaattcagtctaagacggagtgagcatcaaggagcctgtgtgtagtctac
ccagatggtgctcccagtaggattacacatcccagggaacttgtgaacca
tatggaggggaaggttccccggctgagagttccgctccattatttcgctt
tggaagtagctcattgtgatcaggcttgaattatcagatgtgagccaatg
ggtaccggaacggtatactcgccagagttgggaaacgctcattcttagct
taatcacaaaggacacgtgggtacagccatagtatattctgagacatgcc
atcaggacccttcacaagaccaagggtactgccatgcgactacaacgaga
atcagtgccctgcattgtcccagaagtcaagatcatcccaagtgcactgg
ggtgtggcttggcatctgagtcttgcaggctcctggatcctggatcggat
ctggctttgtgatgggacattgaacttggtgtcagggggaaccgtgccct
tgcctttctggcaccaggttctgtctgtctaccgctgtcaccatgcatga
accttaagagaatgagcctttgactttctgtttacctgtcaatgtctttg
taaatcagaaatacacagaggccaaagttggggcagagaaaacgagcttt
caactcatgtattggggctgcctgaccctggagaatttcagctccagtgt
cccctcctcgggagtgcaggcccagtgcccaagcaccagggtgagcttct
gttgtccatcaaagatctctgtgtgtagccttagaagaggaaactctgag
actgcagagggcattccttgggggtggtgtgttctgtttgtgtaaacacg
tgagccagcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_83723838_83724945
seq2: B6Ng01-041C22.b_44_1148 (reverse)

seq1  CACCTATCAAAATGAGTTCCATAAGAGATAGTGACATTTCCAACTGCTGG  50
      ||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||| |  |||| 
seq2  CACCT-TCAAAAAGAGTTCCATAGGAAAT-GTGACATTTCCCAACGCTGC  48

seq1  CAAGGTTGCAAGGAGACCGAATTGCTCC-ATGCAGTGGTGGAAGGTATAA  99
      ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
seq2  CAAGGTTGCAAAGAGA-CGAATTGCTCCAATGCAGTGGTGGAAGGTATTA  97

seq1  AGTCAGTGTGA-CCACTGTGAGAAGCAGTTTGGTAATTTCTCATAAAACT  148
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AGTCAGTGTGACCCACTGTGAGAAGCAGTTTGGTAA-TTCTCATAAAACT  146

seq1  CAAAAGTTTTTGCCACACAACACAGAAACTACACTCTTGGTGATGAATTT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGTTTTTGCCACACAACACAGAAACTACACTCTTGGTGATGAATTT  196

seq1  CAGAAAACAAAAACCCACATTCCTACAAAAACCTGTACGGATGTGTGCTT  248
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAACAAAAACCCACA-TCCTACAAAAACCTGTACGGATGTGTGCTT  245

seq1  TACAGCTGTGACACTCAGTGGAGAGTGTGCACAGGGGTGTGCCTTACAGC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGCTGTGACACTCAGTGGAGAGTGTGCACAGGGGTGTGCCTTACAGC  295

seq1  TGTGATACTCAGTGGAGAGTGTGCACAGAGGTGTGCCTTACAGATGTGAC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATACTCAGTGGAGAGTGTGCACAGAGGTGTGCCTTACAGATGTGAC  345

seq1  ACTCAGTGGAGAGTGTGCACAGGAGTGTGCCTTACAGCTGTGATACTCAA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGTGGAGAGTGTGCACAGGAGTGTGCCTTACAGCTGTGATACTCAA  395

seq1  AGGGAATTTGTGCACGGGGTGTGACACTCAGTGGGAGAGTGTGCACAGGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAATTTGTGCACGGGGTGTGACACTCAGTGGGAGAGTGTGCACAGGA  445

seq1  GTGTGCCTTACAGCTGTGACAGTCATTGGGAGTGTGTGCACAGGCGTGTG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCCTTACAGCTGTGACAGTCATTGGGAGTGTGTGCACAGGCGTGTG  495

seq1  CCTTACAGCTGTGACACTCAGAGGGAATTTGTGCACAGGGGTGTGACAAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTACAGCTGTGACACTCAGAGGGAATTTGTGCACAGGGGTGTGACAAT  545

seq1  CAGTGGGAGAGTGTGCACAGGGGTATGCCTTACAGATGTGACACTCAGTG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGGAGAGTGTGCACAGGGGTATGCCTTACAGATGTGACACTCAGTG  595

seq1  GGAAATTGTGCACAGGGGTGTGACACTCAGTGGGAGAGTGTGCACAGGGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATTGTGCACAGGGGTGTGACACTCAGTGGGAGAGTGTGCACAGGGG  645

seq1  TATGCCTTACAGATGTGATCCTCAGTGGAGAGTGTGCACAGGGGTGTGCC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCTTACAGATGTGATCCTCAGTGGAGAGTGTGCACAGGGGTGTGCC  695

seq1  TTACAGCTTTGACAGTCATTGGGAGTGTGTGCACAGGCGTGTGCCTTACA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGCTTTGACAGTCATTGGGAGTGTGTGCACAGGCGTGTGCCTTACA  745

seq1  GCTGTGACACTCAGTGGGAAATTGGGCACAGGGGTGTGACACTCAGTGGG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGACACTCAGTGGGAAATTGGGCACAGGGGTGTGACACTCAGTGGG  795

seq1  AGAGTGTGCATAGGGGTGTGCCTTACAGATGTAACACTCAGTGGAGAGTG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGTGCATAGGGGTGTGCCTTACAGATGTAACACTCAGTGGAGAGTG  845

seq1  TGCACAGGCGTGTGCCTCACACTCATTGGGAAAGAGTTAAACATGAACAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACAGGCGTGTGCCTCACACTCATTGGGAAAGAGTTAAACATGAACAG  895

seq1  CATACAGCACTTTCAATGATCAGATAGAGTTTTTCATACCTATAAAGTAG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACAGCACTTTCAATGATCAGATAGAGTTTTTCATACCTATAAAGTAG  945

seq1  ATCCCAGATGATTCTACTTAGGGAGGAAAATCATTCTATGTGACCTGTAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCAGATGATTCTACTTAGGGAGGAAAATCATTCTATGTGACCTGTAA  995

seq1  GTGCCGGTGTCTGTGGGCTGTGGTTCCCACCAGTTTGCAGCCACAGTCAG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCGGTGTCTGTGGGCTGTGGTTCCCACCAGTTTGCAGCCACAGTCAG  1045

seq1  GTAAGTGTTCATGTGCTAAGGCTTATAACTTGTGGACATTTCAGACTTAA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGTGTTCATGTGCTAAGGCTTATAACTTGTGGACATTTCAGACTTAA  1095

seq1  ATTGGAATTC  1108
      ||||||||||
seq2  ATTGGAATTC  1105

seq1: chr18_83599211_83600069
seq2: B6Ng01-041C22.g_70_929

seq1  GAATTCAGTCTAAGACGGAGTGAGCATCAAGGAGCCTGTGTGTAGTCTAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTCTAAGACGGAGTGAGCATCAAGGAGCCTGTGTGTAGTCTAC  50

seq1  CCAGATGGTGCTCCCAGTAGGATTACACATCCCAGGGAACTTGTGAACCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATGGTGCTCCCAGTAGGATTACACATCCCAGGGAACTTGTGAACCA  100

seq1  TATGGAGGGGAAGGTTCCCCGGCTGAGAGTTCCGCTCCATTATTTCGCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAGGGGAAGGTTCCCCGGCTGAGAGTTCCGCTCCATTATTTCGCTT  150

seq1  TGGAAGTAGCTCATTGTGATCAGGCTTGAATTATCAGATGTGAGCCAATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGTAGCTCATTGTGATCAGGCTTGAATTATCAGATGTGAGCCAATG  200

seq1  GGTACCGGAACGGTATACTCGCCAGAGTTGGGAAACGCTCATTCTTAGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACCGGAACGGTATACTCGCCAGAGTTGGGAAACGCTCATTCTTAGCT  250

seq1  TAATCACAAAGGACACGTGGGTACAGCCATAGTATATTCTGAGACATGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCACAAAGGACACGTGGGTACAGCCATAGTATATTCTGAGACATGCC  300

seq1  ATCAGGACCCTTCACAAGACCAAGGGTACTGCCATGCGACTACAACGAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGACCCTTCACAAGACCAAGGGTACTGCCATGCGACTACAACGAGA  350

seq1  ATCAGTGCCCTGCATTGTCCCAGAAGTCAAGATCATCCCAAGTGCACTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGTGCCCTGCATTGTCCCAGAAGTCAAGATCATCCCAAGTGCACTGG  400

seq1  GGTGTGGCTTGGCATCTGAGTCTTGCAGGCTCCTGGATCCTGGATCGGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGGCTTGGCATCTGAGTCTTGCAGGCTCCTGGATCCTGGATCGGAT  450

seq1  CTGGCTTTGTGATGGGACATTGAACTTGGTGTCAGGGGGAACCGTGCCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTTTGTGATGGGACATTGAACTTGGTGTCAGGGGGAACCGTGCCCT  500

seq1  TGCCTTTCTGGCACCAGGTTCTGTCTGTCTACCGCTGTCACCATGCATGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTTCTGGCACCAGGTTCTGTCTGTCTACCGCTGTCACCATGCATGA  550

seq1  ACCTTAAGAGAATGAGCCTTTGACTTTCTGTTTACCTGTCAATGTCTTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTAAGAGAATGAGCCTTTGACTTTCTGTTTACCTGTCAATGTCTTTG  600

seq1  TAAATCAGAAATACACAGAGGCCAAAGTTGGGGCAGAG-AAACGAGCTTT  649
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TAAATCAGAAATACACAGAGGCCAAAGTTGGGGCAGAGAAAACGAGCTTT  650

seq1  CAACTCATGTATTGGGGCTGCCTGACCCTGGAGAATTTCAGCTCCAGTGT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTCATGTATTGGGGCTGCCTGACCCTGGAGAATTTCAGCTCCAGTGT  700

seq1  CCCCTCCTCGGGAGTGCAGGCCCAGTGCCCAAGCACCAGGGTGAGCTTCT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTCCTCGGGAGTGCAGGCCCAGTGCCCAAGCACCAGGGTGAGCTTCT  750

seq1  GTTGTCCATCAAAGATCTCTGTGTGTAGCCTTAGAAGAGGAAACTCTGAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTCCATCAAAGATCTCTGTGTGTAGCCTTAGAAGAGGAAACTCTGAG  800

seq1  ACTGCAGAGGGCATTCCTTGGGGGTGGTGTGTTCTGTTTGTGTAAACACG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCAGAGGGCATTCCTTGGGGGTGGTGTGTTCTGTTTGTGTAAACACG  850

seq1  TGAGCCAGCC  859
      ||||||||||
seq2  TGAGCCAGCC  860