BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-054L21
Chromosome18 (Build37)
Map Location 26,821,579 - 26,963,827
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneBrunol4, LOC665916, LOC100041263, LOC100041274
Downstream geneEG665977, EG665646
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-054L21.bB6Ng01-054L21.g
ACCDH877405DH877406
length1,1191,134
definitionDH877405|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054L21, 5' end.DH877406|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054L21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,962,698 - 26,963,827)(26,821,579 - 26,822,719)
sequence
gaattcataaatattttactaaccttaatgctttagctgttttgaaaata
agaatagtgtaaaaactatcacctgtcaccatgcattttgaaaaaaatat
tgaaattattagctctcacatatgtcataaaggttatatcaagtatactc
aaaatataatttcattaaattatatactcaatattttattgggaatattg
gtacaattaaatccaatgattaaagaatcagctatattgaaatgtataac
tataacaaaagacttccactatttgccaggaagatattagttaaatttcc
aattagtattttatacttctctttccatttttcctttgttaacccataca
catttaatcaatagagaaatattttaaagcatagcagaaacttaagcaag
tgattatcagacatgtgttcttaggcattgtacatgtgtttacatgcatg
tactttctacataggctatgggcagagcaaaacactaccattttgaagct
ttcataactgtgctaggcattattcttgtttattgcctatgatagtgtta
cctggatcccttctaacctaacaaagatttgctactggcattctatttta
gagatgaaaactctgaaatttaaatctttcaatagagtccgtcatagaat
tatgtatttgtaattctgtcactgtgatggccaaagcatattcaaggcca
gcctgagctatagagttaatatgctgctattattccttggttaccaccca
ggacttgaagataagactctaatgctgaagataccacacacctcagacac
agaacatgaaggagtttacctggaactgatctggaaaccaccttgatgag
tattcactatggcagtacctaaagggatccatgtaagcttcaagagagag
aaataattcaaagtcttacctagatagaaatccatgaacccctacaacaa
gtacatcagataccctcatggtacattagtatattttagttttgtaagaa
ccacagctgtctagtaaaaatagggcacttatcagaggattttcatgcat
ggtattgtaactagccaataacaatgggtgggagagttcatgatgtctag
agggagaactatttattgc
gaattcccagtgaccacgaaccagccactggcgggtaataacatcctctc
ccctctgacttgggatggattgccgaggctgacctagaggggaaaggctt
catctcccagcatcagccagtctcatctcattgcaagggaaaggcccctg
gagacatgctcctatccatcatgtggacagctttggccaaagtgcccact
acatcactggctttaataaaaagttgctggaggctgcagtgccagtgata
gatgcacagcacaccagccagtgcctctgaagtccttccaaggtggaatg
gtacttggggaggaagaggaagaaagaaaagggaaacggtgaggaaacca
ttttaaaacaccccttaaaagtgtatttaaggaactcagataaactccat
agtggatgtcttcactctgagaagcaaaagactgagaaagtaaatgacaa
ctgaaaaaaacaacaaataaaaagaaatgagacaccttgaaccttgtcgt
caattctaaaaaattgaactaaatcatagcaaccctttgataccacataa
cgtgttggatttgaaaatgttaaggattttctgattcgtttataggactc
acattatatggatttacagttatgttcaaacgatggagaatttctgacaa
aaagaataattaaatttcattcccagtaaaaatagattctgcaaagtatt
tatggggataagttttgtttgtaattttgaataaagtttcgttaaggaaa
aatcaattgctcatctgtccataacaatgtcactcattcctatagaagct
cttgtttctacctctagggggtggtttatgatgctttgcacctgaaatat
ttcttctaattgactgaatgccactgatttcagtaacataaataatatag
ctttttttctcatgaattatataccagtgagcgctaataattttgcttaa
ggcatgttggacatacagatgtgttatagacttgagtagactatgacatg
tccaatatcactgttttctactacaggtgagtcaggaaaggacccgcaat
taccaagaactaaatgtattcttctcagacatcattaggatgggtatctc
aactgagttacagccagagactgagaccttgact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_26962698_26963827
seq2: B6Ng01-054L21.b_48_1166 (reverse)

seq1  GCAATAAATAGTTCT-CCTCTAGACATCATGAACTCT-CCACCCATTGTT  48
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GCAATAAATAGTTCTCCCTCTAGACATCATGAACTCTCCCACCCATTGTT  50

seq1  ATTTGGCTAGGTTTACAATACCATGCATGAAAATCCTCTGATTAAGTTGG  98
      | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |
seq2  A-TTGGCTAG--TTACAATACCATGCATGAAAATCCTCTGA-TAAGT--G  94

seq1  CCCTATTTTTAACTAGACAGCTGTTGGTTCTTAACAAAACTAAAATATTA  148
      |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||
seq2  CCCTATTTTT-ACTAGACAGCTG-TGGTTCTT-ACAAAACTAAAATA-TA  140

seq1  CTAATGTACCAATGAGGGTATCTTGATGTACTTGTTGTAGGGGTTCATTG  198
      |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CTAATGTACC-ATGAGGGTATC-TGATGTACTTGTTGTAGGGGTTCA-TG  187

seq1  GATTTCTATCTAGGTAAGACTTTGAATTATTTCTCTCTCTTTGAAGCTTA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GATTTCTATCTAGGTAAGACTTTGAATTATTTCTCTCTC-TTGAAGCTTA  236

seq1  CATGGATCCC-TTAGGTACTGCCATAGTGAATACTCATCAAGGTGGTTTC  297
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGATCCCTTTAGGTACTGCCATAGTGAATACTCATCAAGGTGGTTTC  286

seq1  CAGATCAGTTCCAGGTAAACTCCTTCATGTTCTGTGTCTGAGGTGTGTGG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCAGTTCCAGGTAAACTCCTTCATGTTCTGTGTCTGAGGTGTGTGG  336

seq1  TATCTTCAGCATTAGAGTCTTATCTTCAAGTCCTGGGTGGTAACCAAGGA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTCAGCATTAGAGTCTTATCTTCAAGTCCTGGGTGGTAACCAAGGA  386

seq1  ATAATAGCAGCATATTAACTCTATAGCTCAGGCTGGCCTTGAATATGCTT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAGCAGCATATTAACTCTATAGCTCAGGCTGGCCTTGAATATGCTT  436

seq1  TGGCCATCACAGTGACAGAATTACAAATACATAATTCTATGACGGACTCT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCATCACAGTGACAGAATTACAAATACATAATTCTATGACGGACTCT  486

seq1  ATTGAAAGATTTAAATTTCAGAGTTTTCATCTCTAAAATAGAATGCCAGT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAAAGATTTAAATTTCAGAGTTTTCATCTCTAAAATAGAATGCCAGT  536

seq1  AGCAAATCTTTGTTAGGTTAGAAGGGATCCAGGTAACACTATCATAGGCA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAATCTTTGTTAGGTTAGAAGGGATCCAGGTAACACTATCATAGGCA  586

seq1  ATAAACAAGAATAATGCCTAGCACAGTTATGAAAGCTTCAAAATGGTAGT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACAAGAATAATGCCTAGCACAGTTATGAAAGCTTCAAAATGGTAGT  636

seq1  GTTTTGCTCTGCCCATAGCCTATGTAGAAAGTACATGCATGTAAACACAT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGCTCTGCCCATAGCCTATGTAGAAAGTACATGCATGTAAACACAT  686

seq1  GTACAATGCCTAAGAACACATGTCTGATAATCACTTGCTTAAGTTTCTGC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAATGCCTAAGAACACATGTCTGATAATCACTTGCTTAAGTTTCTGC  736

seq1  TATGCTTTAAAATATTTCTCTATTGATTAAATGTGTATGGGTTAACAAAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTTTAAAATATTTCTCTATTGATTAAATGTGTATGGGTTAACAAAG  786

seq1  GAAAAATGGAAAGAGAAGTATAAAATACTAATTGGAAATTTAACTAATAT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAATGGAAAGAGAAGTATAAAATACTAATTGGAAATTTAACTAATAT  836

seq1  CTTCCTGGCAAATAGTGGAAGTCTTTTGTTATAGTTATACATTTCAATAT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTGGCAAATAGTGGAAGTCTTTTGTTATAGTTATACATTTCAATAT  886

seq1  AGCTGATTCTTTAATCATTGGATTTAATTGTACCAATATTCCCAATAAAA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGATTCTTTAATCATTGGATTTAATTGTACCAATATTCCCAATAAAA  936

seq1  TATTGAGTATATAATTTAATGAAATTATATTTTGAGTATACTTGATATAA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGAGTATATAATTTAATGAAATTATATTTTGAGTATACTTGATATAA  986

seq1  CCTTTATGACATATGTGAGAGCTAATAATTTCAATATTTTTTTCAAAATG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTATGACATATGTGAGAGCTAATAATTTCAATATTTTTTTCAAAATG  1036

seq1  CATGGTGACAGGTGATAGTTTTTACACTATTCTTATTTTCAAAACAGCTA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTGACAGGTGATAGTTTTTACACTATTCTTATTTTCAAAACAGCTA  1086

seq1  AAGCATTAAGGTTAGTAAAATATTTATGAATTC  1130
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATTAAGGTTAGTAAAATATTTATGAATTC  1119

seq1: chr18_26821579_26822719
seq2: B6Ng01-054L21.g_64_1197

seq1  GAATTCCCAGTGACCACGAACCAGCCACTGGCGGGTAATAACATCCTCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAGTGACCACGAACCAGCCACTGGCGGGTAATAACATCCTCTC  50

seq1  CCCTCTGACTTGGGATGGATTGCCGAGGCTGACCTAGAGGGGAAAGGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTGACTTGGGATGGATTGCCGAGGCTGACCTAGAGGGGAAAGGCTT  100

seq1  CATCTCCCAGCATCAGCCAGTCTCATCTCATTGCAAGGGAAAGGCCCCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCCCAGCATCAGCCAGTCTCATCTCATTGCAAGGGAAAGGCCCCTG  150

seq1  GAGACATGCTCCTATCCATCATGTGGACAGCTTTGGCCAAAGTGCCCACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACATGCTCCTATCCATCATGTGGACAGCTTTGGCCAAAGTGCCCACT  200

seq1  ACATCACTGGCTTTAATAAAAAGTTGCTGGAGGCTGCAGTGCCAGTGATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCACTGGCTTTAATAAAAAGTTGCTGGAGGCTGCAGTGCCAGTGATA  250

seq1  GATGCACAGCACACCAGCCAGTGCCTCTGAAGTCCTTCCAAGGTGGAATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCACAGCACACCAGCCAGTGCCTCTGAAGTCCTTCCAAGGTGGAATG  300

seq1  GTACTTGGGGAGGAAGAGGAAGAAAGAAAAGGGAAACGGTGAGGAAACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTGGGGAGGAAGAGGAAGAAAGAAAAGGGAAACGGTGAGGAAACCA  350

seq1  TTTTAAAACACCCCTTAAAAGTGTATTTAAGGAACTCAGATAAACTCCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAACACCCCTTAAAAGTGTATTTAAGGAACTCAGATAAACTCCAT  400

seq1  AGTGGATGTCTTCACTCTGAGAAGCAAAAGACTGAGAAAGTAAATGACAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGATGTCTTCACTCTGAGAAGCAAAAGACTGAGAAAGTAAATGACAA  450

seq1  CTGAAAAAAACAACAAATAAAAAGAAATGAGACACCTTGAACCTTGTCGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAAAAAACAACAAATAAAAAGAAATGAGACACCTTGAACCTTGTCGT  500

seq1  CAATTCTAAAAAATTGAACTAAATCATAGCAACCCTTTGATACCACATAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCTAAAAAATTGAACTAAATCATAGCAACCCTTTGATACCACATAA  550

seq1  CGTGTTGGATTTGAAAATGTTAAGGATTTTCTGATTCGTTTATAGGACTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTTGGATTTGAAAATGTTAAGGATTTTCTGATTCGTTTATAGGACTC  600

seq1  ACATTATATGGATTTACAGTTATGTTCAAACGATGGAGAATTTCTGACAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTATATGGATTTACAGTTATGTTCAAACGATGGAGAATTTCTGACAA  650

seq1  AAAGAATAATTAAATTTCATTCCCAGTAAAAATAGATTCTGCAAAGTATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAATAATTAAATTTCATTCCCAGTAAAAATAGATTCTGCAAAGTATT  700

seq1  TATGGGGATAAGTTTTGTTTGTAATTTTGAATAAAGTTTCGTTAAGGAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGGGATAAGTTTTGTTTGTAATTTTGAATAAAGTTTCGTTAAGGAAA  750

seq1  AATCAATTGCTCATCTGTCCATAACAATGTCACTCATTCCTATAGAAGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAATTGCTCATCTGTCCATAACAATGTCACTCATTCCTATAGAAGCT  800

seq1  CTTGTTTCTACCTCTAGGGGGTGGTTTATGATGCTTTGCACCTGAAATAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTTCTACCTCTAGGGGGTGGTTTATGATGCTTTGCACCTGAAATAT  850

seq1  TTCTTCTAATTGACTGAATGCCACTGATTTCAGTAACATAAATAATATAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCTAATTGACTGAATGCCACTGATTTCAGTAACATAAATAATATAG  900

seq1  CTTTTTTTCTCATGAATTATATACCAGTGAGCGCTAATAATTTTGCTTAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTTTCTCATGAATTATATACCAGTGAGCGCTAATAATTTTGCTTAA  950

seq1  GGCATGTTGGACATACAGATGTGTATATAGACTTGAGTAGACTATGACAT  1000
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATGTTGGACATACAGATGTGT-TATAGACTTGAGTAGACTATGACAT  999

seq1  GTCCAAATATCACTGTTTTCTACTACAGGTGAGTCAGGATAGGACCCGAA  1050
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
seq2  GTCC-AATATCACTGTTTTCTACTACAGGTGAGTCAGGAAAGGACCCGCA  1048

seq1  ATCA-CAAGAGCT-AATGTATCTCTCTCAGGACATCA-TAGGATGGGTTA  1097
      || | ||||| || |||||||   ||||| ||||||| ||||||||| ||
seq2  ATTACCAAGAACTAAATGTATTCTTCTCA-GACATCATTAGGATGGG-TA  1096

seq1  TCTCAACATGAGTTTACAAGCACAGGAGGACTGAGACCTTGACT  1141
      ||||||| |||| |||||  || |    ||||||||||||||||
seq2  TCTCAAC-TGAG-TTACAGCCAGA----GACTGAGACCTTGACT  1134