BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-058B24
Chromosome18 (Build37)
Map Location 22,016,929 - 22,173,762
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4921528I01Rik
Upstream geneD030074E01Rik, Rnf125, Rnf138, Mep1b, EG622978, Gm944, LOC665722, LOC225264, Klhl14
Downstream geneLOC546708, LOC100040547, Asxl3, Nol4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-058B24.bB6Ng01-058B24.g
ACCDH879787DH879788
length1,0471,036
definitionDH879787|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-058B24, 5' end.DH879788|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-058B24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,016,929 - 22,017,984)(22,172,718 - 22,173,762)
sequence
gaattcaggaagccaggatttcaactccctcccaccccctgtccttgcag
ctatggccattgctgtgaggtcagctgggatgaaaaactatcctacatag
aaacatgggaggggtatggcccctaaaacaagcacagatgggcagcccag
cagagctatgggctgtgttggacccggcaactagttctgttaatattatc
atttaagtatctttttttaaaaaattgaatccttcattctttcttttact
gtgatgtctaccattatttgaaaggttccatgtggacttacttaagaatg
aagtttagaacataaaagtacttattacttttatttaatgaatacttagg
atccaaatactaacctctagaatagcaataggaagtgagagatgtgttag
ccctctgacccattagcttagtccagaaaagtgaagattcagtgatgtaa
taggaaaggcctgggaatgctttcaaaatataagtgactaagagcttgac
tttttgaagtgaagtgaagagggcaatcctctgtcatgacttaagcatgg
agaaggtgctctgggtgattttcattggtgtgtgggactcagtccaacac
tggaaggtagtttcaattttagcattgccttcagcaatattaagaaccac
agcatcttgtcacggtttcatttgagaagtttttttccctgaataattta
ctacattgatttggagatttagaaaaatgtaaacaagagaattcactagg
gatgttaaaaggcacttttacttttaaatggataaattcttcacactgat
gggtttgaagtacattagggaaattcccaagggcagagcctggggtatct
gtgtgaggcctgaacaagtaggagcattgctaagaaggtagtgggtggtc
tcaacctttggctcttacactctactccaaacacagctcggatatccatg
ctctgcttcccctccggactcagaaaaaatcagtatctattttctctgga
ggaaagcacatactgaggatagagagacattgacacagtagcgaaac
gaattctttggaataccccattattaatgctcagcaagaacttgaatata
aaaaattgattcctaactgccttagatatatctatcctgatagtttgcca
catgtgacccaaagcatagtgttcatatgtgtgatgagaaaattcagggt
tcactgatgaccaaatcttctcattggggacattttttatgtggggtcca
ctttaaggttttagtggtaaacagtgtggtagcacactctgcttcctccc
agcaagcatgatgtcattcctttttagaaactgagtaagttcacaaatac
ctatgtaaggcaatccaagaagagatatgttatatgaaaggtatacttgg
tgttactgatccagacattctccttgggcagaagaattgatcacaattat
agatcatctttagatctataattgtttagggagaaaaccctataatatct
actgtagtgttgaccaagcaaataaaagaattagatgtacaagcaactag
taagagagtcagacactctactccactctgcattcttgacagcccagtct
ttccccatgccaaagcttctctcctgtgtttttaacatttatttatttat
tgttgttgtttgtttgttgtttttggcagccatgctcagctctctgtaat
ttgtgttatgatggaagagcaatagactaccctaggagaacaattaccac
attgggtccatacacagactctctcgcaatgtcttccaaagcttatttta
ctccttaacattgctacctatctccctatgtaaggagatacaacttctcc
tggttagaggattgaaacattggccaagtcattatttcttcaccttttca
catggagaatgcttggcttctaacaaaatggaaaacccaccttattcatc
agacaggcacctaaatagaaaatagactcttttacctcagctttaatttc
aaagcatattatgacatgctagtagttctatagttgcctacaaattgttt
tcttcatttccaaccctgatagtgctcccggcctcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_22016929_22017984
seq2: B6Ng01-058B24.b_46_1092

seq1  GAATTCAGGAAGCCAGGATTTCAACTCCCTCCCACCCCCTGTCCTTGCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGAAGCCAGGATTTCAACTCCCTCCCACCCCCTGTCCTTGCAG  50

seq1  CTATGGCCATTGCTGTGAGGTCAGCTGGGATGAAAAACTATCCTACATAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGGCCATTGCTGTGAGGTCAGCTGGGATGAAAAACTATCCTACATAG  100

seq1  AAACATGGGAGGGGTATGGCCCCTAAAACAAGCACAGATGGGCAGCCCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATGGGAGGGGTATGGCCCCTAAAACAAGCACAGATGGGCAGCCCAG  150

seq1  CAGAGCTATGGGCTGTGTTGGACCCGGCAACTAGTTCTGTTAATATTATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCTATGGGCTGTGTTGGACCCGGCAACTAGTTCTGTTAATATTATC  200

seq1  ATTTAAGTATCTTTTTTTAAAAAATTGAATCCTTCATTCTTTCTTTTACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGTATCTTTTTTTAAAAAATTGAATCCTTCATTCTTTCTTTTACT  250

seq1  GTGATGTCTACCATTATTTGAAAGGTTCCATGTGGACTTACTTAAGAATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGTCTACCATTATTTGAAAGGTTCCATGTGGACTTACTTAAGAATG  300

seq1  AAGTTTAGAACATAAAAGTACTTATTACTTTTATTTAATGAATACTTAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTAGAACATAAAAGTACTTATTACTTTTATTTAATGAATACTTAGG  350

seq1  ATCCAAATACTAACCTCTAGAATAGCAATAGGAAGTGAGAGATGTGTTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAAATACTAACCTCTAGAATAGCAATAGGAAGTGAGAGATGTGTTAG  400

seq1  CCCTCTGACCCATTAGCTTAGTCCAGAAAAGTGAAGATTCAGTGATGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTGACCCATTAGCTTAGTCCAGAAAAGTGAAGATTCAGTGATGTAA  450

seq1  TAGGAAAGGCCTGGGAATGCTTTCAAAATATAAGTGACTAAGAGCTTGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAAAGGCCTGGGAATGCTTTCAAAATATAAGTGACTAAGAGCTTGAC  500

seq1  TTTTTGAAGTGAAGTGAAGAGGGCAATCCTCTGTCATGACTTAAGCATGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGAAGTGAAGTGAAGAGGGCAATCCTCTGTCATGACTTAAGCATGG  550

seq1  AGAAGGTGCTCTGGGTGATTTTCATTGGTGTGTGGGACTCAGTCCAACAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGTGCTCTGGGTGATTTTCATTGGTGTGTGGGACTCAGTCCAACAC  600

seq1  TGGAAGGTAGTTTCAATTTTAGCATTGCCTTCAGCAATATTAAGAACCAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGGTAGTTTCAATTTTAGCATTGCCTTCAGCAATATTAAGAACCAC  650

seq1  AGCATCTTGTCACGGTTTCATTTGAGAAGTTTTTTTCCCTGAATAATTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCTTGTCACGGTTTCATTTGAGAAGTTTTTTTCCCTGAATAATTTA  700

seq1  CTACATTGATTTGGAGATTTAGAAAAATGTAAACAAGAGAATTCACTAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATTGATTTGGAGATTTAGAAAAATGTAAACAAGAGAATTCACTAGG  750

seq1  GATGTTAAAAGGCACTTTTACTTTTAAATGGATAAATTCTTCACACTGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTAAAAGGCACTTTTACTTTTAAATGGATAAATTCTTCACACTGAT  800

seq1  GGGTTTGAAGTACATTAGGGAAATTCCCAAGGGCAGAGCCTGGGGTATCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTGAAGTACATTAGGGAAATTCCCAAGGGCAGAGCCTGGGGTATCT  850

seq1  GTGTGAGGCCTGAACAAGTAGGAGCATTGCTAAGAAGGTAGTGGGTGGTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGAGGCCTGAACAAGTAGGAGCATTGCTAAGAAGGTAGTGGGTGGTC  900

seq1  TCAACCTTTGGCTCTTACACTCTACTCCAAACACAGCTCGGATATCCATG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACCTTTGGCTCTTACACTCTACTCCAAACACAGCTCGGATATCCATG  950

seq1  CTCTTGCTTCCCCTCCGGACTCCAGAAAAAAATCAGTATCTATTTTCTCT  1000
      ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTC-TGCTTCCCCTCCGGACT-CAG-AAAAAATCAGTATCTATTTTCTCT  997

seq1  GGAGAAAAGCACATTAACTGAGGATAGGAGAGACAATGAACACAGGTAGC  1050
      |||| |||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||||
seq2  GGAGGAAAGCACAT--ACTGAGGATA-GAGAGACATTG-ACACA-GTAGC  1042

seq1  AGAAAC  1056
       |||||
seq2  -GAAAC  1047

seq1: chr18_22172718_22173762
seq2: B6Ng01-058B24.g_68_1103 (reverse)

seq1  GGAGTGCCGTGAGCACTTATCAAGTGGTTGGGAAATGAAG-AAACAATTT  49
      |||| |||| |||||| |||||   || | |||||||||| |||||||||
seq2  GGAG-GCCGGGAGCAC-TATCA---GGGTTGGAAATGAAGAAAACAATTT  45

seq1  GTAGGCAACTATAGAACTAACTCGCATGTCATAATATGCTTTGAAATTAA  99
      |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGCAACTATAGAACT-ACTAGCATGTCATAATATGCTTTGAAATTAA  94

seq1  AGCTGAGGTTAAAAGAGTCTAATTTTTCCTATTTAGGTGCCTGTCTGATG  149
      |||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAGG-TAAAAGAGTCTA---TTTTCTATTTAGGTGCCTGTCTGATG  140

seq1  AATAAGGTGGGTTTTCCATTTTGTTAGAAGCCAAGCATTCTCCATGTGAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGGTGGGTTTTCCATTTTGTTAGAAGCCAAGCATTCTCCATGTGAA  190

seq1  AAGGTGAAGAAATAATGACTTGGCCAATGTTTCAATCCTCTAACCAGGAG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGAAGAAATAATGACTTGGCCAATGTTTCAATCCTCTAACCAGGAG  240

seq1  AAGTTGTATCTCCTTACATAGGGAGATAGGTAGCAATGTTAAGGAGTAAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGTATCTCCTTACATAGGGAGATAGGTAGCAATGTTAAGGAGTAAA  290

seq1  ATAAGCTTTGGAAGACATTGCGAGAGAGTCTGTGTATGGACCCAATGTGG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCTTTGGAAGACATTGCGAGAGAGTCTGTGTATGGACCCAATGTGG  340

seq1  TAATTGTTCTCCTAGGGTAGTCTATTGCTCTTCCATCATAACACAAATTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTGTTCTCCTAGGGTAGTCTATTGCTCTTCCATCATAACACAAATTA  390

seq1  CAGAGAGCTGAGCATGGCTGCCAAAAACAACAAACAAACAACAACAATAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGCTGAGCATGGCTGCCAAAAACAACAAACAAACAACAACAATAA  440

seq1  ATAAATAAATGTTAAAAACACAGGAGAGAAGCTTTGGCATGGGGAAAGAC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAAATGTTAAAAACACAGGAGAGAAGCTTTGGCATGGGGAAAGAC  490

seq1  TGGGCTGTCAAGAATGCAGAGTGGAGTAGAGTGTCTGACTCTCTTACTAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTGTCAAGAATGCAGAGTGGAGTAGAGTGTCTGACTCTCTTACTAG  540

seq1  TTGCTTGTACATCTAATTCTTTTATTTGCTTGGTCAACACTACAGTAGAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTGTACATCTAATTCTTTTATTTGCTTGGTCAACACTACAGTAGAT  590

seq1  ATTATAGGGTTTTCTCCCTAAACAATTATAGATCTAAAGATGATCTATAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATAGGGTTTTCTCCCTAAACAATTATAGATCTAAAGATGATCTATAA  640

seq1  TTGTGATCAATTCTTCTGCCCAAGGAGAATGTCTGGATCAGTAACACCAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGATCAATTCTTCTGCCCAAGGAGAATGTCTGGATCAGTAACACCAA  690

seq1  GTATACCTTTCATATAACATATCTCTTCTTGGATTGCCTTACATAGGTAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATACCTTTCATATAACATATCTCTTCTTGGATTGCCTTACATAGGTAT  740

seq1  TTGTGAACTTACTCAGTTTCTAAAAAGGAATGACATCATGCTTGCTGGGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGAACTTACTCAGTTTCTAAAAAGGAATGACATCATGCTTGCTGGGA  790

seq1  GGAAGCAGAGTGTGCTACCACACTGTTTACCACTAAAACCTTAAAGTGGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCAGAGTGTGCTACCACACTGTTTACCACTAAAACCTTAAAGTGGA  840

seq1  CCCCACATAAAAAATGTCCCCAATGAGAAGATTTGGTCATCAGTGAACCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCACATAAAAAATGTCCCCAATGAGAAGATTTGGTCATCAGTGAACCC  890

seq1  TGAATTTTCTCATCACACATATGAACACTATGCTTTGGGTCACATGTGGC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTTTCTCATCACACATATGAACACTATGCTTTGGGTCACATGTGGC  940

seq1  AAACTATCAGGATAGATATATCTAAGGCAGTTAGGAATCAATTTTTTATA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTATCAGGATAGATATATCTAAGGCAGTTAGGAATCAATTTTTTATA  990

seq1  TTCAAGTTCTTGCTGAGCATTAATAATGGGGTATTCCAAAGAATTC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGTTCTTGCTGAGCATTAATAATGGGGTATTCCAAAGAATTC  1036