BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-063M01
Chromosome18 (Build37)
Map Location 63,755,180 - 63,898,349
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC627792, Txnl1, Wdr7
Upstream geneSpink10, EG408198, 2700046A07Rik, Apcdd1, Napg, 9430028L06Rik, 9030411M15Rik
Downstream geneLOC629436, LOC667773, St8sia3, LOC433193, Onecut2, LOC667783, LOC100043304, Fech, Nars, Atp8b1, LOC629480
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-063M01.bB6Ng01-063M01.g
ACCDH883748DH883749
length1,1491,152
definitionDH883748|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063M01, 5' end.DH883749|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063M01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,897,185 - 63,898,349)(63,755,180 - 63,756,358)
sequence
gaattcaaatagtttatcgattaagatgtgttcatattaaggtatttaga
tgctttgatcatacccccgttttaaaagtgcttacagcatggttattcgg
tgtattttcatgtaattcaatagtgttagtattcatgtcaactacagtag
aacataaatgctaaaggagtgaaaaactctataacatttctctaaaacta
gtatttatagtcttgtgttcaattttattaaaaagtggtttaccaatcac
agggaaagttacttatttgttgttaaataatcaatctagaaagcaggcca
ctcttaaccaaaaagaagtctccactttaaaataaaaatacaaaacaaag
agctctacacatgagcaacactaagcagtctcagcagactgtactgatag
tcatatatatgtgtaacaatggtaacgaaagaggaggacgccatcaggtt
gagagacgtgggagaggctggcctgggaaagcacaaggtagaaaggacgt
aaatacagtactcatgtatgaaattgaaaacataacaaatatatatgcga
ttgcatcataaaaattactggcctctagaatttacctatagtatgcatag
acaagtatttgactttacttaaactttgatgatttcaatttactacacac
ttaacagggagttgccatagaagctacaattaccaataccacatttcagt
gtctgagtgtctctcactataacacacatacatttcaatttaaaatatac
tcgaacatactagacagctgacatttaaagaaaatcacatgcacatgatg
gctaataacggctgtcgacttgacaggatctagaatcagtacaggggcct
ctgaatacctgtgtaaaggtcctctagacttctacaggctgggtcagact
gcatgacacacaagacaagctacacaccagcactctgactagggaagcaa
tgtaaccagctgccttaggccgctgcctgagatgtcaccgccaagacgga
ctgggtcccccactacatggcaagcacaccctgcttctttacctgatgtg
ggtattttgtgaagcacaaggaacgtactaaacagataattatgttttat
taatgcagtcttttctaaccatcgcttccttagttagctgatgactgac
gaattctttggtaaactaagcagagataaatagcatctgtgagatagtgt
ggtaatttcacaagaagatggtaggtgtgtagattatgcatattagtggg
taactatgagtcaccaataatgcatcagtgtcccattaagaaaggaaata
aaagcactttcccgtagagttgtttaaccaagagcaagtctagttttgaa
ctttctacttcatgttcctcgtgtcttctgtttttctgttatatgagtct
gaatctctgccttcctgaaagccttcctgtgaacgtgtccctgtctgtgt
gtctgctatgtgactaagtgtgtctgttcctaacaaaagactttgttctg
tctttattgaacagcagagaaagcatcacgtggcggaaggaatgggaaac
tttatagaaccctttaacaggattttttacaagggactaagtccctggct
ccaagtgatcccaactgactcagacaacaaacatcactgttgatcaacca
atatccataaatgtttgctttcagctttatgggagatgttaggaagttgc
tttcaactgctgtattaactacgttcagtaagtgatacacacacacatca
tctggggcaggggcatggacggattcacaacttacgtttgcagctgtaca
attaacttaggttgtgaaagctggttacgtgggaaatccaaggcaagtaa
gattaattattagattaattattacactgttctcttaaagtcaggttaaa
gagacagtcagggtatacagtaggatagcagtcttaagtcttaagtgacc
tcaaggtgtattactgtctctggctgtgagctccagcaaaagctccagtt
ttcttggcatataagagacattttcataatatcgcattgccagagagtga
gcaaatgccactctcatctggcgtttcttcccaaggtcaatcatcatctt
tgcccagtttgagctattgctctcattcctcagtagcttctaatagtgtg
gtagaaaaattttttatcatagtttgaaaatggattcactactctgatct
agacctcagaacctcttgttaatttatgctcgtgggaattatgtttaaca
gaatcaaaagcattacatgcacacagacacaggaaatgggctgtaattac
aa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_63897185_63898349
seq2: B6Ng01-063M01.b_46_1194 (reverse)

seq1  GTCAGTCACTTCAGCTAAACTAAGGGATAGCGATGTGTATGAAAAGACCT  50
      ||||||||  |||||| ||||||||   ||||||| ||  ||||||| ||
seq2  GTCAGTCA--TCAGCT-AACTAAGG--AAGCGATG-GTTAGAAAAGA-CT  43

seq1  GCATTAATAAAACATAATATACTGTGTTAGTTACGTTCCTTGTTGCTGTC  100
      ||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| |||| ||
seq2  GCATTAATAAAACATAATTATCTGT-TTAG-TACGTTCCTTG-TGCT-TC  89

seq1  ACAAAATACCCAACATCAGGGTAAAGGAAGCAGGGTGTGCTTTGCCATGT  150
      ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||
seq2  ACAAAATACCC-ACATCA-GGTAAA-GAAGCAGGGTGTGC-TTGCCATGT  135

seq1  AGTTGGGGGACCCAGTCCGTCTTGGCGGTGACATCTCAGGCAGCGGCCTA  200
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AG-TGGGGGACCCAGTCCGTCTTGGCGGTGACATCTCAGGCAGCGGCCTA  184

seq1  AGGCAGCTGGTTACATTGCTTCCCTAGTCAGAGTGCTGGTGTGTAGCTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGCTGGTTACATTGCTTCCCTAGTCAGAGTGCTGGTGTGTAGCTTG  234

seq1  TCTTGTGTGTCATGCAGTCTGACCCAGCCTGTAGAAGTCTAGAGGACCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTGTGTCATGCAGTCTGACCCAGCCTGTAGAAGTCTAGAGGACCTT  284

seq1  TACACAGGTATTCAGAGGCCCCTGTACTGATTCTAGATCCTGTCAAGTCG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACAGGTATTCAGAGGCCCCTGTACTGATTCTAGATCCTGTCAAGTCG  334

seq1  ACAGCCGTTATTAGCCATCATGTGCATGTGATTTTCTTTAAATGTCAGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCCGTTATTAGCCATCATGTGCATGTGATTTTCTTTAAATGTCAGCT  384

seq1  GTCTAGTATGTTCGAGTATATTTTAAATTGAAATGTATGTGTGTTATAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAGTATGTTCGAGTATATTTTAAATTGAAATGTATGTGTGTTATAGT  434

seq1  GAGAGACACTCAGACACTGAAATGTGGTATTGGTAATTGTAGCTTCTATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGACACTCAGACACTGAAATGTGGTATTGGTAATTGTAGCTTCTATG  484

seq1  GCAACTCCCTGTTAAGTGTGTAGTAAATTGAAATCATCAAAGTTTAAGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACTCCCTGTTAAGTGTGTAGTAAATTGAAATCATCAAAGTTTAAGTA  534

seq1  AAGTCAAATACTTGTCTATGCATACTATAGGTAAATTCTAGAGGCCAGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCAAATACTTGTCTATGCATACTATAGGTAAATTCTAGAGGCCAGTA  584

seq1  ATTTTTATGATGCAATCGCATATATATTTGTTATGTTTTCAATTTCATAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTATGATGCAATCGCATATATATTTGTTATGTTTTCAATTTCATAC  634

seq1  ATGAGTACTGTATTTACGTCCTTTCTACCTTGTGCTTTCCCAGGCCAGCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTACTGTATTTACGTCCTTTCTACCTTGTGCTTTCCCAGGCCAGCC  684

seq1  TCTCCCACGTCTCTCAACCTGATGGCGTCCTCCTCTTTCGTTACCATTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCACGTCTCTCAACCTGATGGCGTCCTCCTCTTTCGTTACCATTGT  734

seq1  TACACATATATATGACTATCAGTACAGTCTGCTGAGACTGCTTAGTGTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACATATATATGACTATCAGTACAGTCTGCTGAGACTGCTTAGTGTTG  784

seq1  CTCATGTGTAGAGCTCTTTGTTTTGTATTTTTATTTTAAAGTGGAGACTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGTGTAGAGCTCTTTGTTTTGTATTTTTATTTTAAAGTGGAGACTT  834

seq1  CTTTTTGGTTAAGAGTGGCCTGCTTTCTAGATTGATTATTTAACAACAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTGGTTAAGAGTGGCCTGCTTTCTAGATTGATTATTTAACAACAAA  884

seq1  TAAGTAACTTTCCCTGTGATTGGTAAACCACTTTTTAATAAAATTGAACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTAACTTTCCCTGTGATTGGTAAACCACTTTTTAATAAAATTGAACA  934

seq1  CAAGACTATAAATACTAGTTTTAGAGAAATGTTATAGAGTTTTTCACTCC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACTATAAATACTAGTTTTAGAGAAATGTTATAGAGTTTTTCACTCC  984

seq1  TTTAGCATTTATGTTCTACTGTAGTTGACATGAATACTAACACTATTGAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCATTTATGTTCTACTGTAGTTGACATGAATACTAACACTATTGAA  1034

seq1  TTACATGAAAATACACCGAATAACCATGCTGTAAGCACTTTTAAAACGGG  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATGAAAATACACCGAATAACCATGCTGTAAGCACTTTTAAAACGGG  1084

seq1  GGTATGATCAAAGCATCTAAATACCTTAATATGAACACATCTTAATCGAT  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATGATCAAAGCATCTAAATACCTTAATATGAACACATCTTAATCGAT  1134

seq1  AAACTATTTGAATTC  1165
      |||||||||||||||
seq2  AAACTATTTGAATTC  1149

seq1: chr18_63755180_63756358
seq2: B6Ng01-063M01.g_66_1217

seq1  GAATTCTTTGGTAAACTAAGCAGAGATAAATAGCATCTGTGAGATAGTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGGTAAACTAAGCAGAGATAAATAGCATCTGTGAGATAGTGT  50

seq1  GGTAATTTCACAAGAAGATGGTAGGTGTGTAGATTATGCATATTAGTGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAATTTCACAAGAAGATGGTAGGTGTGTAGATTATGCATATTAGTGGG  100

seq1  TAACTATGAGTCACCAATAATGCATCAGTGTCCCATTAAGAAAGGAAATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTATGAGTCACCAATAATGCATCAGTGTCCCATTAAGAAAGGAAATA  150

seq1  AAAGCACTTTCCCGTAGAGTTGTTTAACCAAGAGCAAGTCTAGTTTTGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCACTTTCCCGTAGAGTTGTTTAACCAAGAGCAAGTCTAGTTTTGAA  200

seq1  CTTTCTACTTCATGTTCCTCGTGTCTTCTGTTTTTCTGTTATATGAGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTACTTCATGTTCCTCGTGTCTTCTGTTTTTCTGTTATATGAGTCT  250

seq1  GAATCTCTGCCTTCCTGAAAGCCTTCCTGTGAACGTGTCCCTGTCTGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTCTGCCTTCCTGAAAGCCTTCCTGTGAACGTGTCCCTGTCTGTGT  300

seq1  GTCTGCTATGTGACTAAGTGTGTCTGTTCCTAACAAAAGACTTTGTTCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCTATGTGACTAAGTGTGTCTGTTCCTAACAAAAGACTTTGTTCTG  350

seq1  TCTTTATTGAACAGCAGAGAAAGCATCACGTGGCGGAAGGAATGGGAAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTATTGAACAGCAGAGAAAGCATCACGTGGCGGAAGGAATGGGAAAC  400

seq1  TTTATAGAACCCTTTAACAGGATTTTTTACAAGGGACTAAGTCCCTGGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAGAACCCTTTAACAGGATTTTTTACAAGGGACTAAGTCCCTGGCT  450

seq1  CCAAGTGATCCCAACTGACTCAGACAACAAACATCACTGTTGATCAACCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTGATCCCAACTGACTCAGACAACAAACATCACTGTTGATCAACCA  500

seq1  ATATCCATAAATGTTTGCTTTCAGCTTTATGGGAGATGTTAGGAAGTTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCATAAATGTTTGCTTTCAGCTTTATGGGAGATGTTAGGAAGTTGC  550

seq1  TTTCAACTGCTGTATTAACTACGTTCAGTAAGTGATACACACACACATCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAACTGCTGTATTAACTACGTTCAGTAAGTGATACACACACACATCA  600

seq1  TCTGGGGCAGGGGCATGGACGGATTCACAACTTACGTTTGCAGCTGTACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGGCAGGGGCATGGACGGATTCACAACTTACGTTTGCAGCTGTACA  650

seq1  ATTAACTTAGGTTGTGAAAGCTGGTTACGTGGGAAATCCAAGGCAAGTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAACTTAGGTTGTGAAAGCTGGTTACGTGGGAAATCCAAGGCAAGTAA  700

seq1  GATTAATTATTAGATTAATTATTACACTGTTCTCTTAAAGTCAGGTTAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAATTATTAGATTAATTATTACACTGTTCTCTTAAAGTCAGGTTAAA  750

seq1  GAGACAGTCAGGGTATACAGTAGGATAGCAGTCTTAAGTCTTAAGTGACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAGTCAGGGTATACAGTAGGATAGCAGTCTTAAGTCTTAAGTGACC  800

seq1  TCAAGGTGTATTACTGTCTCTGGCTGTGAGCTCCAGCAAAAGCTCCAG-T  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TCAAGGTGTATTACTGTCTCTGGCTGTGAGCTCCAGCAAAAGCTCCAGTT  850

seq1  CTCTTGGCATATAAGAGACATTTTCATAATATCGCATTGCCAGAGAGTGA  899
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGGCATATAAGAGACATTTTCATAATATCGCATTGCCAGAGAGTGA  900

seq1  GCAAATGCCACTCTCATCTGGCGTTTCTTCCCAAGGTCAATCAATCATCT  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GCAAATGCCACTCTCATCTGGCGTTTCTTCCCAAGGTCAATC-ATCATCT  949

seq1  TTGCCCCAGTTTGAGCCTATTGCTCTTCATTCCTCAGTAGCTTCTAATAG  999
      ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TTG-CCCAGTTTGAG-CTATTGCTC-TCATTCCTCAGTAGCTTCTAATAG  996

seq1  TTGTGGTTAGAAAAATATTTTATCCATAGTTTGACAAAGGGGATTCCACT  1049
       ||||| ||||||||| |||||| |||||||||  |||  ||||| ||||
seq2  -TGTGG-TAGAAAAATTTTTTAT-CATAGTTTG--AAAATGGATT-CACT  1040

seq1  ACTTCTGGATCTAGGACTCCAAGAA-CTCTTGTTTAAATATTAATTGGCT  1098
      || ||| |||||||  |||  |||| |||||||| |  |||      |||
seq2  AC-TCT-GATCTAGACCTC--AGAACCTCTTGTTAATTTAT------GCT  1080

seq1  CGTGGG-ATTATGGTTTACCAG-ATCAAATAGGCAATATACATGCAAACC  1146
      |||||| ||||| ||||| ||| |||||  | |||   ||||||||   |
seq2  CGTGGGAATTAT-GTTTAACAGAATCAA--AAGCA--TTACATGCA---C  1122

seq1  ACAGACCACAGGAAAATGGGCCTGTAGTTACAA  1179
      ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||
seq2  ACAGA-CACAGG-AAATGGG-CTGTAATTACAA  1152