BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-071I06
Chromosome18 (Build37)
Map Location 21,795,909 - 21,903,218
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKlhl14
Upstream geneTtr, LOC100040823, B4galt6, D030074E01Rik, Rnf125, Rnf138, Mep1b, EG622978, Gm944, LOC665722, LOC225264
Downstream gene4921528I01Rik, LOC546708, LOC100040547, Asxl3, Nol4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-071I06.bB6Ng01-071I06.g
ACCDH889195DH889196
length1,1331,162
definitionDH889195|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-071I06, 5' end.DH889196|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-071I06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(21,902,059 - 21,903,218)(21,795,909 - 21,797,067)
sequence
gaattccacaagaaaacaggactattcctccaagaaagaaggctgtctgc
atttgctgcttcctgcatcagggcatgcctccaatcttaagagctttggg
ggaacacatgtgtgtgtatataaagttgctatacaattcctgactcctgt
aactaactgtgggcactctgtttttgagatatctttataagtgtatgcac
attcacactggccactcacataaacatctttgcctactatttttaggcac
actgtagcattttggagagtatattgtttggaataaggccccgatgtagc
agtgacctggatttattgtcagtgttcaaacctcaggcgttatctcctgt
ggttgggcttacaacttaccatttggtcctgagagatctaaaacatcttc
tgggtctttatctttctcatatctcacattccagaacaattcttctaaat
agcatgttaatgcgttttctaggtaaatattaaataatgtttcaaggctg
gaaagttagttcattccataaaattcttgccacaaatcatgaagaactaa
attttatcccagtattccaccttaataagttgactgtgttagtatagctt
tagaatcctggtacttaaggggtagagttacacagatctctggggcttac
tgaacaaccagtctggcctacttagttagttccaatcaatcaatcaatca
atcaatcaatccaccaatcactaatggttccactatatttacaagaaatg
atgttgtctaaattaaggtagggaagtgtcctggagagcagggcatcatg
acagcattgggtagagagctctttggataggtacataggtccttgagtct
ttcaagatagtgagaaaactgcaaaaaaaaaaaagttcatattacagagg
gaatttctattgatcagttcagttctgccctgcagtcaaataagactaag
ccttctcagacctccaaagtggacttcagagaagcgcagaggtaacaagg
cagccaagaactgcccttctgaagctgggcactatctaggcaagaattca
gatctgtcacaatgtcaaggcaagaaggatgctttatcatttcttatagc
aattctttataaaaaaaactgattaagctacta
gaattcaattgtgtctcctccaaattcagacagatacctaagtcctaaac
cttagtgggactcacttgtctatgtaactttaaggaactaatcaggttaa
ataacttctacaggggaactctgacctaacagcactagtttctggtaaga
agagaaggagacaggagaatgcataagacatggagggaagaccatacaca
ggaagggggagaccttccatttaggcagaaaggcacacctacaaatagcc
ctggcatttaaacatgcagcttccagtcacccaatctgtgatgacaagtt
atcacagaccaaatgggtacaagcatccctggcagaactgacacatacac
acaaagggctgacaaggaccagtgagtgagtttcgtgttcagttttggga
acagacatcagagaaggtcatcctgatgaggcttgtatggctgtcttgag
aaagctcgtgagttcacatatgatcactccatcttatgacccagtgttgt
gtcacctaactgtgtatggagtgcctggaatatgcaaaatcatggttcct
tagttcttctttggtgttctgaaactatatgcatatggtgagtcttcgtg
atagtgttgttgcagaggaaggaaagctggggaacagataaagcatttat
ggtggagtctaggatctgtaaaactatacatctgcatttctttgagcctt
cagaaattttaaacagttaccctccctccattccttccagagccactttc
ctgcactagcctcttcccccgagtcactgctcctctgattccctttagta
aaaagcaggactccctcagatattaatgaaacacagcagaacaagttaca
gtaagactaggtccaaaccctcatatcaaaggctgggtgaggcaagtcag
tagaaaggaaaagggcccaaaaagcatgtgtagagtcagatacaccccta
ctccccctgttaggagtcctacaaagcaccacgaagcacttatcacatat
atgcagaggacataggagcagattcatgcagtgattgccattccagtctc
ttggggagcctatgacaggccccttctttttgcagacagatgttcatctc
ccgagatttaggtttatttatcttacccattaccacctataccttgcctg
ccttctagttct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_21902059_21903218
seq2: B6Ng01-071I06.b_43_1175 (reverse)

seq1  TAGTAGCTATAATACAGTTTTTTTTTTTATTAAGAATTTGCTTTATAAGA  50
      |||||||| |||| |||   |||||||||| ||||| ||||  |||||||
seq2  TAGTAGCT-TAAT-CAG---TTTTTTTTATAAAGAA-TTGC--TATAAGA  42

seq1  AATTGATAAAGCATTCCTCTTTGCCTTTGACATTGTGACAGGATCTTGGA  100
      || |||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||  ||
seq2  AA-TGATAAAGCA-TCCTTCTTGCC-TTGACATTGTGACA-GATCT--GA  86

seq1  ATTTCCTTGCCTAGGATAAGTGCCCAGCCTTCAGAAGGGGCAGTTCTTTG  150
      |||  |||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||
seq2  ATT--CTTGCCTA-GAT-AGTGCCCAG-CTTCAGAA-GGGCAGTTC-TTG  129

seq1  GCTGCCTTGTTACCTCTTGCGCTTCTTCCTGAAGTCCCACTTTGGAGGTC  200
      |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||
seq2  GCTGCCTTGTTACCTC-TGCGCTTCT--CTGAAGT-CCACTTTGGAGGTC  175

seq1  TGAGAAGGCCTTAGTCTTATTTGACCTGCAGGGCAGAACTGAACTGATCA  250
      |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAGG-CTTAGTCTTATTTGA-CTGCAGGGCAGAACTGAACTGATCA  223

seq1  ATAGAAATTCCCTCTGTAATATGAACTTTTTTTTTTTTGCAGTTTTCTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAAATTCCCTCTGTAATATGAACTTTTTTTTTTTTGCAGTTTTCTCA  273

seq1  CTATCTTGAAAGACTCAAGGACCTATGTACCTATCCAAAGAGCTCTCTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTTGAAAGACTCAAGGACCTATGTACCTATCCAAAGAGCTCTCTAC  323

seq1  CCAATGCTGTCATGATGCCCTGCTCTCCAGGACACTTCCCTACCTTAATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGCTGTCATGATGCCCTGCTCTCCAGGACACTTCCCTACCTTAATT  373

seq1  TAGACAACATCATTTCTTGTAAATATAGTGGAACCATTAGTGATTGGTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACAACATCATTTCTTGTAAATATAGTGGAACCATTAGTGATTGGTGG  423

seq1  ATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGGAACTAACTAAGTAGGCCAGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGGAACTAACTAAGTAGGCCAGAC  473

seq1  TGGTTGTTCAGTAAGCCCCAGAGATCTGTGTAACTCTACCCCTTAAGTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGTTCAGTAAGCCCCAGAGATCTGTGTAACTCTACCCCTTAAGTAC  523

seq1  CAGGATTCTAAAGCTATACTAACACAGTCAACTTATTAAGGTGGAATACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATTCTAAAGCTATACTAACACAGTCAACTTATTAAGGTGGAATACT  573

seq1  GGGATAAAATTTAGTTCTTCATGATTTGTGGCAAGAATTTTATGGAATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATAAAATTTAGTTCTTCATGATTTGTGGCAAGAATTTTATGGAATGA  623

seq1  ACTAACTTTCCAGCCTTGAAACATTATTTAATATTTACCTAGAAAACGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAACTTTCCAGCCTTGAAACATTATTTAATATTTACCTAGAAAACGCA  673

seq1  TTAACATGCTATTTAGAAGAATTGTTCTGGAATGTGAGATATGAGAAAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACATGCTATTTAGAAGAATTGTTCTGGAATGTGAGATATGAGAAAGA  723

seq1  TAAAGACCCAGAAGATGTTTTAGATCTCTCAGGACCAAATGGTAAGTTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGACCCAGAAGATGTTTTAGATCTCTCAGGACCAAATGGTAAGTTGT  773

seq1  AAGCCCAACCACAGGAGATAACGCCTGAGGTTTGAACACTGACAATAAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCCAACCACAGGAGATAACGCCTGAGGTTTGAACACTGACAATAAAT  823

seq1  CCAGGTCACTGCTACATCGGGGCCTTATTCCAAACAATATACTCTCCAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTCACTGCTACATCGGGGCCTTATTCCAAACAATATACTCTCCAAA  873

seq1  ATGCTACAGTGTGCCTAAAAATAGTAGGCAAAGATGTTTATGTGAGTGGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTACAGTGTGCCTAAAAATAGTAGGCAAAGATGTTTATGTGAGTGGC  923

seq1  CAGTGTGAATGTGCATACACTTATAAAGATATCTCAAAAACAGAGTGCCC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTGAATGTGCATACACTTATAAAGATATCTCAAAAACAGAGTGCCC  973

seq1  ACAGTTAGTTACAGGAGTCAGGAATTGTATAGCAACTTTATATACACACA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTAGTTACAGGAGTCAGGAATTGTATAGCAACTTTATATACACACA  1023

seq1  CATGTGTTCCCCCAAAGCTCTTAAGATTGGAGGCATGCCCTGATGCAGGA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTTCCCCCAAAGCTCTTAAGATTGGAGGCATGCCCTGATGCAGGA  1073

seq1  AGCAGCAAATGCAGACAGCCTTCTTTCTTGGAGGAATAGTCCTGTTTTCT  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCAAATGCAGACAGCCTTCTTTCTTGGAGGAATAGTCCTGTTTTCT  1123

seq1  TGTGGAATTC  1160
      ||||||||||
seq2  TGTGGAATTC  1133

seq1: chr18_21795909_21797067
seq2: B6Ng01-071I06.g_68_1229

seq1  GAATTCAATTGTGTCTCCTCCAAATTCAGACAGATACCTAAGTCCTAAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATTGTGTCTCCTCCAAATTCAGACAGATACCTAAGTCCTAAAC  50

seq1  CTTAGTGGGACTCACTTGTCTATGTAACTTTAAGGAACTAATCAGGTTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGTGGGACTCACTTGTCTATGTAACTTTAAGGAACTAATCAGGTTAA  100

seq1  ATAACTTCTACAGGGGAACTCTGACCTAACAGCACTAGTTTCTGGTAAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTTCTACAGGGGAACTCTGACCTAACAGCACTAGTTTCTGGTAAGA  150

seq1  AGAGAAGGAGACAGGAGAATGCATAAGACATGGAGGGAAGACCATACACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAGGAGACAGGAGAATGCATAAGACATGGAGGGAAGACCATACACA  200

seq1  GGAAGGGGGAGACCTTCCATTTAGGCAGAAAGGCACACCTACAAATAGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGGGGAGACCTTCCATTTAGGCAGAAAGGCACACCTACAAATAGCC  250

seq1  CTGGCATTTAAACATGCAGCTTCCAGTCACCCAATCTGTGATGACAAGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCATTTAAACATGCAGCTTCCAGTCACCCAATCTGTGATGACAAGTT  300

seq1  ATCACAGACCAAATGGGTACAAGCATCCCTGGCAGAACTGACACATACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACAGACCAAATGGGTACAAGCATCCCTGGCAGAACTGACACATACAC  350

seq1  ACAAAGGGCTGACAAGGACCAGTGAGTGAGTTTCGTGTTCAGTTTTGGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGGGCTGACAAGGACCAGTGAGTGAGTTTCGTGTTCAGTTTTGGGA  400

seq1  ACAGACATCAGAGAAGGTCATCCTGATGAGGCTTGTATGGCTGTCTTGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACATCAGAGAAGGTCATCCTGATGAGGCTTGTATGGCTGTCTTGAG  450

seq1  AAAGCTCGTGAGTTCACATATGATCACTCCATCTTATGACCCAGTGTTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTCGTGAGTTCACATATGATCACTCCATCTTATGACCCAGTGTTGT  500

seq1  GTCACCTAACTGTGTATGGAGTGCCTGGAATATGCAAAATCATGGTTCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACCTAACTGTGTATGGAGTGCCTGGAATATGCAAAATCATGGTTCCT  550

seq1  TAGTTCTTCTTTGGTGTTCTGAAACTATATGCATATGGTGAGTCTTCGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTCTTCTTTGGTGTTCTGAAACTATATGCATATGGTGAGTCTTCGTG  600

seq1  ATAGTGTTGTTGCAGAGGAAGGAAAGCTGGGGAACAGATAAAGCATTTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTGTTGTTGCAGAGGAAGGAAAGCTGGGGAACAGATAAAGCATTTAT  650

seq1  GGTGGAGTCTAGGATCTGTAAAACTATACATCTGCATTTCTTTGAGCCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGAGTCTAGGATCTGTAAAACTATACATCTGCATTTCTTTGAGCCTT  700

seq1  CAGAAATTTTAAACAGTTACCCTCCCTCCATTCCTTCCAGAGCCACTTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAATTTTAAACAGTTACCCTCCCTCCATTCCTTCCAGAGCCACTTTC  750

seq1  CTGCACTAGCCTCTTCCCCCGAGTCACTGCTCCTCTGATTCCCTTTAGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCACTAGCCTCTTCCCCCGAGTCACTGCTCCTCTGATTCCCTTTAGTA  800

seq1  AAAAGCAGGACTCCCTCAGATATTAATGAAACACAGCAGAACAAGTTACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCAGGACTCCCTCAGATATTAATGAAACACAGCAGAACAAGTTACA  850

seq1  GTAAGACTAGGTCCAAACCCTCATATC-AAGGCTGGGTGAGGCAAGTCAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGACTAGGTCCAAACCCTCATATCAAAGGCTGGGTGAGGCAAGTCAG  900

seq1  TAG-AAGGAAAAGGGCCCAAAAAGCATGTGTAAGAGTCAGATACACCCCT  948
      ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAGGAAAAGGGCCCAAAAAGCATGTGT-AGAGTCAGATACACCCCT  949

seq1  ACTCCCACTGTTAGGAGTCCTACAAAAGCACCAACGAAGCAACTATCACA  998
      |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||
seq2  ACTCCCCCTGTTAGGAGTCCTAC-AAAGCACC-ACGAAGCACTTATCACA  997

seq1  TATATGCAGAGGACATA-GAGCAGATTCATGCAGGTGATTGCCATTCCAG  1047
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TATATGCAGAGGACATAGGAGCAGATTCATGCA-GTGATTGCCATTCCAG  1046

seq1  TCTCT--GTGAGCCTATGAACAGGGCTC-TCTTTTTGCAGACAGGATG-T  1093
      |||||  | ||||||||| ||||| | | |||||||||||||| |||| |
seq2  TCTCTTGGGGAGCCTATG-ACAGGCCCCTTCTTTTTGCAGACA-GATGTT  1094

seq1  CATCTTCCGAGGATTTAGTTTTA-TTATCTTACCCATTACCACCTATA-C  1141
      ||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
seq2  CATCTCCCGA-GATTTAGGTTTATTTATCTTACCCATTACCACCTATACC  1143

seq1  TTG-CTGCTCTCTAGTTCT  1159
      ||| ||||  |||||||||
seq2  TTGCCTGCCTTCTAGTTCT  1162