BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-074M14
Chromosome18 (Build37)
Map Location 85,499,569 - 85,599,775
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneZfp407, Cndp1, EG640234, Cndp2, LOC100039711, LOC100039725, B230399E16Rik, Cyb5, Fbxo15, 1700034H14Rik, LOC100039765
Downstream geneLOC665382, LOC545269, LOC545270, LOC665402, Neto1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-074M14.bB6Ng01-074M14.g
ACCDH891536DH891537
length1,1551,119
definitionDH891536|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074M14, 5' end.DH891537|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074M14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(85,499,569 - 85,500,745)(85,598,658 - 85,599,775)
sequence
gaattctatattgccttgaactgtctttcaccgaattaatttgtctaatc
ttttgaatttatccatactcagcatttcatgacaaggcagaaaatagctt
tcccccactttgattttttttttttttgccagagtatagcatgaatggcc
tgccttcgaattcacaataaagtcctcatttccttcaaaacagtggagct
gggctctcactgttaatatttcttttggcatttagtttttctgatatccc
aaggtaatgtcctatttctcagtgttcatagctttctgcggctttgatac
tccacagctacttactcttctatatctcccccacaaactatttctgaaag
cttatgaactacataatcaggtatctaacaaaaaacagcatcacttcttg
tacccattttctgtcttatttacttttcttaccacagtgttgaaacatcc
catttcatggtccattggtctgtcactctcgggaaggcatgacagcagag
gctttcacaacactgttatatcttagcagcagataaacagaatttaggac
aggaatatagctataaccctcaaattatgccctccagacaatcactccct
ctgagtgggctccacttactaaaggttgtacaatctccccaaacagtatt
tcgggaacataaacctgtgggggtattttgtattcaaacaattattctac
tcttaaatgctcagaagatgcctggagaactcattgcttttacaaactga
ttagaaagcaggaggaagatgtttatgaaatggcttgcccttaaaccact
aaaaagggtttgctataatcagaactattttaacaacctttagttgtata
attttgtgcattgatactttactttctctggaatgtagagctggaagcaa
tcttcatgatgactagctttgatttgagcttgactgtgctaagggcacct
agagagctggtagatcattattttgagtgtgtctgtgaagatatttcaga
gagatcagattgggcttagcagactgagggaaggtactctattaccgtgt
gttgtagtatgaatttctttcgatctgatagacaagaagcagggtagtgg
gttagttgatgccagaatcttccatcctcacaaggccagcatgtgaacct
tgatc
gaattcattttggatattgcatatatactgagcttcatctggattggaag
acagaaggctgctatcagctagtgtgtgaacagatccagcccagagggta
tggaaatcttcctgcatgagctggcttttagtctagggaaggggactgag
gggactaagtcactgtcattcacagatgactctgaaaagctagctgtgct
acagagtgccttgtaaacatcattgacaagctgctgagccacaggtggcc
atgataaaacactagcccagggtcactggcagtaaatagccactcagaga
gagggaatttagatcttagtcttttgtatctgacttccctggttgttggc
ctttgattaaatctctcataactagaatgacatcatacctggtagcagct
ggggaggaaatttcgcgtctatgagcaatcctaagctcagtgataaagtg
ggtttatatgcatttgtatttctcagtgtttaattttactttcgttttcc
tataataccgattattccgtaaaggacttacttcctttcaatcagatgga
gagagaatattacagcaggaaaagtgtgatttgcctggtaaagtgtcatt
atagttacctgaacagctatcagtgctggtggttactaacttttgatttc
taactcaactctccccgggcttcacactgatgcatccacttgttgtctgt
aaacccagcaccagctctggttcaacatgcctacactcatgttgtctacc
caccacatacccattttccacagctctaacacactagtaggaatctgtga
tcttccagttccttacccttgtgtacatcagggaaaattccctgctttgg
gtttccttttgtaatatttttattattgtgtgtatgtgtgcttatatatc
tgtatgtctgtgtgtgggcagacatcacagtatgcttgtggaggacagag
gacaaagtgcaggacttgggttgtttcttttcacatgttgatcctagagg
tcaaactcagcttatcacccttggcgcaagcacctttacatgctgaagca
tcttcacagctcttccctgctttcttctcgttagccctctcctactgcct
catttcttgaggttgataa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_85499569_85500745
seq2: B6Ng01-074M14.b_45_1199

seq1  GAATTCTATATTGCCTTGAACTGTCTTTCACCGAATTAATTTGTCTAATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATATTGCCTTGAACTGTCTTTCACCGAATTAATTTGTCTAATC  50

seq1  TTTTGAATTTATCCATACTCAGCATTTCATGACAAGGCAGAAAATAGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGAATTTATCCATACTCAGCATTTCATGACAAGGCAGAAAATAGCTT  100

seq1  TCCCCCACTTTGATTTTTTTTTTTTTTGCCAGAGTATAGCATGAATGGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCCACTTTGATTTTTTTTTTTTTTGCCAGAGTATAGCATGAATGGCC  150

seq1  TGCCTTCGAATTCACAATAAAGTCCTCATTTCCTTCAAAACAGTGGAGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTCGAATTCACAATAAAGTCCTCATTTCCTTCAAAACAGTGGAGCT  200

seq1  GGGCTCTCACTGTTAATATTTCTTTTGGCATTTAGTTTTTCTGATATCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCTCACTGTTAATATTTCTTTTGGCATTTAGTTTTTCTGATATCCC  250

seq1  AAGGTAATGTCCTATTTCTCAGTGTTCATAGCTTTCTGCGGCTTTGATAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAATGTCCTATTTCTCAGTGTTCATAGCTTTCTGCGGCTTTGATAC  300

seq1  TCCACAGCTACTTACTCTTCTATATCTCCCCCACAAACTATTTCTGAAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACAGCTACTTACTCTTCTATATCTCCCCCACAAACTATTTCTGAAAG  350

seq1  CTTATGAACTACATAATCAGGTATCTAACAAAAAACAGCATCACTTCTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATGAACTACATAATCAGGTATCTAACAAAAAACAGCATCACTTCTTG  400

seq1  TACCCATTTTCTGTCTTATTTACTTTTCTTACCACAGTGTTGAAACATCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCATTTTCTGTCTTATTTACTTTTCTTACCACAGTGTTGAAACATCC  450

seq1  CATTTCATGGTCCATTGGTCTGTCACTCTCGGGAAGGCATGACAGCAGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCATGGTCCATTGGTCTGTCACTCTCGGGAAGGCATGACAGCAGAG  500

seq1  GCTTTCACAACACTGTTATATCTTAGCAGCAGATAAACAGAATTTAGGAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCACAACACTGTTATATCTTAGCAGCAGATAAACAGAATTTAGGAC  550

seq1  AGGAATATAGCTATAACCCTCAAATTATGCCCTCCAGACAATCACTCCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAATATAGCTATAACCCTCAAATTATGCCCTCCAGACAATCACTCCCT  600

seq1  CTGAGTGGGCTCCACTTACTAAAGGTTGTACAATCTCCCCAAACAGTATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTGGGCTCCACTTACTAAAGGTTGTACAATCTCCCCAAACAGTATT  650

seq1  TCGGGAACATAAACCTGTGGGGGTATTTTGTATTCAAACAATTATTCTAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGGAACATAAACCTGTGGGGGTATTTTGTATTCAAACAATTATTCTAC  700

seq1  TCTTAAATGCTCAGAAGATGCCTGGAGAACTCATTGCTTTTACAAACTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAATGCTCAGAAGATGCCTGGAGAACTCATTGCTTTTACAAACTGA  750

seq1  TTAGAAAGCAGGAGGAAGATGTTTATGAAATGGCTTGCCCTTAAACCACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAAAGCAGGAGGAAGATGTTTATGAAATGGCTTGCCCTTAAACCACT  800

seq1  AAAAAGGGTTTGCTATAATCAGAACTATTTTAACAACCTTTAGTTGTATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGGGTTTGCTATAATCAGAACTATTTTAACAACCTTTAGTTGTATA  850

seq1  ATTTTGTGCATTGATACTTTACTTTCTCTGGAATGTAGAGCTGGAAGCAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGTGCATTGATACTTTACTTTCTCTGGAATGTAGAGCTGGAAGCAA  900

seq1  TCTTCATGATGACTAGCTTTGATTTGAGCTTGACTGTGCTAAGGGCACCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCATGATGACTAGCTTTGATTTGAGCTTGACTGTGCTAAGGGCACCT  950

seq1  AGAGAGCTGGTAGATCATTATTTTGAGTGTGTCTGTGAAGATATTTCAGG  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AGAGAGCTGGTAGATCATTATTTTGAGTGTGTCTGTGAAGATATTTCA-G  999

seq1  AGAGATCAGGATTGGGCTTAGCAGACTGAGGGAAGGTTACTCTTATTACC  1050
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
seq2  AGAGATCA-GATTGGGCTTAGCAGACTGAGGGAAGG-TACTC-TATTACC  1046

seq1  GTGTG-TGTAGTAATGATATCTTTCAGATCTGAGTAGGACAAAGAAGCAG  1099
      ||||| |||||||   || |||||| ||||||| || ||| |||||||| 
seq2  GTGTGTTGTAGTATGAATTTCTTTC-GATCTGA-TA-GAC-AAGAAGCA-  1091

seq1  GGGTAGTGGTGTGAGGTTTGATTGCAAGATATCTTCGCATCCTCAACCCC  1149
      ||||||||| || ||  |||| ||| ||| |||||| ||||||||    |
seq2  GGGTAGTGG-GTTAG--TTGA-TGCCAGA-ATCTTC-CATCCTCA----C  1131

seq1  ATAGGCTCAGGCATGTGAACACTTGATC  1177
      | |||| || |||||||||| |||||||
seq2  A-AGGC-CA-GCATGTGAAC-CTTGATC  1155

seq1: chr18_85598658_85599775
seq2: B6Ng01-074M14.g_67_1185 (reverse)

seq1  TTATCAACCTCAAGAAATGA-GCAGTAGAGAGA-GGCTAACGAGAAGAAA  48
      |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||
seq2  TTATCAACCTCAAGAAATGAGGCAGTAG-GAGAGGGCTAACGAGAAGAAA  49

seq1  GCAGGG-AGAGCTGGTGAGATGGCTCAGCATGTAAAGGTGCTTGCGGCCA  97
      |||||| |||||||   |||||  ||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GCAGGGAAGAGCTGTGAAGATGCTTCAGCATGTAAAGGTGCTTGC-GCCA  98

seq1  AGGGTGATAAGCTGAGTTTGACCTCTAGGATCAACATGGTGAAAGGAAAC  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
seq2  AGGGTGATAAGCTGAGTTTGACCTCTAGGATCAACAT-GTGAAAAGAAAC  147

seq1  AA-CCAAGTCCTGCACTTTGTCCTCTGTCCTCCACAAGCATACTGTGATG  196
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCAAGTCCTGCACTTTGTCCTCTGTCCTCCACAAGCATACTGTGATG  197

seq1  TCTGCCCACACACAGACATACAGATATATAAGCACACATACACACAATAA  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCCACACACAGACATACAGATATATAAGCACACATACACACAATAA  247

seq1  TAAAAATATTACAAAAGGAAACCCAAAGCAGGGAATTTTCCCTGATGTAC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATATTACAAAAGGAAACCCAAAGCAGGGAATTTTCCCTGATGTAC  297

seq1  ACAAGGGTAAGGAACTGGAAGATCACAGATTCCTACTAGTGTGTTAGAGC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGGTAAGGAACTGGAAGATCACAGATTCCTACTAGTGTGTTAGAGC  347

seq1  TGTGGAAAATGGGTATGTGGTGGGTAGACAACATGAGTGTAGGCATGTTG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAAAATGGGTATGTGGTGGGTAGACAACATGAGTGTAGGCATGTTG  397

seq1  AACCAGAGCTGGTGCTGGGTTTACAGACAACAAGTGGATGCATCAGTGTG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAGAGCTGGTGCTGGGTTTACAGACAACAAGTGGATGCATCAGTGTG  447

seq1  AAGCCCGGGGAGAGTTGAGTTAGAAATCAAAAGTTAGTAACCACCAGCAC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCCGGGGAGAGTTGAGTTAGAAATCAAAAGTTAGTAACCACCAGCAC  497

seq1  TGATAGCTGTTCAGGTAACTATAATGACACTTTACCAGGCAAATCACACT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGCTGTTCAGGTAACTATAATGACACTTTACCAGGCAAATCACACT  547

seq1  TTTCCTGCTGTAATATTCTCTCTCCATCTGATTGAAAGGAAGTAAGTCCT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTGCTGTAATATTCTCTCTCCATCTGATTGAAAGGAAGTAAGTCCT  597

seq1  TTACGGAATAATCGGTATTATAGGAAAACGAAAGTAAAATTAAACACTGA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACGGAATAATCGGTATTATAGGAAAACGAAAGTAAAATTAAACACTGA  647

seq1  GAAATACAAATGCATATAAACCCACTTTATCACTGAGCTTAGGATTGCTC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATACAAATGCATATAAACCCACTTTATCACTGAGCTTAGGATTGCTC  697

seq1  ATAGACGCGAAATTTCCTCCCCAGCTGCTACCAGGTATGATGTCATTCTA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACGCGAAATTTCCTCCCCAGCTGCTACCAGGTATGATGTCATTCTA  747

seq1  GTTATGAGAGATTTAATCAAAGGCCAACAACCAGGGAAGTCAGATACAAA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATGAGAGATTTAATCAAAGGCCAACAACCAGGGAAGTCAGATACAAA  797

seq1  AGACTAAGATCTAAATTCCCTCTCTCTGAGTGGCTATTTACTGCCAGTGA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTAAGATCTAAATTCCCTCTCTCTGAGTGGCTATTTACTGCCAGTGA  847

seq1  CCCTGGGCTAGTGTTTTATCATGGCCACCTGTGGCTCAGCAGCTTGTCAA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGGCTAGTGTTTTATCATGGCCACCTGTGGCTCAGCAGCTTGTCAA  897

seq1  TGATGTTTACAAGGCACTCTGTAGCACAGCTAGCTTTTCAGAGTCATCTG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTTTACAAGGCACTCTGTAGCACAGCTAGCTTTTCAGAGTCATCTG  947

seq1  TGAATGACAGTGACTTAGTCCCCTCAGTCCCCTTCCCTAGACTAAAAGCC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGACAGTGACTTAGTCCCCTCAGTCCCCTTCCCTAGACTAAAAGCC  997

seq1  AGCTCATGCAGGAAGATTTCCATACCCTCTGGGCTGGATCTGTTCACACA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCATGCAGGAAGATTTCCATACCCTCTGGGCTGGATCTGTTCACACA  1047

seq1  CTAGCTGATAGCAGCCTTCTGTCTTCCAATCCAGATGAAGCTCAGTATAT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCTGATAGCAGCCTTCTGTCTTCCAATCCAGATGAAGCTCAGTATAT  1097

seq1  ATGCAATATCCAAAATGAATTC  1118
      ||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAATATCCAAAATGAATTC  1119