BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-095E06
Chromosome18 (Build37)
Map Location 13,599,420 - 13,775,488
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLama3, 2810439F02Rik, Cabyr, LOC665356, Osbpl1a, LOC435556, Impact, Hrh4, EG383354, LOC665379
Downstream geneLOC100040358, Zfp521, LOC100040094, LOC100040103, LOC100040391, LOC382096, LOC100040129, EG623867
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-095E06.bB6Ng01-095E06.g
ACCDH906253DH906254
length1,136479
definitionDH906253|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095E06, 5' end.DH906254|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095E06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(13,599,420 - 13,600,562)(13,775,004 - 13,775,488)
sequence
gaattcttcatgtagctaaagggagctgatgagctctgtgagggagagag
atcagcctcggggaaggggttaagaaagagaaaactgagttagcagttcc
cttaccctctgctaggacgtgggttattcatgctggctacacaaagatga
gttgttttaaagaaatgtagattgaatgaggtaaattgaatttacagagt
caaaaagaagttaattcagaccaaaagggttaggcggatggggaagggag
tcctttgttttgtttggaaaagagcaattttaagctgggttgtatgaact
aacttgtttgccaaccctcttgaatggagagacatgtctacaatactttc
ctgatttggtttgccaagaagcagttcccaattagaagttgaagacaaat
actatatatgacaaatggataattactaaaattttgaatctgttctctat
ctcgcattcttgatacaactgcttctaccatagcgagctctttgcaagca
atggtaccaggaacagttaacactaaaatcaatgttaagtgtggatattt
atttgtacttgtgctaactgatgtgcacagtacttctgtgtgagtctgtt
aagtcacatatctctgtaagctaaatgccaggagtggtctaagagcttta
cagtctagggtgatggctcagtggagaagtgctcttgctctttaagcatg
gggacctgggacagaatcctcagcacccacataaaacgtagagcatggcc
ccatggggattgctgggcttgttgaacctgtgagctcccagttcagtgta
agactgtttcagggaataaggcagaaagcaatatggcaggacatgcagtg
tctttcactggtctccacaacagtacagctatcctcccaatataggtccc
tctcccgccacacacacacacacacacacatttccatgtgcacaaacaca
caaattaacattatgatgctgtgggaatgtctagtacattagatccctgg
aattcatataggaagcgttgtgccttctctctacatattgaaaaaactgt
agcccagtgaagtacatgatgtaataaagtcagagaaacgaagaacagat
gtgattccgagttgggctcctactggtaatattaat
caagacagccagagctacataaccctgttttgagaagaagacagcaacag
aaaattatttgagattattattttatctcgtgttcagtgttcttattaca
acactaagcaaaataaataaataaataaataaataaataaataaataaat
aaataaataaaggttgggtatttttatatcttggtcacagtgacagttac
acaagcttattagtatctataaatttgcaatattgtatgtgtgaatcatg
tgcgatttctctattccaaacattctttggtgaagcttgaaggggattct
ttgagctacactattcagacttccacagtagatcttgtggcataagacat
taagatatttgttctctcagtgttgatgggaaattcaaggctaagaggtc
ctacccacttcaaagcaaggtttggatgaagaagcttcagaccataaaga
aagaagaaaagagagagggaggggggagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_13599420_13600562
seq2: B6Ng01-095E06.b_46_1181

seq1  GAATTCTTCATGTAGCTAAAGGGAGCTGATGAGCTCTGTGAGGGAGAGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCATGTAGCTAAAGGGAGCTGATGAGCTCTGTGAGGGAGAGAG  50

seq1  ATCAGCCTCGGGGAAGGGGTTAAGAAAGAGAAAACTGAGTTAGCAGTTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGCCTCGGGGAAGGGGTTAAGAAAGAGAAAACTGAGTTAGCAGTTCC  100

seq1  CTTACCCTCTGCTAGGACGTGGGTTATTCATGCTGGCTACACAAAGATGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACCCTCTGCTAGGACGTGGGTTATTCATGCTGGCTACACAAAGATGA  150

seq1  GTTGTTTTAAAGAAATGTAGATTGAATGAGGTAAATTGAATTTACAGAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTTTTAAAGAAATGTAGATTGAATGAGGTAAATTGAATTTACAGAGT  200

seq1  CAAAAAGAAGTTAATTCAGACCAAAAGGGTTAGGCGGATGGGGAAGGGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAGAAGTTAATTCAGACCAAAAGGGTTAGGCGGATGGGGAAGGGAG  250

seq1  TCCTTTGTTTTGTTTGGAAAAGAGCAATTTTAAGCTGGGTTGTATGAACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTGTTTTGTTTGGAAAAGAGCAATTTTAAGCTGGGTTGTATGAACT  300

seq1  AACTTGTTTGCCAACCCTCTTGAATGGAGAGACATGTCTACAATACTTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGTTTGCCAACCCTCTTGAATGGAGAGACATGTCTACAATACTTTC  350

seq1  CTGATTTGGTTTGCCAAGAAGCAGTTCCCAATTAGAAGTTGAAGACAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATTTGGTTTGCCAAGAAGCAGTTCCCAATTAGAAGTTGAAGACAAAT  400

seq1  ACTATATATGACAAATGGATAATTACTAAAATTTTGAATCTGTTCTCTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATATATGACAAATGGATAATTACTAAAATTTTGAATCTGTTCTCTAT  450

seq1  CTCGCATTCTTGATACAACTGCTTCTACCATAGCGAGCTCTTTGCAAGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGCATTCTTGATACAACTGCTTCTACCATAGCGAGCTCTTTGCAAGCA  500

seq1  ATGGTACCAGGAACAGTTAACACTAAAATCAATGTTAAGTGTGGATATTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTACCAGGAACAGTTAACACTAAAATCAATGTTAAGTGTGGATATTT  550

seq1  ATTTGTACTTGTGCTAACTGATGTGCACAGTACTTCTGTGTGAGTCTGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTACTTGTGCTAACTGATGTGCACAGTACTTCTGTGTGAGTCTGTT  600

seq1  AAGTCACATATCTCTGTAAGCTAAATGCCAGGAGTGGTCTAAGAGCTTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCACATATCTCTGTAAGCTAAATGCCAGGAGTGGTCTAAGAGCTTTA  650

seq1  CAGTCTAGGGTGATGGCTCAGTGGAGAAGTGCTCTTGCTCTTTAAGCATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTAGGGTGATGGCTCAGTGGAGAAGTGCTCTTGCTCTTTAAGCATG  700

seq1  GGGACCTGGGACAGAATCCTCAGCACCCACATAAAACGTAGAGCATGGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACCTGGGACAGAATCCTCAGCACCCACATAAAACGTAGAGCATGGCC  750

seq1  CCATGGGGATTGCTGGGCTTGTTGAACCTGTGAGCTCCCAGTTCAGTGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGGGATTGCTGGGCTTGTTGAACCTGTGAGCTCCCAGTTCAGTGTA  800

seq1  AGACTGTTTCAGGGGAATAAGGCAGAAAGCAATATGGCAGGACATGCAGT  850
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGTTTCA-GGGAATAAGGCAGAAAGCAATATGGCAGGACATGCAGT  849

seq1  GTCTTTCACTGGTCTCCACAACAGTACAGCTATCCTCCCAATATAGGTCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTCACTGGTCTCCACAACAGTACAGCTATCCTCCCAATATAGGTCC  899

seq1  CTCTCCCGCCACACACACACACACACACACATTTCCATGTGCACAAACAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCCGCCACACACACACACACACACACATTTCCATGTGCACAAACAC  949

seq1  ACAAATAAACATTATGAATGCTGTTGGAATGTCTAGTACATTAGAATCCC  1000
      |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||
seq2  ACAAATTAACATTATG-ATGCTGTGGGAATGTCTAGTACATTAG-ATCCC  997

seq1  TGGATTTCATATAGGAAGCGTTGTGGCCTTCTCTCTACATA-TGAAAAAA  1049
      |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
seq2  TGGAATTCATATAGGAAGCGTTGT-GCCTTCTCTCTACATATTGAAAAAA  1046

seq1  CTGTAGCCCAGTGAAGTTACATGATGTAATAAAGTCAGAG-AACGAAGAA  1098
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CTGTAGCCCAGTGAAG-TACATGATGTAATAAAGTCAGAGAAACGAAGAA  1095

seq1  CAAGATTGTGATTTCAGAGTTTGGTCTCCTACTGGTAATATTAAT  1143
      | ||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||
seq2  C-AGA-TGTGA-TTCCGAG-TTGGGCTCCTACTGGTAATATTAAT  1136

seq1: chr18_13775004_13775488
seq2: B6Ng01-095E06.g_67_551 (reverse)

seq1  CCTCCCCCCTCCCTCTCTCTTTTCTTCTTTCTTTATGGTCTGAAGCTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCCCCTCCCTCTCTCTTTTCTTCTTTCTTTATGGTCTGAAGCTTCT  50

seq1  TCATCCAAACCTTGCTTTGAAGTGGGTAGGACCTCTTAGCCTTGAATTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCAAACCTTGCTTTGAAGTGGGTAGGACCTCTTAGCCTTGAATTTC  100

seq1  CCATCAACACTGAGAGAACAAATATCTTAATGTCTTATGCCACAAGATCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCAACACTGAGAGAACAAATATCTTAATGTCTTATGCCACAAGATCT  150

seq1  ACTGTGGAAGTCTGAATAGTGTAGCTCAAAGAATCCCCTTCAAGCTTCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGGAAGTCTGAATAGTGTAGCTCAAAGAATCCCCTTCAAGCTTCAC  200

seq1  CAAAGAATGTTTGGAATAGAGAAATCGCACATGATTCACACATACAATAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAATGTTTGGAATAGAGAAATCGCACATGATTCACACATACAATAT  250

seq1  TGCAAATTTATAGATACTAATAAGCTTGTGTAACTGTCACTGTGACCAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAATTTATAGATACTAATAAGCTTGTGTAACTGTCACTGTGACCAAG  300

seq1  ATATAAAAATACCCAACCTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAAAATACCCAACCTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTA  350

seq1  TTTATTTATTTATTTATTTTGCTTAGTGTTGTAATAAGAACACTGAACAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTATTTATTTATTTTGCTTAGTGTTGTAATAAGAACACTGAACAC  400

seq1  GAGATAAAATAATAATCTCAAATAATTTTCTGTTGCTGTCTTCTTCTCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATAAAATAATAATCTCAAATAATTTTCTGTTGCTGTCTTCTTCTCAA  450

seq1  AACAGGGTTATGTAGCTCTGGCTGTCTTGGAATTC  485
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGGTTATGTAGCTCTGGCTGTCTTGGAATTC  485