BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-101G18
Chromosome18 (Build37)
Map Location 25,490,077 - 25,620,319
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene2700062C07Rik, BC021395, Slc39a6, Epl2, Mocos, Fhod3, 5730494M16Rik, AW554918
Downstream geneBrunol4, LOC100041241, LOC665916, LOC100041263, LOC100041274
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-101G18.bB6Ng01-101G18.g
ACCDH910611DH910612
length1,0981,082
definitionDH910611|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-101G18, 5' end.DH910612|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-101G18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(25,619,211 - 25,620,319)(25,490,077 - 25,491,163)
sequence
gaattccattgcttccgaatggcagagagtctgtgctcctgacttttcta
ggtacatagctgactttatgagcttcattatagcagcgtgatgagcaaaa
agcttgtttggtctgttctgctagtcccatcttgatctgtgctgatatgg
aactaattctattcctataaagctagatataactagagccttactttcca
tttgcttgctcctgatctaacaagatgcaggcacaaaacttcagagagga
cacaacctacactgatttgacttggctccatactgccaattttagagcca
gtctgacagggtgtgctagaatagtacaaagacaaattatttctaggttc
attccataggctgctctggatgggaagcccctccccacaggctaccccaa
taagaaaccactctcccttagttgcccatgatgaaaagcatctctccatt
cactgacccaaaggagaagaacttctctataggctgttaagatgaatcat
catgatgacagagatttccttcccctttctgatgttttgtaatttcatta
aacctctcttagtttcatttttattaccaacccagtcaggattcaatcct
tagcttccatctcttaggtgattttatccattcttatggctagcatctac
atgtcaatgactaccaaaggcaggtaaacaacactggtcttaagttccag
aatcatacagtcaactgatacctgatacttttattcagatgtgtgtggga
aaccacatgtgccattacagagtggtgctggctactgctggccaccacaa
ataagtttggacaaacaaccaatgtgtacatatgcagtaaagctttttgc
caagacactgcctggcccaggcatgataatgaggttttgagagtataacc
aatcagatgtgagacatgcaaatgaggtatgataatgagttctgtgaggt
actgagagagagtaaccatcagatgaggacatgcaaatgaggcatagtgc
atacaatctggttgtgagaaccgcctctctagctacataagcagcacagt
tcttggatccaggtctctttgctctgcaatcagctctcccattaaacg
gaattcaagacgccttcacttcatgagtgtgagtgctgggactatagtct
tgtcactacactcatatgcattgtttacttcttttgttggggtttaagag
ttttgtttgtttgtttgtttgtttgttttttctggcagtactggagattc
atcctagggccttccacatgcaatgtaaatgttctatgcttgacctccac
ccttaacactattagaatttcctaatgcgaagacataatcaccaaattta
gttgacagtagcagaccaaatacagctaatttttggttttattaaacaga
tgaactaagaatattttaatattctaatatggttatagagagaacaaatg
tgaaatttcattaagctgtacacttaagtcacgcagtttattacaaattt
tgcctctattttaaaatatcattttctaagtttgtattatttaaagtttc
atgttaaacccatatgcgggctaaagaaatgattccttggtaaatgttct
ggctaccactcttgacaacttcaatttggtcctcaggacccacatggttg
aaggaaagacccaactcctacaattgtcctctgacctctttgtgagcatc
atggtagccatgtacttgggcacacatgtatgcatgcacatactgacatt
aaatacaatttgcaatgcatgtttttaacactcatgtgcctcagaaacaa
ttgagaatgctttgttggtttaagcctttgttcagtgaatttgtgttagt
taatattacatataaacaactgtagaaagaaaacacatatgctttattca
agcctatttgttacttgcatgggtcccagaggcattggctatctttagct
tcactaataaagcagctgaatttatatttagaacattttgagaagtttgc
tttctatttattttcttgctttctcttggtaagacatgattgagtctatc
tcagattccacccccccacacacacttttttttccttttgagtcagtcta
tgtagccaggttggttctagatcttgctatagagccaacactggctttgg
gctgggattctgcctttccatcagtgcggaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_25619211_25620319
seq2: B6Ng01-101G18.b_45_1142 (reverse)

seq1  CGTTTATTGGGAGAGCTTGATTGCAGAGGCAAAGAGACCCTGATCCCAGA  50
      |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||| |||
seq2  CGTTTAATGGGAGAGC-TGATTGCAGA-GCAAAGAGACCTGGATCCAAGA  48

seq1  ACTGGTGCTGCTTATGTAGGCCTAGGAGAGGCGTGTCTCACACCCGGATT  100
      ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||| || ||||
seq2  ACT-GTGCTGCTTATGTAG--CTA-GAGAGGCGGTTCTCACAACCAGATT  94

seq1  GGTTATGCACTATGCCTCATTTGCATGTTCCTCATCTGATTGGTTACTCT  150
      |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
seq2  G--TATGCACTATGCCTCATTTGCATG-TCCTCATCTGA-TGGTTACTCT  140

seq1  CTCTCAGTACCTCACAGAACCTCATTATCATACCTCATTTGCATGTCTCA  200
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCAGTACCTCACAGAA-CTCATTATCATACCTCATTTGCATGTCTCA  189

seq1  CATCTGATTGGTTATACTCTCAAAACCTCATTATCATGCCTGGGCCAGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGATTGGTTATACTCTCAAAACCTCATTATCATGCCTGGGCCAGGC  239

seq1  AGTGTCTTGGCAAAAAGCTTTACTGCATATGTACACATTGGTTGTTTGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCTTGGCAAAAAGCTTTACTGCATATGTACACATTGGTTGTTTGTC  289

seq1  CAAACTTATTTGTGGTGGCCAGCAGTAGCCAGCACCACTCTGTAATGGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTTATTTGTGGTGGCCAGCAGTAGCCAGCACCACTCTGTAATGGCA  339

seq1  CATGTGGTTTCCCACACACATCTGAATAAAAGTATCAGGTATCAGTTGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGGTTTCCCACACACATCTGAATAAAAGTATCAGGTATCAGTTGAC  389

seq1  TGTATGATTCTGGAACTTAAGACCAGTGTTGTTTACCTGCCTTTGGTAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGATTCTGGAACTTAAGACCAGTGTTGTTTACCTGCCTTTGGTAGT  439

seq1  CATTGACATGTAGATGCTAGCCATAAGAATGGATAAAATCACCTAAGAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGACATGTAGATGCTAGCCATAAGAATGGATAAAATCACCTAAGAGA  489

seq1  TGGAAGCTAAGGATTGAATCCTGACTGGGTTGGTAATAAAAATGAAACTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGCTAAGGATTGAATCCTGACTGGGTTGGTAATAAAAATGAAACTA  539

seq1  AGAGAGGTTTAATGAAATTACAAAACATCAGAAAGGGGAAGGAAATCTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGGTTTAATGAAATTACAAAACATCAGAAAGGGGAAGGAAATCTCT  589

seq1  GTCATCATGATGATTCATCTTAACAGCCTATAGAGAAGTTCTTCTCCTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATCATGATGATTCATCTTAACAGCCTATAGAGAAGTTCTTCTCCTTT  639

seq1  GGGTCAGTGAATGGAGAGATGCTTTTCATCATGGGCAACTAAGGGAGAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCAGTGAATGGAGAGATGCTTTTCATCATGGGCAACTAAGGGAGAGT  689

seq1  GGTTTCTTATTGGGGTAGCCTGTGGGGAGGGGCTTCCCATCCAGAGCAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTCTTATTGGGGTAGCCTGTGGGGAGGGGCTTCCCATCCAGAGCAGC  739

seq1  CTATGGAATGAACCTAGAAATAATTTGTCTTTGTACTATTCTAGCACACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGGAATGAACCTAGAAATAATTTGTCTTTGTACTATTCTAGCACACC  789

seq1  CTGTCAGACTGGCTCTAAAATTGGCAGTATGGAGCCAAGTCAAATCAGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCAGACTGGCTCTAAAATTGGCAGTATGGAGCCAAGTCAAATCAGTG  839

seq1  TAGGTTGTGTCCTCTCTGAAGTTTTGTGCCTGCATCTTGTTAGATCAGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTGTGTCCTCTCTGAAGTTTTGTGCCTGCATCTTGTTAGATCAGGA  889

seq1  GCAAGCAAATGGAAAGTAAGGCTCTAGTTATATCTAGCTTTATAGGAATA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCAAATGGAAAGTAAGGCTCTAGTTATATCTAGCTTTATAGGAATA  939

seq1  GAATTAGTTCCATATCAGCACAGATCAAGATGGGACTAGCAGAACAGACC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTAGTTCCATATCAGCACAGATCAAGATGGGACTAGCAGAACAGACC  989

seq1  AAACAAGCTTTTTGCTCATCACGCTGCTATAATGAAGCTCATAAAGTCAG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAGCTTTTTGCTCATCACGCTGCTATAATGAAGCTCATAAAGTCAG  1039

seq1  CTATGTACCTAGAAAAGTCAGGAGCACAGACTCTCTGCCATTCGGAAGCA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTACCTAGAAAAGTCAGGAGCACAGACTCTCTGCCATTCGGAAGCA  1089

seq1  ATGGAATTC  1109
      |||||||||
seq2  ATGGAATTC  1098

seq1: chr18_25490077_25491163
seq2: B6Ng01-101G18.g_68_1149

seq1  GAATTCAAGACGCCTTCACTTCATGAGTGTGAGTGCTGGGACTATAGTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGACGCCTTCACTTCATGAGTGTGAGTGCTGGGACTATAGTCT  50

seq1  TGTCACTACACTCATATGCATTGTTTACTTCTTTTGTTGGGGTTTAAGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACTACACTCATATGCATTGTTTACTTCTTTTGTTGGGGTTTAAGAG  100

seq1  TTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTCTGGCAGTACTGGAGATTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTCTGGCAGTACTGGAGATTC  150

seq1  ATCCTAGGGCCTTCCACATGCAATGTAAATGTTCTATGCTTGACCTCCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTAGGGCCTTCCACATGCAATGTAAATGTTCTATGCTTGACCTCCAC  200

seq1  CCTTAACACTATTAGAATTTCCTAATGCGAAGACATAATCACCAAATTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAACACTATTAGAATTTCCTAATGCGAAGACATAATCACCAAATTTA  250

seq1  GTTGACAGTAGCAGACCAAATACAGCTAATTTTTGGTTTTATTAAACAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGACAGTAGCAGACCAAATACAGCTAATTTTTGGTTTTATTAAACAGA  300

seq1  TGAACTAAGAATATTTTAATATTCTAATATGGTTATAGAGAGAACAAATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTAAGAATATTTTAATATTCTAATATGGTTATAGAGAGAACAAATG  350

seq1  TGAAATTTCATTAAGCTGTACACTTAAGTCACGCAGTTTATTACAAATTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATTTCATTAAGCTGTACACTTAAGTCACGCAGTTTATTACAAATTT  400

seq1  TGCCTCTATTTTAAAATATCATTTTCTAAGTTTGTATTATTTAAAGTTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCTATTTTAAAATATCATTTTCTAAGTTTGTATTATTTAAAGTTTC  450

seq1  ATGTTAAACCCATATGCGGGCTAAAGAAATGATTCCTTGGTAAATGTTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAAACCCATATGCGGGCTAAAGAAATGATTCCTTGGTAAATGTTCT  500

seq1  GGCTACCACTCTTGACAACTTCAATTTGGTCCTCAGGACCCACATGGTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTACCACTCTTGACAACTTCAATTTGGTCCTCAGGACCCACATGGTTG  550

seq1  AAGGAAAGACCCAACTCCTACAATTGTCCTCTGACCTCTTTGTGAGCATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAAGACCCAACTCCTACAATTGTCCTCTGACCTCTTTGTGAGCATC  600

seq1  ATGGTAGCCATGTACTTGGGCACACATGTATGCATGCACATACTGACATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTAGCCATGTACTTGGGCACACATGTATGCATGCACATACTGACATT  650

seq1  AAATACAATTTGCAATGCATGTTTTTAACACTCATGTGCCTCAGAAACAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACAATTTGCAATGCATGTTTTTAACACTCATGTGCCTCAGAAACAA  700

seq1  TTGAGAATGCTTTGTTGGTTTAAGCCTTTGTTCAGTGAATTTGTGTTAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAATGCTTTGTTGGTTTAAGCCTTTGTTCAGTGAATTTGTGTTAGT  750

seq1  TAATATTACATATAAACAACTGTAGAAAGAAAACACATATGCTTTATTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATTACATATAAACAACTGTAGAAAGAAAACACATATGCTTTATTCA  800

seq1  AGCCTA-TTGTTACTTGCATGGGTCCCAGAGGCATTGGCTATCTTTAGCT  849
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTATTTGTTACTTGCATGGGTCCCAGAGGCATTGGCTATCTTTAGCT  850

seq1  TCACTAATAAAGCAGCTGAATTTTATATTTAGAACATTTTGAGAAGTTTG  899
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTAATAAAGCAGCTGAA-TTTATATTTAGAACATTTTGAGAAGTTTG  899

seq1  CTTTCTATTTATTTTCTTGCTTTCTCTTGGTAAGACATGATTGAGTCTAA  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CTTTCTATTTATTTTCTTGCTTTCTCTTGGTAAGACATGATTGAGTCT-A  948

seq1  TCTCAGATTCCACCCCCCCACACACACTTTTTTTTCCTTTTTGAGTCAGT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TCTCAGATTCCACCCCCCCACACACACTTTTTTTTCC-TTTTGAGTCAGT  997

seq1  CTATGTAAGCCAGGTTGG-TCTAGATCTTGCTACAGAGCCCACACTGGCT  1048
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||
seq2  CTATGT-AGCCAGGTTGGTTCTAGATCTTGCTATAGAGCCAACACTGGCT  1046

seq1  TTGGCCTTGTGATTCTGCTTTTCCCATCAAGTGCTGAGA  1087
      |||| | || |||||||| ||| ||||| ||||| ||||
seq2  TTGGGC-TGGGATTCTGCCTTT-CCATC-AGTGCGGAGA  1082