BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-106I24
Chromosome18 (Build37)
Map Location 61,412,823 - 61,613,774
singlet/doubletdoublet
Overlap genePde6a, EG667279, Ppargc1b, LOC667675
Upstream geneEG225594, F830016B08Rik, LOC667578, EG667584, LOC435565, Iigp1, EG629292, LOC667597, 2010002N04Rik, Dctn4, Rbm22, Myoz3, Synpo, LOC100042675, Ndst1, Rps14, LOC667619, Cd74, Tcof1, LOC100042699, Arsi, Camk2a, Slc6a7, Cdx1, Pdgfrb, Csf1r, A630042L21Rik, Slc26a2
Downstream gene4933429F08Rik, Csnk1a1, Il17b, Pcyox1l, LOC100042730, Grpel2, Afap1l1, LOC100042738, Ablim3, Sh3tc2, Adrb2, Htr4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-106I24.bB6Ng01-106I24.g
ACCDH914266DH914267
length867770
definitionDH914266|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-106I24, 5' end.DH914267|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-106I24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,612,908 - 61,613,774)(61,412,823 - 61,413,592)
sequence
gaattcaatgcagcgcagaagagtcgtcaaggcaaacaactgtagcttag
accctagcaggcctcagctgaggcttcaagccacctgactggcttccttg
gccatctcttttcaaagacctccacctgtgtgtgagtgcctgatccccca
cccccagagccctctgtctgagccacccctatggctttttctgttgttcc
cactcctcctaacccttgcacctttggatgctttgtggtgtgcacagcaa
agagattttacaaccaacacttatttctaaggagccaagtaacttcttta
gaggggccttcttaggttctcagcatttgccacagaggcaaagctataaa
gcccttgagtcccagctgccccttcttctcttactagcctacagaagccc
atggagattcttttcctcacccacaagaattccgccttccctctaagggg
gcagaagtcactgccatgagtttgagttttaaaggacattttctgtctct
accttacccatgctctcgtttaaacagtttagattggctttaacagatgt
agggctggagtgatccggtgtagttcttgggaaggatgggagctgacgca
ggatttcagagccgggatggcaaggcatgtcgggagtgggcatggggatc
gattggcacagaggacccacaatctccagcgtggtcaatggccatgagcg
ttccacggagaggtggtcttctggcagacaccccaggggacaaacagatt
tgaatgaccagaggcactcccggatgagagggccatttgggctgagggat
tagatggatgtgtgggtgactgagctgagggggcaggaagctcttagtta
ggaggctgggaaacggg
gaattccaggtaagccatttttatttgatctcttagccataggactttct
tcttcctctctcctaaaagagcatcagaatatactaggatctacctgttt
tcttgggaagcagtctgaatggtggaaatttggacgaagttacataataa
atggaagggggcggcaatggtaactgggtaaattccaaggacactttcaa
cttcaaaacacttgcaaccctcactttctgaccccggaacattgtttagg
ctactcagtacctgagatgctctgatcctgcctggcacatgccagctctg
acatcttggggataggaaccttagctcgtgggcttggaagttcacggtgt
ttgttggcagctaaacccacacaagagtcaagttctggcttcttagagct
gagccaggccattagagtccagccacagccccaatcctgtccctgcaatc
tgcaccacatggaagtggtggagccccagccctgccattctcttacagaa
agagcctctggatgagtctgggtggatgattaaaaatgtactctccatgc
ccatcgtcaacaagaaggaagagatcgtcggcgtggccacattttacaac
cgcaaagatgggaagcccttcgacgatatggacgagaccctcatggaggt
gtgggatgctgggtagcccttggctggtggggcttggtgaccaccagttt
cagagttgcccttcagagctgcatggtgtttcccagtgtgtagctgcctg
accgtgggggtggggtgggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_61612908_61613774
seq2: B6Ng01-106I24.b_44_910 (reverse)

seq1  CCCGTCTCCCAGCCTCCTAACTAAGAGCTTCCTGCCCCCTCAGCTCAGTC  50
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGTTTCCCAGCCTCCTAACTAAGAGCTTCCTGCCCCCTCAGCTCAGTC  50

seq1  ACCCACACATCCATCTAATCCCTCAGCCCAAATGGCCCTCTCATCCGGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCACACATCCATCTAATCCCTCAGCCCAAATGGCCCTCTCATCCGGGA  100

seq1  GTGCCTCTGGTCATTCAAATCTGTTTGTCCCCTGGGGTGTCTGCCAGAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTCTGGTCATTCAAATCTGTTTGTCCCCTGGGGTGTCTGCCAGAAG  150

seq1  ACCACCTCTCCGTGGAACGCTCATGGCCATTGACCACGCTGGAGATTGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCTCTCCGTGGAACGCTCATGGCCATTGACCACGCTGGAGATTGTG  200

seq1  GGTCCTCTGTGCCAATCGATCCCCATGCCCACTCCCGACATGCCTTGCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTCTGTGCCAATCGATCCCCATGCCCACTCCCGACATGCCTTGCCA  250

seq1  TCCCGGCTCTGAAATCCTGCGTCAGCTCCCATCCTTCCCAAGAACTACAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCGGCTCTGAAATCCTGCGTCAGCTCCCATCCTTCCCAAGAACTACAC  300

seq1  CGGATCACTCCAGCCCTACATCTGTTAAAGCCAATCTAAACTGTTTAAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGATCACTCCAGCCCTACATCTGTTAAAGCCAATCTAAACTGTTTAAAC  350

seq1  GAGAGCATGGGTAAGGTAGAGACAGAAAATGTCCTTTAAAACTCAAACTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGCATGGGTAAGGTAGAGACAGAAAATGTCCTTTAAAACTCAAACTC  400

seq1  ATGGCAGTGACTTCTGCCCCCTTAGAGGGAAGGCGGAATTCTTGTGGGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCAGTGACTTCTGCCCCCTTAGAGGGAAGGCGGAATTCTTGTGGGTG  450

seq1  AGGAAAAGAATCTCCATGGGCTTCTGTAGGCTAGTAAGAGAAGAAGGGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAAGAATCTCCATGGGCTTCTGTAGGCTAGTAAGAGAAGAAGGGGC  500

seq1  AGCTGGGACTCAAGGGCTTTATAGCTTTGCCTCTGTGGCAAATGCTGAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGACTCAAGGGCTTTATAGCTTTGCCTCTGTGGCAAATGCTGAGA  550

seq1  ACCTAAGAAGGCCCCTCTAAAGAAGTTACTTGGCTCCTTAGAAATAAGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAAGAAGGCCCCTCTAAAGAAGTTACTTGGCTCCTTAGAAATAAGTG  600

seq1  TTGGTTGTAAAATCTCTTTGCTGTGCACACCACAAAGCATCCAAAGGTGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTGTAAAATCTCTTTGCTGTGCACACCACAAAGCATCCAAAGGTGC  650

seq1  AAGGGTTAGGAGGAGTGGGAACAACAGAAAAAGCCATAGGGGTGGCTCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTTAGGAGGAGTGGGAACAACAGAAAAAGCCATAGGGGTGGCTCAG  700

seq1  ACAGAGGGCTCTGGGGGTGGGGGATCAGGCACTCACACACAGGTGGAGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGGGCTCTGGGGGTGGGGGATCAGGCACTCACACACAGGTGGAGGT  750

seq1  CTTTGAAAAGAGATGGCCAAGGAAGCCAGTCAGGTGGCTTGAAGCCTCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGAAAAGAGATGGCCAAGGAAGCCAGTCAGGTGGCTTGAAGCCTCAG  800

seq1  CTGAGGCCTGCTAGGGTCTAAGCTACAGTTGTTTGCCTTGACGACTCTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGCCTGCTAGGGTCTAAGCTACAGTTGTTTGCCTTGACGACTCTTC  850

seq1  TGCGCTGCATTGAATTC  867
      |||||||||||||||||
seq2  TGCGCTGCATTGAATTC  867

seq1: chr18_61412823_61413592
seq2: B6Ng01-106I24.g_68_837

seq1  GAATTCCAGGTAAGCCATTTTTATTTGATCTCTTAGCCATAGGACTTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGTAAGCCATTTTTATTTGATCTCTTAGCCATAGGACTTTCT  50

seq1  TCTTCCTCTCTCCTAAAAGAGCATCAGAATATACTAGGATCTACCTGTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCTCTCTCCTAAAAGAGCATCAGAATATACTAGGATCTACCTGTTT  100

seq1  TCTTGGGAAGCAGTCTGAATGGTGGAAATTTGGACGAAGTTACATAATAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGGAAGCAGTCTGAATGGTGGAAATTTGGACGAAGTTACATAATAA  150

seq1  ATGGAAGGGGGCGGCAATGGTAACTGGGTAAATTCCAAGGACACTTTCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAGGGGGCGGCAATGGTAACTGGGTAAATTCCAAGGACACTTTCAA  200

seq1  CTTCAAAACACTTGCAACCCTCACTTTCTGACCCCGGAACATTGTTTAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAAAACACTTGCAACCCTCACTTTCTGACCCCGGAACATTGTTTAGG  250

seq1  CTACTCAGTACCTGAGATGCTCTGATCCTGCCTGGCACATGCCAGCTCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTCAGTACCTGAGATGCTCTGATCCTGCCTGGCACATGCCAGCTCTG  300

seq1  ACATCTTGGGGATAGGAACCTTAGCTCGTGGGCTTGGAAGTTCACGGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTTGGGGATAGGAACCTTAGCTCGTGGGCTTGGAAGTTCACGGTGT  350

seq1  TTGTTGGCAGCTAAACCCACACAAGAGTCAAGTTCTGGCTTCTTAGAGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGGCAGCTAAACCCACACAAGAGTCAAGTTCTGGCTTCTTAGAGCT  400

seq1  GAGCCAGGCCATTAGAGTCCAGCCACAGCCCCAATCCTGTCCCTGCAATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCAGGCCATTAGAGTCCAGCCACAGCCCCAATCCTGTCCCTGCAATC  450

seq1  TGCACCACATGGAAGTGGTGGAGCCCCAGCCCTGCCATTCTCTTACAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACCACATGGAAGTGGTGGAGCCCCAGCCCTGCCATTCTCTTACAGAA  500

seq1  AGAGCCTCTGGATGAGTCTGGGTGGATGATTAAAAATGTACTCTCCATGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCTCTGGATGAGTCTGGGTGGATGATTAAAAATGTACTCTCCATGC  550

seq1  CCATCGTCAACAAGAAGGAAGAGATCGTCGGCGTGGCCACATTTTACAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCGTCAACAAGAAGGAAGAGATCGTCGGCGTGGCCACATTTTACAAC  600

seq1  CGCAAAGATGGGAAGCCCTTCGACGATATGGACGAGACCCTCATGGAGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCAAAGATGGGAAGCCCTTCGACGATATGGACGAGACCCTCATGGAGGT  650

seq1  GTGGGATGCTGGGTAGCCCTTGGCTGGTGGGGCTTGGTGACCACCAGTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGATGCTGGGTAGCCCTTGGCTGGTGGGGCTTGGTGACCACCAGTTT  700

seq1  CAGAGTTGCCCTTCAGAGCTGCATGGTGTTTCCCAGTGTGTAGCTGCCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTTGCCCTTCAGAGCTGCATGGTGTTTCCCAGTGTGTAGCTGCCTG  750

seq1  ACCGTGGGGGTGGGGTGGGG  770
      ||||||||||||||||||||
seq2  ACCGTGGGGGTGGGGTGGGG  770