BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-107M14
Chromosome18 (Build37)
Map Location 12,628,389 - 12,830,763
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLama3, 2810439F02Rik
Upstream geneLOC665310, LOC100040148, Rbbp8, LOC621998, Cables1, 6030446N20Rik, Riok3, 3110002H16Rik, Npc1, Ankrd29
Downstream geneCabyr, LOC665356, Osbpl1a, LOC435556, Impact, Hrh4, EG383354, LOC665379
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-107M14.bB6Ng01-107M14.g
ACCDH915150DH915151
length8011,056
definitionDH915150|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-107M14, 5' end.DH915151|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-107M14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,628,389 - 12,629,189)(12,829,700 - 12,830,763)
sequence
gaattctcaactgaatatttgagacctcaagtccactgcattgccagcta
caggcagcatgctaatccaaggtaatgtttccctctcttcttccttatca
atactctgaacaatactgccatcatatacataaggctaaaactttatgca
gtttggggatctcttctctgaaatgtttggaaacttaactgttttgaatt
tgagagcatttgtaaatatataataagatatcttggggataagacccaag
tctgaacatgaaatggattatatatcacatgcagcttttttaaagtatca
cgtatagataatttatacattacatctggtatgcttctttttggattatg
atcgatcacacgaggtcaccagtggaattttctacttggtgctggggttc
cacagtcccaaccatgcacagtgtactgggattccacagttctaaccatg
cagtgtgctggggttccacagccctggccatgcagtgtgctggggttcca
cagccctggccatgtagtgtgctggggttccacagtcctaaccatgcagt
gtgttggggttccacagcctaaccatgcagtgtgctggggttccacagcc
ctggccatgcagtgtgctggggttccacagccctgaccatgtagtgtgct
ggggttctacagtcctaaccatgcagtgtgttggggttccacagccctga
ccatgcagtgtgttggggttccacagccctgaccatgtaatgtgctgggg
ttccaccgtcctgactgtgaagtgtgctggggatccacagcctaaccatg
c
gaattccacactggatggagcttgagcatagaaggcctcaaagcctgcct
ttttgacacacttcctccaacaagaccacacctattccaacaaggccact
cctcctaataatgccactccctacggtcaagcactgaaacacacgaatct
atggtggccaaacccattcaaaccagaatggccatggcaagttgttcctc
aaagccactgaatgagctctaagaaggcagatctatgaccatgccactca
aacactcccttttaagcctctagttcctcacgtgggaaccctaggctggg
ccaggggaaaggccttggtctccggcctagggctttgacatacagacagc
atccccacccaggccactcactggccaagtccttccatccctcaacagct
cctgctctgcctccaggcttctagacaaacactcaggtccatacagttcc
tggtctcttggatgagagtgggagccccctcttggatgtcgatgctgctg
agcccccacccttcagagcatgtcacaccagcttggtgcccatgccaggg
tctggggtgctcttgctgacaagctagctcgtgaatggatgagggaatga
acgcaaatcctaaggaaagagtgcctgcatctggtattggggatggctcg
atcatccatcacccattaactgtttctgcacctttctgtgttgtgatatg
gtttattgagtaattgaaacagtgatcggcagtgagcaggcacagcagga
ggcaaagtgatgaataaggaagtagtttaagtaaacaaaaatcctcacta
ttcttaagaagctatccctgagaggatgtcttcttgccagtctttggagc
atataattgcttaaaatgatttcctgcctctcccaggagcttcccaccac
tgtcattcggaaagaacagtccttacccactcagctaatatagcctaaat
gggtaccacatggcagctcaggagccagtctttctacgatggaattgtaa
agcctttaagttttcaacacatcttaactcatattatgcactggtatcta
tttgta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_12628389_12629189
seq2: B6Ng01-107M14.b_46_846

seq1  GAATTCTCAACTGAATATTTGAGACCTCAAGTCCACTGCATTGCCAGCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAACTGAATATTTGAGACCTCAAGTCCACTGCATTGCCAGCTA  50

seq1  CAGGCAGCATGCTAATCCAAGGTAATGTTTCCCTCTCTTCTTCCTTATCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCAGCATGCTAATCCAAGGTAATGTTTCCCTCTCTTCTTCCTTATCA  100

seq1  ATACTCTGAACAATACTGCCATCATATACATAAGGCTAAAACTTTATGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTCTGAACAATACTGCCATCATATACATAAGGCTAAAACTTTATGCA  150

seq1  GTTTGGGGATCTCTTCTCTGAAATGTTTGGAAACTTAACTGTTTTGAATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGGGATCTCTTCTCTGAAATGTTTGGAAACTTAACTGTTTTGAATT  200

seq1  TGAGAGCATTTGTAAATATATAATAAGATATCTTGGGGATAAGACCCAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGCATTTGTAAATATATAATAAGATATCTTGGGGATAAGACCCAAG  250

seq1  TCTGAACATGAAATGGATTATATATCACATGCAGCTTTTTTAAAGTATCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAACATGAAATGGATTATATATCACATGCAGCTTTTTTAAAGTATCA  300

seq1  CGTATAGATAATTTATACATTACATCTGGTATGCTTCTTTTTGGATTATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTATAGATAATTTATACATTACATCTGGTATGCTTCTTTTTGGATTATG  350

seq1  ATCGATCACACGAGGTCACCAGTGGAATTTTCTACTTGGTGCTGGGGTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGATCACACGAGGTCACCAGTGGAATTTTCTACTTGGTGCTGGGGTTC  400

seq1  CACAGTCCCAACCATGCACAGTGTACTGGGATTCCACAGTTCTAACCATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTCCCAACCATGCACAGTGTACTGGGATTCCACAGTTCTAACCATG  450

seq1  CAGTGTGCTGGGGTTCCACAGCCCTGGCCATGCAGTGTGCTGGGGTTCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTGCTGGGGTTCCACAGCCCTGGCCATGCAGTGTGCTGGGGTTCCA  500

seq1  CAGCCCTGGCCATGTAGTGTGCTGGGGTTCCACAGTCCTAACCATGCAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCTGGCCATGTAGTGTGCTGGGGTTCCACAGTCCTAACCATGCAGT  550

seq1  GTGTTGGGGTTCCACAGCCTAACCATGCAGTGTGCTGGGGTTCCACAGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGGGGTTCCACAGCCTAACCATGCAGTGTGCTGGGGTTCCACAGCC  600

seq1  CTGGCCATGCAGTGTGCTGGGGTTCCACAGCCCTGACCATGTAGTGTGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCATGCAGTGTGCTGGGGTTCCACAGCCCTGACCATGTAGTGTGCT  650

seq1  GGGGTTCCACAGTCCTAACCATGCAGTGTGTTGGGGTTCCACAGCCCTGA  700
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTTCTACAGTCCTAACCATGCAGTGTGTTGGGGTTCCACAGCCCTGA  700

seq1  CCATGCAGTGTGTTGGGGTTCCACAGCCCTGACCATGTAGTGTGCTGGGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CCATGCAGTGTGTTGGGGTTCCACAGCCCTGACCATGTAATGTGCTGGGG  750

seq1  TTCCACCGTCCTGACTGTGTAGTGTGCTGGGGTTCCACAGCCTAACCATG  800
      ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTCCACCGTCCTGACTGTGAAGTGTGCTGGGGATCCACAGCCTAACCATG  800

seq1  C  801
      |
seq2  C  801

seq1: chr18_12829700_12830763
seq2: B6Ng01-107M14.g_67_1122 (reverse)

seq1  TACAAATAAGATACCAGTGCATAATTATGTAGTTAAGATGTGTTTGAAAA  50
      ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||
seq2  TACAAAT-AGATACCAGTGCATAA-TATG-AGTTAAGATGTG-TTGAAAA  46

seq1  CTTAAAGGCTTTACAATTCCATCGTAGAAAGACTGGCTCCTGGAGCTGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTTAAAGGCTTTACAATTCCATCGTAGAAAGACTGGCTCCT-GAGCTGCC  95

seq1  ATGTGGTACCCATTTAGGCTATATTTAGCTGAGTGGGTAAGGACTGTTCT  150
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATGTGGTACCCATTTAGGCTATA-TTAGCTGAGTGGGTAAGGACTGTTC-  143

seq1  TTTCCGAATGACAGTGGTGGGAAGCTCCTGGGAGAGGCAGGAAATCATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCGAATGACAGTGGTGGGAAGCTCCTGGGAGAGGCAGGAAATCATTT  193

seq1  TAAGCAATTTATATGCTCCAAAGACTGGCAAGAAGACATCCTCTCAGGGA  250
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAA-TTATATGCTCCAAAGACTGGCAAGAAGACATCCTCTCAGGGA  242

seq1  TAGCTTCTTAGGAATAGTGAGGATTTTTGTTTACTTAAACTACTTCCTTA  300
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTCTTAAGAATAGTGAGGATTTTTGTTTACTTAAACTACTTCCTTA  292

seq1  TTCATCACTTTGCCTCCTGCTGTGCCTGCTCACTGCCGATCACTGTTTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCACTTTGCCTCCTGCTGTGCCTGCTCACTGCCGATCACTGTTTCA  342

seq1  ATTACTCAATAAACCATATCACAACACAGAAAGGTGCAGAAACAGTTAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACTCAATAAACCATATCACAACACAGAAAGGTGCAGAAACAGTTAAT  392

seq1  GGGTGATGGATGATCGAGCCATCCCCAATACCAGATGCAGGCACTCTTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGATGGATGATCGAGCCATCCCCAATACCAGATGCAGGCACTCTTTC  442

seq1  CTTAGGATTTGCGTTCATTCCCTCATCCATTCACGAGCTAGCTTGTCAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGGATTTGCGTTCATTCCCTCATCCATTCACGAGCTAGCTTGTCAGC  492

seq1  AAGAGCACCCCAGACCCTGGCATGGGCACCAAGCTGGTGTGACATGCTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCACCCCAGACCCTGGCATGGGCACCAAGCTGGTGTGACATGCTCT  542

seq1  GAAGGGTGGGGGCTCAGCAGCATCGACATCCAAGAGGGGGCTCCCACTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGTGGGGGCTCAGCAGCATCGACATCCAAGAGGGGGCTCCCACTCT  592

seq1  CATCCAAGAGACCAGGAACTGTATGGACCTGAGTGTTTGTCTAGAAGCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCAAGAGACCAGGAACTGTATGGACCTGAGTGTTTGTCTAGAAGCCT  642

seq1  GGAGGCAGAGCAGGAGCTGTTGAGGGATGGAAGGACTTGGCCAGTGAGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCAGAGCAGGAGCTGTTGAGGGATGGAAGGACTTGGCCAGTGAGTG  692

seq1  GCCTGGGTGGGGATGCTGTCTGTATGTCAAAGCCCTAGGCCGGAGACCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGGTGGGGATGCTGTCTGTATGTCAAAGCCCTAGGCCGGAGACCAA  742

seq1  GGCCTTTCCCCTGGCCCAGCCTAGGGTTCCCACGTGAGGAACTAGAGGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTTTCCCCTGGCCCAGCCTAGGGTTCCCACGTGAGGAACTAGAGGCT  792

seq1  TAAAAGGGAGTGTTTGAGTGGCATGGTCATAGATCTGCCTTCTTAGAGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGGGAGTGTTTGAGTGGCATGGTCATAGATCTGCCTTCTTAGAGCT  842

seq1  CATTCAGTGGCTTTGAGGAACAACTTGCCATGGCCATTCTGGTTTGAATG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCAGTGGCTTTGAGGAACAACTTGCCATGGCCATTCTGGTTTGAATG  892

seq1  GGTTTGGCCACCATAGATTCGTGTGTTTCAGTGCTTGACCGTAGGGAGTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGGCCACCATAGATTCGTGTGTTTCAGTGCTTGACCGTAGGGAGTG  942

seq1  GCATTATTAGGAGGAGTGGCCTTGTTGGAATAGGTGTGGTCTTGTTGGAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTATTAGGAGGAGTGGCCTTGTTGGAATAGGTGTGGTCTTGTTGGAG  992

seq1  GAAGTGTGTCAAAAAGGCAGGCTTTGAGGCCTTCTATGCTCAAGCTCCAT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGTGTCAAAAAGGCAGGCTTTGAGGCCTTCTATGCTCAAGCTCCAT  1042

seq1  CCAGTGTGGAATTC  1064
      ||||||||||||||
seq2  CCAGTGTGGAATTC  1056