BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-113F15
Chromosome18 (Build37)
Map Location 29,180,857 - 29,352,471
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG271505, EG625997, BC051408
Downstream geneLOC100040930, 4930578E11Rik, LOC666073
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-113F15.bB6Ng01-113F15.g
ACCDH919170DH919171
length1,130610
definitionDH919170|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113F15, 5' end.DH919171|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113F15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(29,351,342 - 29,352,471)(29,180,857 - 29,181,466)
sequence
gaattctctggcagctagagtgctctcaaactcttactacattggcctca
ttggtgtttttgtagctggtgtttcccttcaacagtaaaagttcctcttt
cattatgaccttttcctttcaactaatttactgtacttttcattcaccgt
gaacagacatctcttcttcctgctatgctatatttgaccaatatcttctt
tcttggttcatccatcatcttaactggagaaaatgtgtttcaatggatac
aacattggtttatccttgatgttacaaatcccaagctcatttccttcctc
ctgcgaagatttctatacatgtgaagtatgtcttctgtcacactggacct
tagttgagtatcctacttcctgtaacataatcaattttaaatgagatttt
gcacatattttaatagactagcagccacttcttattacattgtctgtctc
tatcttccaagcaatgtctttgttttatgtgaatatgcatatttatgtgt
attcacgtgtgaacacacttgtgtatgcatggtgtggaagtcagaggaca
atgttggctgtcaatattcatgtgtcttctctcatgttggaagatagtct
gtctttgacctgaaaggctagctagtcagtgaactccaaggagcctcctg
aatctgtcttccattgctccatcaatagaattacaggcatgaatttgggt
cctcatacctgcaagacaaatgttttgattgaagagccatctccccagtc
cctaaatgctctttaaatttatgagtacttctcaagtgctaagtccctat
atttttcttacaggcacagttgaatcaaaatacaataatgtttttagaca
tattctcttgaaacttaaaagcaattcttaaattcattgaaataagtatt
tttggtattatgaaaattccattgcacttacttctgaagcattataagat
ttaagttttctactgtgagactattacacaaccctgttatctgttttatc
tgttcattctgaaataattatatctctatccagagtctattccttaatga
ttatgaaataaagcaaattttattcaaatcaaagcaccttatcttataat
accacagactgggagcagccctggaagtaa
gaattcctagtccttgaatggacttctttctaccataagatttaattcca
gaacccaaagcttgaggaagaaccgcaacactagatcatggtagctactg
caacttaaaagttttctgagttctttccatcttctggctattataaataa
ggctactatgaacatagtggagcatgtgtccttcttatcggatgcccctc
aacagaggaatggatacaaaaaatgtggtacatttacacaatggagtact
actcagctattaaaaagaatgaatttatgaaattcctaggcaaatggatg
gacctggagggcatcatcctgagtgaagtaacacaatcacaaaagaaatc
aaatgatatgtgctcactgataagtggatattagcccagaaacttagtat
acccgagatataagatacaatttgcaaaacacatgaaactgaagaagaac
gaagaccaaagtgtggacactttgccccttcttagaattggaaacaatca
cccatggaaagagttacagagacaaagtttggagctgagacaaaaggatg
gaccatctagagactgccatatccagagatccatcccataattagtcttc
aaatgatgac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_29351342_29352471
seq2: B6Ng01-113F15.b_49_1178 (reverse)

seq1  TTACATCCAAGGCTGCTACCATGCTTGTGGTATTTATAAG-TAAGGTGCT  49
      |||| |||| ||||||| ||| |  ||||||| ||||||| |||||||| 
seq2  TTACTTCCAGGGCTGCTCCCA-GTCTGTGGTA-TTATAAGATAAGGTGC-  47

seq1  TTTGATTTG-ATAAAATTTGCTTTATCTCATAATCATTAGAGAATAGACT  98
      ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||
seq2  TTTGATTTGAATAAAATTTGCTTTATTTCATAATCATTAAGGAATAGACT  97

seq1  CTGGATAG-GATAATAATTATTTCAGAATGAACAGATAAAACAGATAACA  147
      |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATAGAGAT-ATAATTATTTCAGAATGAACAGATAAAACAGATAACA  146

seq1  GGGTTGTGTAATAGTCTCACAGTAGAAAACTAAAATCTTATAATGCTTCA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGTGTAATAGTCTCACAGTAGAAAACTTAAATCTTATAATGCTTCA  196

seq1  GAAGTGAGTGCAATGGAATTTTCATAATACCAAAAATACTTATTTCAATG  247
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTAAGTGCAATGGAATTTTCATAATACCAAAAATACTTATTTCAATG  246

seq1  AATTTAAGAATTGCTTTTAAGTTTCAAGAGAATATGTCT-AAAACATTAT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AATTTAAGAATTGCTTTTAAGTTTCAAGAGAATATGTCTAAAAACATTAT  296

seq1  TGTATTTTGATTCAACTGTGCCTGTAAGAAAAATATAGGGACTTAGCACT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTTTGATTCAACTGTGCCTGTAAGAAAAATATAGGGACTTAGCACT  346

seq1  TGAGAAGTACTCATAAATTTAAAGAGCATTTAGGGACTGGGGAGATGGCT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAGTACTCATAAATTTAAAGAGCATTTAGGGACTGGGGAGATGGCT  396

seq1  CTTCAATCAAAACATTTGTCTTGCAGGTATGAGGACCCAAATTCATGCCT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAATCAAAACATTTGTCTTGCAGGTATGAGGACCCAAATTCATGCCT  446

seq1  GTAATTCTATTGATGGAGCAATGGAAGACAGATTCAGGAGGCTCCTTGGA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATTCTATTGATGGAGCAATGGAAGACAGATTCAGGAGGCTCCTTGGA  496

seq1  GTTCACTGACTAGCTAGCCTTTCAGGTCAAAGACAGACTATCTTCCAACA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCACTGACTAGCTAGCCTTTCAGGTCAAAGACAGACTATCTTCCAACA  546

seq1  TGAGAGAAGACACATGAATATTGACAGCCAACATTGTCCTCTGACTTCCA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGAAGACACATGAATATTGACAGCCAACATTGTCCTCTGACTTCCA  596

seq1  CACCATGCATACACAAGTGTGTTCACACGTGAATACACATAAATATGCAT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATGCATACACAAGTGTGTTCACACGTGAATACACATAAATATGCAT  646

seq1  ATTCACATAAAACAAAGACATTGCTTGGAAGATAGAGACAGACAATGTAA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACATAAAACAAAGACATTGCTTGGAAGATAGAGACAGACAATGTAA  696

seq1  TAAGAAGTGGCTGCTAGTCTATTAAAATATGTGCAAAATCTCATTTAAAA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAGTGGCTGCTAGTCTATTAAAATATGTGCAAAATCTCATTTAAAA  746

seq1  TTGATTATGTTACAGGAAGTAGGATACTCAACTAAGGTCCAGTGTGACAG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTATGTTACAGGAAGTAGGATACTCAACTAAGGTCCAGTGTGACAG  796

seq1  AAGACATACTTCACATGTATAGAAATCTTCGCAGGAGGAAGGAAATGAGC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACATACTTCACATGTATAGAAATCTTCGCAGGAGGAAGGAAATGAGC  846

seq1  TTGGGATTTGTAACATCAAGGATAAACCAATGTTGTATCCATTGAAACAC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGATTTGTAACATCAAGGATAAACCAATGTTGTATCCATTGAAACAC  896

seq1  ATTTTCTCCAGTTAAGATGATGGATGAACCAAGAAAGAAGATATTGGTCA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTCCAGTTAAGATGATGGATGAACCAAGAAAGAAGATATTGGTCA  946

seq1  AATATAGCATAGCAGGAAGAAGAGATGTCTGTTCACGGTGAATGAAAAGT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATAGCATAGCAGGAAGAAGAGATGTCTGTTCACGGTGAATGAAAAGT  996

seq1  ACAGTAAATTAGTTGAAAGGAAAAGGTCATAATGAAAGAGGAACTTTTAC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTAAATTAGTTGAAAGGAAAAGGTCATAATGAAAGAGGAACTTTTAC  1046

seq1  TGTTGAAGGGAAACACCAGCTACAAAAACACCAATGAGGCCAATGTAGTA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGAAGGGAAACACCAGCTACAAAAACACCAATGAGGCCAATGTAGTA  1096

seq1  AGAGTTTGAGAGCACTCTAGCTGCCAGAGAATTC  1130
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTTGAGAGCACTCTAGCTGCCAGAGAATTC  1130

seq1: chr18_29180857_29181466
seq2: B6Ng01-113F15.g_69_678

seq1  GAATTCCTAGTCCTTGAATGGACTTCTTTCTACCATAAGATTTAATTCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAGTCCTTGAATGGACTTCTTTCTACCATAAGATTTAATTCCA  50

seq1  GAACCCAAAGCTTGAGGAAGAACCGCAACACTAGATCATGGTAGCTACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCCAAAGCTTGAGGAAGAACCGCAACACTAGATCATGGTAGCTACTG  100

seq1  CAACTTAAAAGTTTTCTGAGTTCTTTCCATCTTCTGGCTATTATAAATAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTAAAAGTTTTCTGAGTTCTTTCCATCTTCTGGCTATTATAAATAA  150

seq1  GGCTACTATGAACATAGTGGAGCATGTGTCCTTCTTATCGGATGCCCCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTACTATGAACATAGTGGAGCATGTGTCCTTCTTATCGGATGCCCCTC  200

seq1  AACAGAGGAATGGATACAAAAAATGTGGTACATTTACACAATGGAGTACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAGGAATGGATACAAAAAATGTGGTACATTTACACAATGGAGTACT  250

seq1  ACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATG  300

seq1  GACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAAGTAACACAATCACAAAAGAAATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAAGTAACACAATCACAAAAGAAATC  350

seq1  AAATGATATGTGCTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCAGAAACTTAGTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGATATGTGCTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCAGAAACTTAGTAT  400

seq1  ACCCGAGATATAAGATACAATTTGCAAAACACATGAAACTGAAGAAGAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCGAGATATAAGATACAATTTGCAAAACACATGAAACTGAAGAAGAAC  450

seq1  GAAGACCAAAGTGTGGACACTTTGCCCCTTCTTAGAATTGGAAACAATCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACCAAAGTGTGGACACTTTGCCCCTTCTTAGAATTGGAAACAATCA  500

seq1  CCCATGGAAAGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGACAAAAGGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGGAAAGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGACAAAAGGATG  550

seq1  GACCATCTAGAGACTGCCATATCCAGAGATCCATCCCATAATTAGTCTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCATCTAGAGACTGCCATATCCAGAGATCCATCCCATAATTAGTCTTC  600

seq1  AAATGATGAC  610
      ||||||||||
seq2  AAATGATGAC  610