BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-129M24
Chromosome18 (Build37)
Map Location 21,877,674 - 22,040,443
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4921528I01Rik
Upstream geneB4galt6, D030074E01Rik, Rnf125, Rnf138, Mep1b, EG622978, Gm944, LOC665722, LOC225264, Klhl14
Downstream geneLOC546708, LOC100040547, Asxl3, Nol4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-129M24.bB6Ng01-129M24.g
ACCDH931300DH931301
length9551,082
definitionDH931300|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129M24, 5' end.DH931301|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129M24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(21,877,674 - 21,878,637)(22,039,367 - 22,040,443)
sequence
gaattcattcccaggggccaacagtgtgatttagcttctgatatttatca
aggcagcttgtcagtgttgtgaattatcctgcttaatcagacatcagagt
acactgctaatttgctgaaagaaaaaaaaatagaaaggaaggaaggaagg
aaggaaggaaggaaggaaggacggacaaaagcatcatccttggtcagcta
aggagaaaacgtctgtactgcctcttttgatggtatatctctatatgcta
ctccaggccttgagttttactgtagagggctttgctgaccctgatccctg
atgttagtgatgtgcaaaatgatggagcctagtgataaaggaattttcag
gaagaaaactcaaaacagttcattttaatttatgagcatttatgtggtaa
tatatgctcctagaagccatgggtcattaaatgaaagtctctgtgtcaaa
agtaggctatttctggtcagggagacactgaaggttcccccaaacaatac
aggcagttgccataacagttgctcatcaaaattagatggtaagatgctag
tgctgcagatcacgcgtgctttgaacactggagccgagatggaaacttcc
cctgctgcacatcggatataatgctggaggcatctgcaaggaggaattgt
gtcaacactattactcagctgtggaccctatgtgctacactgactagcaa
gtcaaggtgtgctcactgatgctacagtggcacattagtcatagggacaa
ccaactgctttctgattggaccatcttttaaatagctatgattatgcccg
tacacttgtcagtgtgcagaggacaaaccctactgaactcttagccatat
atggggtatctatatcaacccctccaaggctcatggcacatcacagatag
cgggagaaggactgagagcagaggtcggggaggggtgaaatggaagctga
ttgaa
gaattctctattactggaattacaggctggtgttactgtcctagaatcct
gggaaactaactggggtgtctggaagaacagcacatgttcctaacagctg
agtcatctctacaaccactattttctcaatgtttcttataacctgatatt
agttttaaaagcacactgcatgtcattttgtaaggaagctcgtcttttgg
ttagagactatgtcaatgacctaaggttaatttggtccctatcatttctt
cttgatcaacagaactcagctgatgctgtgtcatcaacttactgatggta
gaaacttccatcttcagacttgttcttttacattggagagtgcaaatgtc
atttttctattaacacaaccacaagttcacaaagagtatcttgagcaagt
gcgtttcttctagatagatcacctggcttagagaaccctcaaaaaagtgc
aaaactgaggaagagagtgacctcttttaccactaggccttcacctgatg
gccatgcagagagctgagggctggagatgcagctgagtgctacagttgct
cacccagggggtacaaggccccaagttcagtcccagccctgaggaagccg
agagctcatttgaagctcctgctttttgctgcttggtgtaaaacttgtag
aaagatttttgagtttacaaggagacatgaagattagggcatttcagttt
ggaagtacctcttttcatttcacagatgaacaaacacttgaaggccctaa
gcaatattttgtccagaaagaaaaaagaactaaaaaaacttcccagtaga
tggattaagcagagaaacttttatccataaagagtgttttatgtctttaa
agatatacaaattagaagctttagttaggaactattgtattcttatactc
acacacacacacacacacacacagagaggagagagaggggggggggctac
taaaattcagatatatcacggaaatgaacctcaaactgtaggttttcact
ttgtgacgtatcagtgaaagtatgaacactgactttatggaccgagggac
cccacccttaaggaaaccatattatgtaatat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_21877674_21878637
seq2: B6Ng01-129M24.b_51_1005

seq1  GAATTCATTCCCAGGGGCCAACAGTGTGATTTAGCTTCTGATATTTATCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTCCCAGGGGCCAACAGTGTGATTTAGCTTCTGATATTTATCA  50

seq1  AGGCAGCTTGTCAGTGTTGTGAATTATCCTGCTTAATCAGACATCAGAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGCTTGTCAGTGTTGTGAATTATCCTGCTTAATCAGACATCAGAGT  100

seq1  ACACTGCTAATTTGCTGAAAGAAAAAAAAATAGAAAGGAAGGAAGGAAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGCTAATTTGCTGAAAGAAAAAAAAATAGAAAGGAAGGAAGGAAGG  150

seq1  AAGGAAGGAAGGAAGGAAGGACGGACAAAAGCATCATCCTTGGTCAGCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAGGAAGGAAGGAAGGACGGACAAAAGCATCATCCTTGGTCAGCTA  200

seq1  AGGAGAAAACGTCTGTACTGCCTCTTTTGATGGTATATCTCTATATGCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAAAACGTCTGTACTGCCTCTTTTGATGGTATATCTCTATATGCTA  250

seq1  CTCCAGGCCTTGAGTTTTACTGTAGAGGGCTTTGCTGACCCTGATCCCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGGCCTTGAGTTTTACTGTAGAGGGCTTTGCTGACCCTGATCCCTG  300

seq1  ATGTTAGTGATGTGCAAAATGATGGAGCCTAGTGATAAAGGAATTTTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAGTGATGTGCAAAATGATGGAGCCTAGTGATAAAGGAATTTTCAG  350

seq1  GAAGAAAACTCAAAACAGTTCATTTTAATTTATGAGCATTTATGTGGTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAAACTCAAAACAGTTCATTTTAATTTATGAGCATTTATGTGGTAA  400

seq1  TATATGCTCCTAGAAGCCATGGGTCATTAAATGAAAGTCTCTGTGTCAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGCTCCTAGAAGCCATGGGTCATTAAATGAAAGTCTCTGTGTCAAA  450

seq1  AGTAGGCTATTTCTGGTCAGGGAGACACTGAAGGTTCCCCCAAACAATAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGGCTATTTCTGGTCAGGGAGACACTGAAGGTTCCCCCAAACAATAC  500

seq1  AGGCAGTTGCCATAACAGTTGCTCATCAAAATTAGATGGTAAGATGCTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGTTGCCATAACAGTTGCTCATCAAAATTAGATGGTAAGATGCTAG  550

seq1  TGCTGCAGATCACGCGTGCTTTGAACACTGGAGCCGAGATGGAAACTTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCAGATCACGCGTGCTTTGAACACTGGAGCCGAGATGGAAACTTCC  600

seq1  CCTGCTGCACATCGGATATAATGCTGGAGGCATCTGCAAGGAGGAATTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTGCACATCGGATATAATGCTGGAGGCATCTGCAAGGAGGAATTGT  650

seq1  GTCAACACTATTACTCAGCTGTGGACCCTATGTGCTACACTGACTAGCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAACACTATTACTCAGCTGTGGACCCTATGTGCTACACTGACTAGCAA  700

seq1  GTCAAGGTGTGCTCACTGATGCTACAGTGGCACATTAGTCATAGGGACAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAGGTGTGCTCACTGATGCTACAGTGGCACATTAGTCATAGGGACAA  750

seq1  CCAACTGCTTTCTGATTGGACCATCTTTTAAATAGCTATGATTATGCCCG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTGCTTTCTGATTGGACCATCTTTTAAATAGCTATGATTATGCCCG  800

seq1  TACACTTGTCAGTGTGCAGAGGACAAACCCTACTGAACTCTTAGCCATAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTTGTCAGTGTGCAGAGGACAAACCCTACTGAACTCTTAGCCATAT  850

seq1  ATGGGGTATCTATATCAACCCCTCCAAGGCTCAGGGCACATCACAGATAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ATGGGGTATCTATATCAACCCCTCCAAGGCTCATGGCACATCACAGATAG  900

seq1  CGGGGAGAAGGAACTGAAGAGCAGGAGGGTCGGGGGAGGGGTGAAATGGG  950
      | ||||||||| |||| |||||||   |||| ||||||||||||||| ||
seq2  C-GGGAGAAGG-ACTG-AGAGCAG--AGGTC-GGGGAGGGGTGAAAT-GG  943

seq1  AAGCTGAAGTTGAA  964
      |||||||  |||||
seq2  AAGCTGA--TTGAA  955

seq1: chr18_22039367_22040443
seq2: B6Ng01-129M24.g_68_1149 (reverse)

seq1  ATATTAATTAATATGGTTTCCCTAA--GTGTGGTCCTTCGGT-CATAATG  47
      ||||||  ||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||| ||||| |
seq2  ATATTACATAATATGGTTTCCTTAAGGGTGGGGTCCCTCGGTCCATAAAG  50

seq1  TCTGTGTCTATACTTTTCACTGATACGTCACAAAGTGAAAACCTACAGTT  97
      || ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGTTCATAC-TTTCACTGATACGTCACAAAGTGAAAACCTACAGTT  99

seq1  TGAGGTTCATTTCTGTGATATATCTGAATTTTAGTAG-CCCCCCCCCTCT  146
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TGAGGTTCATTTCCGTGATATATCTGAATTTTAGTAGCCCCCCCCCCTCT  149

seq1  CTCT-CTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTATAAGAATAC-AT  194
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CTCTCCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTATAAGAATACAAT  199

seq1  AGTTCCTAACTAAAGCCTCTAATTTGTATATCTTTAAAGACATAAAACAC  244
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCTAACTAAAGCTTCTAATTTGTATATCTTTAAAGACATAAAACAC  249

seq1  TCTTTATGGATAAAAGTTTCTCTGCTTAATCCATCTACTGGGAAGTTTTT  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TCTTTATGGATAAAAGTTTCTCTGCTTAATCCATCTACTGGGAAG-TTTT  298

seq1  TTTAGTTCTTTTTTCTTTCTGGAC-AAATATTGCTTAGGGCCTTCAAGTG  343
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTTCTTTTTTCTTTCTGGACAAAATATTGCTTAGGGCCTTCAAGTG  348

seq1  TTTGTTCATCTGTGAAATGAAAAGAGGTACTTCCAAACTGAAATGCCCTA  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTCATCTGTGAAATGAAAAGAGGTACTTCCAAACTGAAATGCCCTA  398

seq1  ATCTTCATGTCTCCTTGTAAACTCAAAAATCTTTCTACAAGTTTTACACC  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCATGTCTCCTTGTAAACTCAAAAATCTTTCTACAAGTTTTACACC  448

seq1  AAGCAGCAAAAAGCAGGAGCTTCAAATGAGCTCTCGGCTTCCTCAGGGCT  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGCAAAAAGCAGGAGCTTCAAATGAGCTCTCGGCTTCCTCAGGGCT  498

seq1  GGGACTGAACTTGGGGCCTTGTACCCCCTGGGTGAGCAACTGTAGCACTC  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACTGAACTTGGGGCCTTGTACCCCCTGGGTGAGCAACTGTAGCACTC  548

seq1  AGCTGCATCTCCAGCCCTCAGCTCTCTGCATGGCCATCAGGTGAAGGCCT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCATCTCCAGCCCTCAGCTCTCTGCATGGCCATCAGGTGAAGGCCT  598

seq1  AGTGGTAAAAGAGGTCACTCTCTTCCTCAGTTTTGCACTTTTTTGAGGGT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTAAAAGAGGTCACTCTCTTCCTCAGTTTTGCACTTTTTTGAGGGT  648

seq1  TCTCTAAGCCAGGTGATCTATCTAGAAGAAACGCACTTGCTCAAGATACT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAAGCCAGGTGATCTATCTAGAAGAAACGCACTTGCTCAAGATACT  698

seq1  CTTTGTGAACTTGTGGTTGTGTTAATAGAAAAATGACATTTGCACTCTCC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTGAACTTGTGGTTGTGTTAATAGAAAAATGACATTTGCACTCTCC  748

seq1  AATGTAAAAGAACAAGTCTGAAGATGGAAGTTTCTACCATCAGTAAGTTG  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTAAAAGAACAAGTCTGAAGATGGAAGTTTCTACCATCAGTAAGTTG  798

seq1  ATGACACAGCATCAGCTGAGTTCTGTTGATCAAGAAGAAATGATAGGGAC  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACACAGCATCAGCTGAGTTCTGTTGATCAAGAAGAAATGATAGGGAC  848

seq1  CAAATTAACCTTAGGTCATTGACATAGTCTCTAACCAAAAGACGAGCTTC  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTAACCTTAGGTCATTGACATAGTCTCTAACCAAAAGACGAGCTTC  898

seq1  CTTACAAAATGACATGCAGTGTGCTTTTAAAACTAATATCAGGTTATAAG  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACAAAATGACATGCAGTGTGCTTTTAAAACTAATATCAGGTTATAAG  948

seq1  AAACATTGAGAAAATAGTGGTTGTAGAGATGACTCAGCTGTTAGGAACAT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATTGAGAAAATAGTGGTTGTAGAGATGACTCAGCTGTTAGGAACAT  998

seq1  GTGCTGTTCTTCCAGACACCCCAGTTAGTTTCCCAGGATTCTAGGACAGT  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGTTCTTCCAGACACCCCAGTTAGTTTCCCAGGATTCTAGGACAGT  1048

seq1  AACACCAGCCTGTAATTCCAGTAATAGAGAATTC  1077
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACCAGCCTGTAATTCCAGTAATAGAGAATTC  1082