BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-137I07
Chromosome18 (Build37)
Map Location 77,539,516 - 77,682,527
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLoxhd1
Upstream geneEG639576, EG664805, LOC620139, Ier3ip1, Hdhd2, Katnal2, Pias2, EG639653, St8sia5
Downstream geneRnf165, 8030462N17Rik, 4930465K10Rik, Ccdc5, Atp5a1, Pstpip2, 5430411K18Rik, Cd33l3, Slc14a1, Slc14a2, EG620155
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-137I07.bB6Ng01-137I07.g
ACCDH937017DH937018
length345989
definitionDH937017|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137I07, 5' end.DH937018|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137I07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(77,682,183 - 77,682,527)(77,539,516 - 77,540,484)
sequence
agaagtgataaaattgggcatccttaagaccttgagctagtacaagtctc
agcagacagggtatcctaagtatttaaattaatttacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacatttaccctttcaacagcacattca
accacctatccatctattcacaatctatccatccatcaatctacccaacc
atgtatccatccatccacctactcactatcccttccatctgtccttcctt
ccttccttccttccttccttccttccttacttccttccttccttccttcc
ttctctttcctccatctaccatcaaacatttatacactcacaaat
gaattctctgtctagctctgcaccccatttttaaattgggttatttgggg
tgttggtgtttaacttcttaagtcctttataattttggatttttgataaa
gaagacaaaggcatacaacagaaaaaagaagacatcttccacaaatggtg
ctggtctaactgaatgtctacatgtctacatgacatgtctgaatgtctga
atgtctacatgaaaatcaatcaatatttatcaccctgcataaaattcatg
tccaagtggatcaaggaactcaacataaaactggatacactaaatctcat
agaagagaaagtgggaaatacccttgagcacattggtgtaggagacaatt
tcctgaacagaacacgaatggcctaggcactaagatcaacaattgataaa
tgggacctcatggaactgtaaagcttctgtaaggcaagggacagtgtcaa
taggacaaaatggcagcctacagaatgggaaaagatcttcactaacccta
catctgacagagggaaggcaggagcttaagcaggtcctgggagattcctc
taagggagatctcatttcaagctttgagacaagcacaggaaaacttgccc
tgtgggtggcagtagagggcagcagtgggcacaggacaagatgtcagatg
gccttttactccaaagctcctctgtcaatgcgcttcctgggcaagtgtct
aacatgttcctaacttttagagagatagtctttgccttagttaaggttac
tattgctgtgaagagacaccatagccacagcaaccctcataaagaaaaaa
catttaattggggctggcttataattcagagggtttagtccattatcagc
cttggtggtacataggcagacatagtgctggagaagagctgggagttcta
tcatcttgatctgaaagcagcagaaagtgactgtgacacacaggctaagg
ctgagctctgagacctcaaagcctgccgccagtgacacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_77682183_77682527
seq2: B6Ng01-137I07.b_58_402 (reverse)

seq1  ATTTGTGAGTGAATAAATGTTTGATGGTAGATGGAGGAAAGGGAAGGAAG  50
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ATTTGTGAGTGTATAAATGTTTGATGGTAGATGGAGGAAAGAGAAGGAAG  50

seq1  GAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGA  100
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAAGGAAGGAAGTAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGA  100

seq1  AGGACAGATGGAAGGGATAGTGAGTAGGTGGATGGATGGATACATGGTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAGATGGAAGGGATAGTGAGTAGGTGGATGGATGGATACATGGTTG  150

seq1  GGTAGATTGATGGATGGATAGATTGTGAATAGATGGATAGGTGGTTGAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGATTGATGGATGGATAGATTGTGAATAGATGGATAGGTGGTTGAAT  200

seq1  GTGCTGTTGAAAGGGTAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGTTGAAAGGGTAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  250

seq1  GTGTGTGTGTAAATTAATTTAAATACTTAGGATACCCTGTCTGCTGAGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTAAATTAATTTAAATACTTAGGATACCCTGTCTGCTGAGAC  300

seq1  TTGTACTAGCTCAAGGTCTTAAGGATGCCCAATTTTATCACTTCT  345
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTACTAGCTCAAGGTCTTAAGGATGCCCAATTTTATCACTTCT  345

seq1: chr18_77539516_77540484
seq2: B6Ng01-137I07.g_86_1056

seq1  TGCACCCCATTTTTAAATTGGGTTATTTGGGGTGTTGGTGTTTAACTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACCCCATTTTTAAATTGGGTTATTTGGGGTGTTGGTGTTTAACTTCT  50

seq1  TAAGTCCTTTATAATTTTGGATTTTTGATAAAGAAGACAAAGGCATACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTCCTTTATAATTTTGGATTTTTGATAAAGAAGACAAAGGCATACAA  100

seq1  CAGAAAAAAGAAGACATCTTCCACAAATGGTGCTGGTCTAACTGAATGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAAAAGAAGACATCTTCCACAAATGGTGCTGGTCTAACTGAATGTC  150

seq1  TACATGTCTACATGACATGTCTGAATGTCTGAATGTCTACATGAAAATCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGTCTACATGACATGTCTGAATGTCTGAATGTCTACATGAAAATCA  200

seq1  ATCAATATTTATCACCCTGCATAAAATTCATGTCCAAGTGGATCAAGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAATATTTATCACCCTGCATAAAATTCATGTCCAAGTGGATCAAGGAA  250

seq1  CTCAACATAAAACTGGATACACTAAATCTCATAGAAGAGAAAGTGGGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACATAAAACTGGATACACTAAATCTCATAGAAGAGAAAGTGGGAAA  300

seq1  TACCCTTGAGCACATTGGTGTAGGAGACAATTTCCTGAACAGAACACGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCTTGAGCACATTGGTGTAGGAGACAATTTCCTGAACAGAACACGAA  350

seq1  TGGCCTAGGCACTAAGATCAACAATTGATAAATGGGACCTCATGGAACTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTAGGCACTAAGATCAACAATTGATAAATGGGACCTCATGGAACTG  400

seq1  TAAAGCTTCTGTAAGGCAAGGGACAGTGTCAATAGGACAAAATGGCAGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGCTTCTGTAAGGCAAGGGACAGTGTCAATAGGACAAAATGGCAGCC  450

seq1  TACAGAATGGGAAAAGATCTTCACTAACCCTACATCTGACAGAGGGAAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAATGGGAAAAGATCTTCACTAACCCTACATCTGACAGAGGGAAGG  500

seq1  CAGGAGCTTAAGCAGGTCCTGGGAGATTCCTCTAAGGGAGATCTCATTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGCTTAAGCAGGTCCTGGGAGATTCCTCTAAGGGAGATCTCATTTC  550

seq1  AAGCTTTGAGACAAGCACAGGAAAACTTGCCCTGTGGGTGGCAGTAGAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTTGAGACAAGCACAGGAAAACTTGCCCTGTGGGTGGCAGTAGAGG  600

seq1  GCAGCAGTGGGCACAGGACAAGATGTCAGATGGCCTTTTACTCCAAAGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAGTGGGCACAGGACAAGATGTCAGATGGCCTTTTACTCCAAAGCT  650

seq1  CCTCTGTCAATGCGCTTCCTGGGCAAGTGTCCAACATGTTCCTAACTTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGTCAATGCGCTTCCTGGGCAAGTGTCTAACATGTTCCTAACTTTT  700

seq1  AGAGAGATAGTCTTTGCCTTAGTTAAGGTTACTATTGCTGTGAAGAGACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGATAGTCTTTGCCTTAGTTAAGGTTACTATTGCTGTGAAGAGACA  750

seq1  CCATAGCCACAGCAACCCTCATAAAG-AAAAACATTTAATTGGGGCTGGC  799
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGCCACAGCAACCCTCATAAAGAAAAAACATTTAATTGGGGCTGGC  800

seq1  TTATAATTCAGA-GGTTTAGTCCATTATCAGCCTTGGTGGTACATAGGCA  848
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAATTCAGAGGGTTTAGTCCATTATCAGCCTTGGTGGTACATAGGCA  850

seq1  GACATAGTGCTGGAGAAGAGCTGGGAGTTCTA-CATCTTGATCTGAAAGC  897
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GACATAGTGCTGGAGAAGAGCTGGGAGTTCTATCATCTTGATCTGAAAGC  900

seq1  AGCAGAAAGTGACTGTGACACACAGGCTAGGCTTGAGCTTCTGAGACCTC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||
seq2  AGCAGAAAGTGACTGTGACACACAGGCTAAGGCTGAGC-TCTGAGACCTC  949

seq1  AAAGCCTGCCGCCAGTGACACC  969
      ||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCTGCCGCCAGTGACACC  971