BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-137L12
Chromosome18 (Build37)
Map Location 75,234,864 - 75,359,436
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDym, LOC628356, EG667777
Upstream gene2810433K01Rik, Cxxc1, EG435570, Mbd1, Ccdc11, LOC628298, LOC668124, LOC668126, Myo5b, Acaa2, LOC672799, Lipg, Rpl17, BC031181
Downstream geneSmad7, Gm672, Zbtb7c, 4833419G08Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-137L12.bB6Ng01-137L12.g
ACCDH937159DH937160
length960893
definitionDH937159|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137L12, 5' end.DH937160|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137L12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,234,864 - 75,235,823)(75,358,543 - 75,359,436)
sequence
gaattcaagggctatagatttcactgtctggcattaaatttttcttttgc
tctgtaccaatacatgtgtttggaaataagtcttttttttttttttttta
acttttcttgcttgcttgcttcttctaaagaagagtgccctgctatagcc
tgaactttctgtgaagaccaagctggcatcaaatttggagtggtattttt
gccttcccctcatgtgtgctgagctacctacaggttcttctgccctgccc
agatggggtatgggcaggcaagcttttcagatgctggactccagcacccc
ctccccccttgttcctttccttcccctgtgtgacaactgcaggtggcagt
agcaggctgagggaagcagtggcaagtggagccctctagtgttacaaccc
caagccagtcttgtgtatagagacccttagccttacaagtgctggtatca
gggccttggcttctggcagaaaccagtattaaagctgtcatgccctgtgc
cctgatgattgatagctttctgggactcctgtgctgagtagggccctcag
gttctcttcacccctctgcactcttgtctctgcacctacttccctgctta
ccctggctgtagggaatttggaattgttcactgcagcctgtgttgacggt
ttgtcttctgttgggatggcattcaaaggggaaccagggcccattaaggg
ctattcagggactgggcatggcctatgcagggacagctcaggtacaggca
cctctgcctcacatcggggacttcagtagatcaggcctgaggtcaccctg
tgtcttaagctttaggcagttgctgcagcctctgcagcttctttagtagc
tggcaagaacctatgcttttgtgtgctgggaagccaggactagggacctg
ggtgtgggtgatgagtgggttatgtgagagaacactgctggcttctgggt
accaggtgcc
gaattcaaacgtgtatcacaaaatgggttctaccattacagtcatactca
tgattggcattaaatatgaccacttcctcttagaaacgccaatgttgtac
tctgattaatggaagaaactattaggaggactttaaaactccatgaattc
aacacattttgtggaataaataactacacagcactaatgcacgattcagt
aatactggctaaggatgaagcgggtgcagatggacccagctcaagccccc
actagcaccttgcaaggcaggcactctttacacagccttggacggctttt
ctgttgagtgtcattggtttgggaggtgtttttgtttgtttggttcaact
actaggattcctgactatcaataaccaccacttgaggttcatcttcttca
gctccttccctgaagatgtctaggggtgcttagacatggacagacttggc
aaagttcagtgactcaaggatctaacagcacagaggacctggtgaccagg
acagggcagctactcacataatctgggagagggacatcgctggagctcag
gggacctctcaaggactgcgtggcttgctccaggaccttgttgtgttttt
tagacagcaaagaaaacaaactgaaaaacataaggaaaagccaattacac
caagaaacccagccctcctcctctaggcctaacaaggactaacagtctca
tagcacagtaatgattctgaaatctctgtgacagcaatgtcaggagcaaa
gcagatttattaaggaggctgttgcaaaagcaaccggctagtcagtgacc
aagcactgcccaaagcatattgataatcctttcatgcctatgtcaacagt
agatcaatagcattaatgtacagagcaaatcgagtaccggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_75234864_75235823
seq2: B6Ng01-137L12.b_51_1010

seq1  GAATTCAAGGGCTATAGATTTCACTGT-TGGCATTAAATTTTTCTTTTGC  49
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGGCTATAGATTTCACTGTCTGGCATTAAATTTTTCTTTTGC  50

seq1  TCTGTACCAATACATGTGTTTGGAAATAAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTACCAATACATGTGTTTGGAAATAAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTA  100

seq1  ACTTTTCTTGCTTGCTTGCTTCTTCTAAAGAAGAGTGCCCTGCTATAGCC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTCTTGCTTGCTTGCTTCTTCTAAAGAAGAGTGCCCTGCTATAGCC  150

seq1  TGAACTTTCTGTGAAGACCAAGCTGGCATCAAATTTGGAGTGGTATTTTT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTTTCTGTGAAGACCAAGCTGGCATCAAATTTGGAGTGGTATTTTT  200

seq1  GCCTTCCCCTCATGTGTGCTGAGCTACCTACAGGTTCTTCTGCCCTGCCC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCCCCTCATGTGTGCTGAGCTACCTACAGGTTCTTCTGCCCTGCCC  250

seq1  AGATGGGGTATGGGCAGGCAAGCTTTTCAGATGCTGGACTCCAGCACCCC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGGGTATGGGCAGGCAAGCTTTTCAGATGCTGGACTCCAGCACCCC  300

seq1  CTCCCCCCTTGTTCCTTTCCTTCCCCTGTGTGACAACTGCAGGTGGCAGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCCCTTGTTCCTTTCCTTCCCCTGTGTGACAACTGCAGGTGGCAGT  350

seq1  AGCAGGCTGAGGGAAGCAGTGGCAAGTGGAGCCCTCTAGTGTTACAACCC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGCTGAGGGAAGCAGTGGCAAGTGGAGCCCTCTAGTGTTACAACCC  400

seq1  CAAGCCAGTCTTGTGTATAGAGACCCTTAGCCTTACAAGTGCTGGTATCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCAGTCTTGTGTATAGAGACCCTTAGCCTTACAAGTGCTGGTATCA  450

seq1  GGGCCTTGGCTTCTGGCAGAAACCAGTATTAAAGCTGTCATGCCCTGTGC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCTTGGCTTCTGGCAGAAACCAGTATTAAAGCTGTCATGCCCTGTGC  500

seq1  CCTGATGATTGATAGCTTTCTGGGACTCCTGTGCTGAGTAGGGCCCTCAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGATGATTGATAGCTTTCTGGGACTCCTGTGCTGAGTAGGGCCCTCAG  550

seq1  GTTCTCTTCACCCCTCTGCACTCTTGTCTCTGCACCTACTTCCCTGCTTA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTCTTCACCCCTCTGCACTCTTGTCTCTGCACCTACTTCCCTGCTTA  600

seq1  CCCTGGCTGTAGGGAATTTGGAATTGTTCACTGCAGCCTGTGTTGACGGT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGCTGTAGGGAATTTGGAATTGTTCACTGCAGCCTGTGTTGACGGT  650

seq1  TTGTCTTCTGTTGGGATGGCATTCAAAGGGGAACCAGGGCCCATTAAGGG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTTCTGTTGGGATGGCATTCAAAGGGGAACCAGGGCCCATTAAGGG  700

seq1  CTATTCAGGGACTGGGCATGGCCTATGCAGGGACAGCTCAGGTACAGGCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCAGGGACTGGGCATGGCCTATGCAGGGACAGCTCAGGTACAGGCA  750

seq1  CCTCTGCCTCACATCGGGGACTTCAGGTAGATCAGGCCTGAGGTCACCCT  799
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGCCTCACATCGGGGACTTCA-GTAGATCAGGCCTGAGGTCACCCT  799

seq1  GTGTCTTAAGCTTTAGGCAGTTGCTGCAGCCTCTGCAGCTTCTTTAGTAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTTAAGCTTTAGGCAGTTGCTGCAGCCTCTGCAGCTTCTTTAGTAG  849

seq1  CTGGCAGGAACCTATGC-TTTGTGTGCTGGGAAGCCAGGACTAGGGACCT  898
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCAAGAACCTATGCTTTTGTGTGCTGGGAAGCCAGGACTAGGGACCT  899

seq1  GGGTGTGGGTGATGAGTGGGTTATGTGAGAGAGCACTGCTGGCTTATGGG  948
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
seq2  GGGTGTGGGTGATGAGTGGGTTATGTGAGAGAACACTGCTGGCTTCTGGG  949

seq1  TAACAAGGTGCC  960
      | || |||||||
seq2  T-ACCAGGTGCC  960

seq1: chr18_75358543_75359436
seq2: B6Ng01-137L12.g_70_962 (reverse)

seq1  CCCCCGGTACTCGATTTTGCTCTGTACATTAATGCTATTGATCTACTGTT  50
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCGGTACTCGA-TTTGCTCTGTACATTAATGCTATTGATCTACTGTT  49

seq1  GACATAGGCATGAAAGGATTATCAATATGCTTTGGGCAGTGCTTGGTCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATAGGCATGAAAGGATTATCAATATGCTTTGGGCAGTGCTTGGTCAC  99

seq1  TGACTAGCCGGTTGCTTTTGCAACAGCCTCCTTAATAAATCTGCTTTGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTAGCCGGTTGCTTTTGCAACAGCCTCCTTAATAAATCTGCTTTGCT  149

seq1  CCTGACATTGCTGTCACAGAGATTTCAGAATCATTACTGTGCTATGAGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGACATTGCTGTCACAGAGATTTCAGAATCATTACTGTGCTATGAGAC  199

seq1  TGTTAGTCCTTGTTAGGCCTAGAGGAGGAGGGCTGGGTTTCTTGGTGTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGTCCTTGTTAGGCCTAGAGGAGGAGGGCTGGGTTTCTTGGTGTAA  249

seq1  TTGGCTTTTCCTTATGTTTTTCAGTTTGTTTTCTTTGCTGTCTAAAAAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTTTTCCTTATGTTTTTCAGTTTGTTTTCTTTGCTGTCTAAAAAAC  299

seq1  ACAACAAGGTCCTGGAGCAAGCCACGCAGTCCTTGAGAGGTCCCCTGAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAAGGTCCTGGAGCAAGCCACGCAGTCCTTGAGAGGTCCCCTGAGC  349

seq1  TCCAGCGATGTCCCTCTCCCAGATTATGTGAGTAGCTGCCCTGTCCTGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCGATGTCCCTCTCCCAGATTATGTGAGTAGCTGCCCTGTCCTGGT  399

seq1  CACCAGGTCCTCTGTGCTGTTAGATCCTTGAGTCACTGAACTTTGCCAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGGTCCTCTGTGCTGTTAGATCCTTGAGTCACTGAACTTTGCCAAG  449

seq1  TCTGTCCATGTCTAAGCACCCCTAGACATCTTCAGGGAAGGAGCTGAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCCATGTCTAAGCACCCCTAGACATCTTCAGGGAAGGAGCTGAAGA  499

seq1  AGATGAACCTCAAGTGGTGGTTATTGATAGTCAGGAATCCTAGTAGTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGAACCTCAAGTGGTGGTTATTGATAGTCAGGAATCCTAGTAGTTGA  549

seq1  ACCAAACAAACAAAAACACCTCCCAAACCAATGACACTCAACAGAAAAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAACAAACAAAAACACCTCCCAAACCAATGACACTCAACAGAAAAGC  599

seq1  CGTCCAAGGCTGTGTAAAGAGTGCCTGCCTTGCAAGGTGCTAGTGGGGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCCAAGGCTGTGTAAAGAGTGCCTGCCTTGCAAGGTGCTAGTGGGGGC  649

seq1  TTGAGCTGGGTCCATCTGCACCCGCTTCATCCTTAGCCAGTATTACTGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGCTGGGTCCATCTGCACCCGCTTCATCCTTAGCCAGTATTACTGAA  699

seq1  TCGTGCATTAGTGCTGTGTAGTTATTTATTCCACAAAATGTGTTGAATTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTGCATTAGTGCTGTGTAGTTATTTATTCCACAAAATGTGTTGAATTC  749

seq1  ATGGAGTTTTAAAGTCCTCCTAATAGTTTCTTCCATTAATCAGAGTACAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGTTTTAAAGTCCTCCTAATAGTTTCTTCCATTAATCAGAGTACAA  799

seq1  CATTGGCGTTTCTAAGAGGAAGTGGTCATATTTAATGCCAATCATGAGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGCGTTTCTAAGAGGAAGTGGTCATATTTAATGCCAATCATGAGTA  849

seq1  TGACTGTAATGGTAGAACCCATTTTGTGATACACGTTTGAATTC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGTAATGGTAGAACCCATTTTGTGATACACGTTTGAATTC  893