BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-144E15
Chromosome18 (Build37)
Map Location 10,128,113 - 10,258,281
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRock1, LOC100039978, LOC635344
Upstream geneFzd8, 9430022F06Rik, Ccny, LOC665176, LOC665184, EG639618, LOC100039755, Cetn1, LOC225155, Colec12, LOC665111, LOC100039787, EG433161, Thoc1, Usp14
Downstream geneLOC435554, AK220484, LOC621832, Esco1, Snrpd1, LOC100039880, Abhd3, Mib1, LOC665296, 1010001N08Rik, Gata6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-144E15.bB6Ng01-144E15.g
ACCDH942007DH942008
length716618
definitionDH942007|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-144E15, 5' end.DH942008|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-144E15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(10,257,587 - 10,258,281)(10,128,113 - 10,128,730)
sequence
gaattctcaacaggctctgatagtggtcatatggtttctgtggatgtata
gctgagttggaagaaaaaaagaaacagaacaattgaccattgacttaagt
aacaaaaagatttcttcccattatgcagcaaggccttcatgcttccccaa
acctgataagtccatggacatttaccctttagagacagatagacaatgga
taccttgatctatgaatgagagtgagttatacagcatcaaaacagaggtg
aggtatacagcattagaacaaaggtgagatatacagcatcagaaacaggt
gagttatacagcatcaggaaccgagtccaaggaaacatacatctgtgttc
tgagacacccagagagtctatgggtgactctctgggccctgtccttaaga
aagttcagaaacttatagagatttgaccagcccagtaaaatacatcaaaa
cacacaacattgattccccagtaaagcaatgtggccagattactccaatg
tgaagatcacatctaacaagttattcttctctttgtaaagcccagtcaac
tctgtttttgagagtgcacaaagtccacttgagcaaacagtctatgacaa
tccccccttagcaacaatgagtctacaacagcagggccaaggtacatata
gataacctaagacatcctgcaggaaattgatataacctagccaccctgtt
tgtcgggggtgggggt
gaattccacagtcctactgttcctatccaggaaagctcatttcccttact
attcataggtgatgggctagcagcagtatccttcttttgataagtaaaaa
ggaaaaataaaaaaccaaccaaacaaaaaaaaccaacaacaaacaaaaac
ttctgaaacttcagtatggaaaaagatgaattcttattcttctaagtctg
ggtcgtctgtagtactattatataccttgatgctaatgtacagcataata
atcttataatcataattatgatgtataatatacatttaatatattttaca
tgtttatataattatatatgtgattatataatacacaatatgattatatt
atgaaatatacaatacagcatatacataatcataataaaaatattataag
ccgggcagtggtggcgcacgcctttaatcccagcacttgggaggcagagg
caggcggatttctgagtttgaggccagcctggtctacaaagtgagttcca
ggacagccaggactatacagagaaaccctgactcgaaaaccccccccaaa
aatttaaaaaaaaaaaatatatatatgtgtgtatatatatgtatatatat
gtatatatatgtatatat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_10257587_10258281
seq2: B6Ng01-144E15.b_67_761 (reverse)

seq1  ACCCCCACCCCCGACAAACAGGGTGGCTAGGTTATATCAATTTCCTGCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCCACCCCCGACAAACAGGGTGGCTAGGTTATATCAATTTCCTGCAG  50

seq1  GATGTCTTAGGTTATCTATATGTACCTTGGCCCTGCTGTTGTAGACTCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCTTAGGTTATCTATATGTACCTTGGCCCTGCTGTTGTAGACTCAT  100

seq1  TGTTGCTAAGGGGGGATTGTCATAGACTGTTTGCTCAAGTGGACTTTGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGCTAAGGGGGGATTGTCATAGACTGTTTGCTCAAGTGGACTTTGTG  150

seq1  CACTCTCAAAAACAGAGTTGACTGGGCTTTACAAAGAGAAGAATAACTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCTCAAAAACAGAGTTGACTGGGCTTTACAAAGAGAAGAATAACTTG  200

seq1  TTAGATGTGATCTTCACATTGGAGTAATCTGGCCACATTGCTTTACTGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATGTGATCTTCACATTGGAGTAATCTGGCCACATTGCTTTACTGGG  250

seq1  GAATCAATGTTGTGTGTTTTGATGTATTTTACTGGGCTGGTCAAATCTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCAATGTTGTGTGTTTTGATGTATTTTACTGGGCTGGTCAAATCTCT  300

seq1  ATAAGTTTCTGAACTTTCTTAAGGACAGGGCCCAGAGAGTCACCCATAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGTTTCTGAACTTTCTTAAGGACAGGGCCCAGAGAGTCACCCATAGA  350

seq1  CTCTCTGGGTGTCTCAGAACACAGATGTATGTTTCCTTGGACTCGGTTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTGGGTGTCTCAGAACACAGATGTATGTTTCCTTGGACTCGGTTCC  400

seq1  TGATGCTGTATAACTCACCTGTTTCTGATGCTGTATATCTCACCTTTGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGCTGTATAACTCACCTGTTTCTGATGCTGTATATCTCACCTTTGTT  450

seq1  CTAATGCTGTATACCTCACCTCTGTTTTGATGCTGTATAACTCACTCTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGCTGTATACCTCACCTCTGTTTTGATGCTGTATAACTCACTCTCA  500

seq1  TTCATAGATCAAGGTATCCATTGTCTATCTGTCTCTAAAGGGTAAATGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATAGATCAAGGTATCCATTGTCTATCTGTCTCTAAAGGGTAAATGTC  550

seq1  CATGGACTTATCAGGTTTGGGGAAGCATGAAGGCCTTGCTGCATAATGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGACTTATCAGGTTTGGGGAAGCATGAAGGCCTTGCTGCATAATGGG  600

seq1  AAGAAATCTTTTTGTTACTTAAGTCAATGGTCAATTGTTCTGTTTCTTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAATCTTTTTGTTACTTAAGTCAATGGTCAATTGTTCTGTTTCTTTT  650

seq1  TTTCTTCCAACTCAGCTATACATCCACAGAAACCATATGACCACT  695
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCCAACTCAGCTATACATCCACAGAAACCATATGACCACT  695

seq1: chr18_10128113_10128730
seq2: B6Ng01-144E15.g_67_684

seq1  GAATTCCACAGTCCTACTGTTCCTATCCAGGAAAGCTCATTTCCCTTACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACAGTCCTACTGTTCCTATCCAGGAAAGCTCATTTCCCTTACT  50

seq1  ATTCATAGGTGATGGGCTAGCAGCAGTATCCTTCTTTTGATAAGTAAAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATAGGTGATGGGCTAGCAGCAGTATCCTTCTTTTGATAAGTAAAAA  100

seq1  GGAAAAATAAAAAACCAACCAAACAAAAAAAACCAACAACAAACAAAAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAATAAAAAACCAACCAAACAAAAAAAACCAACAACAAACAAAAAC  150

seq1  TTCTGAAACTTCAGTATGGAAAAAGATGAATTCTTATTCTTCTAAGTCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAAACTTCAGTATGGAAAAAGATGAATTCTTATTCTTCTAAGTCTG  200

seq1  GGTCGTCTGTAGTACTATTATATACCTTGATGCTAATGTACAGCATAATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCGTCTGTAGTACTATTATATACCTTGATGCTAATGTACAGCATAATA  250

seq1  ATCTTATAATCATAATTATGATGTATAATATACATTTAATATATTTTACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTATAATCATAATTATGATGTATAATATACATTTAATATATTTTACA  300

seq1  TGTTTATATAATTATATATGTGATTATATAATACACAATATGATTATATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTATATAATTATATATGTGATTATATAATACACAATATGATTATATT  350

seq1  ATGAAATATACAATACAGCATATACATAATCATAATAAAAATATTATAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAATATACAATACAGCATATACATAATCATAATAAAAATATTATAAG  400

seq1  CCGGGCAGTGGTGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGGCAGTGGTGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGG  450

seq1  CAGGCGGATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCGGATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCA  500

seq1  GGACAGCCAGGACTATACAGAGAAACCCTGACTCGAAAACCCCCCCCAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGCCAGGACTATACAGAGAAACCCTGACTCGAAAACCCCCCCCAAA  550

seq1  AATTTAAAAAAAAAAAATATATATATGTGTGTATATATATGTATATATAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAAAAAAAAAAAATATATATATGTGTGTATATATATGTATATATAT  600

seq1  GTATATATATGTATATAT  618
      ||||||||||||||||||
seq2  GTATATATATGTATATAT  618