BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-145H14
Chromosome18 (Build37)
Map Location 58,929,628 - 59,050,142
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdamts19
Upstream geneSlc12a2, 9330166H04Rik, Fbn2, Slc27a6, Isoc1
Downstream geneA730017C20Rik, 4833446K15Rik, LOC667549
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-145H14.bB6Ng01-145H14.g
ACCDH942867DH942868
length1,1411,128
definitionDH942867|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-145H14, 5' end.DH942868|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-145H14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(59,048,987 - 59,050,142)(58,929,628 - 58,930,772)
sequence
gaattcacttcctacttcacacagagttaaattgtctcaggattagttac
ctgaaatgacaccacagtgatggcggtgaacagctgagttctctgttact
ttttcctctgtggacctcttctgcctgtataaacggtgcgggtgacctat
gatggccattgtatcattgaatggctcaatgaataggaagtcctcattga
gctgtataaagcccatctggaacacataacacacacacacagacaaaaaa
agagagagagatgtaagaaataccattgagaaattgcttttcagattcca
cacccacactctgttttctttaacgaatgtgcacacgaactctttgcaaa
gctatttttgcagccccactaggaagccagccaccttctcatagtatgac
ttcatcttgatgcacttactgcactaagcataaactccatttagttagcc
tgagcctgtgtgggtgggaggcagaacgccagtaacagatgcacagtaaa
aaatctggaatgctaaagactgactttgagagacccatggggtcactaac
atgaacaacgtgttcagcgacagcaaggcagtttttaattgcaggcacca
cacaggccaacttcttgacaacctcaacttagtgaagcaatccgtgtaaa
atattgaggccaatgacgaggcacagcattgaaattaacatagaaaatgt
tttaaactctgcacaaaacactttagaaacttttcagaatgaatcagaac
tttagcacgataccttcaagcacaaatttcatgtcatagagttttgactt
atctcattgggcctgtaaacgtaaacactgtaaaatatagttgggatcaa
tacaaatgatcagtttgtattttttgttttatgttgaggctaagcctcag
cacttgtgtgtttgttcccttcttgaaatataaactgcagaagcccataa
acaaccaccaaaccagactctatacgatgccaacaagagcttgctgatag
agcctgacatagctgtttctgaaagctctgccagtgctgacaaatacgag
tgggcagagcatggtttccaatgaggagctaagagaaagaacttaggagc
tgaagggtttgcagcctcaaaagagaacaacaaatgaacta
gaattcatttcgaacactgttgtaatcaacacccatgaatacttcaataa
tatggtacaactcagaggtagacccatagataagggcagttgtgtatgca
taatgctctgctttaaaaaaatatataattatattctatatattctagat
acaattatatataaatttatatataataataacatttcttccctccatgc
ccttcctccataccctctcatatacctctccttgatctctttcaaattca
tgccctcttttgtggtaataattattatatgcatatatatatatatatat
atatatatttcgtagtgtaatgaaaatctttttcttcttaaatgagaaaa
tcaaattattgaagacaatgtgttgatttaaagaggtatatatggtgctt
tgaagttcataattatgactgtaataactacatcctgttatttttctcct
cagtgtaaaaacaattttatattgcaatatttcatatgcactgtgggaca
tttaaaaccacatccacaatctattccacattcctttcaaatgatgctcc
ctaattcctgcacttcaacatgggctacaacttggggacctgccttttga
caaatagaggatactgagtttaaggatttggttaaagaaaggggtgtttt
tcattgttccctccacatcctcactcactacaggacagtctgccatactg
ttaactatgctatgagaagacttacccgaaaggaactgaagcttcagtcc
ggctgtgaggagctgaagcctgccaataacccggtcagtgagctcagaca
tgaagctcttagcttccaacaaatattgtgatgttatggccatgacagta
gccaattaagatcttgaccaagaaccacttggcttaacttctacctcaaa
cctggctttatcagaaactacaggaagcatgtgctgtctccagcttctaa
actcaggttggttttgccacgtgcagtaataataaacccactatcatggt
ggactgaccaaagcagctttacaccttctagacttgaggatagatctaat
gtttttcattctacaccctcacccctttcatgaaccgggggaaaaagatt
aatgtccgaaaccaactggactaccagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_59048987_59050142
seq2: B6Ng01-145H14.b_49_1189 (reverse)

seq1  TAGTTCATATTGTTGTTCCTCTTTTGGGGCTGCAAACCCCTTCAGCTCCT  50
      |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| 
seq2  TAGTTCAT-TTGTTGTT-CTCTTTTGAGGCTGCAAA-CCCTTCAGCTCC-  46

seq1  TAGGTCCTTTCTC-TAGCTCCTTCATTGGGAACCCTGTGCTCTGCCCACT  99
      || || ||||||| ||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||
seq2  TAAGTTCTTTCTCTTAGCTCC-TCATTGGAAACC--ATGCTCTGCCCACT  93

seq1  TCTGTATTTGTCAGGCACTGGCAGAGCCTTTCAGGAGACAGCTATGTCAG  149
         |||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||
seq2  --CGTATTTGTCA-GCACTGGCAGAG-CTTTCA-GAAACAGCTATGTCAG  138

seq1  GCTCCTATCAGCAAGCTCTTGTTGGCATCCGTAATAGAGTCTGGGTTTGG  199
      ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||
seq2  GCT-CTATCAGCAAGCTCTTGTTGGCAT-CGT-ATAGAGTCT-GGTTTGG  184

seq1  TGGTTGTTTATGGGCTTCTGCAGTTTATATTTCAAGAAGGGAACAAACAC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGTTTATGGGCTTCTGCAGTTTATATTTCAAGAAGGGAACAAACAC  234

seq1  AACAAGTGCTGAGGCTTAGCCTCAACATAAAAC-AAAAATACAAACTGAT  298
       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  -ACAAGTGCTGAGGCTTAGCCTCAACATAAAACAAAAAATACAAACTGAT  283

seq1  CATTTGTATTGATCCCAACTATATTTTACAGTGTTTACGTTTACAGGCCC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGTATTGATCCCAACTATATTTTACAGTGTTTACGTTTACAGGCCC  333

seq1  AATGAGATAAGTCAAAACTCTATGACATGAAATTTGTGCTTGAAGGTATC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGATAAGTCAAAACTCTATGACATGAAATTTGTGCTTGAAGGTATC  383

seq1  GTGCTAAAGTTCTGATTCATTCTGAAAAGTTTCTAAAGTGTTTTGTGCAG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTAAAGTTCTGATTCATTCTGAAAAGTTTCTAAAGTGTTTTGTGCAG  433

seq1  AGTTTAAAACATTTTCTATGTTAATTTCAATGCTGTGCCTCGTCATTGGC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTAAAACATTTTCTATGTTAATTTCAATGCTGTGCCTCGTCATTGGC  483

seq1  CTCAATATTTTACACGGATTGCTTCACTAAGTTGAGGTTGTCAAGAAGTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATATTTTACACGGATTGCTTCACTAAGTTGAGGTTGTCAAGAAGTT  533

seq1  GGCCTGTGTGGTGCCTGCAATTAAAAACTGCCTTGCTGTCGCTGAACACG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTGTGTGGTGCCTGCAATTAAAAACTGCCTTGCTGTCGCTGAACACG  583

seq1  TTGTTCATGTTAGTGACCCCATGGGTCTCTCAAAGTCAGTCTTTAGCATT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCATGTTAGTGACCCCATGGGTCTCTCAAAGTCAGTCTTTAGCATT  633

seq1  CCAGATTTTTTACTGTGCATCTGTTACTGGCGTTCTGCCTCCCACCCACA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATTTTTTACTGTGCATCTGTTACTGGCGTTCTGCCTCCCACCCACA  683

seq1  CAGGCTCAGGCTAACTAAATGGAGTTTATGCTTAGTGCAGTAAGTGCATC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTCAGGCTAACTAAATGGAGTTTATGCTTAGTGCAGTAAGTGCATC  733

seq1  AAGATGAAGTCATACTATGAGAAGGTGGCTGGCTTCCTAGTGGGGCTGCA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGAAGTCATACTATGAGAAGGTGGCTGGCTTCCTAGTGGGGCTGCA  783

seq1  AAAATAGCTTTGCAAAGAGTTCGTGTGCACATTCGTTAAAGAAAACAGAG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAGCTTTGCAAAGAGTTCGTGTGCACATTCGTTAAAGAAAACAGAG  833

seq1  TGTGGGTGTGGAATCTGAAAAGCAATTTCTCAATGGTATTTCTTACATCT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGTGTGGAATCTGAAAAGCAATTTCTCAATGGTATTTCTTACATCT  883

seq1  CTCTCTCTTTTTTTGTCTGTGTGTGTGTGTTATGTGTTCCAGATGGGCTT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTTTTTTTGTCTGTGTGTGTGTGTTATGTGTTCCAGATGGGCTT  933

seq1  TATACAGCTCAATGAGGACTTCCTATTCATTGAGCCATTCAATGATACAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACAGCTCAATGAGGACTTCCTATTCATTGAGCCATTCAATGATACAA  983

seq1  TGGCCATCATAGGTCACCCGCACCGTTTATACAGGCAGAAGAGGTCCACA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCATCATAGGTCACCCGCACCGTTTATACAGGCAGAAGAGGTCCACA  1033

seq1  GAGGAAAAAGTAACAGAGAACTCAGCTGTTCACCGCCATCACTGTGGTGT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAAAAGTAACAGAGAACTCAGCTGTTCACCGCCATCACTGTGGTGT  1083

seq1  CATTTCAGGTAACTAATCCTGAGACAATTTAACTCTGTGTGAAGTAGGAA  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCAGGTAACTAATCCTGAGACAATTTAACTCTGTGTGAAGTAGGAA  1133

seq1  GTGAATTC  1156
      ||||||||
seq2  GTGAATTC  1141

seq1: chr18_58929628_58930772
seq2: B6Ng01-145H14.g_68_1195

seq1  GAATTCATTTCGAACACTGTTGTAATCAACACCCATGAATACTTCAATAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTCGAACACTGTTGTAATCAACACCCATGAATACTTCAATAA  50

seq1  TATGGTACAACTCAGAGGTAGACCCATAGATAAGGGCAGTTGTGTATGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGTACAACTCAGAGGTAGACCCATAGATAAGGGCAGTTGTGTATGCA  100

seq1  TAATGCTCTGCTTTAAAAAAATATATAATTATATTCTATATATTCTAGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGCTCTGCTTTAAAAAAATATATAATTATATTCTATATATTCTAGAT  150

seq1  ACAATTATATATAAATTTATATATAATAATAACATTTCTTCCCTCCATGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTATATATAAATTTATATATAATAATAACATTTCTTCCCTCCATGC  200

seq1  CCTTCCTCCATACCCTCTCATATACCTCTCCTTGATCTCTTTCAAATTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCTCCATACCCTCTCATATACCTCTCCTTGATCTCTTTCAAATTCA  250

seq1  TGCCCTCTTTTGTGGTAATAATTATTATATGCATATATATATATATATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTCTTTTGTGGTAATAATTATTATATGCATATATATATATATATAT  300

seq1  ATATATATTTCGTAGTGTAATGAAAATCTTTTTCTTCTTAAATGAGAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATTTCGTAGTGTAATGAAAATCTTTTTCTTCTTAAATGAGAAAA  350

seq1  TCAAATTATTGAAGACAATGTGTTGATTTAAAGAGGTATATATGGTGCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATTATTGAAGACAATGTGTTGATTTAAAGAGGTATATATGGTGCTT  400

seq1  TGAAGTTCATAATTATGACTGTAATAACTACATCCTGTTATTTTTCTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTTCATAATTATGACTGTAATAACTACATCCTGTTATTTTTCTCCT  450

seq1  CAGTGTAAAAACAATTTTATATTGCAATATTTCATATGCACTGTGGGACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTAAAAACAATTTTATATTGCAATATTTCATATGCACTGTGGGACA  500

seq1  TTTAAAACCACATCCACAATCTATTCCACATTCCTTTCAAATGATGCTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAACCACATCCACAATCTATTCCACATTCCTTTCAAATGATGCTCC  550

seq1  CTAATTCCTGCACTTCAACATGGGCTACAACTTGGGGACCTGCCTTTTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATTCCTGCACTTCAACATGGGCTACAACTTGGGGACCTGCCTTTTGA  600

seq1  CAAATAGAGGATACTGAGTTTAAGGATTTGGTTAAAGAAAGGGGTGTTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAGAGGATACTGAGTTTAAGGATTTGGTTAAAGAAAGGGGTGTTTT  650

seq1  TCATTGTTCCCTCCACATCCTCACTCACTACAGGACAGTCTGCCATACTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGTTCCCTCCACATCCTCACTCACTACAGGACAGTCTGCCATACTG  700

seq1  TTAACTATGCTATGAGAAGACTTACCCGAAAGGAACTGAAGCTTCAGTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTATGCTATGAGAAGACTTACCCGAAAGGAACTGAAGCTTCAGTCC  750

seq1  GGCTGTGAGGAGCTGAAGCCTGCCAATAACCCGGTCAGTGAGCTCAGACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTGAGGAGCTGAAGCCTGCCAATAACCCGGTCAGTGAGCTCAGACA  800

seq1  TGAAGCTCTTAGCTTCCAACAAATATTGTGATGTTATGGCCATGACAGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCTCTTAGCTTCCAACAAATATTGTGATGTTATGGCCATGACAGTA  850

seq1  GCCAAATAAAGATCCTGACCAAGAACCACTTGGCTTAAC-TCTACCTCAA  899
      ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GCC-AATTAAGATCTTGACCAAGAACCACTTGGCTTAACTTCTACCTCAA  899

seq1  ACCTGGC-TTATCAGAAACTACAGGAAGCATGTGCTGTCT-CAGCTTCTA  947
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  ACCTGGCTTTATCAGAAACTACAGGAAGCATGTGCTGTCTCCAGCTTCTA  949

seq1  AACTCAGGGTGGTTTTGTCACGGTGCAGTAGATAAATAACACACATTCAT  997
      |||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||  ||| |||  ||||
seq2  AACTCAGGTTGGTTTTGCCAC-GTGCAGTA-ATAATAAACCCACTATCAT  997

seq1  GGT-GACTGGCCCAAAGCAGCTTTACACC-TCTAGACATGAGAAATAGAT  1045
      ||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||
seq2  GGTGGACT-GACCAAAGCAGCTTTACACCTTCTAGACTTGAG-GATAGAT  1045

seq1  CTTAATGTTTTTCATCTCTACAACCCTCAACCCCCTCCATGACCCCAGGG  1095
      | ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||| ||  |||
seq2  C-TAATGTTTTTCAT-TCTAC-ACCCTC-ACCCCTTTCATGAACC--GGG  1089

seq1  GGAAAAAAAAAGATTAAAAAGTGCCAGAAAACCAACCTTGACATACCAGC  1145
      ||    |||||||||||    || | | ||||||| || ||| |||||||
seq2  GG----AAAAAGATTAA----TGTCCG-AAACCAA-CTGGAC-TACCAGC  1128