BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-148K16
Chromosome18 (Build37)
Map Location 75,650,381 - 75,798,557
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm672
Upstream geneMyo5b, Acaa2, LOC672799, Lipg, Rpl17, BC031181, Dym, LOC628356, EG667777, Smad7
Downstream geneZbtb7c, 4833419G08Rik, LOC668184, Smad2, LOC668188
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-148K16.bB6Ng01-148K16.g
ACCDH945209DH945210
length8751,076
definitionDH945209|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148K16, 5' end.DH945210|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148K16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,797,686 - 75,798,557)(75,650,381 - 75,651,453)
sequence
gaattccataagtggaagagggtctaggtttggaaagtagggattgaaag
agtgcgggcagcaggcaatcaccctaccatcaccctttccccctgtaccc
ccttcactttccctcccccactgctgctaccaccatcttcctactgctgt
gtgaagaattaccacccccctttgggtcttgccacagcaccttctgttat
cccacagttctgtaagtcaggagcctgccacccagcaggtacacacacac
acacacacacacacacacacacacacacacacacacggtctcagtgcttc
agtactacagctgaacactccactgattcttggttattagcaaccaagca
ctcactggtgatccagaatccagaagagtgctcgagaatgtcgatgtcga
caccagttctcccattgagtgctcagggcctcacctctcttaccctgagc
atcttcagatggcctgtgaagtgtccgcggcatctgctcttcagacctgc
tttgttattgtgcaaagggggagtctggagaaagtgcatgtagttgtgct
gattgttcaagttgcatagcacttttcttgggggtcacgggtccctgggt
ggtgaaagagacataagacaagttttaacatacatcctttaccatcaagc
ctggagtccctctgtccgtgcaaggacggggtggggagcctggaagggag
aagggttctggctttttcagataatggatgaagtgtgactatcagggaca
aggggtggcagagggcagtggtgggtttgcgctcctatagactgggggag
acaattttgttggaagtctctagagctcatcccaggtacagctgggttct
gtctgtcaggttgaacttgaaagtg
gaattctccattgtcaaagaggaaggtacctgtcctcaagggcagaacct
gattgggggatccagaagacagcagttttgttacaactttccaagtcaac
ccatgtctcaaaagccacaagttatcaagacccctggacacttggagaaa
tcaagttgggtagaaggttagacattcagcagagtcgaggggactctgag
ggggccttggtaccagagaatgtcagtcatgtgtcccggtgaacttccca
tgaagaagcatgtcatggtctcttctgcaaaaactaactttgccacgggg
gaccaaaatagtgggccagaatgggcttccagaccatggctcactcttaa
agtgacagtaacatccactgatgcagggagtgaagggaagactaaccact
taggatttccacgtggttaccaatgccctcccagaaccagagccagctca
tctggaggacaggtagtgctacaagcatcatctgtccactcatctacacc
ctgccccacctgccttgggtctctccttctgtggacactggtgggtctgt
ctggtgctcctctgtcagatgctggttctaatgcagtatgtacaaggagc
ccagggggaatgaacgtcctaagctgtgccccgaggtctgctgaacaatc
ggggaaaacctacagcgttttgacatacttgggtctgacaggcatctcca
gaaagcatctgtttcaatcctacctgctttcaatcagcttaggtgctctg
tgaggctgccctagttttaaatctattctgggacgagcatccctaaactt
ccctccgcatccctaacgtccctatatgcaccatgtcaagaggttgacta
cagagaggcccatcagcctgcttatccagagccgcctgtcaaagcacatc
ttctccttggtctcacagtccctcctctaccctggggaggcaccggaggc
ctggcttgtcaaatgcaggcttgggcgagggtcctaacttttcaatcgtg
tctcttagctcaagcttttgtcctttcatcttgactgggctagaacctac
actggtcttgtcgggggggactcagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_75797686_75798557
seq2: B6Ng01-148K16.b_46_920 (reverse)

seq1  CACTCTCAAGTTCAACCTGACAGACAGAA-CCAGCTGTACCTGGGATGAG  49
      |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTCAAGTTCAACCTGACAGACAGAACCCAGCTGTACCTGGGATGAG  50

seq1  CTCTAGAGACTTCCAACAAAATTGTCT-CCCCAGTCTATAGGAGCGCAAA  98
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGAGACTTCCAACAAAATTGTCTCCCCCAGTCTATAGGAGCGCAAA  100

seq1  CCCACCACTGCCCTCTGCCACCCCTTGTCCCTGATAGTCACACTTCATCC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCACTGCCCTCTGCCACCCCTTGTCCCTGATAGTCACACTTCATCC  150

seq1  ATTATCTG-AAAAGCCAGAACCCTTCTCCCTTCCAGGCTCCCCACCCCGT  197
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCTGAAAAAGCCAGAACCCTTCTCCCTTCCAGGCTCCCCACCCCGT  200

seq1  CCTTGCACGGACAGAGGGACTCCAGGCTTGATGGTAAAGGATGTATGTTA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGCACGGACAGAGGGACTCCAGGCTTGATGGTAAAGGATGTATGTTA  250

seq1  AAACTTGTCTTATGTCTCTTTCACCACCCAGGGACCCGTGACCCCCAAGA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTGTCTTATGTCTCTTTCACCACCCAGGGACCCGTGACCCCCAAGA  300

seq1  AAAGTGCTATGCAACTTGAACAATCAGCACAACTACATGCACTTTCTCCA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGCTATGCAACTTGAACAATCAGCACAACTACATGCACTTTCTCCA  350

seq1  GACTCCCCCTTTGCACAATAACAAAGCAGGTCTGAAGAGCAGATGCCGCG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCCCCCTTTGCACAATAACAAAGCAGGTCTGAAGAGCAGATGCCGCG  400

seq1  GACACTTCACAGGCCATCTGAAGATGCTCAGGGTAAGAGAGGTGAGGCCC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACTTCACAGGCCATCTGAAGATGCTCAGGGTAAGAGAGGTGAGGCCC  450

seq1  TGAGCACTCAATGGGAGAACTGGTGTCGACATCGACATTCTCGAGCACTC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCACTCAATGGGAGAACTGGTGTCGACATCGACATTCTCGAGCACTC  500

seq1  TTCTGGATTCTGGATCACCAGTGAGTGCTTGGTTGCTAATAACCAAGAAT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGATTCTGGATCACCAGTGAGTGCTTGGTTGCTAATAACCAAGAAT  550

seq1  CAGTGGAGTGTTCAGCTGTAGTACTGAAGCACTGAGACCGTGTGTGTGTG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGAGTGTTCAGCTGTAGTACTGAAGCACTGAGACCGTGTGTGTGTG  600

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCTGCTGGGTGGCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCTGCTGGGTGGCA  650

seq1  GGCTCCTGACTTACAGAACTGTGGGATAACAGAAGGTGCTGTGGCAAGAC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCCTGACTTACAGAACTGTGGGATAACAGAAGGTGCTGTGGCAAGAC  700

seq1  CCAAAGGGGGGTGGTAATTCTTCACACAGCAGTAGGAAGATGGTGGTAGC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGGGGGGTGGTAATTCTTCACACAGCAGTAGGAAGATGGTGGTAGC  750

seq1  AGCAGTGGGGGAGGGAAAGTGAAGGGGGTACAGGGGGAAAGGGTGATGGT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTGGGGGAGGGAAAGTGAAGGGGGTACAGGGGGAAAGGGTGATGGT  800

seq1  AGGGTGATTGCCTGCTGCCCGCACTCTTTCAATCCCTACTTTCCAAACCT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGATTGCCTGCTGCCCGCACTCTTTCAATCCCTACTTTCCAAACCT  850

seq1  AGACCCTCTTCCACTTATGGAATTC  872
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCTCTTCCACTTATGGAATTC  875

seq1: chr18_75650381_75651453
seq2: B6Ng01-148K16.g_70_1145

seq1  GAATTCTCCATTGTCAAAGAGGAAGGTACCTGTCCTCAAGGGCAGAACCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCATTGTCAAAGAGGAAGGTACCTGTCCTCAAGGGCAGAACCT  50

seq1  GATTGGGGGATCCAGAAGACAGCAGTTTTGTTACAACTTTCCAAGTCAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGGGGGATCCAGAAGACAGCAGTTTTGTTACAACTTTCCAAGTCAAC  100

seq1  CCATGTCTCAAAAGCCACAAGTTATCAAGACCCCTGGACACTTGGAGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTCTCAAAAGCCACAAGTTATCAAGACCCCTGGACACTTGGAGAAA  150

seq1  TCAAGTTGGGTAGAAGGTTAGACATTCAGCAGAGTCGAGGGGACTCTGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTTGGGTAGAAGGTTAGACATTCAGCAGAGTCGAGGGGACTCTGAG  200

seq1  GGGGCCTTGGTACCAGAGAATGTCAGTCATGTGTCCCGGTGAACTTCCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCCTTGGTACCAGAGAATGTCAGTCATGTGTCCCGGTGAACTTCCCA  250

seq1  TGAAGAAGCATGTCATGGTCTCTTCTGCAAAAACTAACTTTGCCACGGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAAGCATGTCATGGTCTCTTCTGCAAAAACTAACTTTGCCACGGGG  300

seq1  GACCAAAATAGTGGGCCAGAATGGGCTTCCAGACCATGGCTCACTCTTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAAAATAGTGGGCCAGAATGGGCTTCCAGACCATGGCTCACTCTTAA  350

seq1  AGTGACAGTAACATCCACTGATGCAGGGAGTGAAGGGAAGACTAACCACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGACAGTAACATCCACTGATGCAGGGAGTGAAGGGAAGACTAACCACT  400

seq1  TAGGATTTCCACGTGGTTACCAATGCCCTCCCAGAACCAGAGCCAGCTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGATTTCCACGTGGTTACCAATGCCCTCCCAGAACCAGAGCCAGCTCA  450

seq1  TCTGGAGGACAGGTAGTGCTACAAGCATCATCTGTCCACTCATCTACACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAGGACAGGTAGTGCTACAAGCATCATCTGTCCACTCATCTACACC  500

seq1  CTGCCCCACCTGCCTTGGGTCTCTCCTTCTGTGGACACTGGTGGGTCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCCACCTGCCTTGGGTCTCTCCTTCTGTGGACACTGGTGGGTCTGT  550

seq1  CTGGTGCTCCTCTGTCAGATGCTGGTTCTAATGCAGTATGTACAAGGAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGCTCCTCTGTCAGATGCTGGTTCTAATGCAGTATGTACAAGGAGC  600

seq1  CCAGGGGGAATGAACGTCCTAAGCTGTGCCCCGAGGTCTGCTGAACAATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGGGAATGAACGTCCTAAGCTGTGCCCCGAGGTCTGCTGAACAATC  650

seq1  GGGGAAAACCTACAGCGTTTTGACATACTTGGGTCTGACAGGCATCTCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAAACCTACAGCGTTTTGACATACTTGGGTCTGACAGGCATCTCCA  700

seq1  GAAAGCATCTGTTTCAATCCTACCTGCTTTCAATCAGCTTAGGTGCTCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGCATCTGTTTCAATCCTACCTGCTTTCAATCAGCTTAGGTGCTCTG  750

seq1  TGAGGCTGCCCTAGTTTTAAATCTATTCTGGGACGAGCATCCCTAAACTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCTGCCCTAGTTTTAAATCTATTCTGGGACGAGCATCCCTAAACTT  800

seq1  CCCTCCGCATCCCTAACGTCCCTATATGCACCATGTCAAGAGGTTGACTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCGCATCCCTAACGTCCCTATATGCACCATGTCAAGAGGTTGACTA  850

seq1  CAGAGAGGCCCATCAGCCTGCTTATCCAGAGCCGCCTGTCAAAGCACATC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGGCCCATCAGCCTGCTTATCCAGAGCCGCCTGTCAAAGCACATC  900

seq1  TTCTCC-TGGCCTCACAGTCCCTCCTCTACCCTGGGGAGGCACCGGAGGC  949
      |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCTTGGTCTCACAGTCCCTCCTCTACCCTGGGGAGGCACCGGAGGC  950

seq1  CTGGCTTGTCAGATGCAGGCTTGGGCGAGGGTCCTAACTTTTCATTCGTG  999
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CTGGCTTGTCAAATGCAGGCTTGGGCGAGGGTCCTAACTTTTCAATCGTG  1000

seq1  TCTCTTAGCTC-AGCTTTTGTCCTTCCATCTTGACTGTGCTAG-ACCTAC  1047
      ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||
seq2  TCTCTTAGCTCAAGCTTTTGTCCTTTCATCTTGACTGGGCTAGAACCTAC  1050

seq1  ACTGTCCTTGTCTGGGGTGACTCAGC  1073
      ||||  |||||| |||| ||||||||
seq2  ACTGGTCTTGTCGGGGGGGACTCAGC  1076