BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-149L05
Chromosome18 (Build37)
Map Location 75,106,263 - 75,222,957
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLipg, Rpl17, BC031181, Dym
Upstream geneMapk4, 2810433K01Rik, Cxxc1, EG435570, Mbd1, Ccdc11, LOC628298, LOC668124, LOC668126, Myo5b, Acaa2, LOC672799
Downstream geneLOC628356, EG667777, Smad7, Gm672, Zbtb7c, 4833419G08Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-149L05.bB6Ng01-149L05.g
ACCDH945967DH945968
length1,112995
definitionDH945967|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-149L05, 5' end.DH945968|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-149L05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,221,868 - 75,222,957)(75,106,263 - 75,107,260)
sequence
gaattcacccaacactgcctgccccacaccccccatcaaacacacacaca
cacacacacccctcttcagcacagtcaattctcattttcattacagaatg
gagagcaagcccggctcaggcagaacttacaagagtggagtatcagtgat
taactgtaccaagctgcagagcaactcttccagaaggtcttcagagtcag
aacctagtaagacacacaaaggtttgttttgacaaggtagacaatgagga
aattacttagatgttaagttttcatttctaataagaaaaatttattagta
catatattccaacactattttaacctctgaataaaatctagatcctgagc
aagccagcacccagcacagccttaacaacaacttgacacagttttccttt
tgtatcggtgtacgcgccacagcacacgggtgagaggcaggaggtaactc
cgtggagtggttttctccttctacttttacgtgcgtttcagagttagaaa
aacgcatgatttgcttaactacctcactggctctatttttgctttcaaga
ttgggtctcactgtgtagtcctcaactggcaagcctcccccaaattctaa
gattacaagtatgtacttgtaatcttagagcaagaaagcgggccctggcc
ctcacctgctgcaacactcgggagagcagccccagcacctcgcctgggca
gaagggtggagctggccctggtgcaagggttgacagtgaaccaggccaag
ggtgtgagagcacgagagctgaagggcagagcagctcagatcctctcagg
cccagatccagggctttgaattggtccaccccaacatctaccccatcaat
gaactgctagagaggatgaaggggttggtcctacagagcaaaactacaag
atttccatgacacagggcaacaacaggaacatccaagaggagtcccagtg
aagattccagtattgatagagtagcagaagccagaggcctggaacctgat
cagtggggtcattgcagtgaacatggtgcaagcaaagaagtgtggaaaga
agggaacactgtttccagaaccactgtagcttcagaccactctgttacct
ttttttctgggg
gaattcaaccaatcactacagacttctacgaacccctcccacagatgatc
actacagaagacccagggatgacatatagtcccttaaagcctctggtgtc
aggcgttgcctgagataacacagccgtctctgggcagctgatccagcagt
ttctcacacagctgactcatctcgggagcttttctccctgaagccctctg
agtcaaggacttggagaacacacagtagaggagaggaaagagaagacacg
gatgccagctagaaccaccctattcttcccccgggcaagctggcttgtct
ctcctgtgcttcttccaatgccttcctttgcactctcaatcttgggccaa
cttgttctttgtcctgaatcggagttgcctagaacgctcacacttacatt
tccaagggcaggttctgggagtctgcgttgctaccatacagggtaatgta
gagggtgggctgggtgtccccactgttattgtaagagaacatgtgaactt
tcagctggtaatggtaaactgcagagacaataacagagacctctgtgagc
cttgcttgcatctcgagagtcatacagcacactgaattttagagacaaac
atccttctggcccaggctagtctcagcctggctctggtcttgctctgcct
gaaagcataaaaaaatcactgaagagggaccctgaccttggcagtcagat
gttcggacacttggagctatttattttctactgcatgacactggattagg
gactgaggtacaaacctctctgagtctcaggtcttcctatgtaaaacgat
gtttcacaaactattgtaaacaggttataaaagtagagactattcaatca
acaatcttgggtacattgtttcacatctatggaacatgaacatgctttga
aaaacaaaatgtgccaggggtgcttacgcctttaaccccagcactcggga
ggcagaggcaggggtattctgagtttgatgcagcctggtctatac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_75221868_75222957
seq2: B6Ng01-149L05.b_45_1135 (reverse)

seq1  AGTGTGTCTGGAAGCTACAGTGTGTCTGGAAACAGTGTTCCCTTCTGTCC  50
      |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||
seq2  AGTG-GTCT-GAAGCTACAGTGGTTCTGGAAACAGTGTTCCCTTCTTTCC  48

seq1  ACACTTCTTTGCTTGCA-CATGTTCACTGCAATGA-CCCACTGATCAGGT  98
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ACACTTCTTTGCTTGCACCATGTTCACTGCAATGACCCCACTGATCAGGT  98

seq1  TCCAGGCCTCTGGCTTCTGCTACTCTATCAATACTGGAATC-TCACTGGG  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TCCAGGCCTCTGGCTTCTGCTACTCTATCAATACTGGAATCTTCACTGGG  148

seq1  ACTCCTCTTGGATG-TCCTGTTGTTGCCCTGTGTCATGGAAATCTTGTAG  196
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTCTTGGATGTTCCTGTTGTTGCCCTGTGTCATGGAAATCTTGTAG  198

seq1  TTTTGGCTCTGTAGGACCAGCCCCTTCATCCTCTCTAGCAGTTCATTGAT  246
      |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTT-GCTCTGTAGGACCAACCCCTTCATCCTCTCTAGCAGTTCATTGAT  247

seq1  GGGGTAGATGTTGGGGTGGACCAATTCAAAGCCCTGGATCTGGGCCTGAG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTAGATGTTGGGGTGGACCAATTCAAAGCCCTGGATCTGGGCCTGAG  297

seq1  AGGATCTGAGCTGCTCTGCCCTTCAGCTCTCGTGCTCTCACACCCTTGGC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCTGAGCTGCTCTGCCCTTCAGCTCTCGTGCTCTCACACCCTTGGC  347

seq1  CTGGTTCACTGTCAACCCTTGCACCAGGGCCAGCTCCACCCTTCTGCCCA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTCACTGTCAACCCTTGCACCAGGGCCAGCTCCACCCTTCTGCCCA  397

seq1  GGCGAGGTGCTGGGGCTGCTCTCCCGAGTGTTGCAGCAGGTGAGGGCCAG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGAGGTGCTGGGGCTGCTCTCCCGAGTGTTGCAGCAGGTGAGGGCCAG  447

seq1  GGCCCGCTTTCTTGCTCTAAGATTACAAGTACATACTTGTAATCTTAGAA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCGCTTTCTTGCTCTAAGATTACAAGTACATACTTGTAATCTTAGAA  497

seq1  TTTGGGGGAGGCTTGCCAGTTGAGGACTACACAGTGAGACCCAATCTTGA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGGGAGGCTTGCCAGTTGAGGACTACACAGTGAGACCCAATCTTGA  547

seq1  AAGCAAAAATAGAGCCAGTGAGGTAGTTAAGCAAATCATGCGTTTTTCTA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAAAATAGAGCCAGTGAGGTAGTTAAGCAAATCATGCGTTTTTCTA  597

seq1  ACTCTGAAACGCACGTAAAAGTAGAAGGAGAAAACCACTCCACGGAGTTA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGAAACGCACGTAAAAGTAGAAGGAGAAAACCACTCCACGGAGTTA  647

seq1  CCTCCTGCCTCTCACCCGTGTGCTGTGGCGCGTACACCGATACAAAAGGA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTGCCTCTCACCCGTGTGCTGTGGCGCGTACACCGATACAAAAGGA  697

seq1  AAACTGTGTCAAGTTGTTGTTAAGGCTGTGCTGGGTGCTGGCTTGCTCAG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGTGTCAAGTTGTTGTTAAGGCTGTGCTGGGTGCTGGCTTGCTCAG  747

seq1  GATCTAGATTTTATTCAGAGGTTAAAATAGTGTTGGAATATATGTACTAA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTAGATTTTATTCAGAGGTTAAAATAGTGTTGGAATATATGTACTAA  797

seq1  TAAATTTTTCTTATTAGAAATGAAAACTTAACATCTAAGTAATTTCCTCA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTTTTCTTATTAGAAATGAAAACTTAACATCTAAGTAATTTCCTCA  847

seq1  TTGTCTACCTTGTCAAAACAAACCTTTGTGTGTCTTACTAGGTTCTGACT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTACCTTGTCAAAACAAACCTTTGTGTGTCTTACTAGGTTCTGACT  897

seq1  CTGAAGACCTTCTGGAAGAGTTGCTCTGCAGCTTGGTACAGTTAATCACT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGACCTTCTGGAAGAGTTGCTCTGCAGCTTGGTACAGTTAATCACT  947

seq1  GATACTCCACTCTTGTAAGTTCTGCCTGAGCCGGGCTTGCTCTCCATTCT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTCCACTCTTGTAAGTTCTGCCTGAGCCGGGCTTGCTCTCCATTCT  997

seq1  GTAATGAAAATGAGAATTGACTGTGCTGAAGAGGGGTGTGTGTGTGTGTG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGAAAATGAGAATTGACTGTGCTGAAGAGGGGTGTGTGTGTGTGTG  1047

seq1  TGTGTTTGATGGGGGGTGTGGGGCAGGCAGTGTTGGGTGAATTC  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTTGATGGGGGGTGTGGGGCAGGCAGTGTTGGGTGAATTC  1091

seq1: chr18_75106263_75107260
seq2: B6Ng01-149L05.g_68_1062

seq1  GAATTCAACCAATCACTACAGACTTCTACGAACCCCTCCCACAGATGATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACCAATCACTACAGACTTCTACGAACCCCTCCCACAGATGATC  50

seq1  ACTACAGAAGACCCAGGGATGACATATAGTCCCTTAAAGCCTCTGGTGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACAGAAGACCCAGGGATGACATATAGTCCCTTAAAGCCTCTGGTGTC  100

seq1  AGGCGTTGCCTGAGATAACACAGCCGTCTCTGGGCAGCTGATCCAGCAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCGTTGCCTGAGATAACACAGCCGTCTCTGGGCAGCTGATCCAGCAGT  150

seq1  TTCTCACACAGCTGACTCATCTCGGGAGCTTTTCTCCCTGAAGCCCTCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCACACAGCTGACTCATCTCGGGAGCTTTTCTCCCTGAAGCCCTCTG  200

seq1  AGTCAAGGACTTGGAGAACACACAGTAGAGGAGAGGAAAGAGAAGACACG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAAGGACTTGGAGAACACACAGTAGAGGAGAGGAAAGAGAAGACACG  250

seq1  GATGCCAGCTAGAACCACCCTATTCTTCCCCCGGGCAAGCTGGCTTGTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCCAGCTAGAACCACCCTATTCTTCCCCCGGGCAAGCTGGCTTGTCT  300

seq1  CTCCTGTGCTTCTTCCAATGCCTTCCTTTGCACTCTCAATCTTGGGCCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGTGCTTCTTCCAATGCCTTCCTTTGCACTCTCAATCTTGGGCCAA  350

seq1  CTTGTTCTTTGTCCTGAATCGGAGTTGCCTAGAACGCTCACACTTACATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTCTTTGTCCTGAATCGGAGTTGCCTAGAACGCTCACACTTACATT  400

seq1  TCCAAGGGCAGGTTCTGGGAGTCTGCGTTGCTACCATACAGGGTAATGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAGGGCAGGTTCTGGGAGTCTGCGTTGCTACCATACAGGGTAATGTA  450

seq1  GAGGGTGGGCTGGGTGTCCCCACTGTTATTGTAAGAGAACATGTGAACTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGTGGGCTGGGTGTCCCCACTGTTATTGTAAGAGAACATGTGAACTT  500

seq1  TCAGCTGGTAATGGTAAACTGCAGAGACAATAACAGAGACCTCTGTGAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTGGTAATGGTAAACTGCAGAGACAATAACAGAGACCTCTGTGAGC  550

seq1  CTTGCTTGCATCTCGAGAGTCATACAGCACACTGAATTTTAGAGACAAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTTGCATCTCGAGAGTCATACAGCACACTGAATTTTAGAGACAAAC  600

seq1  ATCCTTCTGGCCCAGGCTAGTCTCAGCCTGGCTCTGGTCTTGCTCTGCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTCTGGCCCAGGCTAGTCTCAGCCTGGCTCTGGTCTTGCTCTGCCT  650

seq1  GAAAGCATAAAAAAATCACTGAAGAGGGACCCTGACCTTGGCAGTCAGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGCATAAAAAAATCACTGAAGAGGGACCCTGACCTTGGCAGTCAGAT  700

seq1  GTTCGGACACTTGGAGCTATTTATTTTCTACTGCATGACACTGGATTAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCGGACACTTGGAGCTATTTATTTTCTACTGCATGACACTGGATTAGG  750

seq1  GACTGAGGTACAAACCTCTCTGAGTCTCAAGGTCTTCCTATGTAAAACGA  800
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GACTGAGGTACAAACCTCTCTGAGTCTC-AGGTCTTCCTATGTAAAACGA  799

seq1  TGTTTCACAAACTATTGTAAACAGGTTATAAAAGTAGAGACTATTCAATC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCACAAACTATTGTAAACAGGTTATAAAAGTAGAGACTATTCAATC  849

seq1  AACAATCTT-GGTACATTGTTTCACATCTATGGAACATGAACATGCTTTG  899
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATCTTGGGTACATTGTTTCACATCTATGGAACATGAACATGCTTTG  899

seq1  AAAAACAAAATGTGCCAGGGGTGGCTTACGCCTTTAACCCCAGCACTCGG  949
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACAAAATGTGCCAGGGGT-GCTTACGCCTTTAACCCCAGCACTCGG  948

seq1  GAGGCAGAGGCAGGGGTATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTATAC  998
      |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||
seq2  GAGGCAGAGGCAGGGGTA-TTCTGAGTTTGATG-CAGCCTGGTCTATAC  995