BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-151E23
Chromosome18 (Build37)
Map Location 75,029,357 - 75,170,354
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC672799, Lipg, Rpl17, BC031181
Upstream geneMro, Mapk4, 2810433K01Rik, Cxxc1, EG435570, Mbd1, Ccdc11, LOC628298, LOC668124, LOC668126, Myo5b, Acaa2
Downstream geneDym, LOC628356, EG667777, Smad7, Gm672, Zbtb7c
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-151E23.bB6Ng01-151E23.g
ACCDH947161DH947162
length754895
definitionDH947161|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151E23, 5' end.DH947162|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151E23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,029,357 - 75,030,111)(75,169,454 - 75,170,354)
sequence
gaattctcaagcttattatttctcaagttaatattacttcctccttcatc
ttatcttcctaccacccctgctcaaaataactcaaatggtccataatttg
gggaaatgctacactgtgacacacaccctggctgccgaaaccttgcacat
gcccgcccattggtggtttgggtaggatacatctctctagaaatgaaaat
tacagaaacaaaagacgtccaaaaaaagtcacacctttgattgtaaaatt
tcctcaggaatggacgcaccagttggatttccatccaaagcaacacagaa
gagtcctcccctgccctcacatgaacccttgctacagttctctcattcca
gagatgggcagtttgtgtaagatggcagaccaaaaactcagctccctccc
agacatgagataacatgttaaaaatagcaagtgtcattgcagacacactg
gctacttactaaggagaaaaaatcctacagccaagaagaaaactgaaact
aaagagagagctgggtggggtgagagggttgcagacatattggtctccat
caggtaggaaactaaagagtggaccaaggacaagcatcattggaacggcc
acagatccaagacttcccgctctagacaggaaagtaagaggtgggtgaag
tgggtggtaatatgaaggtttagtgggtgaagggatctgccatcaatcct
gacagctggcatttgttttcctgaggcctaaggtggaaggaaagaacgga
cctc
gaattcctggccaaccagagcgaagtgatgagaccctacttcaaaggaac
aaaaggagcgtgtggggtgggggtggatgtgcaggcacacaactgtaagc
agagcacttgggagggacaggcaggaagaccagaagttcaaggccaccct
ctgctacacttacagtgctgtgggctggacccagggcttcaggttaagca
aactctttgtcattgggttacatctccaaccctttttgcatttttaaatt
ttgacacaagatgtgcctaagttagactcaaactcattctgtagcaaaag
ccaggtgtgaacttgagtcctcttgcctcagcccccaggtagctgggatt
ataggcttcaggtacgggattggcttttctcaagaccagaccctcagctg
ctttagacaaaatcaggcaagcctttgctgtggaagtcactcactgtggc
agtgacttccactcacccactgtcttcatcgctgttctaagattttactt
gttgacctatatacatacatacaaacacacacacacacacatcgctgggg
cagcaatgaacaatggtgcatgcctttaattccagcattaggaaggcata
ggcaggcagatctctgtaagttatagttcagcctggtctacagaacaaag
tctaagacagcagggctgcacagagaaaccttatctaaaaccaaacccaa
accaaactctaaaaaaacatcagcaacaaaaaaaactttcaagtatgaaa
gacaaaagcaggaccacaagttaaattggacgttaatacaccgtcaggac
tagaagcacagagagtcatgggttgtgggattgacaatcatgttcagtta
cattttcaaggagcttccgtcctccttctccagctgcctgggagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_75029357_75030111
seq2: B6Ng01-151E23.b_44_797

seq1  GAATTCTCAAGCTTATTATTTCTCAAGTTAATATTACTTCCTCCTTCATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAAGCTTATTATTTCTCAAGTTAATATTACTTCCTCCTTCATC  50

seq1  TTATCTTCCTACCACCCCTGCTCAAAATAACTCAAATGGTCCATAATTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTTCCTACCACCCCTGCTCAAAATAACTCAAATGGTCCATAATTTG  100

seq1  GGGAAATGCTACACTGTGACACACACCCTGGCTGCCGAAACCTTGCACAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAATGCTACACTGTGACACACACCCTGGCTGCCGAAACCTTGCACAT  150

seq1  GCCCGCCCATTGGTGGTTTGGGTAGGATACATCTCTCTAGAAATGAAAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCGCCCATTGGTGGTTTGGGTAGGATACATCTCTCTAGAAATGAAAAT  200

seq1  TACAGAAACAAAAGACGTCCAAAAAAAGTCACACCTTTGATTGTAAAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAAACAAAAGACGTCCAAAAAAAGTCACACCTTTGATTGTAAAATT  250

seq1  TCCTCAGGAATGGACGCACCAGTTGGATTTCCATCCAAAGCAACACAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCAGGAATGGACGCACCAGTTGGATTTCCATCCAAAGCAACACAGAA  300

seq1  GAGTCCTCCCCTGCCCTCACATGAACCCTTGCTACAGTTCTCTCATTCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCCTCCCCTGCCCTCACATGAACCCTTGCTACAGTTCTCTCATTCCA  350

seq1  GAGATGGGCAGTTTGTGTAAGATGGCAGACCAAAAACTCAGCTCCCTCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGGGCAGTTTGTGTAAGATGGCAGACCAAAAACTCAGCTCCCTCCC  400

seq1  AGACATGAGATAACATGTTAAAAATAGCAAGTGTCATTGCAGACACACTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATGAGATAACATGTTAAAAATAGCAAGTGTCATTGCAGACACACTG  450

seq1  GCTACTTACTAAGGAGAAAAAATCCTACAGCCAAGAAGAAAACTGAAACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACTTACTAAGGAGAAAAAATCCTACAGCCAAGAAGAAAACTGAAACT  500

seq1  AAAGAGAGAGCTGGGTGGGGTGAGAGGGTTGCAGACATATTGGTCTCCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGAGAGCTGGGTGGGGTGAGAGGGTTGCAGACATATTGGTCTCCAT  550

seq1  CAGGTAGGAAACTAAAGAGTGGACCAAGGACAAGCATCATTGGAACGGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTAGGAAACTAAAGAGTGGACCAAGGACAAGCATCATTGGAACGGCC  600

seq1  ACAGATCCAAGACTTCCCGCTCTAGACAGGAAAGTAAGAGGTGGGTGAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATCCAAGACTTCCCGCTCTAGACAGGAAAGTAAGAGGTGGGTGAAG  650

seq1  TGGGTGGTAATATGAAGGTTTAGTGGGTGAAGGGAGCTGCCATCAATCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TGGGTGGTAATATGAAGGTTTAGTGGGTGAAGGGATCTGCCATCAATCCT  700

seq1  GACAGCTGGCATTTGTTTCCCAGAGGCCACAAGGTGGAAGGAGAGAACGG  750
      |||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| |||||||
seq2  GACAGCTGGCATTTGTTTTCCTGAGGCC-TAAGGTGGAAGGAAAGAACGG  749

seq1  ACCTC  755
      |||||
seq2  ACCTC  754

seq1: chr18_75169454_75170354
seq2: B6Ng01-151E23.g_67_961 (reverse)

seq1  GCTCCAAGGCAGCTGGAGAAGGAAGGACGGGAGCTTCCTTGAAAAATGTA  50
      ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||
seq2  GCTCCCAGGCAGCTGGAGAAGG-AGGACGGAAGC-TCCTTG-AAAATGTA  47

seq1  ACCTGGACATCGTTGTCAATCCCACAACCCCTGACTCTCTGTGCTTCTAG  100
      | ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  A-CTGAACATGATTGTCAATCCCACAACCCATGACTCTCTGTGCTTCTAG  96

seq1  TCCTGACGGTGTATTAAACGTCC-ATTTAACTTGTGGTTCCTGCTTTTTG  149
      ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||
seq2  TCCTGACGGTGTATT-AACGTCCAATTTAACTTGTGG-TCCTGC-TTTTG  143

seq1  TCTTTTCATACTTGAAAGTTTTTTTTGTTGCTGATGTTTTTTTAGAGTTT  199
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TC-TTTCATACTTGAAAGTTTTTTTTGTTGCTGATGTTTTTTTAGAGTTT  192

seq1  GGTTT-GGTTTGGTTTTAGATAAGGTTTCTCTGTGCAGCCCTGCTGTCTT  248
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGGGTTTGGTTTTAGATAAGGTTTCTCTGTGCAGCCCTGCTGTCTT  242

seq1  AGACTTTGTTCTGTAGACCAGGCTGAACTATAACTTACAGAGATCTGCCT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTTGTTCTGTAGACCAGGCTGAACTATAACTTACAGAGATCTGCCT  292

seq1  GCCTATGCCTTCCTAATGCTGGAATTAAAGGCATGCACCATTGTTCATTG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTATGCCTTCCTAATGCTGGAATTAAAGGCATGCACCATTGTTCATTG  342

seq1  CTGCCCCAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATGTATGTATATAGGTC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCCAGCGATGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATGTATGTATATAGGTC  392

seq1  AACAAGTAAAATCTTAGAACAGCGATGAAGACAGTGGGTGAGTGGAAGTC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGTAAAATCTTAGAACAGCGATGAAGACAGTGGGTGAGTGGAAGTC  442

seq1  ACTGCCACAGTGAGTGACTTCCACAGCAAAGGCTTGCCTGATTTTGTCTA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCCACAGTGAGTGACTTCCACAGCAAAGGCTTGCCTGATTTTGTCTA  492

seq1  AAGCAGCTGAGGGTCTGGTCTTGAGAAAAGCCAATCCCGTACCTGAAGCC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGCTGAGGGTCTGGTCTTGAGAAAAGCCAATCCCGTACCTGAAGCC  542

seq1  TATAATCCCAGCTACCTGGGGGCTGAGGCAAGAGGACTCAAGTTCACACC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATCCCAGCTACCTGGGGGCTGAGGCAAGAGGACTCAAGTTCACACC  592

seq1  TGGCTTTTGCTACAGAATGAGTTTGAGTCTAACTTAGGCACATCTTGTGT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTTTGCTACAGAATGAGTTTGAGTCTAACTTAGGCACATCTTGTGT  642

seq1  CAAAATTTAAAAATGCAAAAAGGGTTGGAGATGTAACCCAATGACAAAGA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATTTAAAAATGCAAAAAGGGTTGGAGATGTAACCCAATGACAAAGA  692

seq1  GTTTGCTTAACCTGAAGCCCTGGGTCCAGCCCACAGCACTGTAAGTGTAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGCTTAACCTGAAGCCCTGGGTCCAGCCCACAGCACTGTAAGTGTAG  742

seq1  CAGAGGGTGGCCTTGAACTTCTGGTCTTCCTGCCTGTCCCTCCCAAGTGC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGGTGGCCTTGAACTTCTGGTCTTCCTGCCTGTCCCTCCCAAGTGC  792

seq1  TCTGCTTACAGTTGTGTGCCTGCACATCCACCCCCACCCCACACGCTCCT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTTACAGTTGTGTGCCTGCACATCCACCCCCACCCCACACGCTCCT  842

seq1  TTTGTTCCTTTGAAGTAGGGTCTCATCACTTCGCTCTGGTTGGCCAGGAA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTCCTTTGAAGTAGGGTCTCATCACTTCGCTCTGGTTGGCCAGGAA  892

seq1  TTC  901
      |||
seq2  TTC  895