BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-160P09
Chromosome18 (Build37)
Map Location 14,002,817 - 14,122,995
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp521
Upstream geneOsbpl1a, LOC435556, Impact, Hrh4, EG383354, LOC665379, LOC100040358
Downstream geneLOC100040094, LOC100040103, LOC100040391, LOC382096, LOC100040129, EG623867, Ss18, LOC100040446, Psma8, Taf4b, LOC669965
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-160P09.bB6Ng01-160P09.g
ACCDH954202DH954203
length9981,131
definitionDH954202|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-160P09, 5' end.DH954203|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-160P09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,122,012 - 14,122,995)(14,002,817 - 14,003,954)
sequence
gaattctttaaaacttcagcagcttcagtccttgcacggctaatgatcaa
gcagcagtcatcctgccacctggggaccctatcacagctacggcaccagg
ctgatcttggtggtatcattatgatggtagaacacaccacagttagcatt
tctcctctggatgtctgcgaggaaaggtttgtaatttgggcattaacaac
acaaaaagtcagaatcaaatatgccttccaagtaactatgttttctagga
agattattttttgaagatgaatgtatacattcacaaattatttttcatac
tctatgtactttaacaagatagtaaatactttgaaaattcctgagaagaa
aaatatgtagtcattctcatttgttcatgcatatatatatatatacatat
atatatatatacacatacatatatataacttaaatatatattaaacttca
tatatatacatatacatatacatatacatatacatatacatatacatata
catatacatatacatatacatatacatatataggcatgggttaaatttgc
atctagttttcaaatgaagataatttggtttagaatacatttactattta
tgttagcttaaggtgttccaaactaaagacagacaaggaatcaccatttc
catagtagtgcaggttggttgggtgggttggtttgtttattttgttttaa
attacattgtggtattgcttatgattttttttttcaagtatgaaaccaaa
tgggttttttgacattttagttagcacaatgtactgcagaacatacagga
cgcttggtatggcactctcacaagcagacttttgatgttctaatttgcct
tacctttcccatatgttattcacttcgtaaaaggacaaatttaactttcc
ccatttgaattgtgttatcatgttaaggaaaggtaaaccccttttctttg
gggtccttaccactgttctcataaccctctttattattggccatttgg
gaattcctcaggtcagggtgcatctggcagtgctccaaaaactcctcttc
gctctgcaggggcatcttacaaatacgacagtttccggtatccaggctct
tgctgtgtgtgactttgtgctctgtgagagttaacagggaagggaagcgc
tctccacagatagggcacatgtagtgtttgaccgggcctaagtgggtctg
catgtgttcacggagcccgttttcggagaagaaggttctcgagcaaacgt
tacacttgtaattccctttaatgagctccgccttcttcttcacgatggcg
ctttctccgggcctgatgttgtggtctcggagctggtggttctgcagcaa
cgtctccatggtgtaggccgccccgcagatgtcacagccatacatgggtt
cagagctgtccacgtcctcctcactcccatcatggctgttatgggactcc
tggctgttggtgagcaaggtctgcagctcagcctcctccttctgcacttg
ctccgaggccccgttggtgccacagttgggggtcttggtttcaaacacac
agtgtttctcccgcaggtgcttctccagcaggatgacggcgtggaaggct
ttgctgcagaacctgcagttgtacttcttgctgtgggtggtgatgtggca
ctgcagctccacctcggtgccaaacgactcgccgcagaagatgcacttgt
gcactttgccttggttctccaagtggttgtgcttcacgtgcagctgcagg
tcggtctcgttgcggaagtcccagttgcaggacgtgcagcggtacacctt
cttctcgttactgtgcttcacggccaagtgcagctggatagagaccttgg
agtcgaacacttcctggcagagtgtgcagcggagaagacgatgtgtgcat
gtccagcagtgcttctggaggtcatccacggaggtgaactgcttgtcaca
gctctcacagatgtagtagttgagtgatcataagtggatggtcacgtgct
ttagcaaggacttcttggttggggatttcttttgttactgaggcagggtc
agtttggccagccacggtgtctcaatgggctgaaggtgagtctgaagctg
tctaagggacggttccttagcaccacctgat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_14122012_14122995
seq2: B6Ng01-160P09.b_45_1042 (reverse)

seq1  CCAAATGG-CAATAATAAAGA-GGTTATAAAAACAGTGTTATGAACCCAA  48
      |||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||| || | |||| |
seq2  CCAAATGGCCAATAATAAAGAGGGTTATGAGAACAGTGGTAAGGACCCCA  50

seq1  AAGATAAGTGCTTTTACATTCCTTAAAATGATACCA-AATTTAATTGGGG  97
      |||| ||| | |||  | |||||||| |||||| || |||| || |||||
seq2  AAGAAAAGGGGTTTACCTTTCCTTAACATGATAACACAATTCAAATGGGG  100

seq1  AAAGTTTAATTTTGTCC-TTTAAGAAGTGATTAACATATGGGAAATGTAT  146
      |||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| 
seq2  AAAG-TTAAATTTGTCCTTTTACGAAGTGAATAACATATGGGAAAGGTAA  149

seq1  GGCATA-TAG-ACATC-AAAGTCTGCTGGTGAGTGTG-CATACCATGTGT  192
      |||| | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||
seq2  GGCAAATTAGAACATCAAAAGTCTGCTTGTGAGAGTGCCATACCAAGCGT  199

seq1  -CTGTATGTTCTGCAGTATATTGTGCTAACT-AAATGTCTAAAA--CCAT  238
       ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||||
seq2  CCTGTATGTTCTGCAGTACATTGTGCTAACTAAAATGTCAAAAAACCCAT  249

seq1  TTGGTTTCATACTTG-AAAAAAAAATCATAAGCAATACCACAATGTAATT  287
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTTCATACTTGAAAAAAAAAATCATAAGCAATACCACAATGTAATT  299

seq1  TAAAAC-AAATAAACAAACCAA-CCAACCAACCAACCTGCACTACTATGG  335
      |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACAAAATAAACAAACCAACCCACCCAACCAACCTGCACTACTATGG  349

seq1  AAATGGTGATTCCTTGTCTGTCTTTAGTTTGGAACACCTTAAGCTAACAT  385
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGTGATTCCTTGTCTGTCTTTAGTTTGGAACACCTTAAGCTAACAT  399

seq1  AAATAGTAAATGTATTCTAAACCAAATTATCTTCATTTGAAAACTAGATG  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGTAAATGTATTCTAAACCAAATTATCTTCATTTGAAAACTAGATG  449

seq1  CAAATTTAACCCATGCCTATATATGTATATGTATATGTATATGTATATGT  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTTAACCCATGCCTATATATGTATATGTATATGTATATGTATATGT  499

seq1  ATATGTATATGTATATGTATATGTATATGTATATGTATATGTATATATAT  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTATATGTATATGTATATGTATATGTATATGTATATGTATATATAT  549

seq1  GAAGTTTAATATATATTTAAGTTATATATATGTATGTGTATATATATATA  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTTAATATATATTTAAGTTATATATATGTATGTGTATATATATATA  599

seq1  TATGTATATATATATATATGCATGAACAAATGAGAATGACTACATATTTT  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATATATATATATATGCATGAACAAATGAGAATGACTACATATTTT  649

seq1  TCTTCTCAGGAATTTTCAAAGTATTTACTATCTTGTTAAAGTACATAGAG  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTCAGGAATTTTCAAAGTATTTACTATCTTGTTAAAGTACATAGAG  699

seq1  TATGAAAAATAATTTGTGAATGTATACATTCATCTTCAAAAAATAATCTT  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAAAAATAATTTGTGAATGTATACATTCATCTTCAAAAAATAATCTT  749

seq1  CCTAGAAAACATAGTTACTTGGAAGGCATATTTGATTCTGACTTTTTGTG  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGAAAACATAGTTACTTGGAAGGCATATTTGATTCTGACTTTTTGTG  799

seq1  TTGTTAATGCCCAAATTACAAACCTTTCCTCGCAGACATCCAGAGGAGAA  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTAATGCCCAAATTACAAACCTTTCCTCGCAGACATCCAGAGGAGAA  849

seq1  ATGCTAACTGTGGTGTGTTCTACCATCATAATGATACCACCAAGATCAGC  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTAACTGTGGTGTGTTCTACCATCATAATGATACCACCAAGATCAGC  899

seq1  CTGGTGCCGTAGCTGTGATAGGGTCCCCAGGTGGCAGGATGACTGCTGCT  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGCCGTAGCTGTGATAGGGTCCCCAGGTGGCAGGATGACTGCTGCT  949

seq1  TGATCATTAGCCGTGCAAGGACTGAAGCTGCTGAAGTTTTAAAGAATTC  984
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCATTAGCCGTGCAAGGACTGAAGCTGCTGAAGTTTTAAAGAATTC  998

seq1: chr18_14002817_14003954
seq2: B6Ng01-160P09.g_70_1200

seq1  GAATTCCTCAGGTCAGGGTGCATCTGGCAGTGCTCCAAAAACTCCTCTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCAGGTCAGGGTGCATCTGGCAGTGCTCCAAAAACTCCTCTTC  50

seq1  GCTCTGCAGGGGCATCTTACAAATACGACAGTTTCCGGTATCCAGGCTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGCAGGGGCATCTTACAAATACGACAGTTTCCGGTATCCAGGCTCT  100

seq1  TGCTGTGTGTGACTTTGTGCTCTGTGAGAGTTAACAGGGAAGGGAAGCGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTGTGTGACTTTGTGCTCTGTGAGAGTTAACAGGGAAGGGAAGCGC  150

seq1  TCTCCACAGATAGGGCACATGTAGTGTTTGACCGGGCCTAAGTGGGTCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCACAGATAGGGCACATGTAGTGTTTGACCGGGCCTAAGTGGGTCTG  200

seq1  CATGTGTTCACGGAGCCCGTTTTCGGAGAAGAAGGTTCTCGAGCAAACGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTTCACGGAGCCCGTTTTCGGAGAAGAAGGTTCTCGAGCAAACGT  250

seq1  TACACTTGTAATTCCCTTTAATGAGCTCCGCCTTCTTCTTCACGATGGCG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTTGTAATTCCCTTTAATGAGCTCCGCCTTCTTCTTCACGATGGCG  300

seq1  CTTTCTCCGGGCCTGATGTTGTGGTCTCGGAGCTGGTGGTTCTGCAGCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCCGGGCCTGATGTTGTGGTCTCGGAGCTGGTGGTTCTGCAGCAA  350

seq1  CGTCTCCATGGTGTAGGCCGCCCCGCAGATGTCACAGCCATACATGGGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCTCCATGGTGTAGGCCGCCCCGCAGATGTCACAGCCATACATGGGTT  400

seq1  CAGAGCTGTCCACGTCCTCCTCACTCCCATCATGGCTGTTATGGGACTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCTGTCCACGTCCTCCTCACTCCCATCATGGCTGTTATGGGACTCC  450

seq1  TGGCTGTTGGTGAGCAAGGTCTGCAGCTCAGCCTCCTCCTTCTGCACTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGTTGGTGAGCAAGGTCTGCAGCTCAGCCTCCTCCTTCTGCACTTG  500

seq1  CTCCGAGGCCCCGTTGGTGCCACAGTTGGGGGTCTTGGTTTCAAACACAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCGAGGCCCCGTTGGTGCCACAGTTGGGGGTCTTGGTTTCAAACACAC  550

seq1  AGTGTTTCTCCCGCAGGTGCTTCTCCAGCAGGATGACGGCGTGGAAGGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTCTCCCGCAGGTGCTTCTCCAGCAGGATGACGGCGTGGAAGGCT  600

seq1  TTGCTGCAGAACCTGCAGTTGTACTTCTTGCTGTGGGTGGTGATGTGGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGCAGAACCTGCAGTTGTACTTCTTGCTGTGGGTGGTGATGTGGCA  650

seq1  CTGCAGCTCCACCTCGGTGCCAAACGACTCGCCGCAGAAGATGCACTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGCTCCACCTCGGTGCCAAACGACTCGCCGCAGAAGATGCACTTGT  700

seq1  GCACTTTGCCTTGGTTCTCCAAGTGGTTGTGCTTCACGTGCAGCTGCAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTTTGCCTTGGTTCTCCAAGTGGTTGTGCTTCACGTGCAGCTGCAGG  750

seq1  TCGGTCTCGTTGCGGAAGTCCCAGTTGCAGGACGTGCAGCGGTACACCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGTCTCGTTGCGGAAGTCCCAGTTGCAGGACGTGCAGCGGTACACCTT  800

seq1  CTTCTCGTTACTGTGCTTCACGGCCAAGTGCAGCTGGATAGAGACCTTGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCGTTACTGTGCTTCACGGCCAAGTGCAGCTGGATAGAGACCTTGG  850

seq1  AGTCGAACACTTCCTGGCAGAGTGTGCAGCGGAAGAAGACGAAGGTGTGC  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||
seq2  AGTCGAACACTTCCTGGCAGAGTGTGCAGCGG-AGAAGACG-ATGTGTGC  898

seq1  ATGTCCAGCAGGTGCTTCTGGAGGTCATCCACGGAGGTGAACTGCTTGTC  950
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCCAGCA-GTGCTTCTGGAGGTCATCCACGGAGGTGAACTGCTTGTC  947

seq1  ACAGCTCTCACAGATGTAGTAGGTTGAGGTGATCATAAAGTGGATGGTCA  1000
      ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||
seq2  ACAGCTCTCACAGATGTAGTA-GTTGA-GTGATCAT-AAGTGGATGGTCA  994

seq1  CGTGCTTTAGCAAGGAC-TCTTGGTTGGGGAATTC-TTTGTTACACTGAG  1048
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||
seq2  CGTGCTTTAGCAAGGACTTCTTGGTTGGGGATTTCTTTTGTT--ACTGAG  1042

seq1  GGCAGGTCAGTTTTGGCAG-CACGGTGTCCAAATGGGTTTTGAGGTGAGT  1097
      |   ||||||||| | ||| |||||||||  ||||||  |  ||||||||
seq2  GCAGGGTCAGTTTGGCCAGCCACGGTGTCTCAATGGG-CTGAAGGTGAGT  1091

seq1  CTGAAAGCTGTCT-AGGGACGTGTACTTAGCACCACACTGAT  1138
      ||| ||||||||| |||||||  | ||||||||||| |||||
seq2  CTG-AAGCTGTCTAAGGGACGGTTCCTTAGCACCAC-CTGAT  1131