BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-177F24
Chromosome18 (Build37)
Map Location 83,323,321 - 83,465,779
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4921531P14Rik
Upstream geneB020010K11Rik, Galr1, Mbp, EG637748, Zfp236, LOC100039563, Zfp516, LOC100041001
Downstream geneLOC665284, Tshz1, Zadh2, LOC669856, Zfp407
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-177F24.bB6Ng01-177F24.g
ACCGA004662GA004663
length748696
definitionB6Ng01-177F24.b B6Ng01-177F24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(83,323,321 - 83,324,066)(83,465,089 - 83,465,779)
sequence
gaattctgcggatcaacacttcacctgacacaagaacaggttaggtaaat
agatcctgtggctgagtactctgaaaacctattagaccggagttggcgag
atgacccagtgattaagtgcccactgcacatgtagcaagcatggaggctt
gagtcagatctcccagaacccatataaataatgggtgggtgtcacggccc
tcctataattccagggcatcgatagtggagacacatcccagaagtgaggt
gggtagacagaggggccatgttggaggtctctggcttcaatcgagagact
cagcttcattgaccgagatagagacccatggagcaagactctcccaccaa
cccccaacttctatatccaaatgcacacatgtgcacttctatgcgtggga
acatgcatacataccacaacatacacatgagaaagaaaaacaaaatatcc
caccccaaaccagcaattcatatttctgcggggaaggcttgctctatagg
tgacttttacggctgcttacctgttaccctctgaataacctttaaaatcc
ccacaacacagaatttatttgtcgcaaaggaatttcagactccagagagc
caaaaattctgcttttattgaaattcctgaagaataatagtcgtatcttg
cataaatctcaatgaacaggctttctccacctgctatatatgatgcgctc
tgagatataaatatcactggggtgtttcaggctagattcttaggtaca
gaattcttagaaggcagaaaaatgtagtgttaaagtcacagcctcttgag
tcagaggagataagtgccgattccacgcttcccctcagagccctgattag
cctgcgacattctgggggtcactttgcctccatgacttgcctttgttgtc
tacacaggcattttcaaaagagccttttttggtaaggtgatgtgagtgtc
agcttgtgttgctgtgaaaaaacacagagaagctcaacttaaaagaggga
acggtttacctgggctcccagtttctctgcttttggtcagtggtcacttg
gccttgtcgctgtgggtcctagtgagacaggacatcatattagggagcat
gtggactgataaatggctcaccttgtgggagaaaggatgtataaggagac
agtgaagaagggaagagagttggtcctgtcaactagataccaactactca
gtctctgtcaaccccctcaatagcccatcaagttataaatccatccatgt
cagagcctccattttacaaagcccatgaaaattgctgtcctggggaccag
caagcaggcagagctccctgcccttcactgaccttcattctaaggggccc
acagtattctctcacctcaatttcttgtgccaataaaacaaggtaatgca
tctaagcagcttgcactaggccactattttttagagccctaacagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_83323321_83324066
seq2: B6Ng01-177F24.b_44_791

seq1  GAATTCTGCGGATCAACACTTCACCTGACACAAGAACAGGTTAGGTAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCGGATCAACACTTCACCTGACACAAGAACAGGTTAGGTAAAT  50

seq1  AGATCCTGTGGCTGAGTACTCTGAAAACCTATTAGACCGGAGTTGGCGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCCTGTGGCTGAGTACTCTGAAAACCTATTAGACCGGAGTTGGCGAG  100

seq1  ATGACCCAGTGATTAAGTGCCCACTGCACATGTAGCAAGCATGGAGGCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCCAGTGATTAAGTGCCCACTGCACATGTAGCAAGCATGGAGGCTT  150

seq1  GAGTCAGATCTCCCAGAACCCATATAAATAATGGGTGGGTGTCACGGCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCAGATCTCCCAGAACCCATATAAATAATGGGTGGGTGTCACGGCCC  200

seq1  TCCTATAATTCCAGGGCATCGATAGTGGAGACACATCCCAGAAGTGAGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATAATTCCAGGGCATCGATAGTGGAGACACATCCCAGAAGTGAGGT  250

seq1  GGGTAGACAGAGGGGCCATGTTGGAGGTCTCTGGCTTCAATCGAGAGACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGACAGAGGGGCCATGTTGGAGGTCTCTGGCTTCAATCGAGAGACT  300

seq1  CAGCTTCATTGACCGAGATAGAGACCCATGGAGCAAGACTCTCCCACCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTCATTGACCGAGATAGAGACCCATGGAGCAAGACTCTCCCACCAA  350

seq1  CCCCCAACTTCTATATCCAAATGCACACATGTGCACTTCTATGCGTGGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCAACTTCTATATCCAAATGCACACATGTGCACTTCTATGCGTGGGA  400

seq1  ACATGCATACATACCACAACATACACATGAGAAAGAAAAACAAAATATCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCATACATACCACAACATACACATGAGAAAGAAAAACAAAATATCC  450

seq1  CACCCCAAACCAGCAATTCATATTTCTGCGGGGAAGGCTTGCTCTATAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCAAACCAGCAATTCATATTTCTGCGGGGAAGGCTTGCTCTATAGG  500

seq1  TGACTTTTACGGCTGCTTACCTGTTACCCTCTGAATAACCTTTAAAATCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTTTACGGCTGCTTACCTGTTACCCTCTGAATAACCTTTAAAATCC  550

seq1  CCACAACACAGAATTTATTTGTCGCAAAGGAATTTCAGACTCCAGAGAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAACACAGAATTTATTTGTCGCAAAGGAATTTCAGACTCCAGAGAGC  600

seq1  CAAAAATTCTGCTTTTATTGAAATTCCTGAAGAATAAATAGTCGTATCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CAAAAATTCTGCTTTTATTGAAATTCCTGAAGAAT-AATAGTCGTATCTT  649

seq1  GCATAAATCTCAATGAACAGGCTTTCTCCACCTGCTATATATGATGCGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAAATCTCAATGAACAGGCTTTCTCCACCTGCTATATATGATGCGCT  699

seq1  CTGAGATATAAATATCACT-GGGTG-TTCAGGCTAGATTC-TAGGTACA  746
      ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||
seq2  CTGAGATATAAATATCACTGGGGTGTTTCAGGCTAGATTCTTAGGTACA  748

seq1: chr18_83465089_83465779
seq2: B6Ng01-177F24.g_72_767 (reverse)

seq1  GCTGTTAGGGCTCT-AAAAATGGTGGCCTAGTGCAAGCTGCTTAGATGCA  49
      |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTTAGGGCTCTAAAAAATAGTGGCCTAGTGCAAGCTGCTTAGATGCA  50

seq1  TTACCTTG-TTTATTGGCACAAGAAA-TGAGGTGAGAG-ATACTGTGGGC  96
      |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
seq2  TTACCTTGTTTTATTGGCACAAGAAATTGAGGTGAGAGAATACTGTGGGC  100

seq1  CCCTTAGAATGAAGGTCAGTGAA-GGCAGGGAGCTCTGCCTGCTTGCTGG  145
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTAGAATGAAGGTCAGTGAAGGGCAGGGAGCTCTGCCTGCTTGCTGG  150

seq1  TCCCCAGGACAGCAATTTTCATGGGCTTTGTAAAATGGAGGCTCTGACAT  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCAGGACAGCAATTTTCATGGGCTTTGTAAAATGGAGGCTCTGACAT  200

seq1  GGATGGATTTATAACTTGATGGGCTATTGAGGGGGTTGACAGAGACTGAG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGATTTATAACTTGATGGGCTATTGAGGGGGTTGACAGAGACTGAG  250

seq1  TAGTTGGTATCTAGTTGACAGGACCAACTCTCTTCCCTTCTTCACTGTCT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTGGTATCTAGTTGACAGGACCAACTCTCTTCCCTTCTTCACTGTCT  300

seq1  CCTTATACATCCTTTCTCCCACAAGGTGAGCCATTTATCAGTCCACATGC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTATACATCCTTTCTCCCACAAGGTGAGCCATTTATCAGTCCACATGC  350

seq1  TCCCTAATATGATGTCCTGTCTCACTAGGACCCACAGCGACAAGGCCAAG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTAATATGATGTCCTGTCTCACTAGGACCCACAGCGACAAGGCCAAG  400

seq1  TGACCACTGACCAAAAGCAGAGAAACTGGGAGCCCAGGTAAACCGTTCCC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCACTGACCAAAAGCAGAGAAACTGGGAGCCCAGGTAAACCGTTCCC  450

seq1  TCTTTTAAGTTGAGCTTCTCTGTGTTTTTTCACAGCAACACAAGCTGACA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTAAGTTGAGCTTCTCTGTGTTTTTTCACAGCAACACAAGCTGACA  500

seq1  CTCACATCACCTTACCAAAAAAGGCTCTTTTGAAAATGCCTGTGTAGACA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACATCACCTTACCAAAAAAGGCTCTTTTGAAAATGCCTGTGTAGACA  550

seq1  ACAAAGGCAAGTCATGGAGGCAAAGTGACCCCCAGAATGTCGCAGGCTAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGGCAAGTCATGGAGGCAAAGTGACCCCCAGAATGTCGCAGGCTAA  600

seq1  TCAGGGCTCTGAGGGGAAGCGTGGAATCGGCACTTATCTCCTCTGACTCA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGCTCTGAGGGGAAGCGTGGAATCGGCACTTATCTCCTCTGACTCA  650

seq1  AGAGGCTGTGACTTTAACACTACATTTTTCTGCCTTCTAAGAATTC  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCTGTGACTTTAACACTACATTTTTCTGCCTTCTAAGAATTC  696