BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-184K23
Chromosome18 (Build37)
Map Location 86,646,270 - 86,790,708
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNeto1
Upstream geneLOC665382, LOC545269, LOC545270, LOC665402
Downstream geneCbln2, LOC100039872, LOC100039881, LOC665437, LOC435580, LOC546719, LOC383318, Ppia-ps18_1039.1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-184K23.bB6Ng01-184K23.g
ACCGA009999GA010000
length9121,129
definitionB6Ng01-184K23.b B6Ng01-184K23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,646,270 - 86,647,177)(86,789,570 - 86,790,708)
sequence
gaattctgtttgtggtatgaagagggaagtcattatgcagcgaactgggt
gtgtgtagtgctttattcattggaaccatactctactaggtaaggtatga
aaatataagataatacaaagtagacattagtttgaagtggtggcttggga
caattttagggtccctatataagtatcaaggtgactcactgaagaagctt
caggtttcttacctaatgtggatttatgtaacattagttttggcagataa
tttagaattgcattgtgaatgatggtgatgactatatatatataacacac
acatatataacacacacacatatatacacacatatatatgtatatatata
tacatatatacatatgtatatatagtgtgtgtgtgagtgtttgtgtgtgt
tatcttgttttcggtttctaataatgtaattttggtatactgaaaatgtt
ataaagaagagaggcaaatttagacttgagaataattaatgttcagagtt
tatgcttgttcttgtaatggatgatacatagcatatctctacctgcatgt
gtgagtatttacacacatgtggacacatgtgtatatttgtaggcatgtgg
gattatgtgtgtgattctctttgtgtgtactgtctctctcctgatttatg
aaagctccagcagtcaatgacaagcctccatacagaagtttttttttttt
atcataatccattcccaaagactccattcctaccatccataaaaataaat
atatctccatctttctaaatatatcactacagaaatcaaacaccagttat
gtgtagaaaaataatattcaaacaagatccattgatatatagatgtttca
aaagtcacaaaatacataatgtagttgtatgcccagagcaaatgtatacc
taaaaacacata

gaattcaaacccagattttcccagcaaaggctatattgcattagaagtga
acttcaaaagactagtaactgaaagatactatactgtgcgaatacacaca
gagacacacagatttaaattgttcatataataacagttaacatggtacca
gatatggttatgagaggttgtaacttgggttttagtaccttagaagttaa
gtcatttttctttactaacattttaacatctcttaaactcattaatcact
ttatttctatgcacttgaaggacaggacaccatcatgttccatttgtttc
ttctagacaatacaaaccatcaacaggaacactttttatagtctacaatc
aacataatgcatatgtgcagtcctcactaaattctcaagcacaaaattat
gagcacaactatttgtttctctttttacgtaaaaactgatatctttttag
tacataagaaaatatattaccagctaattctacataatttcctctaaagt
aagtcataaatacacaagtgaggtgagacatatgtccccacagaagatat
ctatgatacaaacctattggcaagagcaaatattttcaaaatttgttttt
agaaaattaaatatttatttcatacatgcagaatgccctacaataacctc
tttggccttccttttggaattcattcacccaggtgttttgggaacaacaa
acaaacaaacaaaaatagaaaaagagagtaggtaagaaagaatatcaact
ttcttgaaagactttcaactttcttggagtacaaagtaatacattacaag
gagatcctgtagacatgttatagttactaagcatagaaaggctagaatat
atttttaaaatattctgtatatttgttcttaatcggaactaggtaaccat
tctttttaccatccattccagttctagaaaatgttccttcaagttgtgta
tttagaaagcatagcatgaaaatgaccccttacagctgcatatcaatgtc
actaaaaagatcagaaatggaaaaatgaacatgtcccaagggcttatgca
attcagtgagagagtgaattagatctcagccatcattgcaaaatttcagc
ctcatatcctgacaggtcctgtctcatgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_86646270_86647177
seq2: B6Ng01-184K23.b_45_956

seq1  GAATTCTGTTTGTGGTATGAAGAGGGAAGTCATTATGCAGCGAACTGGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTTTGTGGTATGAAGAGGGAAGTCATTATGCAGCGAACTGGGT  50

seq1  GTGTGTAGTGCTTTATTCATTGGAACCATACTCTACTAGGTAAGGTATGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTAGTGCTTTATTCATTGGAACCATACTCTACTAGGTAAGGTATGA  100

seq1  AAATATAAGATAATACAAAGTAGACATTAGTTTGAAGTGGTGGCTTGGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATAAGATAATACAAAGTAGACATTAGTTTGAAGTGGTGGCTTGGGA  150

seq1  CAATTTTAGGGTCCCTATATAAGTATCAAGGTGACTCACTGAAGAAGCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTTTAGGGTCCCTATATAAGTATCAAGGTGACTCACTGAAGAAGCTT  200

seq1  CAGGTTTCTTACCTAATGTGGATTTATGTAACATTAGTTTTGGCAGATAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTTCTTACCTAATGTGGATTTATGTAACATTAGTTTTGGCAGATAA  250

seq1  TTTAGAATTGCATTGTGAATGATGGTGATGACTATATATATATAACACAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAATTGCATTGTGAATGATGGTGATGACTATATATATATAACACAC  300

seq1  ACATATATAACACACACACATATATACACACATATATATGTATATATATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATATAACACACACACATATATACACACATATATATGTATATATATA  350

seq1  TACATATATACATATGTATATATAGTGTGTGTGTGAGTGTTTGTGTGTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATATATACATATGTATATATAGTGTGTGTGTGAGTGTTTGTGTGTGT  400

seq1  TATCTTGTTTTCTGTTTCTAATAATGTAATTTGTGTAGACTGAAAATGTT  450
      |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||
seq2  TATCTTGTTTTCGGTTTCTAATAATGTAATTTTGGTATACTGAAAATGTT  450

seq1  ATAAAGAAGAGAGGCAAATTTAGACTTGAGAATAATTAATGTTCAGAGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGAAGAGAGGCAAATTTAGACTTGAGAATAATTAATGTTCAGAGTT  500

seq1  TATGCTTGTTCTTGTAATGGATGATACATAGCATATCTCTACCTGCATGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTTGTTCTTGTAATGGATGATACATAGCATATCTCTACCTGCATGT  550

seq1  GTGAGTATTTACACACATGTGGACACATGTGTATATTTGTAGGCATGTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGTATTTACACACATGTGGACACATGTGTATATTTGTAGGCATGTGG  600

seq1  GATTATGTGTGTGATTCTCTTTGTGTGTACTGTCTCTCTCCTGATTTATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATGTGTGTGATTCTCTTTGTGTGTACTGTCTCTCTCCTGATTTATG  650

seq1  AAAGCTCCAGCAGTCAATGACAAGCCTCCATACAGAAG--TTTTTTTTTT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||
seq2  AAAGCTCCAGCAGTCAATGACAAGCCTCCATACAGAAGTTTTTTTTTTTT  700

seq1  ATCATAATCCATTCCCAAAGACTCCATTCCTACCATCCATAAAAATAAAT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATAATCCATTCCCAAAGACTCCATTCCTACCATCCATAAAAATAAAT  750

seq1  ATATCTCCATC-TTCTAAATATATCACTACAGAAATCAAACACCAG-TAT  796
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  ATATCTCCATCTTTCTAAATATATCACTACAGAAATCAAACACCAGTTAT  800

seq1  GTGTAGAAAAATAATATTCAAACAAGATCCATAGATATATAGATGTTTCA  846
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GTGTAGAAAAATAATATTCAAACAAGATCCATTGATATATAGATGTTTCA  850

seq1  AAAGTCACAAAATACATAATGTAGTTGTATGCCCAGAGCAAATGTATACC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCACAAAATACATAATGTAGTTGTATGCCCAGAGCAAATGTATACC  900

seq1  TAAAAACACATA  908
      ||||||||||||
seq2  TAAAAACACATA  912


seq1: chr18_86789570_86790708
seq2: B6Ng01-184K23.g_66_1194 (reverse)

seq1  GCATGAGACAGGA-CTGTCAGGGATTATGAGGGCTGAATTTTTGCAAATG  49
      ||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||| |||||| ||||
seq2  GCATGAGACAGGACCTGTCAGG--ATATGA-GGCTGAAATTTTGC-AATG  46

seq1  ATGGGCCTGAGATTCTAATTTCACTTCTTCTCACCTGAATTTGCATAAGC  99
      ||||  |||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||||||
seq2  ATGG--CTGAGA-TCTAA-TTCACT--CTCTCA-CTGAA-TTGCATAAGC  88

seq1  CCTTGGGACATG-TCATTTTTCCATTTCCTGATTCTTTTAGTGACATTGA  148
      |||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||
seq2  CCTTGGGACATGTTCATTTTTCCATTT-CTGATCTTTTTAGTGACATTGA  137

seq1  TATGCAGCTGTAAGGGGTCATTTTCATGCTATGCTTTCTAAATACACAAC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCAGCTGTAAGGGGTCATTTTCATGCTATGCTTTCTAAATACACAAC  187

seq1  TTGAAGGAACATTTTCTAGAACTGGAATGGATGGTAAAAAGAATGGTTAC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGGAACATTTTCTAGAACTGGAATGGATGGTAAAAAGAATGGTTAC  237

seq1  CTAGTTCCGATTAAGAACAAATATACAGAATATTTTAAAAATATATTCTA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTTCCGATTAAGAACAAATATACAGAATATTTTAAAAATATATTCTA  287

seq1  GCC-TTCTATGCTTAGTAACTATAACATGTCTACAGGATCTCCTTGTAAT  347
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTCTATGCTTAGTAACTATAACATGTCTACAGGATCTCCTTGTAAT  337

seq1  GTATTACTTTGTACTCCAAGAAAGTTGAAAGTCTTTCAAGAAAGTTGATA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTACTTTGTACTCCAAGAAAGTTGAAAGTCTTTCAAGAAAGTTGATA  387

seq1  TTCTTTCTTACCTACTCTCTTTTTCTATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTGTT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTCTTACCTACTCTCTTTTTCTATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTGTT  437

seq1  CCCAAAACACCTGGGTGAATGAATTCCAAAAGGAAGGCCAAAGAGGTTAT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAAACACCTGGGTGAATGAATTCCAAAAGGAAGGCCAAAGAGGTTAT  487

seq1  TGTAGGGCATTCTGCATGTATGAAATAAATATTTAATTTTCTAAAAACAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGGGCATTCTGCATGTATGAAATAAATATTTAATTTTCTAAAAACAA  537

seq1  ATTTTGAAAATATTTGCTCTTGCCAATAGGTTTGTATCATAGATATCTTC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGAAAATATTTGCTCTTGCCAATAGGTTTGTATCATAGATATCTTC  587

seq1  TGTGGGGACATATGTCTCACCTCACTTGTGTATTTATGACTTACTTTAGA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGGACATATGTCTCACCTCACTTGTGTATTTATGACTTACTTTAGA  637

seq1  GGAAATTATGTAGAATTAGCTGGTAATATATTTTCTTATGTACTAAAAAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATTATGTAGAATTAGCTGGTAATATATTTTCTTATGTACTAAAAAG  687

seq1  ATATCAGTTTTTACGTAAAAAGAGAAACAAATAGTTGTGCTCATAATTTT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCAGTTTTTACGTAAAAAGAGAAACAAATAGTTGTGCTCATAATTTT  737

seq1  GTGCTTGAGAATTTAGTGAGGACTGCACATATGCATTATGTTGATTGTAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTTGAGAATTTAGTGAGGACTGCACATATGCATTATGTTGATTGTAG  787

seq1  ACTATAAAAAGTGTTCCTGTTGATGGTTTGTATTGTCTAGAAGAAACAAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATAAAAAGTGTTCCTGTTGATGGTTTGTATTGTCTAGAAGAAACAAA  837

seq1  TGGAACATGATGGTGTCCTGTCCTTCAAGTGCATAGAAATAAAGTGATTA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAACATGATGGTGTCCTGTCCTTCAAGTGCATAGAAATAAAGTGATTA  887

seq1  ATGAGTTTAAGAGATGTTAAAATGTTAGTAAAGAAAAATGACTTAACTTC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTTTAAGAGATGTTAAAATGTTAGTAAAGAAAAATGACTTAACTTC  937

seq1  TAAGGTACTAAAACCCAAGTTACAACCTCTCATAACCATATCTGGTACCA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGTACTAAAACCCAAGTTACAACCTCTCATAACCATATCTGGTACCA  987

seq1  TGTTAACTGTTATTATATGAACAATTTAAATCTGTGTGTCTCTGTGTGTA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAACTGTTATTATATGAACAATTTAAATCTGTGTGTCTCTGTGTGTA  1037

seq1  TTCGCACAGTATAGTATCTTTCAGTTACTAGTCTTTTGAAGTTCACTTCT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGCACAGTATAGTATCTTTCAGTTACTAGTCTTTTGAAGTTCACTTCT  1087

seq1  AATGCAATATAGCCTTTGCTGGGAAAATCTGGGTTTGAATTC  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCAATATAGCCTTTGCTGGGAAAATCTGGGTTTGAATTC  1129


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |