BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-190G04
Chromosome18 (Build37)
Map Location 57,314,040 - 57,481,421
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMegf10
Upstream geneLOC676543, LOC667432, Gramd3, LOC667458, Aldh7a1, Rnuxa, 1700065I17Rik, LOC675171, Lmnb1, March3, C330018D20Rik
Downstream geneLOC672445, Prrc1, 1700011I03Rik, 4930511M06Rik, 2210409D07Rik, Slc12a2, 9330166H04Rik, Fbn2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-190G04.bB6Ng01-190G04.g
ACCGA014152GA014153
length1,0331,094
definitionB6Ng01-190G04.b B6Ng01-190G04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(57,314,040 - 57,314,966)(57,480,318 - 57,481,421)
sequence
gaattctctaacagccaggaagagatcttgtgtgtggagagagggctggg
acccagttcactatggggggcgggggctgcttttgctttccttctttgca
ctctctggttgtagcatcttgattaccagtccaagtgtgatccatggagg
gatgcagagacagtctgtcttaacacagctgcccagcaaagagaagcaaa
cagaaagcctctttgggaagacatctgttgctcccttggacaggccttga
ttgtaggcttttttccccctactggagtaagatacacacgtgtcattaaa
atgtgccagttttatttattttcttagcattctgtttatgtatcctctct
ccctcttctgtttaaagtttgtttttaagaaatttgagcatgtttggtca
tcctccccccatccccccttcgcccgtgttaaatgttgggctctgtagca
ttttaagaatgctcacatcggtatggaactgtcaatccagcctatgtcca
gaaggcttccctgttttccaacggaagctctgtacccctttaaacatcag
ctctccctttccttcccactgacccctgaaaaaccaccactctactcttt
gccttgatgaatctgactttgggaggtgctcatccagactggatcatttg
gtgactgttgcttcatatgaacatcttaaggtttacccacatttcagtct
gtgggactcttttgaaggccaactgtattctgtgggtcagtctgtactga
gctctgttcatccactctcagatatctgtgctgtttcatcctctgagaga
aatgtgaatgaatcagcggggtggaaaatttgttcaaatctgatttcaat
tcttttgaagtcgatgcccagaggtgaagctattgcgcagtaattccaag
gtgttttgccattgttgttgtttgtttgcttgctttatgaggcaagcagc
ttcccacggtggttgctccacgtgacacctccaccagcaatgtgccaggg
ctcatttctccatcgtcacagcatttatatttt
gaattctttgagaaagcctgtccaaaggagagtgggaaagaaaggagcaa
aagaacaacagagtaggagaaagctgctttgccaaattggctcagacatt
gaaggaagaaggtccaaacgtacaaagtctgactgtgtgcactcacctca
gtgctggctttagtatcgcctctaagtgttctttcctaggttttcagatg
ccattaacacccttagaaggtcttgttggtgatgggcttgctcaagctac
tcatgtcagggtatgcattgggaatctctggggggtctactgtagaccat
agctcaggtcagttttgactcacagattccttctgtctaccagtgttctt
caagccaggtttcagaacttaagtctcaggacacctgctctgatagcacc
tttttcctctattgtcaccaagccaatgattcaccaggaaactttagaaa
ctcttcttcttccctctgctctgctccagggtctcctcttcctctgccag
agctgctgctacattcctccctcgcctcactccaccctgtcccaccttcc
caaccccattctcgctgtgtccttcactctagttattctgtaagaccagt
gttaaccagagctacagtgctgatttcaaagctcatcctggagctgtggt
cctggccttctgcagttatactctctcactcatgctcctctgagacatac
tctagactttcctgtttctctccaagctttcctactttgttttgctcttg
aaactacagatttctgccactactcttttctattgctcttgaagctacag
atttctgccaccactcctttctatttatagctattgatctaaatactccg
agttggagatcctagcagtctatgcctgtcttttgccatcttcctgtatc
ctgtttgcatctttttaagatgcccaagctctatccatccttaagtgacc
agctcagactggtcttagctgtccaaaggatccctcagccagaaatacca
ttccctttctgacagcatatcactttatatgctatgtctgcttcataata
gctctgggcagtccgcagttttgatgaagaatgttatccacagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_57314040_57314966
seq2: B6Ng01-190G04.b_42_968

seq1  GAATTCTCTAACAGCCAGGAAGAGATCTTGTGTGTGGAGAGAGGGCTGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTAACAGCCAGGAAGAGATCTTGTGTGTGGAGAGAGGGCTGGG  50

seq1  ACCCAGTTCACTATGGGGGGCGGGGGCTGCTTTTGCTTTCCTTCTTTGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGTTCACTATGGGGGGCGGGGGCTGCTTTTGCTTTCCTTCTTTGCA  100

seq1  CTCTCTGGTTGTAGCATCTTGATTACCAGTCCAAGTGTGATCCATGGAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTGGTTGTAGCATCTTGATTACCAGTCCAAGTGTGATCCATGGAGG  150

seq1  GATGCAGAGACAGTCTGTCTTAACACAGCTGCCCAGCAAAGAGAAGCAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCAGAGACAGTCTGTCTTAACACAGCTGCCCAGCAAAGAGAAGCAAA  200

seq1  CAGAAAGCCTCTTTGGGAAGACATCTGTTGCTCCCTTGGACAGGCCTTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAGCCTCTTTGGGAAGACATCTGTTGCTCCCTTGGACAGGCCTTGA  250

seq1  TTGTAGGCTTTTTTCCCCCTACTGGAGTAAGATACACACGTGTCATTAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAGGCTTTTTTCCCCCTACTGGAGTAAGATACACACGTGTCATTAAA  300

seq1  ATGTGCCAGTTTTATTTATTTTCTTAGCATTCTGTTTATGTATCCTCTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCCAGTTTTATTTATTTTCTTAGCATTCTGTTTATGTATCCTCTCT  350

seq1  CCCTCTTCTGTTTAAAGTTTGTTTTTAAGAAATTTGAGCATGTTTGGTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTTCTGTTTAAAGTTTGTTTTTAAGAAATTTGAGCATGTTTGGTCA  400

seq1  TCCTCCCCCCATCCCCCCTTCGCCCGTGTTAAATGTTGGGCTCTGTAGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCCCCCATCCCCCCTTCGCCCGTGTTAAATGTTGGGCTCTGTAGCA  450

seq1  TTTTAAGAATGCTCACATCGGTATGGAACTGTCAATCCAGCCTATGTCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAGAATGCTCACATCGGTATGGAACTGTCAATCCAGCCTATGTCCA  500

seq1  GAAGGCTTCCCTGTTTTCCAACGGAAGCTCTGTACCCCTTTAAACATCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGCTTCCCTGTTTTCCAACGGAAGCTCTGTACCCCTTTAAACATCAG  550

seq1  CTCTCCCTTTCCTTCCCACTGACCCCTGAAAAACCACCACTCTACTCTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCCTTTCCTTCCCACTGACCCCTGAAAAACCACCACTCTACTCTTT  600

seq1  GCCTTGATGAATCTGACTTTGGGAGGTGCTCATCCAGACTGGATCATTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGATGAATCTGACTTTGGGAGGTGCTCATCCAGACTGGATCATTTG  650

seq1  GTGACTGTTGCTTCATATGAACATCTTAAGGTTTACCCACATTTCAGTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTGTTGCTTCATATGAACATCTTAAGGTTTACCCACATTTCAGTCT  700

seq1  GTGGGACTCTTTTGAAGGCCAACTGTATTCTGTGGGTCAGTCTGTACTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGACTCTTTTGAAGGCCAACTGTATTCTGTGGGTCAGTCTGTACTGA  750

seq1  GCTCTGTTCATCCACTCTCAGATATCTGTGCTGTTTCATCCTCTGAGAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGTTCATCCACTCTCAGATATCTGTGCTGTTTCATCCTCTGAGAGA  800

seq1  AATGTGAATGAATCAGCGGGGTGGAAAATTTGTTCAAATCTGATTTCAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGAATGAATCAGCGGGGTGGAAAATTTGTTCAAATCTGATTTCAAT  850

seq1  TCTTTTGAAGTCGATGCCCAGAGGTGAAGCTATTGCGCAGTAATTCCAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTGAAGTCGATGCCCAGAGGTGAAGCTATTGCGCAGTAATTCCAAG  900

seq1  GTGTTTTGCCATTGTTGTTGTTTGTTT  927
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTTGCCATTGTTGTTGTTTGTTT  927

seq1: chr18_57480318_57481421
seq2: B6Ng01-190G04.g_64_1157 (reverse)

seq1  GCTGTGGAT-ACATGTCCTTTCATTCCAAAACTGCGGACTGCCCAGAGCT  49
      ||||||||| |||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGGATAACAT-TC--TTCAT--CAAAACTGCGGACTGCCCAGAGCT  45

seq1  ATTATGAAAGCCAGACATAGCATATAAAGTGATATTGCTGTTCAGAAAGG  99
      ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
seq2  ATTATGAA--GCAGACATAGCATATAAAGTGATA-TGCTG-TCAGAAAGG  91

seq1  GAATGGTTATTTCTGGCTGAGGGATCCTTTGGACAGCTAAGACCAGTCCT  149
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GAATGG-TATTTCTGGCTGAGGGATCCTTTGGACAGCTAAGACCAGT-CT  139

seq1  GAGCTGGTCACTTAAGGATGGATAGAGCTTGGGCATCTTAAAAAGATGCA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGGTCACTTAAGGATGGATAGAGCTTGGGCATCTTAAAAAGATGCA  189

seq1  AACAGGATACAGGAAGATGGCAAAAGACAGGCATAGACTGCTAGGATCTC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGATACAGGAAGATGGCAAAAGACAGGCATAGACTGCTAGGATCTC  239

seq1  CAACTCGGAGTATTTAGATCAATAGCTATAAATAGAAAGGAGTGGTGGCA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTCGGAGTATTTAGATCAATAGCTATAAATAGAAAGGAGTGGTGGCA  289

seq1  GAAATCTGTAGCTTCAAGAGCAATAGAAAAGAGTAGTGGCAGAAATCTGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCTGTAGCTTCAAGAGCAATAGAAAAGAGTAGTGGCAGAAATCTGT  339

seq1  AGTTTCAAGAGCAAAACAAAGTAGGAAAGCTTGGAGAGAAACAGGAAAGT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTCAAGAGCAAAACAAAGTAGGAAAGCTTGGAGAGAAACAGGAAAGT  389

seq1  CTAGAGTATGTCTCAGAGGAGCATGAGTGAGAGAGTATAACTGCAGAAGG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAGTATGTCTCAGAGGAGCATGAGTGAGAGAGTATAACTGCAGAAGG  439

seq1  CCAGGACCACAGCTCCAGGATGAGCTTTGAAATCAGCACTGTAGCTCTGG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACCACAGCTCCAGGATGAGCTTTGAAATCAGCACTGTAGCTCTGG  489

seq1  TTAACACTGGTCTTACAGAATAACTAGAGTGAAGGACACAGCGAGAATGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACACTGGTCTTACAGAATAACTAGAGTGAAGGACACAGCGAGAATGG  539

seq1  GGTTGGGAAGGTGGGACAGGGTGGAGTGAGGCGAGGGAGGAATGTAGCAG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGGGAAGGTGGGACAGGGTGGAGTGAGGCGAGGGAGGAATGTAGCAG  589

seq1  CAGCTCTGGCAGAGGAAGAGGAGACCCTGGAGCAGAGCAGAGGGAAGAAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTCTGGCAGAGGAAGAGGAGACCCTGGAGCAGAGCAGAGGGAAGAAG  639

seq1  AAGAGTTTCTAAAGTTTCCTGGTGAATCATTGGCTTGGTGACAATAGAGG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTTTCTAAAGTTTCCTGGTGAATCATTGGCTTGGTGACAATAGAGG  689

seq1  AAAAAGGTGCTATCAGAGCAGGTGTCCTGAGACTTAAGTTCTGAAACCTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGGTGCTATCAGAGCAGGTGTCCTGAGACTTAAGTTCTGAAACCTG  739

seq1  GCTTGAAGAACACTGGTAGACAGAAGGAATCTGTGAGTCAAAACTGACCT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGAAGAACACTGGTAGACAGAAGGAATCTGTGAGTCAAAACTGACCT  789

seq1  GAGCTATGGTCTACAGTAGACCCCCCAGAGATTCCCAATGCATACCCTGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTATGGTCTACAGTAGACCCCCCAGAGATTCCCAATGCATACCCTGA  839

seq1  CATGAGTAGCTTGAGCAAGCCCATCACCAACAAGACCTTCTAAGGGTGTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGTAGCTTGAGCAAGCCCATCACCAACAAGACCTTCTAAGGGTGTT  889

seq1  AATGGCATCTGAAAACCTAGGAAAGAACACTTAGAGGCGATACTAAAGCC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGCATCTGAAAACCTAGGAAAGAACACTTAGAGGCGATACTAAAGCC  939

seq1  AGCACTGAGGTGAGTGCACACAGTCAGACTTTGTACGTTTGGACCTTCTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACTGAGGTGAGTGCACACAGTCAGACTTTGTACGTTTGGACCTTCTT  989

seq1  CCTTCAATGTCTGAGCCAATTTGGCAAAGCAGCTTTCTCCTACTCTGTTG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCAATGTCTGAGCCAATTTGGCAAAGCAGCTTTCTCCTACTCTGTTG  1039

seq1  TTCTTTTGCTCCTTTCTTTCCCACTCTCCTTTGGACAGGCTTTCTCAAAG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTTGCTCCTTTCTTTCCCACTCTCCTTTGGACAGGCTTTCTCAAAG  1089

seq1  AATTC  1104
      |||||
seq2  AATTC  1094