BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-191N18
Chromosome18 (Build37)
Map Location 56,957,214 - 57,100,478
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMarch3
Upstream geneLOC667409, LOC629043, LOC100043099, LOC629057, LOC100043104, LOC676543, LOC667432, Gramd3, LOC667458, Aldh7a1, Rnuxa, 1700065I17Rik, LOC675171, Lmnb1
Downstream geneC330018D20Rik, Megf10, LOC672445, Prrc1, 1700011I03Rik, 4930511M06Rik, 2210409D07Rik, Slc12a2, 9330166H04Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-191N18.bB6Ng01-191N18.g
ACCGA015249GA015250
length1,1421,120
definitionB6Ng01-191N18.b B6Ng01-191N18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(56,957,214 - 56,958,365)(57,099,359 - 57,100,478)
sequence
gaattcaaagctggatcttgcaaatcctgtgccaagtcaaggaggccaat
ctcaaagggcgagcaagagccatgggctggaggtgcgggcagatgagctg
tgtgatgtctctctggggcgcagtggaaacattctaatattggctgtgga
gatggttattcagctctttggttacactgaatgccactgagttggtatga
tttaaatgtggggtttcatgacatgtgaattctacttcaatgtgcaaagc
tgtttaaaaaaaatggagactggaaaaatgctgtgtttaaaaacacctga
agccccctcctataggtttcctcatagaaacctccatcttgccagatgag
ccttgcaggtatgtcctgttaccttatcatccttcacctgatagggctgt
gttcagatgaacaccaggtatatcttacacatctggaaatgagttgtgac
aaatgagtgacttctggggttggatgctaaagccacataattaggaacat
aatggagccatctttactcttatctcttgaggcatttctcacactaccta
tgtgcaaacagcaagcctttggagggaggcaggcaggctagttagcaagt
gtctgtacattccatcttacacctttcatgacgatgtcactgccagggtc
tcctatgaatgatctcagcctttcccttcccggtcctgcaagatttgaat
ctcaacactgtttccatcttccagttgctactatcatccctgaaggtaaa
gtcccgacacaacactcactgagtgggaaacactgtttctcaatctgatg
ggcgtcttcacaggtcttacaggtttatacatcctcccaagtggcagagc
ataaaagcaaacttaatctttcagaattcagaaggaaggaaaaagcttaa
acacatttccctgtcttttgtgttattgtgttattcacacacaacacgcc
ttgtgttttctcacgtgccagcagagcaatctgaccctctactcggtgac
gacgggcaagggctatccaacagctcccagcttccctgcttttggagcga
gggcagctgtgcagtagagaagacagtgtagaatgcatgcatggttgaat
aacaggaaggtagttagcctgagactcagagacctggcaagg
gaattctagagttcttgattctggctgagcatcagacctctcccaactcc
taaccaagagcttttccaaggtacagataatctagcttccacccatcact
tacgagtctagaggctgagtaagggtgaggtattcatatgctcttcaaaa
tgtagagacatttctggtttgacaatgactatttcagaaccagccttcag
gtgagaaacttcatgttacatggagtgcaagccccctagtcctagcagta
cttagcttctcctgtgagtctgctaccaccaaggctacttcacgttcttt
ttatttggaaagagtttgtagtcatcttttattagctagagtcacatgcc
gggtgaccctgtacaaatcacataatccttttgtgtcttaaatttcctca
catgtaacctgtaggtggtaatgcctgcccaaccctaaaggggtactgtg
gggactaatgagggcctataaagcagtcaccaaacacgaaatggtccatg
catgcttattagacaggtatgaagtcctagtcacagccttttaaaatgag
gcaaataccaaaagaaacacttaagcaggccttcctgcaacctttatcat
catttgaaagctcctttcccaacatcaacctattccttctcggtaccaaa
acaaagaaacacaaactatggtcacaggaagacagtgcagtaaaaaaagt
gcagaaaggagccctgtaatctgtttgctcatctcttccatgtgacacaa
agaatatgtggtcaaagataccttcacttgtatttcacaatgagactagg
caagaatgaggaggcaggactccataccttgggaatctgggtaggtttta
taaatatgttggcccacaactcacagctcatttgtgtgtgtgttcagctt
tcttggaaaaacaagaagaaaacaagccttggattttaaatatttctaca
ttttgctttgaaaaggtcaaagtttaaagggtcagttccacttttacaac
ttatttagtccacaattgcatgattcctgtgactgtccactctagctaat
gtcagccctgaccttaaggagaagcccttctgaccactttgatcttggat
cccactcatacctcctggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_56957214_56958365
seq2: B6Ng01-191N18.b_50_1191

seq1  GAATTCAAAGCTGGATCTTGCAAATCCTGTGCCAAGTCAAGGAGGCCAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGCTGGATCTTGCAAATCCTGTGCCAAGTCAAGGAGGCCAAT  50

seq1  CTCAAAGGGCGAGCAAGAGCCATGGGCTGGAGGTGCGGGCAGATGAGCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAAGGGCGAGCAAGAGCCATGGGCTGGAGGTGCGGGCAGATGAGCTG  100

seq1  TGTGATGTCTCTCTGGGGCGCAGTGGAAACATTCTAATATTGGCTGTGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATGTCTCTCTGGGGCGCAGTGGAAACATTCTAATATTGGCTGTGGA  150

seq1  GATGGTTATTCAGCTCTTTGGTTACACTGAATGCCACTGAGTTGGTATGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTTATTCAGCTCTTTGGTTACACTGAATGCCACTGAGTTGGTATGA  200

seq1  TTTAAATGTGGGGTTTCATGACATGTGAATTCTACTTCAATGTGCAAAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATGTGGGGTTTCATGACATGTGAATTCTACTTCAATGTGCAAAGC  250

seq1  TGTTTAAAAAAAATGGAGACTGGAAAAATGCTGTGTTTAAAAACACCTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTAAAAAAAATGGAGACTGGAAAAATGCTGTGTTTAAAAACACCTGA  300

seq1  AGCCCCCTCCTATAGGTTTCCTCATAGAAACCTCCATCTTGCCAGATGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCCTCCTATAGGTTTCCTCATAGAAACCTCCATCTTGCCAGATGAG  350

seq1  CCTTGCAGGTATGTCCTGTTACCTTATCATCCTTCACCTGATAGGGCTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGCAGGTATGTCCTGTTACCTTATCATCCTTCACCTGATAGGGCTGT  400

seq1  GTTCAGATGAACACCAGGTATATCTTACACATCTGGAAATGAGTTGTGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAGATGAACACCAGGTATATCTTACACATCTGGAAATGAGTTGTGAC  450

seq1  AAATGAGTGACTTCTGGGGTTGGATGCTAAAGCCACATAATTAGGAACAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAGTGACTTCTGGGGTTGGATGCTAAAGCCACATAATTAGGAACAT  500

seq1  AATGGAGCCATCTTTACTCTTATCTCTTGAGGCATTTCTCACACTACCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAGCCATCTTTACTCTTATCTCTTGAGGCATTTCTCACACTACCTA  550

seq1  TGTGCAAACAGCAAGCCTTTGGAGGGAGGCAGGCAGGCTAGTTAGCAAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCAAACAGCAAGCCTTTGGAGGGAGGCAGGCAGGCTAGTTAGCAAGT  600

seq1  GTCTGTACATTCCATCTTACACCTTTCATGACGATGTCACTGCCAGGGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTACATTCCATCTTACACCTTTCATGACGATGTCACTGCCAGGGTC  650

seq1  TCCTATGAATGATCTCAGCCTTTCCCTTCCCGGTCCTGCAAGATTTGAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATGAATGATCTCAGCCTTTCCCTTCCCGGTCCTGCAAGATTTGAAT  700

seq1  CTCAACACTGTTTCCATCTTCCAGTTGCTACTATCATCCCTGAAGGTAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACACTGTTTCCATCTTCCAGTTGCTACTATCATCCCTGAAGGTAAA  750

seq1  GTCCCGACACAACACTCACTGAGTGGGAAACACTGTTTCTCAATCTGATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCGACACAACACTCACTGAGTGGGAAACACTGTTTCTCAATCTGATG  800

seq1  GGCGTCTTCACAGGTCTTACAGGTTTATACATCCTCCCAAGTGGCAGAGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGTCTTCACAGGTCTTACAGGTTTATACATCCTCCCAAGTGGCAGAGC  850

seq1  ATAAAAGCAAACTTAATCTTTCAGAATTCAGAAAGGAAGGAAAAAGCTTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAGCAAACTTAATCTTTCAGAATTCAG-AAGGAAGGAAAAAGCTTA  899

seq1  AACACATTTCCCTGTCTTTTGTGTTATTTGTGTTATTCACACACAACACG  950
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AACACATTTCCCTGTCTTTTGTGTTA-TTGTGTTATTCACACACAACACG  948

seq1  CCTTGTGTTTTTCTCACGTGCCAGCAGAGCAATCTGACCCTCTAACTCGG  1000
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CCTTGTG-TTTTCTCACGTGCCAGCAGAGCAATCTGACCCTCT-ACTCGG  996

seq1  TGACGACGGGCAAGGGCTATCCCAACAAGCTCCCAAGCTTCCCTGCTTTT  1050
      |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||
seq2  TGACGACGGGCAAGGGCTAT-CCAAC-AGCTCCC-AGCTTCCCTGCTTTT  1043

seq1  GGAGCGAGGGCAGCTGTGCAGTAGAGAAGACAAGTGTAGAAATGCATGCA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||
seq2  GGAGCGAGGGCAGCTGTGCAGTAGAGAAGAC-AGTGTAG-AATGCATGCA  1091

seq1  TGG-TGAATAACAGGAGGGAAGGTAAGGCTGAGGACCCAGAGACCTGGCA  1149
      ||| |||||||||||| || | || || |||| ||| |||||||||||||
seq2  TGGTTGAATAACAGGAAGGTA-GTTAGCCTGA-GACTCAGAGACCTGGCA  1139

seq1  AGG  1152
      |||
seq2  AGG  1142

seq1: chr18_57099359_57100478
seq2: B6Ng01-191N18.g_69_1188 (reverse)

seq1  TCCCAAGGAGGTATGAGTGGGAT-CAAGATC-AAGTGGCCCAGAAAGGGC  48
      |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||
seq2  TCCC-AGGAGGTATGAGTGGGATCCAAGATCAAAGTGG-TCAG-AAGGGC  47

seq1  TTTCTCCCTAAGGTTCAGGGCTGACATTAGCTAGAGTGGACAGTCACAGG  98
       |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TTCTCCTTAAGG-TCAGGGCTGACATTAGCTAGAGTGGACAGTCACAGG  95

seq1  AATCATGCAATTGTGGACTAAAT-AGTTGT-AAAGTGGACCTGACCCTTT  146
      ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||
seq2  AATCATGCAATTGTGGACTAAATAAGTTGTAAAAGTGGAACTGACCCTTT  145

seq1  AAACTTTGACCTTTTCAAAGCAAAATGTAGAAATATTTTAAAATCC-AGG  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
seq2  AAACTTTGACCTTTTCAAAGCAAAATGTAGAAATA-TTTAAAATCCAAGG  194

seq1  CTTGTTTTCTTCTTGTTTTTCCAAG-AAGCTGAACACACACACAAATGAG  244
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTTTCTTCTTGTTTTTCCAAGAAAGCTGAACACACACACAAATGAG  244

seq1  CTGTGAGTTGTGGGCCAACATATTTATAAAACCTACCCAGATTCCCAAGG  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAGTTGTGGGCCAACATATTTATAAAACCTACCCAGATTCCCAAGG  294

seq1  TATGGAGTCCTGCCTCCTCATTCTTGCCTAGTCTCATTGTGAAATACAAG  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAGTCCTGCCTCCTCATTCTTGCCTAGTCTCATTGTGAAATACAAG  344

seq1  TGAAGGTATCTTTGACCACATATTCTTTGTGTCACATGGAAGAGATGAGC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGTATCTTTGACCACATATTCTTTGTGTCACATGGAAGAGATGAGC  394

seq1  AAACAGATTACAGGGCTCCTTTCTGCACTTTTTTTACTGCACTGTCTTCC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGATTACAGGGCTCCTTTCTGCACTTTTTTTACTGCACTGTCTTCC  444

seq1  TGTGACCATAGTTTGTGTTTCTTTGTTTTGGTACCGAGAAGGAATAGGTT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACCATAGTTTGTGTTTCTTTGTTTTGGTACCGAGAAGGAATAGGTT  494

seq1  GATGTTGGGAAAGGAGCTTTCAAATGATGATAAAGGTTGCAGGAAGGCCT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTGGGAAAGGAGCTTTCAAATGATGATAAAGGTTGCAGGAAGGCCT  544

seq1  GCTTAAGTGTTTCTTTTGGTATTTGCCTCATTTTAAAAGGCTGTGACTAG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAAGTGTTTCTTTTGGTATTTGCCTCATTTTAAAAGGCTGTGACTAG  594

seq1  GACTTCATACCTGTCTAATAAGCATGCATGGACCATTTCGTGTTTGGTGA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCATACCTGTCTAATAAGCATGCATGGACCATTTCGTGTTTGGTGA  644

seq1  CTGCTTTATAGGCCCTCATTAGTCCCCACAGTACCCCTTTAGGGTTGGGC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTTATAGGCCCTCATTAGTCCCCACAGTACCCCTTTAGGGTTGGGC  694

seq1  AGGCATTACCACCTACAGGTTACATGTGAGGAAATTTAAGACACAAAAGG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATTACCACCTACAGGTTACATGTGAGGAAATTTAAGACACAAAAGG  744

seq1  ATTATGTGATTTGTACAGGGTCACCCGGCATGTGACTCTAGCTAATAAAA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGTGATTTGTACAGGGTCACCCGGCATGTGACTCTAGCTAATAAAA  794

seq1  GATGACTACAAACTCTTTCCAAATAAAAAGAACGTGAAGTAGCCTTGGTG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACTACAAACTCTTTCCAAATAAAAAGAACGTGAAGTAGCCTTGGTG  844

seq1  GTAGCAGACTCACAGGAGAAGCTAAGTACTGCTAGGACTAGGGGGCTTGC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCAGACTCACAGGAGAAGCTAAGTACTGCTAGGACTAGGGGGCTTGC  894

seq1  ACTCCATGTAACATGAAGTTTCTCACCTGAAGGCTGGTTCTGAAATAGTC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCATGTAACATGAAGTTTCTCACCTGAAGGCTGGTTCTGAAATAGTC  944

seq1  ATTGTCAAACCAGAAATGTCTCTACATTTTGAAGAGCATATGAATACCTC  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCAAACCAGAAATGTCTCTACATTTTGAAGAGCATATGAATACCTC  994

seq1  ACCCTTACTCAGCCTCTAGACTCGTAAGTGATGGGTGGAAGCTAGATTAT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTACTCAGCCTCTAGACTCGTAAGTGATGGGTGGAAGCTAGATTAT  1044

seq1  CTGTACCTTGGAAAAGCTCTTGGTTAGGAGTTGGGAGAGGTCTGATGCTC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTACCTTGGAAAAGCTCTTGGTTAGGAGTTGGGAGAGGTCTGATGCTC  1094

seq1  AGCCAGAATCAAGAACTCTAGAATTC  1120
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGAATCAAGAACTCTAGAATTC  1120