BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-194H05
Chromosome18 (Build37)
Map Location 75,660,829 - 75,789,965
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm672
Upstream geneMyo5b, Acaa2, LOC672799, Lipg, Rpl17, BC031181, Dym, LOC628356, EG667777, Smad7
Downstream geneZbtb7c, 4833419G08Rik, LOC668184, Smad2, LOC668188
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-194H05.bB6Ng01-194H05.g
ACCGA017140GA017141
length918791
definitionB6Ng01-194H05.b B6Ng01-194H05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,789,058 - 75,789,965)(75,660,829 - 75,661,618)
sequence
gaattcttattttctaatggattctgagtccccgaagtcacttcttaaaa
gttttccttggggccgaagagatggctcagaggttaaaagcattggctgc
tctttcagaggactggagttcagtcccctggtggtagctcatacattatc
tgtaactccagccccaagggacacagtgccctcttccagcttctgcaggc
accattcatcgtgtatacacatacacatgatcacacaaaatattcataca
cgtaagataattttttaattaaaaaatgctgtcctcactccatccttagt
taggagaaggacttggctttgctctgcgtgtgggaaattgagccatagac
ttggtaagcagtacagcactcactcttcctggccctggaggctcaccccg
cccactttcttcttgttcccagctgtaatggatagagtgtcgagtggtta
aggtatggagagagaattaggactcaatcttattagctcttggccctttt
taggggaggtggggatgctgtggtcggaaatgcttggcgcctctgatgtt
ggtaggcaatcaggttatattcatcagaacagcattcacaaccagccaaa
ccggggcacaaagatgttttaagataactcaaggtagcatttattttttc
gggcatggttgtaggctctgaaacaaagtgataaacagaaccagccatga
gctgtgccttgccagctcttgctttctggtaggaggatggaaaaataggg
gactagaaaagcaggcattggtatgaaggaagaaggagaaggaagccggg
gctgttggaaggaggcttggagggaagatcttaatggcacgagagtgagg
ttacttagaaagagtatcccatgcagtgggaatgacccaatgttgagctc
tggggtcaaggttgtata

gaattccaagctccatgatttcttgggctgataaactgagagtttccaaa
cactgctttgttaagaatgccttttaaaatgtccatccatcactccctag
aagcaaggcagtttagtgccaaggcagtaggagatctgtagtctcagagc
aagggtcagcccttcccagaaacagcggtgggtgagcctctgtacacgtc
taagaacagttttggttcgtatgctgatttgtggaaagccctctgctaag
gtactctcagctggtcctgcttgtgtggcctgagtggtactctgtatctg
actaggccacttgtagaagaaaaaaatattaactaagggcttagaactcc
agacaggtatctggccattgaatacatatacatacatacatatatgtgtg
tgtatgtgtatgatattacattaacctggagtgtgctaagaagtcagacc
cagacatgggaagtagcaaccaggcaaagcccctagttccacttctgccc
actggccctctacatctggggttgcaggcttatattcctcttcaggaata
taagtatcagccttatttataagacacaggggatcaaggtgcctatgtgg
ctggatcagctcagcctggaggatcagaagacaggacccaagcccctagg
ccaggctgggctgcccttttatgctgtatcagctgcagcttctcagagcc
gggacatctgacccatggtcctgtggatgccctatggtacaggatctggg
ccagggaagggcaagctattgcaaggccccttggggtaggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_75789058_75789965
seq2: B6Ng01-194H05.b_42_949 (reverse)

seq1  TGACCCCAGAGCTCAGC-TTTGGTCATTCCCACTGCATGGGATACTCTTT  49
      ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TGACCCCAGAGCTCAACATTGGGTCATTCCCACTGCATGGGATACTC-TT  49

seq1  TCTAAGTAACCTCACTCTCGTGGCCTTCAGATCTTCCCTCCAAGGCCTCC  99
      |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||
seq2  TCTAAGTAACCTCACTCTCGTGCCATTAAGATCTTCCCTCCAA-GCCTCC  98

seq1  TTCCAACAGCCCCGGCTTCCTTCTCCTTCTTCCTTCATACCAATGCCTGC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAACAGCCCCGGCTTCCTTCTCCTTCTTCCTTCATACCAATGCCTGC  148

seq1  -TTTCTAGTCCCCTA-TTTTCCATCCTTCCTACCAGAAAGCAAGAGCTGG  197
       |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTAGTCCCCTATTTTTCCATCC-TCCTACCAGAAAGCAAGAGCTGG  197

seq1  CAAGGCACAGCTCATGGCTGGTTCTGTTTATCACTTTGTTTCAGAGCCTA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGCACAGCTCATGGCTGGTTCTGTTTATCACTTTGTTTCAGAGCCTA  247

seq1  CAACCATGCCCGAAAAAATAAATGCTACCTTGAGTTATCTTAAAACATCT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCATGCCCGAAAAAATAAATGCTACCTTGAGTTATCTTAAAACATCT  297

seq1  TTGTGCCCCGGTTTGGCTGGTTGTGAATGCTGTTCTGATGAATATAACCT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGCCCCGGTTTGGCTGGTTGTGAATGCTGTTCTGATGAATATAACCT  347

seq1  GATTGCCTACCAACATCAGAGGCGCCAAGCATTTCCGACCACAGCATCCC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGCCTACCAACATCAGAGGCGCCAAGCATTTCCGACCACAGCATCCC  397

seq1  CACCTCCCCTAAAAAGGGCCAAGAGCTAATAAGATTGAGTCCTAATTCTC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTCCCCTAAAAAGGGCCAAGAGCTAATAAGATTGAGTCCTAATTCTC  447

seq1  TCTCCATACCTTAACCACTCGACACTCTATCCATTACAGCTGGGAACAAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCATACCTTAACCACTCGACACTCTATCCATTACAGCTGGGAACAAG  497

seq1  AAGAAAGTGGGCGGGGTGAGCCTCCAGGGCCAGGAAGAGTGAGTGCTGTA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAGTGGGCGGGGTGAGCCTCCAGGGCCAGGAAGAGTGAGTGCTGTA  547

seq1  CTGCTTACCAAGTCTATGGCTCAATTTCCCACACGCAGAGCAAAGCCAAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTACCAAGTCTATGGCTCAATTTCCCACACGCAGAGCAAAGCCAAG  597

seq1  TCCTTCTCCTAACTAAGGATGGAGTGAGGACAGCATTTTTTAATTAAAAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCTCCTAACTAAGGATGGAGTGAGGACAGCATTTTTTAATTAAAAA  647

seq1  ATTATCTTACGTGTATGAATATTTTGTGTGATCATGTGTATGTGTATACA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCTTACGTGTATGAATATTTTGTGTGATCATGTGTATGTGTATACA  697

seq1  CGATGAATGGTGCCTGCAGAAGCTGGAAGAGGGCACTGTGTCCCTTGGGG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATGAATGGTGCCTGCAGAAGCTGGAAGAGGGCACTGTGTCCCTTGGGG  747

seq1  CTGGAGTTACAGATAATGTATGAGCTACCACCAGGGGACTGAACTCCAGT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGTTACAGATAATGTATGAGCTACCACCAGGGGACTGAACTCCAGT  797

seq1  CCTCTGAAAGAGCAGCCAATGCTTTTAACCTCTGAGCCATCTCTTCGGCC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGAAAGAGCAGCCAATGCTTTTAACCTCTGAGCCATCTCTTCGGCC  847

seq1  CCAAGGAAAACTTTTAAGAAGTGACTTCGGGGACTCAGAATCCATTAGAA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGAAAACTTTTAAGAAGTGACTTCGGGGACTCAGAATCCATTAGAA  897

seq1  AATAAGAATTC  908
      |||||||||||
seq2  AATAAGAATTC  908


seq1: chr18_75660829_75661618
seq2: B6Ng01-194H05.g_69_859

seq1  GAATTCCAAGCTCCATGATTTCTTGGGCTGATAAACTGAGAGTTTCCAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGCTCCATGATTTCTTGGGCTGATAAACTGAGAGTTTCCAAA  50

seq1  CACTGCTTTGTTAAGAATGCCTTTTAAAATGTCCATCCATCACTCCCTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGCTTTGTTAAGAATGCCTTTTAAAATGTCCATCCATCACTCCCTAG  100

seq1  AAGCAAGGCAGTTTAGTGCCAAGGCAGTAGGAGATCTGTAGTCTCAGAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAGGCAGTTTAGTGCCAAGGCAGTAGGAGATCTGTAGTCTCAGAGC  150

seq1  AAGGGTCAGCCCTTCCCAGAAACAGCGGTGGGTGAGCCTCTGTACACGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTCAGCCCTTCCCAGAAACAGCGGTGGGTGAGCCTCTGTACACGTC  200

seq1  TAAGAACAGTTTTGGTTCGTATGCTGATTTGTGGAAAGCCCTCTGCTAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAACAGTTTTGGTTCGTATGCTGATTTGTGGAAAGCCCTCTGCTAAG  250

seq1  GTACTCTCAGCTGGTCCTGCTTGTGTGGCCTGAGTGGTACTCTGTATCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTCTCAGCTGGTCCTGCTTGTGTGGCCTGAGTGGTACTCTGTATCTG  300

seq1  ACTAGGCCACTTGTAGAAGAAAAAAATATTAACTAAGGGCTTAGAACTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGGCCACTTGTAGAAGAAAAAAATATTAACTAAGGGCTTAGAACTCC  350

seq1  AGACAGGTATCTGGCCATTGAATACATATACATACATACATATATGTGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGGTATCTGGCCATTGAATACATATACATACATACATATATGTGTG  400

seq1  TGTATGTGTATGATATTACATTAACCTGGAGTGTGCTAAGAAGTCAGACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTGTATGATATTACATTAACCTGGAGTGTGCTAAGAAGTCAGACC  450

seq1  CAGACATGGGAAGTAGCAACCAGGCAAAGCCCCTAGTTCCACTTCTGCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACATGGGAAGTAGCAACCAGGCAAAGCCCCTAGTTCCACTTCTGCCC  500

seq1  ACTGGCCCTCTACATCTGGGGTTGCAGGCTTATATTCCTCTTCAGGAATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCCCTCTACATCTGGGGTTGCAGGCTTATATTCCTCTTCAGGAATA  550

seq1  TAAGTATCAGCCTTATTTATAAGACACAGGGGATCAAGGTGCCTATGTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTATCAGCCTTATTTATAAGACACAGGGGATCAAGGTGCCTATGTGG  600

seq1  CTGGATCAGCTCAGCCTGGAGGATCAGAAGACAGGACCCAAGCCCCTAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATCAGCTCAGCCTGGAGGATCAGAAGACAGGACCCAAGCCCCTAGG  650

seq1  CCAGGCTGGGCTGCCCTTTTATGCTGTATCAGCTGCAGCTTCTCAGAGCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCTGGGCTGCCCTTTTATGCTGTATCAGCTGCAGCTTCTCAGAGCC  700

seq1  GGGACATCTGACCCATGGTCCTGTGGATGCCCTATGGTACAGGATCTGGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACATCTGACCCATGGTCCTGTGGATGCCCTATGGTACAGGATCTGGG  750

seq1  CCAGGGAAGGGCAAGCTATTGCAAGGCCCC-TGGGGTAGGT  790
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CCAGGGAAGGGCAAGCTATTGCAAGGCCCCTTGGGGTAGGT  791


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |