BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-205P17
Chromosome18 (Build37)
Map Location 23,623,568 - 23,714,697
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDtna
Upstream geneAsxl3, Nol4, LOC100040579, LOC665797
Downstream geneMapre2, EG665813, LOC100040623, Zfp397, C230097I24Rik, Zfp35, Zfp191, D030070L09Rik, Galnt1, LOC665586, 2700062C07Rik, BC021395
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-205P17.bB6Ng01-205P17.g
ACCGA025518GA025519
length1,1771,129
definitionB6Ng01-205P17.b B6Ng01-205P17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(23,623,568 - 23,624,736)(23,713,564 - 23,714,697)
sequence
gaattccttcctttcttcaagctactgcaggagccatgctctctgcaatt
gatttatagtttttatacagtgactatatccatgaacaactctccaccaa
gaatgaaacttctgcctggctatttattttttgaccatgatcataataac
taaaaccagaagttcatattaaaatgaatgaaagaaaattaaggatagga
ggtagatgactttggagccccaaattgacttcttttcttctttaggactc
ccaagtcttcaaggtatgtgttgaagaacatgaaagaaacaagtggggtg
gctccagaccaaactaaagcaagaaaaattagggcacataccacaggaca
ggagctgggtggacatgggaaggcagtgggggacgtctgggcagtaaaca
ggggcaggagaacaactgagtagcagtgacatagtctattcaaaacagca
cagtcaagcaaacctagaactgtgacttctcactgattgtagccaaatca
ggttcagactttactattaggaaacttcttattagaactgctatctagct
cagtgtgtatgacgcttacgcaccataagcaaacctttctcaggagcacc
caacctaaaacagacctggaacgtttagcaagttgcaccaagccatttcc
acaaagctcactgtgtccttttctatgtgcaggaaggagataaataggtc
tttgcatcttaacagcagcctttgcttctcagtgaagtggctggaattaa
gtgagctgtggggcatactcctttgtgctgggacctagagctgtctattg
gcagttcaagatggctgcctgcactgggttggctgagatgcctggagtct
ctgagttagcacagtaagtggaatgctgaagtctgttagtatgtcagtgt
ctactattaccttcaattttaatttaatttattattttcgagagagagcc
agagaagacacagggaagaggagaacagtgtgtgtcctctatgggcatgc
atgtgagtttcaaaaagacaattttctggggtagttcttccccttccacc
atttagttcagagattgatagtaggccaccaaggccttaaggtgacagca
tgcttcacttactggagcaatctcactgatactcaaggtctcactcttaa
tggttgtcttaacaatgctcattcatg
gaattcttgtgtgtgtacgtatgtgcatgaatgcatgtgaatgtgtgagt
gcgtgtacacacaaacacaagctttaaaagatcatgtgaataagggagct
ggagaaatgtctcagtggtgacaagcacttgctcttcttgttcaggatcc
aggacctacatggctgctcaggacttcattctaggagcttgaatgacctt
ctctggcctctacaggcatcaatacacacatggttcacatatacatgcac
atgaataaaaatgatacatctctaaaagtaaatgaaataattttggataa
atggtcattatgttttaattggcacgtgcaaaagttctgggcacagctcg
ctatgatgatgcaactttaggagtgtatttaatggaagtaatgggtaccc
ttaaaatggctttaatggtaaattttatgttacatagtttagaacaattt
aaagacatccatgagatatatttatgctgtgttaaagtaataatgaggtg
gagataattaataccacacttcactgaaccttcgccaaacaaaaaataat
gcaataatttgcctgaacacattagctcttacttttaaggcaataaagca
gctggtttcaagggtatgtacacttttatggtttaccgtatccatccata
tcttctgtagtgacatgtatacattgagctttagtgagcacttaggattc
agtcaaatcctgacatttctcagcgcatgggaaaaggatcaaagtttgct
attgaaccttcatctcaaaatctcaaagacccacagggctttctctgtaa
ggggaatgtaacctattcttccattctttggcttcatataaggaccagag
ctcacttacacacatggagattaacctgacaactttgaaaaccctgtcac
aagaaaattaaagtcgaaaacagaatttgagttaccaagtcttgaggtaa
acctagaagagattgacaaatatttcttcagatttttatgtgatttgagc
atgccagtgttattgctgtgagccagaaatggtgtttgagtcttcttgga
gcagaattgcagcaacgcaggttgttggttctgatcagaccaggaagcca
acctctcacctctaataacaccttcgcat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_23623568_23624736
seq2: B6Ng01-205P17.b_47_1223

seq1  GAATTCCTTCCTTTCTTCAAGCTACTGCAGGAGCCATGCTCTCTGCAATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCCTTTCTTCAAGCTACTGCAGGAGCCATGCTCTCTGCAATT  50

seq1  GATTTATAGTTTTTATACAGTGACTATATCCATGAACAACTCTCCACCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTATAGTTTTTATACAGTGACTATATCCATGAACAACTCTCCACCAA  100

seq1  GAATGAAACTTCTGCCTGGCTATTTATTTTTTGACCATGATCATAATAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAAACTTCTGCCTGGCTATTTATTTTTTGACCATGATCATAATAAC  150

seq1  TAAAACCAGAAGTTCATATTAAAATGAATGAAAGAAAATTAAGGATAGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACCAGAAGTTCATATTAAAATGAATGAAAGAAAATTAAGGATAGGA  200

seq1  GGTAGATGACTTTGGAGCCCCAAATTGACTTCTTTTCTTCTTTAGGACTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGATGACTTTGGAGCCCCAAATTGACTTCTTTTCTTCTTTAGGACTC  250

seq1  CCAAGTCTTCAAGGTATGTGTTGAAGAACATGAAAGAAACAAGTGGGGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTCTTCAAGGTATGTGTTGAAGAACATGAAAGAAACAAGTGGGGTG  300

seq1  GCTCCAGACCAAACTAAAGCAAGAAAAATTAGGGCACATACCACAGGACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCAGACCAAACTAAAGCAAGAAAAATTAGGGCACATACCACAGGACA  350

seq1  GGAGCTGGGTGGACATGGGAAGGCAGTGGGGGACGTCTGGGCAGTAAACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTGGGTGGACATGGGAAGGCAGTGGGGGACGTCTGGGCAGTAAACA  400

seq1  GGGGCAGGAGAACAACTGAGTAGCAGTGACATAGTCTATTCAAAACAGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCAGGAGAACAACTGAGTAGCAGTGACATAGTCTATTCAAAACAGCA  450

seq1  CAGTCAAGCAAACCTAGAACTGTGACTTCTCACTGATTGTAGCCAAATCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCAAGCAAACCTAGAACTGTGACTTCTCACTGATTGTAGCCAAATCA  500

seq1  GGTTCAGACTTTACTATTAGGAAACTTCTTATTAGAACTGCTATCTAGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCAGACTTTACTATTAGGAAACTTCTTATTAGAACTGCTATCTAGCT  550

seq1  CAGTGTGTATGACGCTTACGCACCATAAGCAAACCTTTCTCAGGAGCACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTGTATGACGCTTACGCACCATAAGCAAACCTTTCTCAGGAGCACC  600

seq1  CAACCTAAAACAGACCTGGAACGTTTAGCAAGTTGCACCAAGCCATTTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCTAAAACAGACCTGGAACGTTTAGCAAGTTGCACCAAGCCATTTCC  650

seq1  ACAAAGCTCACTGTGTCCTTTTCTATGTGCAGGAAGGAGATAAATAGGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGCTCACTGTGTCCTTTTCTATGTGCAGGAAGGAGATAAATAGGTC  700

seq1  TTTGCATCTTAACAGCAGCCTTTGCTTCTCAGTGAAGTGGCTGGAATTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCATCTTAACAGCAGCCTTTGCTTCTCAGTGAAGTGGCTGGAATTAA  750

seq1  GTGAGCTGTGGGGCATACTCCTTTGTGCTGGGACCTAGAGCTGTCTATTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGCTGTGGGGCATACTCCTTTGTGCTGGGACCTAGAGCTGTCTATTG  800

seq1  GCAGTTCAAGATGGCTGCCTGCACTGGGTTGGCTGAGATGCCTGGAGTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTTCAAGATGGCTGCCTGCACTGGGTTGGCTGAGATGCCTGGAGTCT  850

seq1  CTGAGTTAGCACAGTAAGTGGAATGCTGAAGTCTGTTAGTATGTCAGTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTTAGCACAGTAAGTGGAATGCTGAAGTCTGTTAGTATGTCAGTGT  900

seq1  CTACTATTACCTTCAATTTTAATTTAATTTATTATTTTCGAGAGAGAGCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CTACTATTACCTTCAATTTTAATTTAATTTATTATTTTCGAGAGAGAGCC  950

seq1  AGAGAAGACACAGGGAAGA-GAG-ACAGTGTGTGTCCTCTAT-GGCATGC  997
      ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||
seq2  AGAGAAGACACAGGGAAGAGGAGAACAGTGTGTGTCCTCTATGGGCATGC  1000

seq1  ATGTGAGTTTC-AAAAGACAATTTTCTGGGGTTAGTTCTT-CCCTTCCAC  1045
      ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
seq2  ATGTGAGTTTCAAAAAGACAATTTTCTGGGG-TAGTTCTTCCCCTTCCAC  1049

seq1  CA-TTAGTTCCAGAGATTGATAGTAGGCCACC-AGGC--TTAGGTGACAG  1091
      || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||
seq2  CATTTAGTT-CAGAGATTGATAGTAGGCCACCAAGGCCTTAAGGTGACAG  1098

seq1  CATGC-TCACCTACT-GAGCCATCTCACTGATACTC-AGGGCTCACTCTT  1138
      ||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||
seq2  CATGCTTCACTTACTGGAGCAATCTCACTGATACTCAAGGTCTCACTCTT  1148

seq1  -ATGGTTGTTCTTAACCTATCCCACATTCATG  1169
       ||||||| |||||||  |   | ||||||||
seq2  AATGGTTG-TCTTAAC--AATGCTCATTCATG  1177

seq1: chr18_23713564_23714697
seq2: B6Ng01-205P17.g_68_1196 (reverse)

seq1  ATGCGAAGTGTTTATTAGAGTTGAGAGG-TGGCTTCCTGGTCTTGATACC  49
      ||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  |
seq2  ATGCGAAGGTGTTATTAGAGGTGAGAGGTTGGCTTCCTGGTC-TGAT--C  47

seq1  AGGACCAACAAACACTGCG-TGCTGCAATTCCTGCTCCAAG-AGACTCAA  97
      || ||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||
seq2  AGAACCAACAA--CCTGCGTTGCTGCAATT-CTGCTCCAAGAAGACTCAA  94

seq1  CACCCTTTTCTGGCCTCAACCAGCAAT-ACACTTGCATGCTCAAATCCAC  146
         || ||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||| |||
seq2  ACACCATTTCTGG-CTCA--CAGCAATAACACTGGCATGCTCAAAT-CAC  140

seq1  AT-AAAATCTGAAGAAAATATTTGTCAATCTCTTCTAGGTTTACCTCAAG  195
      || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAATCTGAAG-AAATATTTGTCAATCTCTTCTAGGTTTACCTCAAG  189

seq1  ACTTGGTAACTCAAATTCTGTTTTCGACTTTAATTTTCTTGTGACAGGGT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGTAACTCAAATTCTGTTTTCGACTTTAATTTTCTTGTGACAGGGT  239

seq1  TTTCAAAGTTGTCAGGTTAATCTCCATGTGTGTAAGTGAGCTCTGGTCCT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAAGTTGTCAGGTTAATCTCCATGTGTGTAAGTGAGCTCTGGTCCT  289

seq1  TATATGAAGCC-AAGAATGGAAGAATAGGTTACATTCCCCTTACAGAGAA  344
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGAAGCCAAAGAATGGAAGAATAGGTTACATTCCCCTTACAGAGAA  339

seq1  AGCCCTGTGGGTCTTTGAGATTTTGAGATGAAGGTTCAATAGCAAACTTT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTGTGGGTCTTTGAGATTTTGAGATGAAGGTTCAATAGCAAACTTT  389

seq1  GATCCTTTTCCCATGCGCTGAGAAATGTCAGGATTTGACTGAATCCTAAG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCTTTTCCCATGCGCTGAGAAATGTCAGGATTTGACTGAATCCTAAG  439

seq1  TGCTCACTAAAGCTCAATGTATACATGTCACTACAGAAGATATGGATGGA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCACTAAAGCTCAATGTATACATGTCACTACAGAAGATATGGATGGA  489

seq1  TACGGTAAACCATAAAAGTGTACATACCCTTGAAACCAGCTGCTTTATTG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGGTAAACCATAAAAGTGTACATACCCTTGAAACCAGCTGCTTTATTG  539

seq1  CCTTAAAAGTAAGAGCTAATGTGTTCAGGCAAATTATTGCATTATTTTTT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAAAAGTAAGAGCTAATGTGTTCAGGCAAATTATTGCATTATTTTTT  589

seq1  GTTTGGCGAAGGTTCAGTGAAGTGTGGTATTAATTATCTCCACCTCATTA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGCGAAGGTTCAGTGAAGTGTGGTATTAATTATCTCCACCTCATTA  639

seq1  TTACTTTAACACAGCATAAATATATCTCATGGATGTCTTTAAATTGTTCT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTTTAACACAGCATAAATATATCTCATGGATGTCTTTAAATTGTTCT  689

seq1  AAACTATGTAACATAAAATTTACCATTAAAGCCATTTTAAGGGTACCCAT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTATGTAACATAAAATTTACCATTAAAGCCATTTTAAGGGTACCCAT  739

seq1  TACTTCCATTAAATACACTCCTAAAGTTGCATCATCATAGCGAGCTGTGC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCCATTAAATACACTCCTAAAGTTGCATCATCATAGCGAGCTGTGC  789

seq1  CCAGAACTTTTGCACGTGCCAATTAAAACATAATGACCATTTATCCAAAA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAACTTTTGCACGTGCCAATTAAAACATAATGACCATTTATCCAAAA  839

seq1  TTATTTCATTTACTTTTAGAGATGTATCATTTTTATTCATGTGCATGTAT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTCATTTACTTTTAGAGATGTATCATTTTTATTCATGTGCATGTAT  889

seq1  ATGTGAACCATGTGTGTATTGATGCCTGTAGAGGCCAGAGAAGGTCATTC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGAACCATGTGTGTATTGATGCCTGTAGAGGCCAGAGAAGGTCATTC  939

seq1  AAGCTCCTAGAATGAAGTCCTGAGCAGCCATGTAGGTCCTGGATCCTGAA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCCTAGAATGAAGTCCTGAGCAGCCATGTAGGTCCTGGATCCTGAA  989

seq1  CAAGAAGAGCAAGTGCTTGTCACCACTGAGACATTTCTCCAGCTCCCTTA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAAGAGCAAGTGCTTGTCACCACTGAGACATTTCTCCAGCTCCCTTA  1039

seq1  TTCACATGATCTTTTAAAGCTTGTGTTTGTGTGTACACGCACTCACACAT  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACATGATCTTTTAAAGCTTGTGTTTGTGTGTACACGCACTCACACAT  1089

seq1  TCACATGCATTCATGCACATACGTACACACACAAGAATTC  1134
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATGCATTCATGCACATACGTACACACACAAGAATTC  1129