BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-224M06
Chromosome18 (Build37)
Map Location 73,205,634 - 73,333,616
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042955
Upstream geneDcc, LOC629684, LOC100043411
Downstream geneRkhd2, Smad4, Elac1, Me2, Mro, Mapk4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-224M06.bB6Ng01-224M06.g
ACCGA039133GA039134
length1,057925
definitionB6Ng01-224M06.b B6Ng01-224M06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,332,559 - 73,333,616)(73,205,634 - 73,206,554)
sequence
gaattcttttttttttttggagcatctaacagagtacagatgtcatcaca
gcatctagtctcaaatgtctgagttcagctggcccatttggcttcatgat
tcactttatcataggcagatgccataattgaactcaaagtataaatttta
attagcaaaaattttacaatttgtctgttttccattttggtgttccaact
aagatttcatttgcaagttcaacgtgaagaacagttgcaacaagagtgga
agggaagagagcagttgactatttgtgttcgggtataccactgcatttgt
ccgattggatagattgatccttatttttatctgctgtgttgttagggatt
acgactatgctaagatagtgatcggccatggtgctacatccctaagcctt
aaatatatcaaactactcttagttgctatcaccacactgaggtcctagag
gtcaaagctcagtagtgcagactcagcagggatttcattttcacaaaagg
aaccaaaattcagttggctacccaggctgggaagcacactgacatccttg
aattatatctctcaaacttcccgtgtgtctgatcatcagatcagttaagt
ctccctctgcaagactctctatcccaatgatcttactcaccatgactcca
actctagttccacttcttgcccatgattatttcaaaatagaatagtgagg
atagttttattaacaacataaagggtgctagaacgtctttacttgttagc
ttctctatggctttactgtttgaaatgagttctgttccttgtgtgtctga
tctggcacctgatatgtctcagtaccattgtgttctgtgttctgcctgcc
acccatccagcccttccgtgctcctgcacacacggatggcatttccttct
tagtatcagtgcacataccgcttctcttccaatttctgctgtaagtacct
caagaagttcttccccatgactctgtgtatgcgtgtgtgagcaccctaac
gtttgtgtgtgcatgcctgcactcatgagtgtatggaggccagggtcatt
tctctgg
gaattctctttctctctggcctttagatgctgaggcagagacaatgaagc
agagaagatgttgaagcagagatgataaaggcagagaaaacgctgaggca
gagacgacactgaggcagaggtactaagccagattgtctttgctaagagt
aaagtacaaagttattatagaactaggaaatgggggatatttttcacaga
agacacagctgaagcatcatctccttaagacgacaaggtgactggcacag
caagataacttgcatacagcaagtaaatcactgactgtcaacgtcagcca
tctacacttaggactgtagagacactgagagaaaagtgctgaagtgactg
agctgggagtatttaaggagtacgggaaccaagagaacgtgacttaaagt
tcactgagctcccacattgaagggtagtatttatgcttcattctctagtt
cagaacatgtttttaaggtgcccctgttatctcattattgtgtatcttat
gctaattttacccagtaaatactgtataaactctgagttaagctggtatc
gactgtgccaagtacacaagcaccatttgaagaagtgagtatatctctac
cttggtggaataaaagaactaactctagtatatacaaaggttataaagga
cctcggtgaaaccttgcctgatgcctcttctgcttctctaaacaacgaat
gtgtgtggtggcttgagtaagaatggctcctataagctcatatctttgaa
tgcttagacatcagggagtggcactatttgagaaggattgggaggtgtgg
ctgtgttggaataagtgtggccttggggatgtgtgtacctggggatgaac
tctggaggtctgaaaagtctgtgcaatacccatttttgcttttttgcttt
ttgcttctctcctctctcttccccc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_73332559_73333616
seq2: B6Ng01-224M06.b_49_1105 (reverse)

seq1  CCAGAGAAATGACCCCCCTGGCCTCCATACACTCATGAGTGCAGGCATGC  50
      ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGAAATGA---CCCTGGCCTCCATACACTCATGAGTGCAGGCATGC  47

seq1  ACACACAAACGTTAGGGTGCTCACACACGCATACACAGAGTCATGGGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACAAACGTTAGGGTGCTCACACACGCATACACAGAGTCATGGGGAA  97

seq1  GAAC-TCTTGAGGTACTTACAGCAGAAAT--GGAGAGAAGCGGTATGTGC  147
      |||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||
seq2  GAACTTCTTGAGGTACTTACAGCAGAAATTGGAAGAGAAGCGGTATGTGC  147

seq1  ACTGATACTAAGAAGGAAATGCCATCCGTGTGTGCAGGGAGCACGGAAGG  197
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  ACTGATACTAAGAAGGAAATGCCATCCGTGTGTGCA-GGAGCACGGAAGG  196

seq1  GCTGGATGGGTGGCAGGCAGAACACAGAACACAATGGTACTGAGACATAT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGATGGGTGGCAGGCAGAACACAGAACACAATGGTACTGAGACATAT  246

seq1  CAGGTGCCAGATCAGACACACAAGGAACAGAACTCATTTCAAACAGTAAA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGCCAGATCAGACACACAAGGAACAGAACTCATTTCAAACAGTAAA  296

seq1  GCCATAGAGAAGCTAACAAGTAAAGACGTTCTAGCACCCTTTATGTTGTT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATAGAGAAGCTAACAAGTAAAGACGTTCTAGCACCCTTTATGTTGTT  346

seq1  AATAAAACTATCCTCACTATTCTATTTTGAAATAATCATGGGCAAGAAGT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAACTATCCTCACTATTCTATTTTGAAATAATCATGGGCAAGAAGT  396

seq1  GGAACTAGAGTTGGAGTCATGGTGAGTAAGATCATTGGGATAGAGAGTCT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACTAGAGTTGGAGTCATGGTGAGTAAGATCATTGGGATAGAGAGTCT  446

seq1  TGCAGAGGGAGACTTAACTGATCTGATGATCAGACACACGGGAAGTTTGA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGAGGGAGACTTAACTGATCTGATGATCAGACACACGGGAAGTTTGA  496

seq1  GAGATATAATTCAAGGATGTCAGTGTGCTTCCCAGCCTGGGTAGCCAACT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATATAATTCAAGGATGTCAGTGTGCTTCCCAGCCTGGGTAGCCAACT  546

seq1  GAATTTTGGTTCCTTTTGTGAAAATGAAATCCCTGCTGAGTCTGCACTAC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTTGGTTCCTTTTGTGAAAATGAAATCCCTGCTGAGTCTGCACTAC  596

seq1  TGAGCTTTGACCTCTAGGACCTCAGTGTGGTGATAGCAACTAAGAGTAGT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTTTGACCTCTAGGACCTCAGTGTGGTGATAGCAACTAAGAGTAGT  646

seq1  TTGATATATTTAAGGCTTAGGGATGTAGCACCATGGCCGATCACTATCTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATATATTTAAGGCTTAGGGATGTAGCACCATGGCCGATCACTATCTT  696

seq1  AGCATAGTCGTAATCCCTAACAACACAGCAGATAAAAATAAGGATCAATC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATAGTCGTAATCCCTAACAACACAGCAGATAAAAATAAGGATCAATC  746

seq1  TATCCAATCGGACAAATGCAGTGGTATACCCGAACACAAATAGTCAACTG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCAATCGGACAAATGCAGTGGTATACCCGAACACAAATAGTCAACTG  796

seq1  CTCTCTTCCCTTCCACTCTTGTTGCAACTGTTCTTCACGTTGAACTTGCA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTTCCCTTCCACTCTTGTTGCAACTGTTCTTCACGTTGAACTTGCA  846

seq1  AATGAAATCTTAGTTGGAACACCAAAATGGAAAACAGACAAATTGTAAAA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAATCTTAGTTGGAACACCAAAATGGAAAACAGACAAATTGTAAAA  896

seq1  TTTTTGCTAATTAAAATTTATACTTTGAGTTCAATTATGGCATCTGCCTA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGCTAATTAAAATTTATACTTTGAGTTCAATTATGGCATCTGCCTA  946

seq1  TGATAAAGTGAATCATGAAGCCAAATGGGCCAGCTGAACTCAGACATTTG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAAAGTGAATCATGAAGCCAAATGGGCCAGCTGAACTCAGACATTTG  996

seq1  AGACTAGATGCTGTGATGACATCTGTACTCTGTTAGATGCTCCAAAAAAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTAGATGCTGTGATGACATCTGTACTCTGTTAGATGCTCCAAAAAAA  1046

seq1  AAAAAGAATTC  1058
      |||||||||||
seq2  AAAAAGAATTC  1057

seq1: chr18_73205634_73206554
seq2: B6Ng01-224M06.g_70_994

seq1  GAATTCTCTTTCTCTCTGGCCTTTAGATGCTGAGGCAGAGACAATGAAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTTCTCTCTGGCCTTTAGATGCTGAGGCAGAGACAATGAAGC  50

seq1  AGAGAAGATGTTGAAGCAGAGATGATAAAGGCAGAGAAAACGCTGAGGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAGATGTTGAAGCAGAGATGATAAAGGCAGAGAAAACGCTGAGGCA  100

seq1  GAGACGACACTGAGGCAGAGGTACTAAGCCAGATTGTCTTTGCTAAGAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACGACACTGAGGCAGAGGTACTAAGCCAGATTGTCTTTGCTAAGAGT  150

seq1  AAAGTACAAAGTTATTATAGAACTAGGAAATGGGGGATATTTTTCACAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTACAAAGTTATTATAGAACTAGGAAATGGGGGATATTTTTCACAGA  200

seq1  AGACACAGCTGAAGCATCATCTCCTTAAGACGACAAGGTGACTGGCACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACAGCTGAAGCATCATCTCCTTAAGACGACAAGGTGACTGGCACAG  250

seq1  CAAGATAACTTGCATACAGCAAGTAAATCACTGACTGTCAACGTCAGCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGATAACTTGCATACAGCAAGTAAATCACTGACTGTCAACGTCAGCCA  300

seq1  TCTACACTTAGGACTGTAGAGACACTGAGAGAAAAGTGCTGAAGTGACTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACACTTAGGACTGTAGAGACACTGAGAGAAAAGTGCTGAAGTGACTG  350

seq1  AGCTGGGAGTATTTAAGGAGTACGGGAACCAAGAGAACGTGACTTAAAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGAGTATTTAAGGAGTACGGGAACCAAGAGAACGTGACTTAAAGT  400

seq1  TCACTGAGCTCCCACATTGAAGGGTAGTATTTATGCTTCATTCTCTAGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGAGCTCCCACATTGAAGGGTAGTATTTATGCTTCATTCTCTAGTT  450

seq1  CAGAACATGTTTTTAAGGTGCCCCTGTTATCTCATTATTGTGTATCTTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACATGTTTTTAAGGTGCCCCTGTTATCTCATTATTGTGTATCTTAT  500

seq1  GCTAATTTTACCCAGTAAATACTGTATAAACTCTGAGTTAAGCTGGTATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAATTTTACCCAGTAAATACTGTATAAACTCTGAGTTAAGCTGGTATC  550

seq1  GACTGTGCCAAGTACACAAGCACCATTTGAAGAAGTGAGTATATCTCTAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTGCCAAGTACACAAGCACCATTTGAAGAAGTGAGTATATCTCTAC  600

seq1  CTTGGTGGAATAAAAGAACTAACTCTAGTATATACAAAGGTTATAAAGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTGGAATAAAAGAACTAACTCTAGTATATACAAAGGTTATAAAGGA  650

seq1  CCTCGGTGAAACCTTGCCTGATGCCTCTTCTGCTTCTCTAAACAACGAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCGGTGAAACCTTGCCTGATGCCTCTTCTGCTTCTCTAAACAACGAAT  700

seq1  GTGTGTGGTGGCTTGAGTAAGAATGGCTCCTATAAGCTCATATCTTTGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGGTGGCTTGAGTAAGAATGGCTCCTATAAGCTCATATCTTTGAA  750

seq1  TGCTTAGACATCAGGGAGTGGCACTATTTGAGAAGGATTGGGAGGTGTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTAGACATCAGGGAGTGGCACTATTTGAGAAGGATTGGGAGGTGTGG  800

seq1  CTGTGTTGGAATAAGTGTGGCCTTGGGGATGTGTGTACCTGGGGATGAAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTTGGAATAAGTGTGGCCTTGGGGATGTGTGTACCTGGGGATGAAC  850

seq1  TCT-GAGGTCTGAAAAGTCTGTGCAATACCCA-TTTTGC-TTTTTGCTTT  897
      ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||
seq2  TCTGGAGGTCTGAAAAGTCTGTGCAATACCCATTTTTGCTTTTTTGCTTT  900

seq1  TTGCTTCTCT-CTCTCTCTTCCCCC  921
      |||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTGCTTCTCTCCTCTCTCTTCCCCC  925