BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-228N16
Chromosome18 (Build37)
Map Location 24,962,369 - 25,096,195
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFhod3
Upstream geneMapre2, EG665813, LOC100040623, Zfp397, C230097I24Rik, Zfp35, Zfp191, D030070L09Rik, Galnt1, LOC665586, 2700062C07Rik, BC021395, Slc39a6, Epl2, Mocos
Downstream gene5730494M16Rik, AW554918, Brunol4, LOC100041241, LOC665916, LOC100041263
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-228N16.bB6Ng01-228N16.g
ACCGA042158GA042159
length949657
definitionB6Ng01-228N16.b B6Ng01-228N16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(25,095,249 - 25,096,195)(24,962,369 - 24,963,020)
sequence
gaattctaacacagataacctagagacttcattccgttcagttttaggat
tcagttccaatcctgcccctctaaatggctataggatttaattccaactt
ttaaaaaggttagactttaaagggctttaggaaaccatacacccatagtg
ccaacagtggaacaactccccataatccatcaggatgcagcccacaactg
actgaccacctcactcacttcccactttattgggaatgagtaaagacaca
tgtctatattttgcctctgatttttgtaacaaaactttcaagtcccttca
agaatacatagccatgattcattaacaggaacggaagaagagcgggacct
gtcgtacgtcctgttgctgagaagtgagcctgggacgaaagcagaggcct
actgggtacaaatggatggctgtgctgagacctggaatgggggtgtcagg
tgggacagctacgtggctgcccccttacagctcctgccttcaaatgtgct
ttccagcttgggagccttcctttccttgctttcctgactctcctttctcc
ccctgtatcttctgtgcactgttgcactgttccctgtgcctgcttcagcc
atgggcacctttgaagaagaatagtgatacatgagcagggggagagcagc
agagtcaaatgaccacacacacacacacacacacacacacacacacaccg
cctttccctccacaagcaagtcccacacagctaagctccgatgtgcattt
cataccccaaaccccttctcctcaggcacatctctaaactgtctatgaaa
agctccaggtccagtagccccaacttccagccatgatgatgcccgtggca
aagcacccagcgtttgtccatgaaggcatttattctacaagttagcccta
tgttctcaactcatccaaaaaattggggaatgcaactgcacaggctgcc
gaattctgctgagctagcacattccccagtgccacggggtcattggaatc
agtgttgcttgaagttggaagtggtgattgggtagtagactgttcttagc
ccagcatccagggaggaacaacctgaggaacatacccacttgcttccttc
agcttgccaagggctctgtgccctctgcagcaaatactttataccgttag
aaggatgctttttttgtcccctccgcacatagacagcagctgagtacccc
aggattgagattgatcatcttaacaagaatagacatggacccatccttgt
ccatctgaaaggttgggcagggatagactatgacctgactgcaatgcctc
ctactgtgtcctcctttgggggaaccatcttgctacagaacctgctggat
aatacactgaggtattatccacttggggtgttgctagtccctgggatgga
agcagcagggtcagctgctgtgtggcctcaggtagtctttccagtctgct
cttccttgtctttttttttatcatttttatgcttgtgctcccctgctcat
ctattctctttaaggagcacgtgtctgctgtattgcaaaggcgtttttca
ccgttccttttagacagagggaggagctgagcaacctttagttaagtaaa
cgtggtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_25095249_25096195
seq2: B6Ng01-228N16.b_47_995 (reverse)

seq1  GACAGCCTGGTGCAGTTGCCTTCCCCATTTTTTGGAATGAGTTGAGAACA  50
      | |||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||
seq2  GGCAGCCT-GTGCAGTTGCATTCCCCAATTTTTTGGATGAGTTGAGAACA  49

seq1  TA-GGCTAACTTGTAGAATAAATGCC-TCATGGACAAACGCTGGGTGCTT  98
      || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
seq2  TAGGGCTAACTTGTAGAATAAATGCCTTCATGGACAAACGCTGGGTGC-T  98

seq1  TTGCCACGGGCATCATCATGGCTGGAAGTTGGGGCTACTGGACCTGGAGC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCACGGGCATCATCATGGCTGGAAGTTGGGGCTACTGGACCTGGAGC  148

seq1  -TTTCATAGACAGTTTAGAGATGTGCCTGAGGAGAAGGGGTTTGGGGTAT  197
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCATAGACAGTTTAGAGATGTGCCTGAGGAGAAGGGGTTTGGGGTAT  198

seq1  GAAATGCACATCGGAGCTTAGCTGTGTGGGACTTGCTTGTGGAGGG-AAG  246
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GAAATGCACATCGGAGCTTAGCTGTGTGGGACTTGCTTGTGGAGGGAAAG  248

seq1  GCGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTCATTTGACTC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTCATTTGACTC  298

seq1  TGCTGCTCTCCCCCTGCTCATGTATCACTATTCTTCTTCAAAGGTGCCCA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCTCTCCCCCTGCTCATGTATCACTATTCTTCTTCAAAGGTGCCCA  348

seq1  TGGCTGAAGCAGGCACAGGGAACAGTGCAACAGTGCACAGAAGATACAGG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGAAGCAGGCACAGGGAACAGTGCAACAGTGCACAGAAGATACAGG  398

seq1  GGGAGAAAGGAGAGTCAGGAAAGCAAGGAAAGGAAGGCTCCCAAGCTGGA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGAAAGGAGAGTCAGGAAAGCAAGGAAAGGAAGGCTCCCAAGCTGGA  448

seq1  AAGCACATTTGAAGGCAGGAGCTGTAAGGGGGCAGCCACGTAGCTGTCCC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCACATTTGAAGGCAGGAGCTGTAAGGGGGCAGCCACGTAGCTGTCCC  498

seq1  ACCTGACACCCCCATTCCAGGTCTCAGCACAGCCATCCATTTGTACCCAG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGACACCCCCATTCCAGGTCTCAGCACAGCCATCCATTTGTACCCAG  548

seq1  TAGGCCTCTGCTTTCGTCCCAGGCTCACTTCTCAGCAACAGGACGTACGA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCCTCTGCTTTCGTCCCAGGCTCACTTCTCAGCAACAGGACGTACGA  598

seq1  CAGGTCCCGCTCTTCTTCCGTTCCTGTTAATGAATCATGGCTATGTATTC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCCCGCTCTTCTTCCGTTCCTGTTAATGAATCATGGCTATGTATTC  648

seq1  TTGAAGGGACTTGAAAGTTTTGTTACAAAAATCAGAGGCAAAATATAGAC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGGGACTTGAAAGTTTTGTTACAAAAATCAGAGGCAAAATATAGAC  698

seq1  ATGTGTCTTTACTCATTCCCAATAAAGTGGGAAGTGAGTGAGGTGGTCAG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTCTTTACTCATTCCCAATAAAGTGGGAAGTGAGTGAGGTGGTCAG  748

seq1  TCAGTTGTGGGCTGCATCCTGATGGATTATGGGGAGTTGTTCCACTGTTG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTGTGGGCTGCATCCTGATGGATTATGGGGAGTTGTTCCACTGTTG  798

seq1  GCACTATGGGTGTATGGTTTCCTAAAGCCCTTTAAAGTCTAACCTTTTTA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTATGGGTGTATGGTTTCCTAAAGCCCTTTAAAGTCTAACCTTTTTA  848

seq1  AAAGTTGGAATTAAATCCTATAGCCATTTAGAGGGGCAGGATTGGAACTG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTGGAATTAAATCCTATAGCCATTTAGAGGGGCAGGATTGGAACTG  898

seq1  AATCCTAAAACTGAACTGAATGAAGTCTCTAGGTTATCTGTGTTAGAATT  946
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCTAAAACTGAACGGAATGAAGTCTCTAGGTTATCTGTGTTAGAATT  948

seq1  C  947
      |
seq2  C  949

seq1: chr18_24962369_24963020
seq2: B6Ng01-228N16.g_72_728

seq1  GAATTCTGCTGAGCTAGCACATTCCCCAGTGCCACGGGGTCATTGGAATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCTGAGCTAGCACATTCCCCAGTGCCACGGGGTCATTGGAATC  50

seq1  AGTGTTGCTTGAAGTTGGAAGTGGTGATTGGGTAGTAGACTGTTCTTAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTGCTTGAAGTTGGAAGTGGTGATTGGGTAGTAGACTGTTCTTAGC  100

seq1  CCAGCATCCAGGGAGGAACAACCTGAGGAACATACCCACTTGCTTCCTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCATCCAGGGAGGAACAACCTGAGGAACATACCCACTTGCTTCCTTC  150

seq1  AGCTTGCCAAGGGCTCTGTGCCCTCTGCAGCAAATACTTTATACCGTTAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGCCAAGGGCTCTGTGCCCTCTGCAGCAAATACTTTATACCGTTAG  200

seq1  AAGGATGCTTTTTTTGTCCCCTCCGCACATAGACAGCAGCTGAGTACCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATGCTTTTTTTGTCCCCTCCGCACATAGACAGCAGCTGAGTACCCC  250

seq1  AGGATTGAGATTGATCATCTTAACAAGAATAGACATGGACCCATCCTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATTGAGATTGATCATCTTAACAAGAATAGACATGGACCCATCCTTGT  300

seq1  CCATCTGAAAGGTTGGGCAGGGATAGACTATGACCTGACTGCAATGCCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTGAAAGGTTGGGCAGGGATAGACTATGACCTGACTGCAATGCCTC  350

seq1  CTACTGTGTCCTCCTTTGGGGGAACCATCTTGCTACAGAACCTGCTGGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGTGTCCTCCTTTGGGGGAACCATCTTGCTACAGAACCTGCTGGAT  400

seq1  AATACACTGAGGTATTATCCACTTGGGGTGTTGCTAGTCCCTGGGATGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACACTGAGGTATTATCCACTTGGGGTGTTGCTAGTCCCTGGGATGGA  450

seq1  AGCAGCAGGGTCAGCTGCTGTGTGGCCTCAGGTAGTCTTTCCAGTCTGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCAGGGTCAGCTGCTGTGTGGCCTCAGGTAGTCTTTCCAGTCTGCT  500

seq1  CTTCCTTGTC-TGTCAGCTAGCA-GGCCATGCTTGTGCTCCCCTGCTCAG  548
      |||||||||| | |    || ||     ||||||||||||||||||||| 
seq2  CTTCCTTGTCTTTTTTTTTATCATTTTTATGCTTGTGCTCCCCTGCTCAT  550

seq1  CGATTCTC-TTAAGGAGCACGTGTCTGCTGTATTGCAAAGGCG-TTTTCA  596
      | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CTATTCTCTTTAAGGAGCACGTGTCTGCTGTATTGCAAAGGCGTTTTTCA  600

seq1  CCGTTCCTTTTAGACAGAGGGAGGAGCTGAGCAACC-TGAGTTAAGTAAT  645
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| 
seq2  CCGTTCCTTTTAGACAGAGGGAGGAGCTGAGCAACCTTTAGTTAAGTAAA  650

seq1  CGTGGTT  652
      |||||||
seq2  CGTGGTT  657