BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-254E14
Chromosome18 (Build37)
Map Location 57,353,553 - 57,481,421
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMegf10
Upstream geneLOC676543, LOC667432, Gramd3, LOC667458, Aldh7a1, Rnuxa, 1700065I17Rik, LOC675171, Lmnb1, March3, C330018D20Rik
Downstream geneLOC672445, Prrc1, 1700011I03Rik, 4930511M06Rik, 2210409D07Rik, Slc12a2, 9330166H04Rik, Fbn2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-254E14.bB6Ng01-254E14.g
ACCGA060792GA060793
length1,193956
definitionB6Ng01-254E14.b B6Ng01-254E14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(57,480,235 - 57,481,421)(57,353,553 - 57,354,498)
sequence
gaattctttgagaaagcctgtccaaaggagagtgggaaagaaaggagcaa
aagaacaacagagtaggagaaagctgctttgccaaattggctcagacatt
gaaggaagaaggtccaaacgtacaaagtctgactgtgtgcactcacctca
gtgctggctttagtatcgcctctaagtgttctttcctaggttttcagatg
ccattaacacccttagaaggtcttgttggtgatgggcttgctcaagctac
tcatgtcagggtatgcattgggaatctctggggggtctactgtagaccat
agctcaggtcagttttgactcacagattccttctgtctaccagtgttctt
caagccaggtttcagaacttaagtctcaggacacctgctctgatagcacc
tttttcctctattgtcaccaagccaatgattcaccaggaaactttagaaa
ctcttcttcttccctctgctctgctccagggtctcctcttcctctgccag
agctgctgctacattcctccctcgcctcactccaccctgtcccaccttcc
caaccccattctcgctgtgtccttcactctagttattctgtaagaccagt
gttaaccagagctacagtgctgatttcaaagctcatcctggagctgtggt
cctggccttctgcagttatactctctcactcatgctcctctgagacatac
tctagactttcctgtttctctccaagctttcctactttgttttgctcttg
aaactacagatttctgccactactcttttctattgctcttgaagctacag
atttctgccaccactcctttctatttatagctattgatctaaatactccg
agttggagatcctagcagtctatgccctgtcttttgccatcttccctgta
atcctgtttgcatctttttaagatgcccaagctctatcccatccttaagt
gaccagctcaggactggtcttagctgtccaaaggatccctcagccagaaa
taccaattccctttctgaacagccaatatcactttatatgctatgtctgg
ctttccatattagctccttgggcagtccgccagttttgaatgaaagacca
tgtatcacaggcataccactaaacaggactcatccacaatcaccagaata
atgggagcccaaggcacctgtagtgaccttaatgtccggttgc
gaattcattggtttttgtttgcttgcttgtttatcccaaatattttctcc
tctcctttataggaaaaaaaaatcaggttcagtaaagagggttcagtaca
tagatggttaaagttaacatgcaccgattgtctgtggtataaaatccaaa
ggctgggctctgtgattacatgcttacatgcttatctgagagagctatgc
tcctgtcccgcggggagtttgccctaagtagtttttaatgtcttcagaat
gacaacagattagtagttatctcgaccgagtatttattctgtgccaggca
tatatggtgtcgttgtattaattcccccagatctcactatgagacagata
tgatcatatgcattctgtagatgaggaaacctgtcaggtggtggttggcg
gtgagaaatggtgctggatgtattctgaatgtggaatgaggtacttcatc
cacaccaaggaaagcggcagggcagctgagaagtgggggagtgtgaccta
actctcagactggatttctcaggagtggcttagtagcattatggttacat
gacctcagagatatcaaagaagctgacagacaactttgcctttggaaaac
aaagttgcttaattccattcacaaattagattctggctttatgttcatct
ctttttaaagtgactaaaatggacattttttttttccccttttgaagttg
gactttgagaaggttgtgcaaacaaagagctttatggatattgtttagat
agataacaaaatgtggtgatcctgtctgtatccgatgggtggcagctttg
tggacacgtagatatatgtgggggttaggatggggtttgcacaaaaccta
gtgagggagccttgggctggtgctctttcttgtctccatattttggcggt
tcggagaattaagatggggagttcagaagacacaaaaacttttttaactt
catatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_57480235_57481421
seq2: B6Ng01-254E14.b_45_1237 (reverse)

seq1  GCAA-CAGACATTAA-GTCACTTAACAGGTGCCTTGTGCTCCCATTATCC  48
      |||| | |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| |
seq2  GCAACCGGACATTAAGGTCACT--ACAGGTGCCTTGGGCTCCCATTATTC  48

seq1  TGTGTGTTTGTGGTTGATGTCCTGTTATGT-GTTTGGCTGTGGATACATG  97
      || ||| |||||| ||| ||||||||  || || || |||| ||||||||
seq2  TG-GTGATTGTGGATGA-GTCCTGTTTAGTGGTATGCCTGT-GATACATG  95

seq1  TCCTTTCATTCCAAAACT-GCGGACTGCCCA--GAGCTATTAT-GAAAGC  143
        |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| ||| ||||||
seq2  GTCTTTCATT-CAAAACTGGCGGACTGCCCAAGGAGCTAATATGGAAAGC  144

seq1  CAGACATAGCATATAAAGTGATATT-GCTGTTCAGAAAGGGAATGGTTAT  192
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||
seq2  CAGACATAGCATATAAAGTGATATTGGCTGTTCAGAAAGGGAATTGGTAT  194

seq1  TTCTGGCTGAGGGATCCTTTGGACAGCTAAGACCAGTCCTGAGCTGGTCA  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGCTGAGGGATCCTTTGGACAGCTAAGACCAGTCCTGAGCTGGTCA  244

seq1  CTTAAGGAT-GGATAGAGCTTGGGCATCTTAAAAAGATGCAAACAGGA-T  290
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CTTAAGGATGGGATAGAGCTTGGGCATCTTAAAAAGATGCAAACAGGATT  294

seq1  ACA-GGAAGATGGCAAAAGACA-GGCATAGACTGCTAGGATCTCCAACTC  338
      ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGAAGATGGCAAAAGACAGGGCATAGACTGCTAGGATCTCCAACTC  344

seq1  GGAGTATTTAGATCAATAGCTATAAATAGAAAGGAGTGGTGGCAGAAATC  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTATTTAGATCAATAGCTATAAATAGAAAGGAGTGGTGGCAGAAATC  394

seq1  TGTAGCTTCAAGAGCAATAGAAAAGAGTAGTGGCAGAAATCTGTAGTTTC  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGCTTCAAGAGCAATAGAAAAGAGTAGTGGCAGAAATCTGTAGTTTC  444

seq1  AAGAGCAAAACAAAGTAGGAAAGCTTGGAGAGAAACAGGAAAGTCTAGAG  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCAAAACAAAGTAGGAAAGCTTGGAGAGAAACAGGAAAGTCTAGAG  494

seq1  TATGTCTCAGAGGAGCATGAGTGAGAGAGTATAACTGCAGAAGGCCAGGA  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCTCAGAGGAGCATGAGTGAGAGAGTATAACTGCAGAAGGCCAGGA  544

seq1  CCACAGCTCCAGGATGAGCTTTGAAATCAGCACTGTAGCTCTGGTTAACA  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGCTCCAGGATGAGCTTTGAAATCAGCACTGTAGCTCTGGTTAACA  594

seq1  CTGGTCTTACAGAATAACTAGAGTGAAGGACACAGCGAGAATGGGGTTGG  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTCTTACAGAATAACTAGAGTGAAGGACACAGCGAGAATGGGGTTGG  644

seq1  GAAGGTGGGACAGGGTGGAGTGAGGCGAGGGAGGAATGTAGCAGCAGCTC  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTGGGACAGGGTGGAGTGAGGCGAGGGAGGAATGTAGCAGCAGCTC  694

seq1  TGGCAGAGGAAGAGGAGACCCTGGAGCAGAGCAGAGGGAAGAAGAAGAGT  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGAGGAAGAGGAGACCCTGGAGCAGAGCAGAGGGAAGAAGAAGAGT  744

seq1  TTCTAAAGTTTCCTGGTGAATCATTGGCTTGGTGACAATAGAGGAAAAAG  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAAGTTTCCTGGTGAATCATTGGCTTGGTGACAATAGAGGAAAAAG  794

seq1  GTGCTATCAGAGCAGGTGTCCTGAGACTTAAGTTCTGAAACCTGGCTTGA  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTATCAGAGCAGGTGTCCTGAGACTTAAGTTCTGAAACCTGGCTTGA  844

seq1  AGAACACTGGTAGACAGAAGGAATCTGTGAGTCAAAACTGACCTGAGCTA  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACACTGGTAGACAGAAGGAATCTGTGAGTCAAAACTGACCTGAGCTA  894

seq1  TGGTCTACAGTAGACCCCCCAGAGATTCCCAATGCATACCCTGACATGAG  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTACAGTAGACCCCCCAGAGATTCCCAATGCATACCCTGACATGAG  944

seq1  TAGCTTGAGCAAGCCCATCACCAACAAGACCTTCTAAGGGTGTTAATGGC  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTGAGCAAGCCCATCACCAACAAGACCTTCTAAGGGTGTTAATGGC  994

seq1  ATCTGAAAACCTAGGAAAGAACACTTAGAGGCGATACTAAAGCCAGCACT  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGAAAACCTAGGAAAGAACACTTAGAGGCGATACTAAAGCCAGCACT  1044

seq1  GAGGTGAGTGCACACAGTCAGACTTTGTACGTTTGGACCTTCTTCCTTCA  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGAGTGCACACAGTCAGACTTTGTACGTTTGGACCTTCTTCCTTCA  1094

seq1  ATGTCTGAGCCAATTTGGCAAAGCAGCTTTCTCCTACTCTGTTGTTCTTT  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTGAGCCAATTTGGCAAAGCAGCTTTCTCCTACTCTGTTGTTCTTT  1144

seq1  TGCTCCTTTCTTTCCCACTCTCCTTTGGACAGGCTTTCTCAAAGAATTC  1187
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCCTTTCTTTCCCACTCTCCTTTGGACAGGCTTTCTCAAAGAATTC  1193

seq1: chr18_57353553_57354498
seq2: B6Ng01-254E14.g_70_1025

seq1  GAATTCATTGGTTTTTGTTTGCTTGCTTGTTTATCCCAAATATTTTCTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTGGTTTTTGTTTGCTTGCTTGTTTATCCCAAATATTTTCTCC  50

seq1  TCTCCTTTATAGGAAAAAAAAATCAGGTTCAGTAAAGAGGGTTCAGTACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTTTATAGGAAAAAAAAATCAGGTTCAGTAAAGAGGGTTCAGTACA  100

seq1  TAGATGGTTAAAGTTAACATGCACCGATTGTCTGTGGTATAAAATCCAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGGTTAAAGTTAACATGCACCGATTGTCTGTGGTATAAAATCCAAA  150

seq1  GGCTGGGCTCTGTGATTACATGCTTACATGCTTATCTGAGAGAGCTATGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGGCTCTGTGATTACATGCTTACATGCTTATCTGAGAGAGCTATGC  200

seq1  TCCTGTCCCGCGGGGAGTTTGCCCTAAGTAGTTTTTAATGTCTTCAGAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTCCCGCGGGGAGTTTGCCCTAAGTAGTTTTTAATGTCTTCAGAAT  250

seq1  GACAACAGATTAGTAGTTATCTCGACCGAGTATTTATTCTGTGCCAGGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAACAGATTAGTAGTTATCTCGACCGAGTATTTATTCTGTGCCAGGCA  300

seq1  TATATGGTGTCGTTGTATTAATTCCCCCAGATCTCACTATGAGACAGATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGGTGTCGTTGTATTAATTCCCCCAGATCTCACTATGAGACAGATA  350

seq1  TGATCATATGCATTCTGTAGATGAGGAAACCTGTCAGGTGGTGGTTGGCG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCATATGCATTCTGTAGATGAGGAAACCTGTCAGGTGGTGGTTGGCG  400

seq1  GTGAGAAATGGTGCTGGATGTATTCTGAATGTGGAATGAGGTACTTCATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGAAATGGTGCTGGATGTATTCTGAATGTGGAATGAGGTACTTCATC  450

seq1  CACACCAAGGAAAGCGGCAGGGCAGCTGAGAAGTGGGGGAGTGTGACCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCAAGGAAAGCGGCAGGGCAGCTGAGAAGTGGGGGAGTGTGACCTA  500

seq1  ACTCTCAGACTGGATTTCTCAGGAGTGGCTTAGTAGCATTATGGTTACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTCAGACTGGATTTCTCAGGAGTGGCTTAGTAGCATTATGGTTACAT  550

seq1  GACCTCAGAGATATCAAAGAAGCTGACAGACAACTTTGCCTTTGGAAAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTCAGAGATATCAAAGAAGCTGACAGACAACTTTGCCTTTGGAAAAC  600

seq1  AAAGTTGCTTAATTCCATTCACAAATTAGATTCTGGCTTTATGTTCATCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTGCTTAATTCCATTCACAAATTAGATTCTGGCTTTATGTTCATCT  650

seq1  CTTTTTAAAGTGACTAAAATGGACATTTTTTTTTTCCCCTTTTGAAGTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTAAAGTGACTAAAATGGACATTTTTTTTTTCCCCTTTTGAAGTTG  700

seq1  GACTTTGAGAAGGTTGTGCAAACAAAGAGCTTTATGGATATTGTTTAGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTGAGAAGGTTGTGCAAACAAAGAGCTTTATGGATATTGTTTAGAT  750

seq1  AGATAAC-AAATGTGGTGATCCTGTCTGTATCCGATGGGTGGCAGC-TTG  798
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AGATAACAAAATGTGGTGATCCTGTCTGTATCCGATGGGTGGCAGCTTTG  800

seq1  TGGACACGTAGATATATGTGGGG--TAGGAT-GGGTTTGCA-GAAAGCTA  844
      |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||| |||
seq2  TGGACACGTAGATATATGTGGGGGTTAGGATGGGGTTTGCACAAAACCTA  850

seq1  GTGAGGGAGCCTT-GGCTGGTGCTC-TTCCTGTCTCAATATTTTGGCGGT  892
      ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||
seq2  GTGAGGGAGCCTTGGGCTGGTGCTCTTTCTTGTCTCCATATTTTGGCGGT  900

seq1  TCGGAGAA-TAAGATTGGGAGTTCAGAAGACACAGAAAC-TTTTTAACTT  940
      |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||
seq2  TCGGAGAATTAAGATGGGGAGTTCAGAAGACACAAAAACTTTTTTAACTT  950

seq1  CATATT  946
      ||||||
seq2  CATATT  956