BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-271M14
Chromosome18 (Build37)
Map Location 3,171,753 - 3,328,484
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCrem
Upstream geneLOC664794
Downstream geneEG621440, Cul2, EG621501, Bambi, LOC100039273, LOC435549, EG664867, LOC621666, Lyzl1, LOC383374, LOC664909
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-271M14.bB6Ng01-271M14.g
ACCGA073776GA073777
length517948
definitionB6Ng01-271M14.b B6Ng01-271M14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(3,327,976 - 3,328,484)(3,171,753 - 3,172,581)
sequence
gaattccaatctttctttccaggtctgagatataatcttctacattttgc
ttttgtttttttatttactagtttaacctcatttcacattgttaaatgtt
tagaaataaaatggttaaaaacttttaaaaaagatgtttcatgctgtata
cctttaatttcagttcttgggagatctgcagagttgggcagatttctgag
tgcaaggccagtttggttaacactgcgagttccagccagccagagttgta
tagtgaaaccttgtgtcaaaaaaagaaattagttttatttgtgtctctgt
gagtacagcatatgtgtgcagtggatggtggagaccaaagagagaattag
atcccctggagctggcgtagcaggcaattgtgagccactcaaacgactgt
ctttaaatattgtgccatttcttcacacacacacacacacacacacacac
acacacacacacacacacacagacacagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgt

gaattcttcttcatctgtgatcttctgctgaggtggaggtgcaaggagac
caagttctctctttagcttctcttaagagctgccctggagttatctgcac
cttggccggagctttatttttgacctgggccaatttaggaaggcgctgct
gtttccaagagactttggatgcctccatagcaggggaatgcaagcttgct
aagcaaccctggctcacaactgaactccaccaatgcccttcaacaaccag
gccctacaacacagccagaccacaacacactagatcccctaaggaggggt
ttttaagtggggctaaatgcaagtccagagttgatcaatgcacttcagag
aagctattaatctagctctgggaaagtactgctatgaccatagtcatcag
ctcaagattgcaaagttcctttggttgcttaaagtatctctcactgtgtt
aaaaactgtctgtctacaaatgtgtatacatacagtcaggattctctaga
gtcttctctatattgagggaatttattgggatgactttcagtctgtagtc
ctaactctccaacaatggtcagctggaaatagccagtccacggatctagt
agttgctcagctataccagatgatcccaactaggctagttgtttcagctg
gctctctgtagaagtgctttacagcagcagtgctggcaagtaaatgcaag
cagttgaaggacagtgaatctctcttcttctgcaggccttatataggtct
tgagccttctagaaggtgtggcctagatgaagggtgtgtcccacccacca
agcctggatctgggacttattttgtcccaggctgaccttgaactcagatc
accttgcattaatctcctgatattataggtgtgtatgaacttgcttggga
ctaatctccatacctagatccaggtcagaacttgtgtctttcaaccta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr18_3327976_3328484
seq2: B6Ng01-271M14.b_50_558 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACTGTGTCTGTGTGTGTGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACTGTGTCTGTGTGTGTGTG  50

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAGAAATGGCACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAGAAATGGCACAA  100

seq1  TATTTAAAGACAGTCGTTTGAGTGGCTCACAATTGCCTGCTACGCCAGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAAAGACAGTCGTTTGAGTGGCTCACAATTGCCTGCTACGCCAGCT  150

seq1  CCAGGGGATCTAATTCTCTCTTTGGTCTCCACCATCCACTGCACACATAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGGATCTAATTCTCTCTTTGGTCTCCACCATCCACTGCACACATAT  200

seq1  GCTGTACTCACAGAGACACAAATAAAACTAATTTCTTTTTTTGACACAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTACTCACAGAGACACAAATAAAACTAATTTCTTTTTTTGACACAAG  250

seq1  GTTTCACTATACAACTCTGGCTGGCTGGAACTCGCAGTGTTAACCAAACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCACTATACAACTCTGGCTGGCTGGAACTCGCAGTGTTAACCAAACT  300

seq1  GGCCTTGCACTCAGAAATCTGCCCAACTCTGCAGATCTCCCAAGAACTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTTGCACTCAGAAATCTGCCCAACTCTGCAGATCTCCCAAGAACTGA  350

seq1  AATTAAAGGTATACAGCATGAAACATCTTTTTTAAAAGTTTTTAACCATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAAGGTATACAGCATGAAACATCTTTTTTAAAAGTTTTTAACCATT  400

seq1  TTATTTCTAAACATTTAACAATGTGAAATGAGGTTAAACTAGTAAATAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTCTAAACATTTAACAATGTGAAATGAGGTTAAACTAGTAAATAAA  450

seq1  AAAACAAAAGCAAAATGTAGAAGATTATATCTCAGACCTGGAAAGAAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAAAAGCAAAATGTAGAAGATTATATCTCAGACCTGGAAAGAAAGA  500

seq1  TTGGAATTC  509
      |||||||||
seq2  TTGGAATTC  509


seq1: chr18_3171753_3172581
seq2: B6Ng01-271M14.g_70_898

seq1  GAATTCTTCTTCATCTGTGATCTTCTGCTGAGGTGGAGGTGCAAGGAGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCTTCATCTGTGATCTTCTGCTGAGGTGGAGGTGCAAGGAGAC  50

seq1  CAAGTTCTCTCTTTAGCTTCTCTTAAGAGCTGCCCTGGAGTTATCTGCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTCTCTCTTTAGCTTCTCTTAAGAGCTGCCCTGGAGTTATCTGCAC  100

seq1  CTTGGCCGGAGCTTTATTTTTGACCTGGGCCAATTTAGGAAGGCGCTGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCCGGAGCTTTATTTTTGACCTGGGCCAATTTAGGAAGGCGCTGCT  150

seq1  GTTTCCAAGAGACTTTGGATGCCTCCATAGCAGGGGAATGCAAGCTTGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCAAGAGACTTTGGATGCCTCCATAGCAGGGGAATGCAAGCTTGCT  200

seq1  AAGCAACCCTGGCTCACAACTGAACTCCACCAATGCCCTTCAACAACCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAACCCTGGCTCACAACTGAACTCCACCAATGCCCTTCAACAACCAG  250

seq1  GCCCTACAACACAGCCAGACCACAACACACTAGATCCCCTAAGGAGGGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTACAACACAGCCAGACCACAACACACTAGATCCCCTAAGGAGGGGT  300

seq1  TTTTAAGTGGGGCTAAATGCAAGTCCAGAGTTGATCAATGCACTTCAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAGTGGGGCTAAATGCAAGTCCAGAGTTGATCAATGCACTTCAGAG  350

seq1  AAGCTATTAATCTAGCTCTGGGAAAGTACTGCTATGACCATAGTCATCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTATTAATCTAGCTCTGGGAAAGTACTGCTATGACCATAGTCATCAG  400

seq1  CTCAAGATTGCAAAGTTCCTTTGGTTGCTTAAAGTATCTCTCACTGTGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGATTGCAAAGTTCCTTTGGTTGCTTAAAGTATCTCTCACTGTGTT  450

seq1  AAAAACTGTCTGTCTACAAATGTGTATACATACAGTCAGGATTCTCTAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACTGTCTGTCTACAAATGTGTATACATACAGTCAGGATTCTCTAGA  500

seq1  GTCTTCTCTATATTGAGGGAATTTATTGGGATGACTTTCAGTCTGTAGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCTCTATATTGAGGGAATTTATTGGGATGACTTTCAGTCTGTAGTC  550

seq1  CTAACTCTCCAACAATGGTCAGCTGGAAATAGCCAGTCCACGGATCTAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTCTCCAACAATGGTCAGCTGGAAATAGCCAGTCCACGGATCTAGT  600

seq1  AGTTGCTCAGCTATACCAGATGATCCCAACTAGGCTAGTTGTTTCAGCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGCTCAGCTATACCAGATGATCCCAACTAGGCTAGTTGTTTCAGCTG  650

seq1  GCTCTCTGTAGAAGTGCTTTACAGCAGCAGTGCTGGCAAGTAAATGCAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCTGTAGAAGTGCTTTACAGCAGCAGTGCTGGCAAGTAAATGCAAG  700

seq1  CAGTTGAAGGACAGTGAATCTCTCTTCTTCTGCAGGCCTTATATAGGTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGAAGGACAGTGAATCTCTCTTCTTCTGCAGGCCTTATATAGGTCT  750

seq1  TGAGCCTTCTAGAAGGTGTGGCCTAGATGAAGGGTGTGTCCCACCCACCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCTTCTAGAAGGTGTGGCCTAGATGAAGGGTGTGTCCCACCCACCA  800

seq1  AGCCTGGATCTGGGACTTATTTTGTCCCA  829
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGGATCTGGGACTTATTTTGTCCCA  829


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |